|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000061_pilon:37298..42131- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_043975 ID=XLOC_043975|Name=XLOC_043975|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4834bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000061_pilon:37298..42131- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ACAAAGCAACCTTATTTGGAATTCAAAACTGACTCTGTCGAAATCTGCAT
GGATAGATGTGTCGCTGAAACGCCTTGTAAATCAATCAATTATAATGACG
TCACTTCTGAATGCCAACACGTCGATTATGACGTCAATGACGGACGAGAA
TACATCAATAAAACCGGTTTCAAACATTATGATACCGGAATAACTCAATT
AACCAGGATTTTAACTATTTCTCAAACGTACTGCGTCACAGTCATCACAT
CTGATCCTTGTTGGCACGGAGATGCGCCGTCCCAAGTATACCTTTATTAT
AAGCCCATCAGCAGTGATGAATGCCAAAACATTGGAGCCTACTATGATTT
TGATAGAACCTCTGGTACGATGGTTCACCATTGTTCTGGTTTAGTGGTGA
CAAGATACAGTGGTTATTTTGTACTGCGAACATTACCTAAATGGTCCCAA
ACCTACGTCAGTAACGAGATGTATATTTGGCGGTTAAATTCTTGTAAGTA
TTTCTATTCGTCCTTTTGTTTAAAGGGACATAATAGTACTACTGTTATGT
CCCTTTAGCGAAATTTGTAAACAAACTGTATGCAGCGGTTACAAAATCAA
AACAAATGTCACATGTCAAAATAAAAAATCAAACCAAATATGGTTAATTT
TGATTGTTCAATTGTTTTACAAGTTTGTTTTGGACACGTGATTTTAATTG
TTCTCTTTAATGACACGTGGTTCGCGCAATGTTTACATTTTACTACTTTA
ATGTCTCTTTAAGCATATTCGAATTCGTTTTTTCTAATAGCTCTTGAAAT
TCTTTGTTAATTTATACACGTTTTTTTTCATAAGAGCGTCCGAAGTTTTA
AAGGCTTCGAATGTTCTTAACTTTTTTTGAGCCTGAAGCCTAAATTTACC
CAGCTGGCACACAACGTTGTTTCAATGTTCATCTAAAGTCTATTCACGAT
AAGTGTGCACTCTTTTTTCTTTTACCTATAGCTTTTGAAGGAATTCTTCA
ATCTTTAAAGTTGGTATCATTTGAAAGATATTAGTGAGTGGAACAATTTG
AAATAAAAAAATCTTTAAAAAAATTCTGAAAATGAAGATGAAAATGAAGA
AGAAAAAATGAAGATCTTGTAGAAAAGTACTATAACTATCATTTTCACTG
AAGTGAATCCTTGATCATCGAACGTCATCACTGTGAAAAAATTTCATTAA
AATATTTATTCAATATAAAGTTATGATACAAAGTTAATAATTGATTGACC
CCAAAAAACAGCAAAAAACTGCAGAAAACAGCGTTTTTAGACGTCAATCA
GCTTATAACTTTGTTTGATATCTTTTGACTGAATGATTATTTTTGAAAAA
TTTTTCACAGCGATTTTTGGTAAAATATCGGTCGGGATTTCCTGAATGTT
TTAGGGAAAATCTTGAAAGCCAAAGGAGCTTTTGTTTGTAGGATGTTCAC
CAGAGTGCTCAAAAGTGTTGAGCTTCGCATAATACCGAGTTTATGTATGT
GTGTTTTTCAGCGATGGAGACGGTAAGGTTCTAATTTGGCTGGATCATAA
CCAACTGAGGACGACGGTAAATCAGCACTTTTACCGTCCTCAATTTCGCA
AGTCAGAACTGCGGGTTTTTCCAAATCGCTTCAGACACTTTACCGTCCTT
AAAAGTGCAAATACATAAACTCGCTAATCGCTTGTGGTGAACGGAGAAAC
AGAGCGTAAGGCGAGCGTTAGCTGCAGCCATCATAGGCGACTATTTTAAT
AATGTATATATTCTCGCTATTGTTTTATTTTAGATGGTTATGTTGACTTC
AACAGTCAAGCTTTACATGCATATACTGGTATTGGAGATGGAAAATATGC
TCGCTATGGAGCAGCAGGTGTTTTGCCCCCTTCAGACGATAGAATCGTCT
TCGATAGATGTAAGTGTGAAGTTAAAGGTTTTGATTTTACATAAGTGTTT
CCGTTTCATACCAGACACATATTCCATATCAGGACAGTGTCTACCTATTG
TTATATTATGCTGATATAAGCAAAAAAATGCTTTTCTTTTCCTCTTTCTG
ACTAATCTTGCTCCACATCCGTGTCAATCCGATGTTAAAAAGCTTGTAAA
TTAAAATTGACGAGTAAGCAAACGATATCACTCTTATTTAAAAACAATAC
CTTATATAGTAGAGTCTATTTGACCATACTTTAACTCGAGCCTTTACATA
GCCCCCCCCCTAGTGGTTTTCGTAATGACGTGAAAGGGACTTTTTTTCAA
GCGCGATTACACCTCAGATAACATAAACAAACACATTTATAAACAACAAA
CTTATAAAAGCTACTAGACTGGAGTCGTTTATAATGCGTGTAATACAGTA
GTATAGGCGTCATACGATAATACGATTATTGTTACGGGATTTAGTTTGTA
TCATCTAAAATTGTTCCTTCTATTACTTTTTGCTTTACTTCTACAATGTC
TGAATTAGTCGTCTAGCTTGCTAGACTAAAAAGATCTTCAAGAAATATAC
AAAGCAACACAAGAAACATAGACGGTCTCAGATCATTTTCATCGTCCAAT
ATCTATATACTGATAGCCGTACGTGTCTGAAGCCTTTGGTTTTGGTTTTC
ACTACAATCAGTGCCGAAATATATTGGCAATTTTGCGTATTTTAATGTTT
TTCAAACCAGAATTTAAAGCTCCGGCGAGAATTGCAATTTCAGTACTTTC
ACTTTACTTGTTCCGGTGGATTTTTCGATTTTGGAGGGGTTAACCGGTCT
AACCGTACTTTAAAGCACTTAAAGATCACTTGCAGTTTTAAATTCCCCTT
TTATGTGCCAAATATTTTGACGCCGATTGTAGCGATATAATTTTTAGAGG
TAGATATGTAATCTAAAGTAAGAATCTTTAACAAAATATAACTTTAATAA
ATTTCTTTTTTTTTAACACAGTTGTTCAGCCAGTGTTATTGCACAAATAT
GACGGAGTGGTTTTTCGCAATATTGATACTCTTGAATCCGATATCCGAAA
TCGAATTAGTACAAATGGTTATCACTACTCAACACGTCAATCCGATTTTT
GGATAGCCCCTTCCATGGGAGACAATTACGTAATCCGAATGCAAGCATTT
TTCATACCAGATGTAACAGGCACATATTCTTTCTGGTTGAGAGGTGATGA
TATGGCTCTTCTTTTTATTGGAACAGATGAAACACCAGAGAGCCGACAAG
AAATTGCGAGATTGAGATATGCTATTGGTGATTATTTAACGTAAGTTGAT
ACAGTAGTACTTTAGTAATAATAGGTGCCTGGTACAGTGTACAATCAGGG
TCAAAATATATTGGAAATTTTGGTTAATTCCTCGATTATAGCAATTTAAA
GTCCGGGCGAAAAAGTCGCTTTTGGGGCAAATTGATAAATTTATTCGAAT
ATTTCAATTCGGGAAGGGTTTATAGGCTTTCAGGCTATATTCTGAGCCCT
ATTGGACTATTCTTGAACTTTTAGTTCGTAATTCTAGCGTTAAAGCTCAG
AGTTAAAACTCTACCCGTCCAATCTAATCTAGAGGGCTTCCAAATCGTTT
GTGGTTGTTTCAAGATTTCGTGGGGATTTCCCTTTTTTCTCAATATGACT
TTGATTGTAGACGATGTTATCGTCCGTTACAGTGATAGTAAAGGCGGGAA
AATATGGCAGTGTTTGGCGTTATGGCGGTATACGGAAAAAAATCGGTGGG
TGAGTTTCGAAGACTGGCAAACTCTACCGACTGTAAGCTCTTTTCGGCAA
AAGAAACCGTATGCGAATTTTCTTCGACTTTGGGCTTTTTTCTTAGATAA
TGATTTGTCTTAGATTATAGTATAGTCTAGGTAAAGTGAAGTCCCCATAA
CTCGAACACCCACGGGGACCACAAAATTGTTGAAAGAGCCATAAAATTTT
GTTCGAGTTAAGGAGACATTCGAGTTATAGAGGTTTGAGTTGAAGAGACT
CCACTTTATATGCAAATCTTAAGGATCGGTTTATATTCCCAAGGGATACA
ATAAAAAAATTCAAATTAAAACAAACTTGCAGACCTTATAAGGATACAGT
AGAGCTTTATTTTTGCCTTTTTGGGTATCTATAAGGATTAAAACAAATCA
AAAAAGAAAAAAGAAAAGACGGGGGTAAGTGGGACAGAAATATTGACGAT
ACCCATCCCCTATATATCAAATCATATCAATTTATATCACACGATATATC
CCCTATTATATCAAAATAAATTCTGGGGATGTGCACACCCAACGAGTTTC
CAGCTCATCCACTCAATCACTGCCGTTCTTTGATAGTTAAGGTTAGGGTT
TGTCTTTTTGTTGCTTCTTAATAGTTATTTGTCGTTCTTTTTAGAACGTC
AGATGAACAGCCCGGCGGGAGTGCTAGGGTTGCAAGCTGACGGGGGGGGG
GGGTGCCGCCCGACATTCGACCCTCGGACCCTTACCGGGACTTAAAAGTA
GAAAACAAAGGAAATTTTGTGAATTTTATGACCCTTACCGGGACAAATTT
GACCAAATTTGACCAAATTTCGATCTTTCTGGGGGGTAAAAAGGTCCGAA
AAAGGTACCCTTAAGGGCGGCACATACCGTACCCTCCATTTGCCTAAGTA
CCCCTCCCCCGGGATGAACGTTCTCCTAATGAATGCTGAAATAAACATTA
TACTTACCTTATTTTCTTTAGAGAGCACAGTGGTACAAAATATATGGAAT
ATGGTCAAAAATATTACATCGAAATATTGTTTAATGAAATAGATGTAGGT
GATATGTTGATAGCTACAATGATGAGACCTGGTGACGAAGATCGAACGCA
TATTGGCCCAAGAAATTTATATCCATTCCCCTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000061_pilon:37298..42131- >XLOC_043975 ID=XLOC_043975|Name=XLOC_043975|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2202bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000061_pilon:37298..42131- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ACAAAGCAACCTTATTTGGAATTCAAAACTGACTCTGTCGAAATCTGCAT
GGATAGATGTGTCGCTGAAACGCCTTGTAAATCAATCAATTATAATGACG
TCACTTCTGAATGCCAACACGTCGATTATGACGTCAATGACGGACGAGAA
TACATCAATAAAACCGGTTTCAAACATTATGATACCGGAATAACTCAATT
AACCAGGATTTTAACTATTTCTCAAACGTACTGCGTCACAGTCATCACAT
CTGATCCTTGTTGGCACGGAGATGCGCCGTCCCAAGTATACCTTTATTAT
AAGCCCATCAGCAGTGATGAATGCCAAAACATTGGAGCCTACTATGATTT
TGATAGAACCTCTGGTACGATGGTTCACCATTGTTCTGGTTTAGTGGTGA
CAAGATACAGTGGTTATTTTGTACTGCGAACATTACCTAAATGGTCCCAA
ACCTACGTCAGTAACGAGATGTATATTTGGCGGTTAAATTCTTACAAAGC
AACCTTATTTGGAATTCAAAACTGACTCTGTCGAAATCTGCATGGATAGA
TGTGTCGCTGAAACGCCTTGTAAATCAATCAATTATAATGACGTCACTTC
TGAATGCCAACACGTCGATTATGACGTCAATGACGGACGAGAATACATCA
ATAAAACCGGTTTCAAACATTATGATACCGGAATAACTCAATTAACCAGG
ATTTTAACTATTTCTCAAACGTACTGCGTCACAGTCATCACATCTGATCC
TTGTTGGCACGGAGATGCGCCGTCCCAAGTATACCTTTATTATAAGCCCA
TCAGCAGTGATGAATGCCAAAACATTGGAGCCTACTATGATTTTGATAGA
ACCTCTGGTACGATGGTTCACCATTGTTCTGGTTTAGTGGTGACAAGATA
CAGTGGTTATTTTGTACTGCGAACATTACCTAAATGGTCCCAAACCTACG
TCAGTAACGAGATGTATATTTGGCGGTTAAATTCTTATGGTTATGTTGAC
TTCAACAGTCAAGCTTTACATGCATATACTGGTATTGGAGATGGAAAATA
TGCTCGCTATGGAGCAGCAGGTGTTTTGCCCCCTTCAGACGATAGAATCG
TCTTCGATAGATATGGTTATGTTGACTTCAACAGTCAAGCTTTACATGCA
TATACTGGTATTGGAGATGGAAAATATGCTCGCTATGGAGCAGCAGGTGT
TTTGCCCCCTTCAGACGATAGAATCGTCTTCGATAGATTTGTTCAGCCAG
TGTTATTGCACAAATATGACGGAGTGGTTTTTCGCAATATTGATACTCTT
GAATCCGATATCCGAAATCGAATTAGTACAAATGGTTATCACTACTCAAC
ACGTCAATCCGATTTTTGGATAGCCCCTTCCATGGGAGACAATTACGTAA
TCCGAATGCAAGCATTTTTCATACCAGATGTAACAGGCACATATTCTTTC
TGGTTGAGAGGTGATGATATGGCTCTTCTTTTTATTGGAACAGATGAAAC
ACCAGAGAGCCGACAAGAAATTGCGAGATTGAGATATGCTATTGGTGATT
ATTTAACTTGTTCAGCCAGTGTTATTGCACAAATATGACGGAGTGGTTTT
TCGCAATATTGATACTCTTGAATCCGATATCCGAAATCGAATTAGTACAA
ATGGTTATCACTACTCAACACGTCAATCCGATTTTTGGATAGCCCCTTCC
ATGGGAGACAATTACGTAATCCGAATGCAAGCATTTTTCATACCAGATGT
AACAGGCACATATTCTTTCTGGTTGAGAGGTGATGATATGGCTCTTCTTT
TTATTGGAACAGATGAAACACCAGAGAGCCGACAAGAAATTGCGAGATTG
AGATATGCTATTGGTGATTATTTAACAGAGCACAGTGGTACAAAATATAT
GGAATATGGTCAAAAATATTACATCGAAATATTGTTTAATGAAATAGATG
TAGGTGATATGTTGATAGCTACAATGATGAGACCTGGTGACGAAGATCGA
ACGCATATTGGCCCAAGAAATTTATATCCATTCCCCTGAAGAGCACAGTG
GTACAAAATATATGGAATATGGTCAAAAATATTACATCGAAATATTGTTT
AATGAAATAGATGTAGGTGATATGTTGATAGCTACAATGATGAGACCTGG
TGACGAAGATCGAACGCATATTGGCCCAAGAAATTTATATCCATTCCCCT
GA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000061_pilon | genome | sc0000061_pilon:37298..42131 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1051-1212:163 |
| Aaloc | 733-1047:1912 |
| Aaloc | 607-729:3050 |
| Aaloc | 112-603:4835 |
|
