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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000101_pilon:83657..86443- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_044103 ID=XLOC_044103|Name=XLOC_044103|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2787bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000101_pilon:83657..86443- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TCGTTGAGACAAGATGAGTCATTATGTGACGTTACATTGATTGTTGGTAG
CACGTCTATCAAAGCTCATAAAATTGTGCTTGCAGCAGCTACACCTTATT
TCAATGCTATGTTTACTAATCAGATGCTAGAGAGCTCTTTACAAGAAGTG
ACTATCCAAGAACTCGATGCTCAATGTATTGTTGAACTTGTCAATTTTAT
TTACGGTGAAAACCTTATTGTGAGGACTGAGAATGTACAAAATTTATTGT
CGGCTGCTTCGCTGTTACAAATAACATGTGTTAAAGATGCCTGTGTAAGC
TTCCTAATGAAGAAATTACATCCAGAGAATTGTTTAACTGTCCGCCATTT
AGCAGATATGTATTCGGCTGCTGAACTTCTACAAGCTGCTAATTCTTTTC
TTGACAAAAATTTTGTGGATGTTTCACAATGTAATGAATTTTTGCAGTTG
CAGTTTGATGATTTGGCTGAACTGATCAAGAAAGATGATTTGAATATTCG
GTCTGAGGAGCAAATTTTCGAAGCTGTGCTTTCTTGGGTGAAAACAGATT
GTGAAGGACGGAAAGGACATTTACCAGAACTGTTAAAATACGTCCGATTA
CCACTGTTGTCACCTCAATATTTAAGTGATCGAGTGTTGTCTGAAGAGAT
CATTCGTAGCAATATTGTGTGTAGAGATCTAATCGATGAAGCAAAAGACT
TCATGTTAATGCCTGAACGCAGAAAACATTTAAAAAGTGAACGCACTTTA
CCTAGACGTTGTAGCGAGGCGGCTGGTTTGATTTATATTGTTGGTGGTTT
AACGTCTTCTGGCGAATCGTTATCCACTGTCGAAAAGTATGATACAATCT
TAGGGAAATGGACACCAGTTTTACCGATGGCTATACAAAGGAGTAGAGTG
GGTGTGGCAATCTTGGATGGGAAATTGTATGCTATTGGCGGTTTCGATGG
TAACGTACGGTTGAATGATGTGGAAAGATATGACCCCAATACAAACAGGT
ATGTTAGTTGTCAATGAAATTGACATACATATTTTAATAATTCTTTTTGC
TTCTATTTGAAAAGGGTTAACAGCCTACTGTTTGGTAAGAAGTTTCCCTT
GTGGTAGTGAAGGAAAAGTGAATATCTTACCTAGTATGTTACTCTTTGAA
GTTTTCAAAAGATTGAAAATAAAAAGAAACTTCTATTTCTGAACCACAAT
ATTTTCGGGCAATACCTCATATTATATATAGTTCTTGCTTTTGCACATAT
CAACTGTCCAAGATCTAGACCAAGTCTAGGGTCATTGACTTCCCTTCAAC
TAAGAATTATACTTGTATTCATGATATGCACCATTGCAATGTCTTCTGAC
ATTACATCACGAACCCAACAGCTGATTGGTTGTGAGTGATGTAAAATCAG
TCAATACGTCACTTGCAACCAATCAGCTGTTGGGTCCGTGGAAGACATTG
CAATGGTGCATATCATGAATTATAACATGATCTTTTTTTCTTTTGTCAGT
TGGAAGAAAGTATGTCCAATGAACATCCGTCGAAGTGCAGTAGGAGCTGC
AGTGTTGGCGAATAAGATCTATGTTGTGGGTGGATATGATGGTAATTCGT
CATTGAACAGTGTGGAATGTTATGATTCTGAAATGAACCAATGGAAATTC
GTTGCGTCCATGTCAACGTTGAGAAGTGCAGCTGGTGTCACCTCGCTCAA
TGGTATGTGCTCTTTTCCTTTAGTTTTCTTTGTTTTATTGATGTCGGTCT
AGATCTTTGACTGTGGAATCTTGATTTCCATGGCACTTTATGTAAAAATA
CTACTGTTTAGATTTGTGTTAAGATGAAGATTTCACCATTTTGCATCACT
TCAGCTAGAATTCAAAAAAGTCGCTGTAATTTTCTTTTTGGATATTGATT
TTTGGTTAGGTGAGGCTAATCTAATTTGTTGTTTTACGGGCCAAGCTATC
CAAAAAAGAATGTCCGTCGGTCGGCGAAAAAATAAAAATAAAAGTATAAA
ATCTCCCAAACAAAAACTACTTCCTCTTGACAAAAATGCGAAGTAAAAAA
TAAAAAGACAATAAAAATGTCGAATTCATGGATAAATTGAAAAATTGAAC
ATAAAATTGGAAAAGCTACCAAAAGTTTGAAAATTTGGCAGTCTGTAAGG
CAATGAAAATAAAAATGTACTACCAAAATCAATTACATTTTTATTTCGGT
TTTGAATATCAGGTTCGGTCAGGCCCGTAAAACAACTAACCAAATTTTGG
TCTCGCCTTACGGAATTTTCATGAAAAAGACGCAACTGTGAGTAGGTATT
TAATATACTTTTTGTGATTCATCTATGGTATTCTTTATTTTTCAATTTCT
CAGGTAAACTGTACAGTGCTGGTGGCCACGATGGTTTGACCATATTTTCT
TCAGTTGAAGCTTACGATAGCACGCTCCGTCAATGGCGTCTTGTCGCTCC
TATGTCCGTCAGAAGATGTCGTCTCGGACTTACCGTTCTTAACAGCCGTA
TTTACGCGACGGGGGGTTACGATGGATCCTCGTTTCTAAGCTCAGTCGAA
TATTACGATATTTGTAACGACCAATGGATTTACGTTGCACCGATGACGAA
ACGTCGTAGCCGAGTATCCTCGGTCACTCTCGGTGGCAAAATTTTCGCTG
TCGGAGGATATGACGGAGCAACAAACTTGAGCACTATAGAGACTTATGAT
CCGTGGGCGAATGAATGGACTTCGGAGACAGAGATGGGTATGCATGACGG
TGGTGTGGGCGTGGGCGTTTTACCACGTTTAACTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000101_pilon:83657..86443- >XLOC_044103 ID=XLOC_044103|Name=XLOC_044103|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3270bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000101_pilon:83657..86443- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TCGTTGAGACAAGATGAGTCATTATGTGACGTTACATTGATTGTTGGTAG
CACGTCTATCAAAGCTCATAAAATTGTGCTTGCAGCAGCTACACCTTATT
TCAATGCTATGTTTACTAATCAGATGCTAGAGAGCTCTTTACAAGAAGTG
ACTATCCAAGAACTCGATGCTCAATGTATTGTTGAACTTGTCAATTTTAT
TTACGGTGAAAACCTTATTGTGAGGACTGAGAATGTACAAAATTTATTGT
CGGCTGCTTCGCTGTTACAAATAACATGTGTTAAAGATGCCTGTGTAAGC
TTCCTAATGAAGAAATTACATCCAGAGAATTGTTTAACTGTCCGCCATTT
AGCAGATATGTATTCGGCTGCTGAACTTCTACAAGCTGCTAATTCTTTTC
TTGACAAAAATTTTGTGGATGTTTCACAATGTAATGAATTTTTGCAGTTG
CAGTTTGATGATTTGGCTGAACTGATCAAGAAAGATGATTTGAATATTCG
GTCTGAGGAGCAAATTTTCGAAGCTGTGCTTTCTTGGGTGAAAACAGATT
GTGAAGGACGGAAAGGACATTTACCAGAACTGTTAAAATACGTCCGATTA
CCACTGTTGTCACCTCAATATTTAAGTGATCGAGTGTTGTCTGAAGAGAT
CATTCGTAGCAATATTGTGTGTAGAGATCTAATCGATGAAGCAAAAGACT
TCATGTTAATGCCTGAACGCAGAAAACATTTAAAAAGTGAACGCACTTTA
CCTAGACGTTGTAGCGAGGCGGCTGGTTTGATTTATATTGTTGGTGGTTT
AACGTCTTCTGGCGAATCGTTATCCACTGTCGAAAAGTATGATACAATCT
TAGGGAAATGGACACCAGTTTTACCGATGGCTATACAAAGGAGTAGAGTG
GGTGTGGCAATCTTGGATGGGAAATTGTATGCTATTGGCGGTTTCGATGG
TAACGTACGGTTGAATGATGTGGAAAGATATGACCCCAATACAAACAGTC
GTTGAGACAAGATGAGTCATTATGTGACGTTACATTGATTGTTGGTAGCA
CGTCTATCAAAGCTCATAAAATTGTGCTTGCAGCAGCTACACCTTATTTC
AATGCTATGTTTACTAATCAGATGCTAGAGAGCTCTTTACAAGAAGTGAC
TATCCAAGAACTCGATGCTCAATGTATTGTTGAACTTGTCAATTTTATTT
ACGGTGAAAACCTTATTGTGAGGACTGAGAATGTACAAAATTTATTGTCG
GCTGCTTCGCTGTTACAAATAACATGTGTTAAAGATGCCTGTGTAAGCTT
CCTAATGAAGAAATTACATCCAGAGAATTGTTTAACTGTCCGCCATTTAG
CAGATATGTATTCGGCTGCTGAACTTCTACAAGCTGCTAATTCTTTTCTT
GACAAAAATTTTGTGGATGTTTCACAATGTAATGAATTTTTGCAGTTGCA
GTTTGATGATTTGGCTGAACTGATCAAGAAAGATGATTTGAATATTCGGT
CTGAGGAGCAAATTTTCGAAGCTGTGCTTTCTTGGGTGAAAACAGATTGT
GAAGGACGGAAAGGACATTTACCAGAACTGTTAAAATACGTCCGATTACC
ACTGTTGTCACCTCAATATTTAAGTGATCGAGTGTTGTCTGAAGAGATCA
TTCGTAGCAATATTGTGTGTAGAGATCTAATCGATGAAGCAAAAGACTTC
ATGTTAATGCCTGAACGCAGAAAACATTTAAAAAGTGAACGCACTTTACC
TAGACGTTGTAGCGAGGCGGCTGGTTTGATTTATATTGTTGGTGGTTTAA
CGTCTTCTGGCGAATCGTTATCCACTGTCGAAAAGTATGATACAATCTTA
GGGAAATGGACACCAGTTTTACCGATGGCTATACAAAGGAGTAGAGTGGG
TGTGGCAATCTTGGATGGGAAATTGTATGCTATTGGCGGTTTCGATGGTA
ACGTACGGTTGAATGATGTGGAAAGATATGACCCCAATACAAACAGTTGG
AAGAAAGTATGTCCAATGAACATCCGTCGAAGTGCAGTAGGAGCTGCAGT
GTTGGCGAATAAGATCTATGTTGTGGGTGGATATGATGGTAATTCGTCAT
TGAACAGTGTGGAATGTTATGATTCTGAAATGAACCAATGGAAATTCGTT
GCGTCCATGTCAACGTTGAGAAGTGCAGCTGGTGTCACCTCGCTCAATGT
TGGAAGAAAGTATGTCCAATGAACATCCGTCGAAGTGCAGTAGGAGCTGC
AGTGTTGGCGAATAAGATCTATGTTGTGGGTGGATATGATGGTAATTCGT
CATTGAACAGTGTGGAATGTTATGATTCTGAAATGAACCAATGGAAATTC
GTTGCGTCCATGTCAACGTTGAGAAGTGCAGCTGGTGTCACCTCGCTCAA
TGGTAAACTGTACAGTGCTGGTGGCCACGATGGTTTGACCATATTTTCTT
CAGTTGAAGCTTACGATAGCACGCTCCGTCAATGGCGTCTTGTCGCTCCT
ATGTCCGTCAGAAGATGTCGTCTCGGACTTACCGTTCTTAACAGCCGTAT
TTACGCGACGGGGGGTTACGATGGATCCTCGTTTCTAAGCTCAGTCGAAT
ATTACGATATTTGTAACGACCAATGGATTTACGTTGCACCGATGACGAAA
CGTCGTAGCCGAGTATCCTCGGTCACTCTCGGTGGCAAAATTTTCGCTGT
CGGAGGATATGACGGAGCAACAAACTTGAGCACTATAGAGACTTATGATC
CGTGGGCGAATGAATGGACTTCGGAGACAGAGATGGGTATGCATGACGGT
GGTGTGGGCGTGGGCGTTTTACCACGTTTAACTTGAGTAAACTGTACAGT
GCTGGTGGCCACGATGGTTTGACCATATTTTCTTCAGTTGAAGCTTACGA
TAGCACGCTCCGTCAATGGCGTCTTGTCGCTCCTATGTCCGTCAGAAGAT
GTCGTCTCGGACTTACCGTTCTTAACAGCCGTATTTACGCGACGGGGGGT
TACGATGGATCCTCGTTTCTAAGCTCAGTCGAATATTACGATATTTGTAA
CGACCAATGGATTTACGTTGCACCGATGACGAAACGTCGTAGCCGAGTAT
CCTCGGTCACTCTCGGTGGCAAAATTTTCGCTGTCGGAGGATATGACGGA
GCAACAAACTTGAGCACTATAGAGACTTATGATCCGTGGGCGAATGAATG
GACTTCGGAGACAGAGATGGGTATGCATGACGGTGGTGTGGGCGTGGGCG
TTTTACCACGTTTAACTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000101_pilon | genome | sc0000101_pilon:83657..86443 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1501-1932:433 |
| Aaloc | 1297-1497:1288 |
| Aaloc | 298-1293:2788 |
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