|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000089_pilon:697917..699168- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_044120 ID=XLOC_044120|Name=XLOC_044120|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=1252bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000089_pilon:697917..699168- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTTTCTTATTTTAAAGAGATCGAGAAGAGAAGTGCAAACCCATGTGG
AATGGGATGTGCTGCCGCATGTGCACCAGCCTGCCAGCCAAGCTGCTGCG
CTGCACCACCTCCACCACCACCACCACCACCTATGCCAGCCTTTGGCTGC
GCACCAATCTGTAGTCATTGGTCATCCATGATCGCTGCACAACCTGCTGC
ACCTATGCCTTGTCCATCACAATGTCAAGCTATGCCAGGGTGTTGTAACG
CTCCACCTCGACCCCCCCCTATGCCATGTGCTGCACCTCCATGCCCCACA
CCCATGCCATGTGCTGCACCTCCATGTGCCCCACCACCCATGCCATGTGC
TGCACCTCCATGTGCCCCACCACCTATGCCATGTGCTGCTCCACCATGTG
CACCACCACCTATGCCTTGCGCTGCTCCACCATGTGCCCCACCACCAATG
CCTATGCCTATGCCATGTGCTGCACCTCCATGTGCCCCACCACCCATGCC
ATGTGCCGCCCCACCATGTGCCCCACCACCTATGCCAGCTTGTCAGCCCT
CTTGTGCTCCTGCTTGTTGCATGCCACCACCTCCACCCCCTATGCCTATG
TGCCAACCCTCATGTGCACCAGCATGTTGCATGCCCCCTCCTCCACCACC
ACCAATGCCTATGTGTCAACCATCTTGTGCACCAGCTTGTTGTAGACCTG
CTCTCCCACCACCTGCTCGAGCTCCCCCACCATGCCCTGCTGGATGTCCA
AGAGCTTGCTACCCCGCTTGCCGACCAAGCTGTTGCGCACCACCTCCTCC
ACCCATGCCATGTGCAGCTCCACCATGCATGCCTCCACCAATGCCAATGG
CCATGCCATGTGCAGCCCCACCATGTGCACCACCACCTATGCCTTGTGCC
GCCCCACCATGCGCACCACCACCTATGCCATGCGCTGCTCCACCATGTGC
ACCACCACCTATGCCATGTGCTGCCCCTCCATGTGCACCACCACCTATGC
CATGTGCTGCCCCACCATGCGCACCACACCTTTCCCTCCCCACCATGCGC
ACCACCACCTATGCCATGTGCCGCCCCACCATGTGCTCCACCAGCCCCAG
CCCCTTGCGCTGCACCACCATGCCAACACGTCAACCTTCCACCAACAGTC
ATCAACCTTCCAGCTCCACCACCTCCACCAATGCCATGTGGTCCAACTTG
TGCTCCAACTTGCGCACCTGCTTGCTCTAAAGCTTGTTGTAGCAAAAAAT
AA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000089_pilon:697917..699168- >XLOC_044120 ID=XLOC_044120|Name=XLOC_044120|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2304bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000089_pilon:697917..699168- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTTTCTTATTTTAAAGAGATCGAGAAGAGAAGTGCAAACCCATGTGG
AATGGGATGTGCTGCCGCATGTGCACCAGCCTGCCAGCCAAGCTGCTGCG
CTGCACCACCTCCACCACCACCACCACCACCTATGCCAGCCTTTGGCTGC
GCACCAATCTGTAGTCATTGGTCATCCATGATCGCTGCACAACCTGCTGC
ACCTATGCCTTGTCCATCACAATGTCAAGCTATGCCAGGGTGTTGTAACG
CTCCACCTCGACCCCCCCCTATGCCATATGTTTTCTTATTTTAAAGAGAT
CGAGAAGAGAAGTGCAAACCCATGTGGAATGGGATGTGCTGCCGCATGTG
CACCAGCCTGCCAGCCAAGCTGCTGCGCTGCACCACCTCCACCACCACCA
CCACCACCTATGCCAGCCTTTGGCTGCGCACCAATCTGTAGTCATTGGTC
ATCCATGATCGCTGCACAACCTGCTGCACCTATGCCTTGTCCATCACAAT
GTCAAGCTATGCCAGGGTGTTGTAACGCTCCACCTCGACCCCCCCCTATG
CCATGTGCTGCACCTCCATGTGCCCCACCACCCATGCCATGTGCTGCACC
TCCATGTGCCCCACCACCTATGCCATGTGCTGCTCCACCATGTGCACCAC
CACCTATGCCTTGCGCTGCTCCACCATGTGCCCCACCACCAATGCCTATG
CCTATGCCATGTGCTGCACCTCCATGTGCTGCACCTCCATGTGCCCCACC
ACCCATGCCATGTGCTGCACCTCCATGTGCCCCACCACCTATGCCATGTG
CTGCTCCACCATGTGCACCACCACCTATGCCTTGCGCTGCTCCACCATGT
GCCCCACCACCAATGCCTATGCCTATGCCATGTGCTGCACCTCCATGTGC
CCCACCACCTATGCCAGCTTGTCAGCCCTCTTGTGCTCCTGCTTGTTGCA
TGCCACCACCTCCACCCCCTATGCCTATGTGCCAACCCTCATGTGCACCA
GCATGTTGCATGCCCCCTCCTCCACCACCACCAATGCCTATGTGTCAACC
ATCTTGTGCACCAGCTTGTTGTAGACCTGCTCTCCCACCACCTGCTCGAG
CTCCCCCACCATGCCCTGCTGGATGTCCAAGAGCTTGCTACCCCGCTTGC
CGACCAAGCTGTTGCGCACCACCTCCTCCACCCATGCCATGTGCAGCTCC
ACCATGCATGCCTCCACCAATGCCAATGGCCATGCCATGTGCAGCCCCAC
CATGTGCACCACCACCTATGCCTTGTGCCGCCCCACCATGCGCACCACCA
CCTATGCCATGCGCTGCTCCACCATGTGCACCACCACCTATGCCATGTGC
TGCCCCTCCATGTGCACCACCACCTATGCCATGTGCTGCCCCACCGTGCC
CCACCACCTATGCCAGCTTGTCAGCCCTCTTGTGCTCCTGCTTGTTGCAT
GCCACCACCTCCACCCCCTATGCCTATGTGCCAACCCTCATGTGCACCAG
CATGTTGCATGCCCCCTCCTCCACCACCACCAATGCCTATGTGTCAACCA
TCTTGTGCACCAGCTTGTTGTAGACCTGCTCTCCCACCACCTGCTCGAGC
TCCCCCACCATGCCCTGCTGGATGTCCAAGAGCTTGCTACCCCGCTTGCC
GACCAAGCTGTTGCGCACCACCTCCTCCACCCATGCCATGTGCAGCTCCA
CCATGCATGCCTCCACCAATGCCAATGGCCATGCCATGTGCAGCCCCACC
ATGTGCACCACCACCTATGCCTTGTGCCGCCCCACCATGCGCACCACCAC
CTATGCCATGCGCTGCTCCACCATGTGCACCACCACCTATGCCATGTGCT
GCCCCTCCATGTGCACCACCACCTATGCCATGTGCTGCCCCACCCGCACC
ACCACCTATGCCATGTGCCGCCCCACCATGTGCTCCACCAGCCCCAGCCC
CTTGCGCTGCACCACCATGCCAACACGTCAACCTTCCACCAACAGTCATC
AACCTTCCAGCTCCACCACCTCCACCAATGCCATGTGGTCCAACTTGTGC
TCCAACTTGCGCACCTGCTTGCTCTAAAGCTTGTTGTAGCAAAAAATAAC
GCACCACCACCTATGCCATGTGCCGCCCCACCATGTGCTCCACCAGCCCC
AGCCCCTTGCGCTGCACCACCATGCCAACACGTCAACCTTCCACCAACAG
TCATCAACCTTCCAGCTCCACCACCTCCACCAATGCCATGTGGTCCAACT
TGTGCTCCAACTTGCGCACCTGCTTGCTCTAAAGCTTGTTGTAGCAAAAA
ATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000089_pilon | genome | sc0000089_pilon:697917..699168 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 961-1155:196 |
| Aaloc | 949-957:205 |
| Aaloc | 451-945:734 |
| Aaloc | 280-447:941 |
| Aaloc | 1-276:1253 |
|
