XLOC_044069 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_044069
Unique NameXLOC_044069
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000089_pilon:622999..638871-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_044069 ID=XLOC_044069|Name=XLOC_044069|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=15873bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000089_pilon:622999..638871- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AATGAACTACCAGTTTAACGCTAACGTGGAAACTTCGAAAAGTATAATAT AAAAAGGGAAACTTTCACCAGGAAAGCTTATGAAAACTCGTTAAAAGTTT AAAAATTTTATTTACCCATATGACGATATGCATAAATCGATTCAATCCTT TTCTTTATGATTCTGTCATTAAATGTGATAATACGCTATAAATGAATCCG TGAAATTATTTTTCTCAGTATTTGAAATCGTTTAAATAAAATGCTTTTTA AATTCACATGGCAATCGACCATGTTTTCAAAAAGGGAATTAACCATTTAG CTCATAAACATTTGACACATGAAGTGTGGGTTTTTTAATTGAAATGTTCC GTTTTTTATGTTAAAGCTTTTTTTCACATGTACGTAAAATCTTACTAAAG ACGTTACAGAAAATCGTTTGTAAGTAAGGCTGTCTTTTGGGAACTTCCCC GACTTTACGTAGAGTCTTTATTGATTCAGAGGGTCTTACGTGACTTTTCT TTTGTTCAAAACTTTTTGAACATAAAATTTTACGTGGATGTGAACTTAAA ATATTTTTAATTCATTGATTTTTTCATTCCCTCTGAATTTCACTTTTTCA TATTCTCAAAATCATTCATCAAAAACCTCACTCTTCTTCTATTTCATAGA AAAAAGGAAAATCGACAGAATCGACCGGTTACGGTGAACTACTGCTAGTG AGTGCAATGATTTCTTCTGCTTTTCGAGGCTTGTCCTTTTATCATCTATT TAGAAACATTCAGGAAATTCATTGTCAACAAGAAGTTTTAAGCCCAACAT GATCAAGTTTGAGATTTTCTCTTTAGAGAGAACCATTTCTGATACAATAG GATACAGTTGCCTCTCTCTCTCATCCGATCTTCAAGGGGCTATAACTTTT ATTCGCATTAGTTCGAATTATAGAGAGTATTTTTTATCGGTGATTTTTCA 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TCCCATCGATATGTAAACATTCGGCTGTCTGTGATGATTAAAAAAACATA TTTCGACTGATTGATGTTTTATCAATGATTTTACTATTTAGGGTCTTCAA ATTTTTTGGAAATTATATGTTCATTCTTTTCACCGTTATCAAGGGTTTCT TCCTCTTTTTCAATTTCAGTGGTATTGTTGACAGGAGAGATTTTTAGTTT CATTGCATTCATCGGAAGGTATCCTTTCGTTTTGTGGAATATGATGCTCT TCTCTTTGACCAGCGCTCTTGGACAGGTTCGTTGGATTGTGTTTTCCCCT TGCTTATTTACAAGATACCTTTTTGAAAAACCTCTCACTAACTTAACTTA TATCTTTCCCTTATTGCTATTAGGGTATCAAAGTGATCATCCTGTTTTTA CCATTTTCTATTTAAAAACCTTTAATGAAGGTTTTTCAAGATATCTTTAA AGTGAATTTTCTATTTTTCTTTCATTTTTAGAATTTCATTTTTTCAACGG TGGCAAGTTTCGGACCACTGACGTGCTCTGTTGTCACGACAACGAGAAAA TTCTTCACGATTTTGTTTTCAATTCTCTTCTTCGGCAATCCAATCACGTC CCGACAATCGTTCGCTGTCGTTCTCGTTTTTATTGGTTTGGGATTGGACG CTAAATTCGGGAAAATTCGTTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000089_pilon:622999..638871-

>XLOC_044069 ID=XLOC_044069|Name=XLOC_044069|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2028bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000089_pilon:622999..638871- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTGATAAAAACTGAAGTTATTTTAGATATCAAACCTTCTTCTGATCG
TAGAGATAAGCAGCAGTTCTCACTGTCGAATATATTTGATTACAAGATGA
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TTCTACTATGGTATTTTACAAGAAAAAATATGGTGATAAAAACTGAAGTT
ATTTTAGATATCAAACCTTCTTCTGATCGTAGAGATAAGCAGCAGTTCTC
ACTGTCGAATATATTTGATTACAAGATGAGTGAAACGCAAAAATTGATAG
GCTGCTGTGTGGGAATTTTTGTATGCTATTTCTACTATGGTATTTTACAA
GAAAAAATTACGAGGACGACATATGGTGATGAACAAGAAAAATTTACATA
TCAGCAAACATTGGTTTGGCTTCAATGCGTTGTCAATGCTGCATTTGCCT
TTCTCATACGAGGACGACATATGGTGATGAACAAGAAAAATTTACATATC
AGCAAACATTGGTTTGGCTTCAATGCGTTGTCAATGCTGCATTTGCCTTT
CTCATGCTGAAGAGAACGAGTTCTTCTTTGGATAACACACCAGCGTTGAT
GTATATTTGGTGCTCAATCTCTTATATGGGAGCCATGCTGGCAAGTAATA
TGGCCTTGAGATACGTCAATTACCCAACACAGTGCTGAAGAGAACGAGTT
CTTCTTTGGATAACACACCAGCGTTGATGTATATTTGGTGCTCAATCTCT
TATATGGGAGCCATGCTGGCAAGTAATATGGCCTTGAGATACGTCAATTA
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GTGTTGCGTTATTCTTCTATAAAGATTGATGATTCTCGGTGTATTGTTAG
CACGAAAACGTTATCCGTTGATGAAATATATTTGTGTTTTGTTTATCGTA
CTTGGTGTTGCGTTATTCTTCTATAAAGATAAAAAAGGAAAATCGACAGA
ATCGACCGGTTACGGTGAACTACTGCTAAAAAAAGGAAAATCGACAGAAT
CGACCGGTTACGGTGAACTACTGCTATTGCTTTCTCTTACGTTGGACGGG
ATGACGGGAGCTAGTCAGGATCGGATGCGTGGTTCATATAAAACGCAAGC
ACACGCTATGATGTACAACGTCAACAAATATTCTATTCTCATACTTGGCG
TCATTGCTTTCTCTTACGTTGGACGGGATGACGGGAGCTAGTCAGGATCG
GATGCGTGGTTCATATAAAACGCAAGCACACGCTATGATGTACAACGTCA
ACAAATATTCTATTCTCATACTTGGCGTCATGGTATTGTTGACAGGAGAG
ATTTTTAGTTTCATTGCATTCATCGGAAGGTATCCTTTCGTTTTGTGGAA
TATGATGCTCTTCTCTTTGACCAGCGCTCTTGGACAGTGGTATTGTTGAC
AGGAGAGATTTTTAGTTTCATTGCATTCATCGGAAGGTATCCTTTCGTTT
TGTGGAATATGATGCTCTTCTCTTTGACCAGCGCTCTTGGACAGAATTTC
ATTTTTTCAACGGTGGCAAGTTTCGGACCACTGACGTGCTCTGTTGTCAC
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ATCCAATCACGTCCCGACAATCGTTCGCTGTCGTTCTCGTTTTTATTGGT
TTGGGATTGGACGCTAAATTCGGGAAAATTCGTTGAAATTTCATTTTTTC
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GAAAATTCTTCACGATTTTGTTTTCAATTCTCTTCTTCGGCAATCCAATC
ACGTCCCGACAATCGTTCGCTGTCGTTCTCGTTTTTATTGGTTTGGGATT
GGACGCTAAATTCGGGAAAATTCGTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_044069XLOC_044069-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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