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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000008_pilon:627533..635980+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_044228 ID=XLOC_044228|Name=XLOC_044228|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8448bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000008_pilon:627533..635980+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGCAAAAGAGCAAGTGTACCAGCAGAGCCAACTTCTACACCTGGAGG
AGTAATGGTTATTTAccctcaaaataaaaaaaagaaatcctcAACaccaa
agtaaatttttttttttttaatttttattccaccaataccgtgagtggtc
ccaaatccgacagccctggctaaatccgatggggtctttcaaagatacaa
actaaaataaaaacaaactttgcgctttgacgcaatgaagataccaaagt
gtcaactaaactgagagatttgatacacattGATTTTGAACCAAATTACA
ATAATtgtgcttcttatacaaaacataattttttattacataaattgtta
atgttttaaacacgagcaacagaCACAGCTTCAGcccccccTTacttttg
ggggggggggggctaagaaatattttggcctttaaagagcctgggggcta
aaattaccaaaatatttggggggacctagattttTTGGGGGGCCTatatg
atctgactgagactctgggggctgttcagctaatttcaaaagatctctta
tcttactattaaatcaagtataaaaagcaaaagatttgtaaacataaata
ttaatatcagtactgtactcgcatatattttttattgacttctctacGGC
CTACggggggggggagaacaatgtttttgtttttccccaagtgttagggg
acctagcacaaggcaattttttggggggagctaaattgttggggggacct
tactttgttggggggagctagaaacctggctgaagctatgaacagattca
gaataatggaggtataattatttttacaactcacacttttttatcacatt
aattgaaatcttgacattatagccatcttgtaatagtttatcgttcaaca
tGGAGAAGGAatatttgtaaacatagaatttttttcataacagttatttg
ggatGTCGGAATTACGCAGGgttgtcggatttaggaccactcacggtacc
tatcctgaaaaatgaattaaattCAGTtaacgataagtgtgcactctttt
tttttacCGCATGGAAACCTCTCCCAAGGGAATTAGTCTATACGTTTCCA
CATTAAAGCGAAAATGAGTGCACAGTTATTGTGAACAGACAGGTTCATTC
AGTCATTAACAATAACAGAGTCTCACATTTTGTATCATTGCATTTGTATT
GTATTAGGAATGTAATTCTatatatttctttcaaatcCTTGAAAATTATT
GTTACTTTTCATTTCAACAGGCaatcaaacaataacaaaagTTTGGACAA
TTCAAGAATAAGTGGAATCAGTATGTTAGATGACAGTAGGGCAAATGGCA
GCGATGTATCCCAGAGGTACTtccctttttattttcaaattttcaaattt
atttttattctccaaaaaaagtgtttttagacttttttaaaCCAGGCATA
TAAATGAAAAAACTCAGCTCTCTACTGTACAATTTATTTTGGGATAGATT
AATTtcaatatcgagaaaaaaagcTCTGATATGATGACTTTCAGTTGTAA
TCAAATACTGTCTTAAAAATCCcctgattttttgttcaatGATAATCTAC
TAACCGGCATCAGTGTAGTCAAATGTGGCAATCACTTTTCCTATACTAAG
GCATTCAAAATGCTAAAGTATAATCAGTAGTATGTCATTGTATGAAGAAG
AAAGGACATTCTTTACATCTTTTTCAACAATATGAATTTTGGGCACTCTA
CTAACCGGCATCAGTGTAGTCAAATGTGGCAATCACTTTTCCTATACTAA
GGCATTCAAAATGCTAAAGTATAATTAGTAGTATGTCccatttttataat
ttgttaAATGTCTATTCCAAAAATCaaactgtttgtttttttgtcatatg
TGAATTAAAGCATATAAAGTATTTGAATACAACTATGAAAGCCATGTTTA
TCGAAGATACCTCTTAAGATGTGaagaataattttgaaatctattctata
tgagattttgaaaattttgagatgCAGGCGAGGTTGACAATTTgggatta
aaaacatcaaagtcACAGGTATTGTTAGATAAGGGGAGGCTCCCACGAAT
ACCAGCAAATTTCAATTGGGACAGTCTGTTATTAAAGTACATTTCAAATT
AGATGGCGGTAAATTTTCAATTGCgttttacttttgatagatttcaAAGG
GGATTAACGAATGATAATTTTCCTGTTAATAAGAAGAGTCTTGTGATAAA
TGGAATGTTCACATTTGATGGGTtatcatagtgtgcaccccccctaAATT
AAAGGGGGGCTTTGTTGATTTCGGTTCCaaatctttaggtgggacttcgG
ATTTTTTGGATCTCAgggggggTTAATAGGATGAGctgggactaaaattt
gattggtGGGACTTGCCAACTTCGTTACAGAGGCCTAATTTTCAAGCACA
AGTATACAtaccattttaaaaattttcgccTTCTTACTTAAACCAATTTG
CTATTTAATGCTCTCTTCTTTATAAAATCATAATTTGAAGCATATCTTAA
TCTTTGAATCTTAGCGGAATCACTTTCATAGTTAAAAGGGGTACACACAA
TTGCCTTTGGGAACAGGGAAAAATTCGAGTTTTAGGTGGGACCAAAGATT
CAAGTTATCAGGTGGGGGTTTTAGATAGTGCTGGGACCTCAtttttttGG
TGGGACCTTGACACCCCTTGCACACAATGCTTATCCCTTGAGGGCAAATT
TTGTCGAAcgtttttaacgaattttttcCCTCTTTCTATCTGAAATCATA
TTATACAAACTCAATTGGtgctaaatttttaaaacaacagTAAGAGTTTA
GCTTGTTGGTAAAATGCTTCAAGTCAGCTAATTTAGTAAGGGGTCTCCAG
TTTTTCCATTTTAGTAAGACCCCTTCCTACGCAAGACTTCCTTCCTTCTT
GATCCCTCTAGAAACTGTGtgtttcacttaaaattttgctTATACCGCTC
TTTAACCCTATTTAGCGGtttttttGCGGTACATAGTTcacataaaaact
tgaaaaatggtAGAAAAGTCATGAAAATTGGCAGGATTGTACATATCCAT
ACAAAGTTTGCTTTGGCAcccaaaatttgatgacgtcagcaattttttat
aagcaatttatgaaaaatagaaaaaaatatgacattttttgaaaagactA
GCTCTTAATGTgaaagagatttttcaattctgttttgatatTCTGAAAGC
CAACTGTAGAATTCCCTTTTAACATTATCAaatcagattttcaaaatttt
taattcctTCTTAGAAATCTTAGAATGAAGAAGAGAGTTCAACCAACCCC
TTGAATTTCAAATCGCCTCAACCCcctctttttcagaaaattagtCCCAA
AAGTcaaccccccctttttaaagAGGTGTTCTCACTATGACGGGGAAGAC
CTTGTTCAAGAGCCAGGGCTGGGCCAAATTAATGAGATTGAAAAAGAATC
TGCAGATCATCCAGGGGAAGAAAacaattattgtttttttaaaatAGCCT
TCATAATGAAAAGTATCAAAATTAGCAATCTAAGTAAATATTGCCAATTA
AGTActcaaaaattctttaaattataATGTACATAAAACAACAGTTaaag
tttagtttagtttttagTTCTCCAATTTTGTCAGAGAAATTCATtgattg
tttacaaatttttaaaaagtttgataatCCTACTTATTGTGAAGAGTACC
GTAATGAAAGTTCTTTCattgtttattgtttatagaaaaTCATTCAGAAG
TGACGCAAAAGCGCTAGAGAGAAAGCAGGATATGAGAGTAAAACAAAGAA
TTAAGAAGGCCAAAGAGGAAAAAACCGTCCGCAGTCAATTGGTGACAGCA
AAAAAGCAATTGAAAACATATGAGGTGAAGAAAAACCATACCATTGTCAC
CAAGAGGCCAGGGACAGTAAAAACAGTGACTGAAATGACAAGGCAGAGTA
GAACTAGGATGAAGAAAACTTGTATGGACAACCTTTTGACTGAGCTGGAA
TCGAACATTCCTGAGTTTGACGATGGATCACTTAAAAATCTAGGCTATAA
GACAATGGGTGGTGCGTTTGGCCAGGTATCGGCCTATGAAATTACATTTA
TGGGAGTCAAATGCGCCCGAAAAACTATTTCCGGATCAATGAAGGAGTTG
AGAGCAGAGGCGTTAGCTTTGAATAGTCTATCTGGACACCCAGGTTTCCC
TTACTTGTTCGGATTAACAAAATCCGGAGCTCTTTTGATGGAGTACATCT
CCTCAAATGCAAACCGCCTCACCAGTTCAACCACGTTAAGATCGGTATTG
AAGTCTGGGCAGTATAAAAAGAAGATTTGGTTCGACATATGTAGAAAGTT
AGTTGATGCGTTATCCTTTATGCACGATAAAGGACTACTCCACAATGATC
TCCACAGTGAGAACATTTTGATTCGAAGTAACAAACAACCGTGTATAATT
GATTTCGGAAAATGTACCCTTGTGAATTCACCATTTCATTATAATATCAA
GGCTGGATCTAAAGAGCAGCTTAAATTCAACACGTACCACATTCACTTGG
CCACCGAATTAAGGAACGTGCCAAATTCTCCCCAGACTGTCTACACAGAC
ATATACTCACTTGGCTTCAATTTCGCCAGCATTGGGAAATTTCAGAACAT
TGAGGACATTACTAAACTGGCGAAACGAATGACAGTTGAAGAACCCTTAA
ATCGGTACGATCTGATGGATTGCAATGTCAGTTTGTTAAAGTACTAgatt
ttattagatttttataaggattttaccttttttacgTCAAACAAAAAGTA
CTTTAATGTGATTAAAGTTTGTGGGCACCATCAGAAgataatatttttac
tttttactttcaaaCATTACGTGTTGGTTCTTGAAATACCTTTGATGTCA
ATAAACATTAAAAGTAGCTTTTTGacaatcttttgaattttttttttcaa
aaatatactgtGGATAAGGCCTTTTCAGATTTCCATTTGGACTTTATTAA
TCTTGCATTAATCTCGCCTGATGACATCCAAATCTGCGAACActacgaaa
tttaatccccattAAAGTACATTcttctttataagcatacagGAAAATCG
ATATGCttgacaaaatttaaaattctcaGCCTAAATTTATGCTTATCTGT
TTAGACTTGGACCTGtttattttctttagatttgaaaatttcgagttTTA
ATATTTACATTGTTCGACCCAGAATAAAGAAATAGCCTAAAGTTTTTGTT
ATTAGTGAAATAATGATCATTtcgattttgaaatgaaaaatttcctggaa
gaaaaaattcaagcaaaatttttgcatttcagcttgggTAGTATGGTTAA
CATGTGCTTTTTACCTAAATTTCAGCCTCGGTATGCCAAGAGTATTGTGA
GTATTGTATATAATTAAATGCTATATTTAGGTATTAGTGTTTTAATGTTA
GCAATTGTATGTTACTTTTGTTtgcaaaaaattataagaatgaCCTTGAA
CCTGCCTAAACCCACTGTTTTGAATCGATTAAATCCTCTGAAATCTTTCC
ACATTAAAGTTTGTAGTACATAAGAAACTCCACTcagaattttctgattt
tgacaTAATCCTACTAAGACCTCAAAGTCAATTCCACCATACGTGAATCC
TTATCTTCTGAAATTTTGATACCAAGTTAAATTTGAGAAGATCCGGTCGC
TATATCCAATCATTTTGTATCTTcagcacacattttttataagcaacttc
aATTTTCGGATCAGGCCTGGGGTTgctaaagatttttcaaaatccatgCA
CAAAGAAAGTTTGCTTAAAACTTTTCAAGCTTGAATATGGTGAAAAgcac
attttctaattttcaacaattttcaatatttaatgagactttttcaaaca
tttctaGTACCAAAGTTATTTTTCATATCTGATTAAAAAAGTTGCTATTT
TGGGTTGCTAAGGCAATTTTGAGGCCTCGAGCCCTTAGGAACTACTACTT
TCCTTgaagtttaaaatattttcatcccaatttttttgtaataacttttg
atacatcaattGAGATAGATACTTAAACTTTTTGcaaacaattaaaaaca
aaatctaaacaaaaaggttgattacccattaaaactaagcttgtaaaaga
gggtaatatAACATTTGAACGTCTCTTTAAGATTCGTAACGTCATTTATG
TAATTAAATTGCTAATTACTCTTGATAAAACAAATTCACAAACAACTTAA
TATAGacatttttgttaagagtgtcAAGGATCTTGAAACTATAAGTTTCA
TCTTTAAATCTCATAATTTATTCAAAGATTTGTATGGCTTTCTTTTAAAT
TTGCACTAGTACCAAAGTTTTTTACATATCTGATTAAAAAAGTGGCTATT
TTGGATTTGAGGCCTCGAAAAAGTGTGTAAAGAGGACCCCTAGGGAAggg
gggggAGTTTCGTCAAAAACTTTCTGGGGGTTCCGGGGGTGTTACGACCG
ATTACGACTTGACGCACTCGAGGCTCGATTCTTTCAATATATACATTGTT
TACTTGCACTCCTCTTGAATGAGGTTTGCTGTGTTAGGCAAGCTAGAATA
CAAACTATCTCATCTTAATGTTATAATTTCAGAGATTTTGACCGGCTCAA
GGATAATTTTAACAAGAGTATCATGAGCGTTCGTCAGAAAAACAAGGCTG
AGGTGGCATCCCTAAAATCCGATATCACTGAGTTACAGAAGAACGTTTTG
GAACTGCAACGTCTTTTCGAAATGTCCAACCAAAGACGAAGGAGACGCCG
TCCAGAAGTTCCGGGAAACGTCTCGGTAAGGGGTTGGATTTGAGTTTGAA
AGGAAATTTAGATATCTAGAGTTGTTATCGTTCCGGCTGTTTTTCTCTAC
TTCAGATTTTCCGCATATCATCTACGTAGAACACCTTTGAGTGTTGCCAA
ATTCGTATTTTCATTATGCATTTTACGTTCTTTTCCTTGATAAATTCCTT
ACCTTTGTCCCTTTGTATTGCTCTGTGCACAGGTAGAATTCGAAAGCTTA
TCGGGGTTATCCCTAGAATTATTTAGGCTCTGACGTATTATTCCTACAAA
TGCTTATAAAGTGTTAAATTTATCAATAGTATCATGTCCATGTCGCGTAT
GATGGCCTCGGGATTGATAACCAATGGTCAACTGGTAGTAAATTCAGTTC
ACAGCGAAACGTGGAAGTGACGACCAAAGTCATCAACAAAGTTAAGGATA
TGGAGCTCGGTGTTGAAGATGATGTAATTCTCGGTGAGTATAAAAAGTTT
GAGTGTAAAAGTTGTCACCGGTTATCTCAATAAGGAACTAATTCTTGTTT
CACTAAatcgatttttttaaatagatacTGCACTCTTAACAAAACCTCTG
CTCGTGATACGGTTGGTTTTTTGTCTTGGCATCTGTTCTTGGTGAAAATT
ATAGAGTAGTTTTCTTTAATTATTTCTCAAATTTATGTTTTCAGAGGCAG
TTAAAACTTATTTCCAAACTCAGAAACGAAATGATCGCGAACCTCCTTCA
GCACCCATTACACGGAAGAGAACGACTAGAAGACACAATGTGAGTACAAG
TATAGTCTTAGTATGGCTTTCCAGTTTGATAAACACCAGAATGAACAGAG
GTCTATTAATCCCAATCCAGATAAGGTCATGCTATTCCAGTTATATCGTA
TGACTGACAATACAACTTACCTTAATTGTTTTCGAACACTCCTTTAGGCT
TTCATGTACCCTTTTTAATGCCGCCTTAATATCTTGTATAATTCCAGGGA
CATTTTTAGGGGTGTTTCTTACGGAAAATGTATATCAAAAGGgcaaaaag
aagtaaatttgcagattttcattgataTGCATTAGATGATCCTGATATGT
CTTCactttactttgatattttctaaTTTCTTTTAGCTTTTCAAAGCCCG
AAGTAAAGTCGTTAACAGTGCGGGCTCTCTGGATGATAAACAGCTTTGGT
CGAAAGCGAGTCCAGCATTAATGTCAGACCAGGAGACGGATGGTGAAGAT
GCTGGTGCTGGGAAGTACAGAAGATACGTTTCGCGGCGTCCGGAATGGAG
AGCAGGAAGACTCAATGATCTTGTTGAACGAATTGacaaagcaatgcaac
gacaaCGAAACTACGGCGAACTGTCAACCAGACAACCAGACCTCACTAAA
ATCTCCAACGAGGTCCTGAGCCCTGAGCACAGATACGCCGAAGAAGTAAT
AGAAAATGAAGTCAACGCTAACACTAATGGAGAGTTGGAAGGTGAAGCTT
ATGCGGAAGAACATGTAGCTGAATTTGAAGCGGAGGCTGATGGATCCAGA
ATGAGTGAATCAGATTTTGAAACGAGTGAATCTGATAGCGATGAATAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000008_pilon:627533..635980+ >XLOC_044228 ID=XLOC_044228|Name=XLOC_044228|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2202bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000008_pilon:627533..635980+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGCAAAAGAGCAAGTGTACCAGCAGAGCCAACTTCTACACCTGGAGG
AGTAATGGTTATTTAccctcaaaataaaaaaaagaaatcctcAACaccaa
aATGGGCAAAAGAGCAAGTGTACCAGCAGAGCCAACTTCTACACCTGGAG
GAGTAATGGTTATTTAccctcaaaataaaaaaaagaaatcctcAACacca
aaGCaatcaaacaataacaaaagTTTGGACAATTCAAGAATAAGTGGAAT
CAGTATGTTAGATGACAGTAGGGCAAATGGCAGCGATGTATCCCAGAGGC
aatcaaacaataacaaaagTTTGGACAATTCAAGAATAAGTGGAATCAGT
ATGTTAGATGACAGTAGGGCAAATGGCAGCGATGTATCCCAGAGAGATTT
TGACCGGCTCAAGGATAATTTTAACAAGAGTATCATGAGCGTTCGTCAGA
AAAACAAGGCTGAGGTGGCATCCCTAAAATCCGATATCACTGAGTTACAG
AAGAACGTTTTGGAACTGCAACGTCTTTTCGAAATGTCCAACCAAAGACG
AAGGAGACGCCGTCCAGAAGTTCCGGGAAACGTCTCGAGATTTTGACCGG
CTCAAGGATAATTTTAACAAGAGTATCATGAGCGTTCGTCAGAAAAACAA
GGCTGAGGTGGCATCCCTAAAATCCGATATCACTGAGTTACAGAAGAACG
TTTTGGAACTGCAACGTCTTTTCGAAATGTCCAACCAAAGACGAAGGAGA
CGCCGTCCAGAAGTTCCGGGAAACGTCTCGTATCATGTCCATGTCGCGTA
TGATGGCCTCGGGATTGATAACCAATGGTCAACTGGTAGTAAATTCAGTT
CACAGCGAAACGTGGAAGTGACGACCAAAGTCATCAACAAAGTTAAGGAT
ATGGAGCTCGGTGTTGAAGATGATGTAATTCTCGTATCATGTCCATGTCG
CGTATGATGGCCTCGGGATTGATAACCAATGGTCAACTGGTAGTAAATTC
AGTTCACAGCGAAACGTGGAAGTGACGACCAAAGTCATCAACAAAGTTAA
GGATATGGAGCTCGGTGTTGAAGATGATGTAATTCTCGAGGCAGTTAAAA
CTTATTTCCAAACTCAGAAACGAAATGATCGCGAACCTCCTTCAGCACCC
ATTACACGGAAGAGAACGACTAGAAGACACAATAGGCAGTTAAAACTTAT
TTCCAAACTCAGAAACGAAATGATCGCGAACCTCCTTCAGCACCCATTAC
ACGGAAGAGAACGACTAGAAGACACAATCTTTTCAAAGCCCGAAGTAAAG
TCGTTAACAGTGCGGGCTCTCTGGATGATAAACAGCTTTGGTCGAAAGCG
AGTCCAGCATTAATGTCAGACCAGGAGACGGATGGTGAAGATGCTGGTGC
TGGGAAGTACAGAAGATACGTTTCGCGGCGTCCGGAATGGAGAGCAGGAA
GACTCAATGATCTTGTTGAACGAATTGacaaagcaatgcaacgacaaCGA
AACTACGGCGAACTGTCAACCAGACAACCAGACCTCACTAAAATCTCCAA
CGAGGTCCTGAGCCCTGAGCACAGATACGCCGAAGAAGTAATAGAAAATG
AAGTCAACGCTAACACTAATGGAGAGTTGGAAGGTGAAGCTTATGCGGAA
GAACATGTAGCTGAATTTGAAGCGGAGGCTGATGGATCCAGAATGAGTGA
ATCAGATTTTGAAACGAGTGAATCTGATAGCGATGAATAGCTTTTCAAAG
CCCGAAGTAAAGTCGTTAACAGTGCGGGCTCTCTGGATGATAAACAGCTT
TGGTCGAAAGCGAGTCCAGCATTAATGTCAGACCAGGAGACGGATGGTGA
AGATGCTGGTGCTGGGAAGTACAGAAGATACGTTTCGCGGCGTCCGGAAT
GGAGAGCAGGAAGACTCAATGATCTTGTTGAACGAATTGacaaagcaatg
caacgacaaCGAAACTACGGCGAACTGTCAACCAGACAACCAGACCTCAC
TAAAATCTCCAACGAGGTCCTGAGCCCTGAGCACAGATACGCCGAAGAAG
TAATAGAAAATGAAGTCAACGCTAACACTAATGGAGAGTTGGAAGGTGAA
GCTTATGCGGAAGAACATGTAGCTGAATTTGAAGCGGAGGCTGATGGATC
CAGAATGAGTGAATCAGATTTTGAAACGAGTGAATCTGATAGCGATGAAT
AG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000008_pilon | genome | sc0000008_pilon:627533..635980 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 640-1101:7987 |
| Aaloc | 547-639:7547 |
| Aaloc | 391-543:7180 |
| Aaloc | 199-390:6684 |
| Aaloc | 103-195:1272 |
| Aaloc | 1-99:1 |
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