|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000101_pilon:228978..231873+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_044057 ID=XLOC_044057|Name=XLOC_044057|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2896bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000101_pilon:228978..231873+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GACGATTTCGGTGTTCGCTTTGGTACGGCTATTATTAAATTCATGGATAG
CATATATCTTCTCAACCCTGTGCGTGCAGAAATGAGAGAATGTACGAAAA
AAGTCCTCGGCTTGAtcgaaaacattcaaaaagaaatGGATTTGTCGTAT
GTTTTGCTATATAATGGCAGCCAAGCTGATGGCTTGTGGAATCGATCAGA
TATCGACGTCATGTATTGCTACAATGATTTCATAGTTGTTGAAAAGGCCT
CACAAATACCTGACAATTATGAGGGTGGTGTATTATTGATTGATTATAAA
CCATGTCACCCTGGTTTCACTCGTCTCCGCCTGTACCGCCCAAACCCAGA
TTTACGCTGTTTTCATCTATTTACAGAACTAGAAGGAGAATATTACCTAA
ACAAGgacaaatatttagtatatacTTCTAAAACGTATCCGGAAGATACA
GAATTACACGGTCCATCTTTTAATGCTAAGCCCGATATCATAACCGGTAG
ACGCGATTTGGATCATGTGACATGTCTCAAATGTATTTTTTGGCCATCTT
GGTTTCGTGATTTTTCACaagtcaaaaacaaaatggcggatcCCGAACGC
GTGTTTGATCATTTCCACGTGGTTTGTTTGGCACATAGAGATAGCCTAAA
GCCAGAGCTGGAATTTCGTCTCTCTTTTTCTGTGGCTGAGAAACAAATGG
CTCAAAATTGGACAATACCTcagatgaaatttttcttgttttgcaAGAAG
GTTATCAAAGAGTTTATTAATATAGATGGTTTGAGCGAAGAAATTGAACC
GTCTCTATTGAGGGAGGATCTTTTAGGCTCCAAATCTCTTTGCTCGTACC
ACATCAAGACAAGTTGTTACTTCTTCTTCGAATTATTCGGTGCAGAAATG
TTTGAAAGTGAGGATTACTACTCGACCTTTCGAAACCTGTTTCTTGCTTA
TTTACGAGATGATTTAAGGAGGAGATCGCTACAACATTACTTTGTGCTTC
CCCATAACATCTTTGAAGGGTTGAGCgagaaagattttaaaatctATTTA
GCAATGCTTACTAATAATTTTGACCCTCTACCAAGTACTGATGAACACTT
TCAAAAGAATGTACTTACACTTAACGAGCAATTGTCTAATGTTGTCGAAA
CGAGGCTGATTACTACTTTACATATCGGCTTCGAGGTTAGCCGGTTACTT
ACCATCTCATCATATTTATTTGCCGAGCATGAGAAGTTCAcaagtcaaaa
ttttgatgaaatcgcTCAAAAATTGATAGTAAATGAATGTTTTGCATCAA
AGTGCTTGACAAGTATTGATCATTTAATTAGTGAAATGAAAACGAGATGT
TTGGCTGTTTTCCATTTGTACGAAGGGCTCTCAAAACCAGGTTTGTTCAT
TGTCTTTCTTTAGAGATATTACAAAAAGTTGTTATAAAATCCTAGCCCTA
ATAAATgagttttggtcaaaatatgacCCTCAGAGAAGCTAAATTGCTAA
AGGAACAAAAGTGtttccgattttcgaaaatcttgttcaaatagttttaa
ctttttatctCTATTTTTGATTCTAGAAAAAACCgaacctttagagagac
tgCTTTGGTTCTTTGTTGTTTcagcaaactttaaagagaggCTATATAAC
TCAGAGGGACTATGGTGGGTGaaaaaaaGCTAACGAAAAGGGGCAGCGCA
GTACTTCATACTCacttttttcctgattttctgtCTATTTAGAGGATGAT
GAGCAACGTCGCATTCTACTTGCTAAAGCTGAAAAGGAATTCAAAGCAAC
AGTCTCGCTACAACATCATCCCAGACCTGACTATGGAGTGATCGGGTTTG
CTTATTTAGCCCTCTACTATTATCTAACAAACCAGCACGATAAATGTAAG
CAATGCTGCTGTTTATGTTGCATTCAATATATGGTTCAACCGGAAGCTTT
CTACCAAATACAACACGCAGCTGTTATTTTACCCTCACAGAAAAATTCTG
GTCTTTGGCCTAACGCAGGCCCTTCATTTCTCCAGAGTACGCCATTGAAA
TTATTATTCGGCCTTCATGGAAACACTGTGGAACCTCTACAGCTTGACCC
CGTTGTTCTCTCAAAATGTCTTTATCGGTTCCTTTCTCGTGGTGATCCTG
ACGAGTTTCTTTTGGAAACAACACCGACCtatgaaaattctaaaaaagca
ACTCGCCTTGAGGATATTGCAAATTATTTATCACCCAATAATCGATTTGC
CTCTCTGCTTTTGTTGAGAATCACTAACTCGGTCATTGGGCCAAACCAAA
ACTCCCTGTTAGAGAATCTCTTCGATGAAGTCCGTCAACACCAAGATGGG
GATGTGTTTGAATCCCTAATGCGCATGTTTCAAGACAAAGAAAATCACTC
ACTCATACAAGCATTCCTTTTCTCACACGTTGGAGATGTTGATAGTGAAG
ATGTCGATGGTGGAGATGTTGATGGTGGAGATGTTGATGGTGAAGATGTC
GATGGTGGAGATGAGGTACAAGAAGTACTCTATAAATTCCTTTTATTTCG
GATGTCCCAAAATCCAATTAAAAGTATTTcagaatttatgaaattaaaCA
GTATGCATCAGATTGTGGGAAAACCAATGTGTACTGGCAAGTATAACGAC
TTTGTGGATTCTCTGATAATTAAAGGTTCTTTGAAATCTCCTTCCACCTA
CAATGCAGTTGATGAAGATGACAATaatgatttgattggtttaatGGAAG
ACCTGGAGCAGAATGTGAAGGGTGGATCGGGTTCATCGATTGTTGAATTG
ATTATGGTTGATGAAATTAACGATTTGGAAGCTTTCAGGTCGACTCTGaa
aaaaaTCGAAGAAGCTGACATGTGGAAATCATTCTCAAATAAATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000101_pilon:228978..231873+ >XLOC_044057 ID=XLOC_044057|Name=XLOC_044057|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5088bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000101_pilon:228978..231873+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GACGATTTCGGTGTTCGCTTTGGTACGGCTATTATTAAATTCATGGATAG
CATATATCTTCTCAACCCTGTGCGTGCAGAAATGAGAGAATGTACGAAAA
AAGTCCTCGGCTTGAtcgaaaacattcaaaaagaaatGGATTTGTCGTAT
GTTTTGCTATATAATGGCAGCCAAGCTGATGGCTTGTGGAATCGATCAGA
TATCGACGTCATGTATTGCTACAATGATTTCATAGTTGTTGAAAAGGCCT
CACAAATACCTGACAATTATGAGGGTGGTGTATTATTGATTGATTATAAA
CCATGTCACCCTGGTTTCACTCGTCTCCGCCTGTACCGCCCAAACCCAGA
TTTACGCTGTTTTCATCTATTTACAGAACTAGAAGGAGAATATTACCTAA
ACAAGgacaaatatttagtatatacTTCTAAAACGTATCCGGAAGATACA
GAATTACACGGTCCATCTTTTAATGCTAAGCCCGATATCATAACCGGTAG
ACGCGATTTGGATCATGTGACATGTCTCAAATGTATTTTTTGGCCATCTT
GGTTTCGTGATTTTTCACaagtcaaaaacaaaatggcggatcCCGAACGC
GTGTTTGATCATTTCCACGTGGTTTGTTTGGCACATAGAGATAGCCTAAA
GCCAGAGCTGGAATTTCGTCTCTCTTTTTCTGTGGCTGAGAAACAAATGG
CTCAAAATTGGACAATACCTcagatgaaatttttcttgttttgcaAGAAG
GTTATCAAAGAGTTTATTAATATAGATGGTTTGAGCGAAGAAATTGAACC
GTCTCTATTGAGGGAGGATCTTTTAGGCTCCAAATCTCTTTGCTCGTACC
ACATCAAGACAAGTTGTTACTTCTTCTTCGAATTATTCGGTGCAGAAATG
TTTGAAAGTGAGGATTACTACTCGACCTTTCGAAACCTGTTTCTTGCTTA
TTTACGAGATGATTTAAGGAGGAGATCGCTACAACATTACTTTGTGCTTC
CCCATAACATCTTTGAAGGGTTGAGCgagaaagattttaaaatctATTTA
GCAATGCTTACTAATAATTTTGACCCTCTACCAAGTACTGATGAACACTT
TCAAAAGAATGTACTTACACTTAACGAGCAATTGTCTAATGTTGTCGAAA
CGAGGCTGATTACTACTTTACATATCGGCTTCGAGGTTAGCCGGTTACTT
ACCATCTCATCATATTTATTTGCCGAGCATGAGAAGTTCAcaagtcaaaa
ttttgatgaaatcgcTCAAAAATTGATAGTAAATGAATGTTTTGCATCAA
AGTGCTTGACAAGTATTGATCATTTAATTAGTGAAATGAAAACGAGATGT
TTGGCTGTTTTCCATTTGTACGAAGGGCTCTCAAAACCAGGACGATTTCG
GTGTTCGCTTTGGTACGGCTATTATTAAATTCATGGATAGCATATATCTT
CTCAACCCTGTGCGTGCAGAAATGAGAGAATGTACGAAAAAAGTCCTCGG
CTTGAtcgaaaacattcaaaaagaaatGGATTTGTCGTATGTTTTGCTAT
ATAATGGCAGCCAAGCTGATGGCTTGTGGAATCGATCAGATATCGACGTC
ATGTATTGCTACAATGATTTCATAGTTGTTGAAAAGGCCTCACAAATACC
TGACAATTATGAGGGTGGTGTATTATTGATTGATTATAAACCATGTCACC
CTGGTTTCACTCGTCTCCGCCTGTACCGCCCAAACCCAGATTTACGCTGT
TTTCATCTATTTACAGAACTAGAAGGAGAATATTACCTAAACAAGgacaa
atatttagtatatacTTCTAAAACGTATCCGGAAGATACAGAATTACACG
GTCCATCTTTTAATGCTAAGCCCGATATCATAACCGGTAGACGCGATTTG
GATCATGTGACATGTCTCAAATGTATTTTTTGGCCATCTTGGTTTCGTGA
TTTTTCACaagtcaaaaacaaaatggcggatcCCGAACGCGTGTTTGATC
ATTTCCACGTGGTTTGTTTGGCACATAGAGATAGCCTAAAGCCAGAGCTG
GAATTTCGTCTCTCTTTTTCTGTGGCTGAGAAACAAATGGCTCAAAATTG
GACAATACCTcagatgaaatttttcttgttttgcaAGAAGGTTATCAAAG
AGTTTATTAATATAGATGGTTTGAGCGAAGAAATTGAACCGTCTCTATTG
AGGGAGGATCTTTTAGGCTCCAAATCTCTTTGCTCGTACCACATCAAGAC
AAGTTGTTACTTCTTCTTCGAATTATTCGGTGCAGAAATGTTTGAAAGTG
AGGATTACTACTCGACCTTTCGAAACCTGTTTCTTGCTTATTTACGAGAT
GATTTAAGGAGGAGATCGCTACAACATTACTTTGTGCTTCCCCATAACAT
CTTTGAAGGGTTGAGCgagaaagattttaaaatctATTTAGCAATGCTTA
CTAATAATTTTGACCCTCTACCAAGTACTGATGAACACTTTCAAAAGAAT
GTACTTACACTTAACGAGCAATTGTCTAATGTTGTCGAAACGAGGCTGAT
TACTACTTTACATATCGGCTTCGAGGTTAGCCGGTTACTTACCATCTCAT
CATATTTATTTGCCGAGCATGAGAAGTTCAcaagtcaaaattttgatgaa
atcgcTCAAAAATTGATAGTAAATGAATGTTTTGCATCAAAGTGCTTGAC
AAGTATTGATCATTTAATTAGTGAAATGAAAACGAGATGTTTGGCTGTTT
TCCATTTGTACGAAGGGCTCTCAAAACCAGAGGATGATGAGCAACGTCGC
ATTCTACTTGCTAAAGCTGAAAAGGAATTCAAAGCAACAGTCTCGCTACA
ACATCATCCCAGACCTGACTATGGAGTGATCGGGTTTGCTTATTTAGCCC
TCTACTATTATCTAACAAACCAGCACGATAAATGTAAGCAATGCTGCTGT
TTATGTTGCATTCAATATATGGTTCAACCGGAAGCTTTCTACCAAATACA
ACACGCAGCTGTTATTTTACCCTCACAGAAAAATTCTGGTCTTTGGCCTA
ACGCAGGCCCTTCATTTCTCCAGAGTACGCCATTGAAATTATTATTCGGC
CTTCATGGAAACACTGTGGAACCTCTACAGCTTGACCCCGTTGTTCTCTC
AAAATGTCTTTATCGGTTCCTTTCTCGTGGTGATCCTGACGAGTTTCTTT
TGGAAACAACACCGACCtatgaaaattctaaaaaagcaACTCGCCTTGAG
GATATTGCAAATTATTTATCACCCAATAATCGATTTGCCTCTCTGCTTTT
GTTGAGAATCACTAACTCGGTCATTGGGCCAAACCAAAACTCCCTGTTAG
AGAATCTCTTCGATGAAGTCCGTCAACACCAAGATGGGGATGTGTTTGAA
TCCCTAATGCGCATGTTTCAAGACAAAGAAAATCACTCACTCATACAAGC
ATTCCTTTTCTCACACGTTGGAGATGTTGATAGTGAAGATGTCGATGGTG
GAGATGTTGATGGTGGAGATGTTGATGGTGAAGATGTCGATGGTGGAGAT
GAGGTACAAGAAGTACTCTATAAATTCCTTTTATTTCGGATGTCCCAAAA
TCCAATTAAAAGTATTTcagaatttatgaaattaaaCAGTATGCATCAGA
TTGTGGGAAAACCAATGTGTACTGGCAAGTATAACGACTTTGTGGATTCT
CTGATAATTAAAGGTTCTTTGAAATCTCCTTCCACCTACAATGCAGTTGA
TGAAGATGACAATaatgatttgattggtttaatGGAAGACCTGGAGCAGA
ATGTGAAGGGTGGATCGGGTTCATCGATTGTTGAATTGATTATGGTTGAT
GAAATTAACGATTTGGAAGCTTTCAGGTCGACTCTGaaaaaaaTCGAAGA
AGCTGACATGTGGAAATCATTCTCAAATAAATAAAGGATGATGAGCAACG
TCGCATTCTACTTGCTAAAGCTGAAAAGGAATTCAAAGCAACAGTCTCGC
TACAACATCATCCCAGACCTGACTATGGAGTGATCGGGTTTGCTTATTTA
GCCCTCTACTATTATCTAACAAACCAGCACGATAAATGTAAGCAATGCTG
CTGTTTATGTTGCATTCAATATATGGTTCAACCGGAAGCTTTCTACCAAA
TACAACACGCAGCTGTTATTTTACCCTCACAGAAAAATTCTGGTCTTTGG
CCTAACGCAGGCCCTTCATTTCTCCAGAGTACGCCATTGAAATTATTATT
CGGCCTTCATGGAAACACTGTGGAACCTCTACAGCTTGACCCCGTTGTTC
TCTCAAAATGTCTTTATCGGTTCCTTTCTCGTGGTGATCCTGACGAGTTT
CTTTTGGAAACAACACCGACCtatgaaaattctaaaaaagcaACTCGCCT
TGAGGATATTGCAAATTATTTATCACCCAATAATCGATTTGCCTCTCTGC
TTTTGTTGAGAATCACTAACTCGGTCATTGGGCCAAACCAAAACTCCCTG
TTAGAGAATCTCTTCGATGAAGTCCGTCAACACCAAGATGGGGATGTGTT
TGAATCCCTAATGCGCATGTTTCAAGACAAAGAAAATCACTCACTCATAC
AAGCATTCCTTTTCTCACACGTTGGAGATGTTGATAGTGAAGATGTCGAT
GGTGGAGATGTTGATGGTGGAGATGTTGATGGTGAAGATGTCGATGGTGG
AGATGAGGTACAAGAAGTACTCTATAAATTCCTTTTATTTCGGATGTCCC
AAAATCCAATTAAAAGTATTTcagaatttatgaaattaaaCAGTATGCAT
CAGATTGTGGGAAAACCAATGTGTACTGGCAAGTATAACGACTTTGTGGA
TTCTCTGATAATTAAAGGTTCTTTGAAATCTCCTTCCACCTACAATGCAG
TTGATGAAGATGACAATaatgatttgattggtttaatGGAAGACCTGGAG
CAGAATGTGAAGGGTGGATCGGGTTCATCGATTGTTGAATTGATTATGGT
TGATGAAATTAACGATTTGGAAGCTTTCAGGTCGACTCTGaaaaaaaTCG
AAGAAGCTGACATGTGGAAATCATTCTCAAATAAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000101_pilon | genome | sc0000101_pilon:228978..231873 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 2134-2535:2495 |
| Aaloc | 1399-2133:1745 |
| Aaloc | 907-1395:901 |
| Aaloc | 1-900:1 |
|
