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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000061_pilon:153073..155409+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_043953 ID=XLOC_043953|Name=XLOC_043953|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2337bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000061_pilon:153073..155409+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgtgtttgAGTGGAGAAATCCCTGACAACTGGCCTCCTTTGATTGAGTT
GATTATATTCCTTGCTTTTGGTGGACTTGATGTGTTTGCACACTACAATA
TCTGGGTGATATCCAAGACAAAGATTATTGATATTACTGggaatatgatt
tttaatgTTTCTCTGCCTAATGATACATCCAGTAATTTTTATCCACCCAT
CACAACAGCTCCATCGACAAATTTGACCGACAACTCAACAATCAGTGGCA
GTACTAGTATATCTTTATTTATGAATGTGACAAAGACTCCTGATGAACTA
TGGGCAGATTTAATAGAATTCCGGCAGTTTTATTTCTATGTTTGGTTAAT
TGGTCTTGTGTTATTTGCCGTGCAGACTGCATGGTTAATACCAAATGTCA
TAAAACATATTATTTCTGCTGACCCAGCAGTTTTAAAAGACCCATCAGCG
CACTGTTACTTTCGTAGTGTTTTTTCTGTACACGTTTTGTTCCTTTTGCT
TGGAACGTTTATTTTTGACATCCCAATCTCTTGCCTGGCGATGGAAATGT
TATCTTTGATTTGGAAAGGAGAGGCTCTTACCACAGATGAGAAGTTGGTT
GCCAGTAAAGATATGGTCATGTATTCTTTACTAGGCTTATCACTAATTGC
CCTTTACAAAGGTGAGAGTCAATGACAGTTTTCTTGAAGGCCTCACTCAT
GCAGTGTGTCCGAAAAAAGCGGAGAAATTTTTGTATAAGTAAAATCCTCA
TGATTCATAACattttatgacttgtatacttaatatttcaatctccAAAA
CCTATATTTAATCTTACTTTGAATGTCTTTTGATTGAGCAGagaatttta
atcttatttcagTTAATCTAAACGTAGATAAGATAATGGGTTTTGAGCAT
TACTAAAAAGTTATATAAaagtttttctgcttttttttaTACACAATGTA
CTTCTTGTTTACAGTGATAGATGTGCAAATGACCGTCACTGTGGTTAGGT
GGCAAACAAAATTTTAGGTTTACAAGTTTATGTACATTTTTCACACCGAA
GAAGCTTTGATGAAGTACGAAGATAAATAATACAAGGGCtatggggccgt
ccacatagtacgtacacactaaaatgtttgaaatgttGAAAATCTAGTAC
CCCCTGcgcgcaagcgtacgcaaatggctataccccctggtgtaagaagc
gtaaaagtaacaaaaaaacagcaaaaaaggcctattaaaaaCATATTCCT
TTGACCCCTCTCCTCCCCCtatacgcaagcatacgcttttgagagactca
tacgtactatgtggacggcccctatgCAATATTTTCAAGTAAAATCTTTG
AAACCTCTCCAATTTCTgcaaaaatttggtaaaatttgcCCTCACAGTTt
ttgccttttctttttcaggaatGATGCCCTTATTCTTATGGATTGGTAAT
CCGTTTTGTTTTCCTTGTATACCGTTACGTTTGTTGATCGTCATGCCAGG
TGGTCTGGTTGTCATGGTGATGACATTCACTCCACCCATGGGTGTGGCCA
AGAATGGGTTGCTGACTTTTGCCCCACCTGGTAAGAATAATATTTAGAGC
AGTCCTTAGGAATTGTATTCGAGAATTTATGAAATCTGTTATTCATATGA
TCTTTTCTGGAACTGATGacgattgaaacatttttaatactttttgtcat
tttttggtttGAGGTGAGAGAGGAAAGGATAAAAATATCAGACTACAGGT
TAACCCCGTAAATCAGAAAGTGTAGAAGAGAAAATTCTCAAACCTTATTG
AAGTAAATAAAAGTAGGCAATTGCAACATAGCAAagttcaggggggggtc
ggtagtaaaatctcagacataatgacgtttactatggtggtggtgtgacg
aaaaatcgagagaaaaaaatttactacccagggtagttaaatacttaaat
gggtggtatctatgtgttgaatgttgaaaaaaatttactacctgggtagt
taaaactggtaaaattagcaaattttagctatttttgtaaaatctgaaaa
tttttataatttgaaaaaactttctgttggaaagttgtttgctgcaaata
aaaatttctcgaaattttttgtcaatataagaaaagaaattactttatta
tattttacatttttcttctCCCTTTATAGAAATGCAAGCACAACTTGGTG
AACTAGCTGGTACATTCTTCCAAATCGGGTTGATCATATGgggtttgttt
tttattgttgttttcttgatcacgtgttgttattgtaagttttgtCGAGA
AGAATCGAAAGATGGAAACACCTGTCTGTGTTGTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000061_pilon:153073..155409+ >XLOC_043953 ID=XLOC_043953|Name=XLOC_043953|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1962bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000061_pilon:153073..155409+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgtgtttgAGTGGAGAAATCCCTGACAACTGGCCTCCTTTGATTGAGTT
GATTATATTCCTTGCTTTTGGTGGACTTGATGTGTTTGCACACTACAATA
TCTGGGTGATATCCAAGACAAAGATTATTGATATTACTGggaatatgatt
tttaatgTTTCTCTGCCTAATGATACATCCAGTAATTTTTATCCACCCAT
CACAACAGCTCCATCGACAAATTTGACCGACAACTCAACAATCAGTGGCA
GTACTAGTATATCTTTATTTATGAATGTGACAAAGACTCCTGATGAACTA
TGGGCAGATTTAATAGAATTCCGGCAGTTTTATTTCTATGTTTGGTTAAT
TGGTCTTGTGTTATTTGCCGTGCAGACTGCATGGTTAATACCAAATGTCA
TAAAACATATTATTTCTGCTGACCCAGCAGTTTTAAAAGACCCATCAGCG
CACTGTTACTTTCGTAGTGTTTTTTCTGTACACGTTTTGTTCCTTTTGCT
TGGAACGTTTATTTTTGACATCCCAATCTCTTGCCTGGCGATGGAAATGT
TATCTTTGATTTGGAAAGGAGAGGCTCTTACCACAGATGAGAAGTTGGTT
GCCAGTAAAGATATGGTCATGTATTCTTTACTAGGCTTATCACTAATTGC
CCTTTACAAAGatgtgtttgAGTGGAGAAATCCCTGACAACTGGCCTCCT
TTGATTGAGTTGATTATATTCCTTGCTTTTGGTGGACTTGATGTGTTTGC
ACACTACAATATCTGGGTGATATCCAAGACAAAGATTATTGATATTACTG
ggaatatgatttttaatgTTTCTCTGCCTAATGATACATCCAGTAATTTT
TATCCACCCATCACAACAGCTCCATCGACAAATTTGACCGACAACTCAAC
AATCAGTGGCAGTACTAGTATATCTTTATTTATGAATGTGACAAAGACTC
CTGATGAACTATGGGCAGATTTAATAGAATTCCGGCAGTTTTATTTCTAT
GTTTGGTTAATTGGTCTTGTGTTATTTGCCGTGCAGACTGCATGGTTAAT
ACCAAATGTCATAAAACATATTATTTCTGCTGACCCAGCAGTTTTAAAAG
ACCCATCAGCGCACTGTTACTTTCGTAGTGTTTTTTCTGTACACGTTTTG
TTCCTTTTGCTTGGAACGTTTATTTTTGACATCCCAATCTCTTGCCTGGC
GATGGAAATGTTATCTTTGATTTGGAAAGGAGAGGCTCTTACCACAGATG
AGAAGTTGGTTGCCAGTAAAGATATGGTCATGTATTCTTTACTAGGCTTA
TCACTAATTGCCCTTTACAAAGgaatGATGCCCTTATTCTTATGGATTGG
TAATCCGTTTTGTTTTCCTTGTATACCGTTACGTTTGTTGATCGTCATGC
CAGGTGGTCTGGTTGTCATGGTGATGACATTCACTCCACCCATGGGTGTG
GCCAAGAATGGGTTGCTGACTTTTGCCCCACCTGgaatGATGCCCTTATT
CTTATGGATTGGTAATCCGTTTTGTTTTCCTTGTATACCGTTACGTTTGT
TGATCGTCATGCCAGGTGGTCTGGTTGTCATGGTGATGACATTCACTCCA
CCCATGGGTGTGGCCAAGAATGGGTTGCTGACTTTTGCCCCACCTGAAAT
GCAAGCACAACTTGGTGAACTAGCTGGTACATTCTTCCAAATCGGGTTGA
TCATATGgggtttgttttttattgttgttttcttgatcacgtgttgttat
tgtaagttttgtCGAGAAGAATCGAAAGATGGAAACACCTGTCTGTGTTG
TTAAAAATGCAAGCACAACTTGGTGAACTAGCTGGTACATTCTTCCAAAT
CGGGTTGATCATATGgggtttgttttttattgttgttttcttgatcacgt
gttgttattgtaagttttgtCGAGAAGAATCGAAAGATGGAAACACCTGT
CTGTGTTGTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000061_pilon | genome | sc0000061_pilon:153073..155409 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 826-981:2182 |
| Aaloc | 664-822:1421 |
| Aaloc | 1-660:1 |
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