XLOC_044049 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_044049
Unique NameXLOC_044049
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000101_pilon:34862..43986+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_044049 ID=XLOC_044049|Name=XLOC_044049|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9125bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000101_pilon:34862..43986+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000101_pilon:34862..43986+

>XLOC_044049 ID=XLOC_044049|Name=XLOC_044049|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2586bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000101_pilon:34862..43986+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTTAAAAGATTGATAAGTTGGCTTAGAAGCCACGGAACTTCCACCAG
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aagaaattggCGTGACCTGGAAGGATattgaaaatgtatttttctgGAAT
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TGTATCTGAAATCTTATTTTTGTTAGGTacatttctttatttctacCCGG
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GCAGTTACCTTGGTATTATTGAGAAATTATTTGAGCGCTTGGAGAGAATC
ATTCAACCCATTGCACTCCAATGGTGCAACACAGAGACAAAACGAACTAG
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CTGAGGAAGACGAATTTTTACCACGTGATCACTCTCAACCAACAGAAACG
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GAGAGGAAAACTACATTTAAAAGttgTACCGCAACGCAAGAGCACAGCTG
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TGATGAATTCCATGCAGGATTGGATTTCCAAAATGTAACAGCTAGATCCA
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CTTTACGACTGGATGACACCGACGAAGATATCAAGGATTTACCGATCGAA
GAAACAGATGGCTCATCAACTCGATTCGCAAATATCGCAAGACAAGAATC
ACCACAACACGAAAGTAATATCGGATTCGAGTTTGTCGATAAAGAAGATT
TACATGATGTCACTGATGAAGAAATTAATGAACAGAATGCCGGTCAAGGT
CAAAAAGGAATCGTGTCCAATATGCTCGGATATTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_044049XLOC_044049-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000101_pilongenomesc0000101_pilon:34862..43986 +
Properties
Property NameValue
Aaloc1009-1293:8841
Aaloc841-1005:8056
Aaloc688-837:6894
Aaloc541-684:6607
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Aaloc346-453:5517
Aaloc313-342:4855
Aaloc202-309:3973
Aaloc1-198:1