|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000001_pilon:4046216..4054435+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_043974 ID=XLOC_043974|Name=XLOC_043974|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8220bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001_pilon:4046216..4054435+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGAGCAATTGTGAGGATGACATTGGAGCATATGATCAGCTCAGACTTCT
TGGAAAAGGAGGTTGTGCTCAAGtctttttggtcaaaaacaaGCACAATG
GAAGGTGAGTGGTTATTTTCAGGATAAGTAGCTCTTGAAGTTGAAAGCTT
CAACAgggtttattttttaaaagaaatacaaaaaatatgaCTCTCCACAT
TGGGAAAAATTAGTCTCAAAACTCAGCTTCATTTTATGTAGTAATATATT
TCAATATTAACTTTGTAGATATTTTGCCATGAAAAAGATTGAACTTGACC
CCAGCCGAAGatcaaaaacaacagaaaatgttttaaaggaGGCAAAGTAA
GTAGGCTCTGGAAAATTCATGAAGTTTTTTAGGTTTAGTTCTAGTCTTAT
GATGTTATCTTTACTTTATCTGAAAGTAGATCGCAACTGGTCGTTTTCCT
CTTATTTTCTTCCAGATTATTGTCTTCTTTACAACACCCTCACATTGTGA
CCTGTAGAAGTTATTTCTTTGACACAGAGAAAGAATTCTTTTATATTGTG
CAGGTAAAATTAATATATTATCTTTCCTACTAGTCATacctttttaagaa
aaagcTGCTCATTATATTCGAAATGTTCATGATCCAAGGTATGTCTTAGT
TTTTTGTGTTATGTTGGGTGTCCACTGGTAAAAATGAGATTGTCACAATC
TTTCTTAATGCAAAAGATGAATCCAGACATACGATGTGACTGCcttaaaa
caaataattttattctttgtctttatctttttactcttttgaaaaaaaag
aaaaggaaaaagattCCGATAGATTTTATATTCCAGCTATTAGGTATGAA
TTTATTTGATAGTAGATAGTACTTGTGACAAACTTATTTTTTGCTATTGG
ACACCTATCTTAATTCTCTTCATGATATTTTAATATTGAGAATattgaaa
aatctaatttttttctttacctaGGATTTTTGTGACGATGGAAGTATTTT
TGACCGAGTGGTTGATGCTAGAGAAGTATTtaataaatgtttttatattt
taatggTGTTTGGCATCCTAGAGTCTTCTAGAGTCTGCTGCCtaaattac
cttaagggaattaatttttgcggcaACTAATTTTTGGGAGACAGCTTCCC
TcgcaaaataatttaatttttgtgggACAAATTTTTGCGACTAACTGTGA
CTATAaatttttgcgaggatttaatttcacgaattggcgaattttttcag
attttcagttttttcgaTAGTTTGATTACGAGGTTTTGTgtgtacagtag
agtctccataaacTCAAATGGCTACgaggaatgaaaatttgttcgattta
taGAGAGATTCAAGTAATGGAGAATCATTTAAGAGAGTTTTAATTTTCGC
AAGGGATTATATTTCACGAAAAAGGCGAAATTCGCaaaatataatccccg
cgaaaatgtATTCCCTGAAGGTAACATAATTGAAAAAGTCTCAAAGACAT
TGATTCTGGATttcacttaattttttttctttattaattgCTTATTTTAT
TATGCAGGCAAAGAATCCACTTCCAGAAGCTGTAATGATGAAAGTAAgtc
gaaaattcttttttaaaagctGGTCaaaattttacatgccataatcaaaa
tttttatttgagttactttttaaaatcaattttttagcaaagattttaaa
tCCTAACCCAAAGTCCCAGTCCTAATTAGACAACGTTCTAAAAATACTGC
AACACAcagtttttcaatattttggtgAAGCCAACTAAATGGTTTGCTTA
CGTTATTGCTTATTTCAGCATAATATACCAGGAAACTACAACACAAGTAA
TTTGGTATTTCCTAGAAAAGATTTAAGACAATGTCCTTTATCGACTATAC
TGCTAGTAATATTTTTGTGTGCACTAGttgtaacaaaaataaaaaaagat
gatTAATTTCATCTTGCTTACCATTACTTTTTCAATATAGTGGTTTGTTC
AAGTTGTGATGGCGGTTCAATACATTCATTCTCAAAAGATTCTACACAGA
gacatcaaaactcaaaatgtatttttaacaaAACAAGGTGTTGCTAAATT
AGGTGAGTCTTTAGGTGAATTTATGAAAAAGACTGGCAGCTACTTTccaa
gtgaagaaaaaaaaaagaaacatcaactagaaatataattttggacGTCA
ATTTATAAAAATGTAATATTTGGCATCCTGATCTTCTTTCAGCTTACATG
GTAGCTCATATTTCAACATTAAAGTAAGGTGCCCATAATGATTTTAGATC
CCCTCCAGAAATTGCTCTAAGTTAAGGAGGAGTTTATTTGAGAGGGTGCT
CAAAAGAAAGGGGTGTTTTATTTGAGGTAATATGGTTTTcagagtttttg
tttttaaaactaaagAAGCTAATGTGTTGATGAATCAACAATACTCTTTT
CCTATCAGagaatataaaaaataatcatgATAGTAAAAAGATGACATAGT
GAGAAGTGAAAGAAACTAGGAATCGGAAGATTTTCACAATTTATAATATT
TAGCAGCTtgattgtgaatttttttctagatttttatcttcaattgttat
tattattaccCTTGGtgccatatttttttcttcaggggATTTTGGCATTG
CTAAAGTGATGGAAAATACCATTGATATGGCTCAAACAGCGATTGGAACT
CCTTGTTATTTAAGTCCTGAAGTTTGCCAAGATATGCCTTACAGTTCAAA
AGCAGACATTTGGGTAGGGGCTAAGTTATATTAATTATGATTTTATCAGA
CCCTAGAAGACTCTTGTTTATAGCCAGATCTGAGATTCAAATCTAAACTC
ATTCTTAGCAGTATCTATCTTTTAGTCCAACCCTTTTTTACCTAACCCTT
GGAATttaggcaattttaggatcatacacATAGATCAATTACCCCTATCG
AATTCAGCTTATTTCTGAAAGGCTTTAATATATCCCCATGGGATTTACTG
CCTTTCAGAACCTAGCCCAATGGAACAGAAAGGAACCTGCTCAACAGGGA
ATGTTCaattatttctgaaaaaataactttaaattgtaaattgtattttt
tcaacAGTTAAGGCTTATAGATTTCTTTTTAAAGGCTCTTGGGTGCTTGC
TGTATGAAATGGCTGTATTGAATTATCCATTTTTGGCCAACAACATTGTG
ACGCTATATTATAAGATTGTCAAGGGAGAATACAAGGTAAACTTTTTGCA
TCATAATCCTACATAAATTGAACCCCATCCTTTAAACTGGGATCtaacaa
tattttggccaaaatatttatACATATCGGATATCATATTATATAAAGAA
TTTggtatttgtttgaaaaattaatagGAAAGCAACAATTAAGCTTGCGG
TACCCTTTACAACCAGAAACTACAGAAATTTTTGCTTATTCAAATGGTTT
GGCGACCTCTGCTTACTAGGCCTCGATTGGCCATTAAGTTCAAAGGAAAT
TAAATGAGATAATAGGACATGAAATAGTTTTATGCATTGTGAGTAGAAAA
GCAGCGTATGAGTATGGgtgttttttattcatttttaagaGTTTACCATT
GAAGTATGATACAAGTATCCATGAACTGGTTGATGCAATGTTGAACAGAA
ACCCTGACAACAGGCCAAGGTATGAAACACAACAATTATTTAATGAAAGC
CAGCTAGAGAATCCATTAACATTGCTATAATAGTGTATAAAAGGTATAAA
ACACaccaattattttttgaaaacaaagggAAACATTGCCATATTGTGTT
AACTTGACTGCTTGAAAACAGCTTTCCCCTTTTTGCTTGTTGCTTGTTAT
ACTTACTTTACTCAAAAAAGGAATACAACATGATCTTTACACATATTTCA
TACACACAATTCTTTAGCAGAATATATTTTTGATGTAAAGGTTCAAGTCC
ACACTTAACATTTTTCAAGcattattttcacttttctttcttAGTACATC
TGCAATTTTGAATATGGAAGTTGTACAAAAATATTTGCAACAGTTTTTAG
TCGAATGTGAAGATctacaaaaaaatgtaaacaagtAAGCTCacattatt
ttaatttttctactGAATGCAATTTGATTTACTCTATTAAAATCCaaagt
tttgcaaaaaaaacaaaacaaaaaaactcttCAATGAAGAAGATTTTCTA
TTTCTCGCTGATCTTCTCCTCATTTATGTCATAGGTTTGTTGGAGCTTCA
AAGAAGCCAGCGGATAGCAAAGTAACCACTCCTAAAGAAGCAAAAGGTAT
ATCATAATGTTTTTGGGCTCAACCCAACCCCTAGCTTCCTCCCACAAAGT
TTGGTCCTACCCAATACTGTCATGAGGGATttataaatagaattttgtat
gtttgaatatttttaaatatgcaTTATGCATGAGATAAAAATATCCGGAC
AAGACGTATTCAGGAATCACGGATTGCGTGGCCATCAGACCTAGGTTAGC
CTGGTTCCACAAGTGGACCCCGTTGACCAGGTCTGACTGCCATGCGCATC
CACAAAGAATGTTAAAGGAGAGTCGTTTAGAGACTGGACCGTAAGGTTGG
TAGAGGGAAGTACCTGGATGAGACAGGTGGTGAATCAAACAGGGTGAACT
GCGGAGTTATGGGGTTCTTGCGCAGAGTTAATAATAAAACCCAAGTCGCA
ATAAACTGCAGTGAGCGGCAACGCCTGGACGCAGGtgaaatattgacatt
taaatttgtttgtttattgtgTGTAACTTTACTTTATCATTTGGATGAAT
TAAAATAAATACGCACGAGCCGAAAaactcttgtttactttgttcTACTG
TCACTCTGAATTCCACTGTACATTCAAGTCCTCCCCGTCTTCTAGCGGCG
GGTCAGATCTTAAACGCCTGGggcataaaaataaatattcgcTTATCGCG
CCAGGAGAGGGCCGTGTACAACCTCTTCCCGCGCGACAATACTTTATACC
TGTAATTTTTGCCTTCTGTTCAATGCTCAGCTATTGAAGAGAAACGAGAA
TCGACGAAAAAGCCCAACAAAAAGAGTAACATTACCTTTTAAAAGACAAC
TATTGAAAAACGGCTTTCGTTGTCCTCAACATTGCAGCTACTCACTACAT
CACTACATCACTATACAAATACATTTTAATTTctccttttcttttatttt
agacTCAGCAGTTGCAGCAGAAGTGAAGAAACTAACATCTAAAGATACAG
GCATATATGCTGACGATTTTGAAGAGCTGCAGGAGGATGATTATTCGGAT
GACTTTGAATCTTCATCCTCAGAGGTGGAGAGTGTGGATGATAGTGGGGA
AGAGAGTAGTGATGAATGCGAATCCAGTGATGAAgtatattttgatgttt
tgtttacttgttttttttatttgcttaAAATTGTTCAGTGTTTAAAGTCT
TCTGTTTCAAATTTTCGTCTCAAtgaagtatataaagaggcttttGCATC
TCAAATTTCTGCATGATTTaccaaaattcaagaaaataatatgTACCAGC
TTGCTTTGTAAAAtacattttccgtctcagatgACAAACCTTGCTTTGAT
CACTGCTTCTTGCCATCCATTGTAGCACATTAATGTAAAATATATCAGGG
TCACATTGTTTTAGGATACCTTCCTCAGGATATAAAAAGCTGGGTGtcca
atttaaaaatatcatttcgCTGCAAATAcctatttacaaaaaatgataCA
TGTGTCAGAAGCAAAATattgttgtttctttttttccGCCTAGTAAAAAA
tagagaattaaaaaattttattacagctatttattttctcttttctcaac
ttcagttgagctacaatctgacaatgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtctg
tgtgtgtgtctgtctgtctgtcacaaaaactttagggcagcctggagact
tcaaaaatgcttggatttggctgaaatctggcacacttgttccttgggtg
aatatctgggggtgtttttttcattttttgaaaattttgatttttggggc
ctggggacgagtttttcgccaaaacgaggctaaaactttggggcaggctg
gagacttcaaaaatggtccgattgggttgaaatttggcacacttgttcct
tgggtgaatatctgggggtgtttttttcatttttcaaagttttgattttt
ggggcctggggacgagttttcgccaaaacgaggctaaaactttggggcag
cctggagacttcagaaattgttcgatttggctgaaattttgcacacttgt
tccttgggtgaatatctgggggtatttttttcatttttcaaaatttttga
tttttggggcctggggacgagttttttgccaaaacgaggctaaagctttg
aagcagcctacagccctccaaaatggtcggatttggttgaaatttggcac
acttgttcattgggtaaatatctgggggtctacaattgggcctatgaata
atttgaagccactgaagttgagcccagtgcgttgcgcacgttcgactata
tcACAAACACGTTTGGATTTGCCACAAATTAATATATTACAATTTGTTCA
GTGGTCACCAAGCTTGAACAACtaattaatatttttcactCATAAAGACT
TTACTCTTTTTAGGAGTTCAACTCGGTCATCCAGAATGCAAGAGAAGAAG
CTGAAAGAGGGACAAGAGATAGTAAgaattatttgaaatataatttattt
gaatttttgtaatttttgtgttctttgcgaacttttgCCTCTATCGAAAA
ATCAAATCTCATTAAAATGTGCTCCGTCCTAATCttcaaaatcattaatt
tttgaattgaCTATTTATTGTCTTCTGTACAATCTTTGACTATCTTGGAA
ATTTGCGAATCCattagaaatttttgaaatcgtgatacACAAAATTAAAT
CCATACACAAATTTTTGGcttgccaaattaaattacacaaaaacaaaatg
caaTTAAAGTgtctttttcaaaagagattgaaAATCTTGCTCAAACTTTA
GCTGGCAAACGTACtgatatcaaattttttcacttcTATTTATTTAAATT
TGTTTAGGTGATGAGCTATTTGAAGAGGCTCACAGGACAGATCTCAAGAT
TGGGCATCGCGATTTTCTCAAAAGGTGATAATTTTGCAGTAAAGCTGCAC
TGAGTATGctttaaagtagaaaaaattcaataagatgtgtggataccccc
tggaaaaggacaaaatttgcaaaaatacccttgaGAGAATTCTTATTCAT
ACTTTTAAGTGAGGGTGGACTAACTAAAACCTGAAGGTCTTTACGCCCTG
TAtttatataaaatggaatggcccattgatTCTTAGCAGTCATACAGTCC
TCAAATTGGTTAAAATAGACCAAATAGAACCACTGTTAATATGTATTGTC
TAACAGAGCTTTCGTGGCCTTTTACTTTggaaaaatctattaaaaaatac
tttttatctAAAATTTCATGTTGTTATGATGATAATCTCCTTCTTTTAAG
GCATTGCAAAGAATTAATGGGTCAAACGATGtttgaaaaagtgacaaaaa
tctGCAGGCAAAATGATGACAAATTGCTTGAAGATTTGAGGTAATGATTT
TCGTCTTTACAGAATGGTTCTCGTTGATATCTCAGATCCAAAATACCAAT
CAAGGGGACAAACAATCTAAAAACCTTTACAAGGGATAAATTAAGGGCCA
TTGACTTTTAATAGCGAGTTTacgtatttgcacttttgaggacggtaaag
tgactgaagcgattttgaATAGCCCgaagttttgacccgcaaaatcgagg
acggtaaaagtgctgatttaccgtcgtcttcATTCAGTCAGGATTTAGAC
AGTATAGAACCTTACCGCCTCCGTTGcagaaaacacacatacataaactc
ggtagtaAGAAAAGGTTGAGTGGACGAAAAAAGCAAAATGTCCACATCAT
AGAAGACGTTATCTGTTTAGCTCACATTCCGATGCTGATTTGTATCCAAA
ATTGTCAACTCTGAACCTAAATCAATTTTCCTTTCAGTAAGTACTTCACA
ACAgtcttttttttatgttttagacCAACACTTGAAGAAACAGTTGGCGA
TGGTTTAATTGAGCCATGTCTTCTTTTAGCACAATTGCTACTGAACCCCC
CTCCCGATGACTCCATGTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000001_pilon:4046216..4054435+ >XLOC_043974 ID=XLOC_043974|Name=XLOC_043974|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2850bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001_pilon:4046216..4054435+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGAGCAATTGTGAGGATGACATTGGAGCATATGATCAGCTCAGACTTCT TGGAAAAGGAGGTTGTGCTCAAGtctttttggtcaaaaacaaGCACAATG GAAGATGAGCAATTGTGAGGATGACATTGGAGCATATGATCAGCTCAGAC TTCTTGGAAAAGGAGGTTGTGCTCAAGtctttttggtcaaaaacaaGCAC AATGGAAGATATTTTGCCATGAAAAAGATTGAACTTGACCCCAGCCGAAG atcaaaaacaacagaaaatgttttaaaggaGGCAAAATATTTTGCCATGA AAAAGATTGAACTTGACCCCAGCCGAAGatcaaaaacaacagaaaatgtt ttaaaggaGGCAAAATTATTGTCTTCTTTACAACACCCTCACATTGTGAC CTGTAGAAGTTATTTCTTTGACACAGAGAAAGAATTCTTTTATATTGTGC AGATTATTGTCTTCTTTACAACACCCTCACATTGTGACCTGTAGAAGTTA TTTCTTTGACACAGAGAAAGAATTCTTTTATATTGTGCAGGATTTTTGTG ACGATGGAAGTATTTTTGACCGAGTGGTTGATGCTAGAGAAGATTTTTGT GACGATGGAAGTATTTTTGACCGAGTGGTTGATGCTAGAGAAGCAAAGAA TCCACTTCCAGAAGCTGTAATGATGAAAGCAAAGAATCCACTTCCAGAAG CTGTAATGATGAAATGGTTTGTTCAAGTTGTGATGGCGGTTCAATACATT CATTCTCAAAAGATTCTACACAGAgacatcaaaactcaaaatgtattttt aacaaAACAAGGTGTTGCTAAATTAGTGGTTTGTTCAAGTTGTGATGGCG GTTCAATACATTCATTCTCAAAAGATTCTACACAGAgacatcaaaactca aaatgtatttttaacaaAACAAGGTGTTGCTAAATTAGgggATTTTGGCA TTGCTAAAGTGATGGAAAATACCATTGATATGGCTCAAACAGCGATTGGA ACTCCTTGTTATTTAAGTCCTGAAGTTTGCCAAGATATGCCTTACAGTTC AAAAGCAGACATTTGGgggATTTTGGCATTGCTAAAGTGATGGAAAATAC CATTGATATGGCTCAAACAGCGATTGGAACTCCTTGTTATTTAAGTCCTG AAGTTTGCCAAGATATGCCTTACAGTTCAAAAGCAGACATTTGGGCTCTT GGGTGCTTGCTGTATGAAATGGCTGTATTGAATTATCCATTTTTGGCCAA CAACATTGTGACGCTATATTATAAGATTGTCAAGGGAGAATACAAGGCTC TTGGGTGCTTGCTGTATGAAATGGCTGTATTGAATTATCCATTTTTGGCC AACAACATTGTGACGCTATATTATAAGATTGTCAAGGGAGAATACAAGaG TTTACCATTGAAGTATGATACAAGTATCCATGAACTGGTTGATGCAATGT TGAACAGAAACCCTGACAACAGGCCAAGaGTTTACCATTGAAGTATGATA CAAGTATCCATGAACTGGTTGATGCAATGTTGAACAGAAACCCTGACAAC AGGCCAAGTACATCTGCAATTTTGAATATGGAAGTTGTACAAAAATATTT GCAACAGTTTTTAGTCGAATGTGAAGATctacaaaaaaatgtaaacaaTA CATCTGCAATTTTGAATATGGAAGTTGTACAAAAATATTTGCAACAGTTT TTAGTCGAATGTGAAGATctacaaaaaaatgtaaacaaGTTTGTTGGAGC TTCAAAGAAGCCAGCGGATAGCAAAGTAACCACTCCTAAAGAAGCAAAAG GTTTGTTGGAGCTTCAAAGAAGCCAGCGGATAGCAAAGTAACCACTCCTA AAGAAGCAAAAGacTCAGCAGTTGCAGCAGAAGTGAAGAAACTAACATCT AAAGATACAGGCATATATGCTGACGATTTTGAAGAGCTGCAGGAGGATGA TTATTCGGATGACTTTGAATCTTCATCCTCAGAGGTGGAGAGTGTGGATG ATAGTGGGGAAGAGAGTAGTGATGAATGCGAATCCAGTGATGAAacTCAG CAGTTGCAGCAGAAGTGAAGAAACTAACATCTAAAGATACAGGCATATAT GCTGACGATTTTGAAGAGCTGCAGGAGGATGATTATTCGGATGACTTTGA ATCTTCATCCTCAGAGGTGGAGAGTGTGGATGATAGTGGGGAAGAGAGTA GTGATGAATGCGAATCCAGTGATGAAGAGTTCAACTCGGTCATCCAGAAT GCAAGAGAAGAAGCTGAAAGAGGGACAAGAGATAGAGTTCAACTCGGTCA TCCAGAATGCAAGAGAAGAAGCTGAAAGAGGGACAAGAGATAGTGATGAG CTATTTGAAGAGGCTCACAGGACAGATCTCAAGATTGGGCATCGCGATTT TCTCAAAAGGTGATGAGCTATTTGAAGAGGCTCACAGGACAGATCTCAAG ATTGGGCATCGCGATTTTCTCAAAAGGCATTGCAAAGAATTAATGGGTCA AACGATGtttgaaaaagtgacaaaaatctGCAGGCAAAATGATGACAAAT TGCTTGAAGATTTGAGGCATTGCAAAGAATTAATGGGTCAAACGATGttt gaaaaagtgacaaaaatctGCAGGCAAAATGATGACAAATTGCTTGAAGA TTTGAGacCAACACTTGAAGAAACAGTTGGCGATGGTTTAATTGAGCCAT GTCTTCTTTTAGCACAATTGCTACTGAACCCCCCTCCCGATGACTCCATG TAGacCAACACTTGAAGAAACAGTTGGCGATGGTTTAATTGAGCCATGTC TTCTTTTAGCACAATTGCTACTGAACCCCCCTCCCGATGACTCCATGTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000001_pilon | genome | sc0000001_pilon:4046216..4054435 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1330-1425:8125 |
| Aaloc | 1240-1326:7552 |
| Aaloc | 1174-1236:7110 |
| Aaloc | 1114-1170:6664 |
| Aaloc | 934-1113:5205 |
| Aaloc | 871-930:4236 |
| Aaloc | 781-867:3996 |
| Aaloc | 700-777:3590 |
| Aaloc | 598-699:3135 |
| Aaloc | 472-597:2638 |
| Aaloc | 358-468:1991 |
| Aaloc | 322-357:1558 |
| Aaloc | 271-321:975 |
| Aaloc | 184-270:467 |
| Aaloc | 106-180:270 |
| Aaloc | 1-102:1 |
|