XLOC_043892 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_043892
Unique NameXLOC_043892
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000111_pilon:460982..473058-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_043892 ID=XLOC_043892|Name=XLOC_043892|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12077bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000111_pilon:460982..473058- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TGAGCTTTGAAGACTCCACTATACTAATTTTCAAAGTTTACCATCCGCGT TTAAAAAAAGTTATTTTCATTTCCGCCTTGTAACGCCTATTTTCTTTTTA ACGCGTCCCTATTTTCGCGCTAGAAAAAATATTTTTCTTCGATACGCGCA AAAATTTGCGGAAACATTGATTTGTTATTATAAGCGGGAAGCCTACACAA CATCGGAATTTTAATCTAATGTTTTGATAAAACACTCTCGTTATCCTAAA TTTTACTTAAAATAAACTACGTGAAGGAGGCTTAGATGTCAATTGTTGTT ATTTAATAACGGATATTTTCGTCTCTTTGAGGTCTTTCCTTCCTTATTCT GTATACTGGAATTATATTCGTAGGGGTGGCGAGGATAATGGAGGAAAAAC TCCCGATAAGGGTCGCAAAAGCTCTAAATTTTTCGGCCGTGTTTTATGAA TATGACTTCAAGAATCAAATAAATTACTTCAATTTTTTAACCAAAATCTC AGATTTTCACAAATCACGCGGCACCTATCTGTTATTCGGCTAACGTAGTA CTCACCGAGAATCGTATTCAGTTAAACTAGCTTCAGTATTGGCACTCAAG GAATAGTCTTGTTTTTTTTATAAACAAAGCGTTAGGTAAATCCAGACGGT TAGTCAATTTCAATCAATTTCTTATCTTTTAGATCGTTTTTCACCGGAGA ATTTACAACGCTCAGACCCAGGTTGTGAGATTATTGCTGACGTAGCATTT TTAATTGATGCATCAGGAAGTATCCGAGAAGAGTATTTGTCGCAATTGCA ATTCGTTCAGTATATCATTGCCAGGTACAGTAGAACCTCCAATTAGCAGA CACTCTAAAATGCGGACACCTGATTAGCGGACAAAATATTTTTCCCCGAC CTTTTCCTGGTCAAATCCTTATAAAAAAGTCTCCAAAAGGCGGACACCTC 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GCTGAACCTGAACTTATTGGACACTGATTTATGGATTTGATTGGAAATTT AATGAAACATTTATTGATTGAACTTATGATGTTGAGCTTGGAACTCACAC GGATAAGATTTATGGATTTACATTTGAATTGAAAACCTTATAGATTGTAT CGAAAATTGGAAAACTTTGGATACAAATTTACGAATAATTCCTATCCGTC ATTGGGGGGATATATCGTCACACATTTGATTTGAGATTTGAGGATACACA TTTACGAATAATTCCTATCCGTCATTGGGGGAATATATCGTCAGACATTT GATTTGAGATTTGAGGATACAAATTTACGAATAATTCCTATCCGTCATTT GGGGGAATATATCGTCACACATTGATTTGAGATTTGAATTTGAAAACTTT TGACATTTAGATTGTATCGGAATGTTGTGATTTATATTTCGGGGGGAATG TCGTGGAATAGAAATTATGATTGACAGTTTGACCACGTGACCAGTAGGGT CACGTGGATATATAAATAGCGCGACATTTGTAATTTATGATTAGTACGAA ACCAGAAAGAGAAGAAGAAGCATCTAATAGAAATATACAGTCCTCCCACT TATTTCGTTTCGGACACGGTCCGTCCTCAAGTTTTTTATATTAAGTCGGC TTTTGTCAACTCTTTTTCATTACAGGAATTGACATTTTCGCCATCGCTGT TGGAGACAAAGCATCCGAAGCCGATTTATCCGCCATCACACGTGATCCAG AACGTGTCTTTACTTCAAAGGATGCCGCCTCTTTGAAAAGTGATGTCTTC ATGAAACAAGTCACACGAAACACTTGCAAGAAAGTCACTACAACTACGAC GAGTGAGAAATTCAAATGCTTAAAACTTCATGCATCTTCTTAGTAGGGAA GCACTTTAGGGTGGGGGTGGGGATTCGTCAGAGGGCACCCTAGGAGGGCA CTACTACGGCACTACTACGACTACAAGTGAGAAATTTCTTCTTGTATCTT CTTAGTAGGGGAAGCACCTTAGGGGAGTTTGGCAGAGGGCACCCTTAGAA TCTTGAAATTGTGCTATGACTTTTTCATAACTTTGGCATAATGGAAAATT TCTACCGGTTGATTTAATACACCATGCCAATAGAGTGGCAAGAAATACAC CATAAATCATATGTCAACAGGAGTTGACATGATAAGAGTGATGGAAGTTA GAAAGGTGTACTCTGAAAAAAATGACGATGACGGTGCCACTTCAGGGGGT AATATCTTAACGAGATATTTCTGCAACGATTCTTTGTTCATAAGCACTCA ACCAAATTTGTCTTTGACTTAACCGAACTCCCTATAAACCTCCTTTCCCG AATACGTTTAAAGGGGACAGTTTTTTTTTTGATTTATAGCTACTACAACA ACTACCACCACAACAACAACGACTAGTAAGAAAAAGTTTATCCTCATTTT CTCAATAATTTTCAATGATTTCATAAAAATTATTCGATTTATACAGGGAA AAGCATCCCAGTACACACCCTCGCTTTAAAAATGATATTTGATCCCCTTT TGGTTTAGTTTTTACCCTTACTATACTTCCTTATTTAAATTTCTTCAGCC CCAACAACTACAACCACAACAACGACCACCCCTACTACAACTACCACTAC GACCACCCCTACAACTACAACGACCACAGAGCCACCAACAACGACCACTG AATGTCTGACAACCAAAGCACCATGTGGAGGTATAATTCAAAGCCAATGA ACTCTAAATAATATACTGAAATAGTCATATTCTTAGCATTGTTTCCAAGT AATAATTGACACTCTCAAATTTGATTTTCTAGAGGAATTGGATTTATTTT CATCTAATAAGGGCTCTCAGTGTATCAAATAGTAGAGCGTCGTTTTTGAC 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TAAAAGGAAATCTAAATCGCAAACTCGCGAGTAAAGTAGCTTTTGTATAG TGCCGCTAGCTACCGGGGGGTTAGGGGGCTAAGAGGGGGGCTTTGTCCCC CAATAATGTTTTCAGGAATGGGTTTTATAAATTTTCTGCTAAGTTATTGA TGCTAGGCTCTATATAAATATATCTTTTTTTCTACAATTATTTAGAGCCA CTTGCTTCTGGGATCACAGATGTTATCAACATTGCTAAATCAGCTGGTTG CAACCTCTTCTTGAAATACCTCGACAATCTGAATCTCTTGAAATCCATCA TCAAAAAATCAACTCGAAACACTATCAACATTTTCTGTCCACAAGACAAC ACATTTAAAACGTACCTTCAATCCACCAGGAACTCTGGTCCTAGGAGTTT ACAGAACATGATACTGGGACATGTCACCAAAAAAACCGGACGAATGACTT TTAAGCCATTCACCTATGGAAATAAACAAAAGAATTTTGTCTTACAACCT TTCATCCAACCCAACGGACAGGTAGGCTACTTAGGTTTGACTCTGGAGGA CTTTTCAGGTTTTCTGAAAGTGCACTGCGAGGTCCTGGGAGAGTATTTTT AAGAAAATTAAAAAAATTTGACAACGCAACATTTTTCAAGTGACATCCCT GATCTACTATTGGACTTCTTTATAAGTTGATTTAAGCTGCTTTTTTCTTC ACTTTAGCGCTTAAAATCAAAATTAGCCACAGCGAAAATTAGCAGCATTA TATATATTGGGAAATTGCCGATGGAGTCTGAAGGAGTTACAATAGACGAT ATCAGCTTTCCGAATTCTCCCCGAATGATTACCCATGATGCATTGCGCAA AAAAATTCACGGACAATATTGACTCACTGAATTTTTTGCGCAATGTATCA TGGGTAATCATTCGGGGAGAATTTCGTTAAGCCGATATCGTCTATTCCTA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000111_pilon:460982..473058-

>XLOC_043892 ID=XLOC_043892|Name=XLOC_043892|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5418bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000111_pilon:460982..473058- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CGTTTTTCACCGGAGAATTTACAACGCTCAGACCCAGGTTGTGAGATTAT
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CTGTTGGAGACAAAGCATCCGAAGCCGATTTATCCGCCATCACACGTGAT
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AACGACCACCCCTACTACAACTACCACTACGACCACCCCTACAACTACAA
CGACCACAGAGCCACCAACAACGACCACTGAATGTCTGACAACCAAAGCA
CCATGTGGAGCCCCAACAACTACAACCACAACAACGACCACCCCTACTAC
AACTACCACTACGACCACCCCTACAACTACAACGACCACAGAGCCACCAA
CAACGACCACTGAATGTCTGACAACCAAAGCACCATGTGGAGTTCCAAAA
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GATGTTAACATGCAAGAGAAAATTGGTGAAAATAACGAAGAAGTTATCAA
GAGAATGGAGAAATTATTGCCAGGCAACGCAGAAGTCATCGATGCATTGC
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GAAGAAATTATTGCCAGGCAACGCAGAAGTCATCGATGCATTGCGAACAG
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CTTTTAAGCCATTCACCTATGGAAATAAACAAAAGAATTTTGTCTTACAA
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GCCTAACCTCACTATCACTGTAATCGATGACCTCATCAAGCACTCTGCTA
TCAAACTCATGCAAACATTGAAGAGCAACGAAGATTTGTCTGTCATGTAC
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GGTTGTTGATAAAGTTTGCTTCGTCAAAGGATTATGCGTTAAAGTCACTG
GTGATGTTCAACAACATTTCAAGGAGCTTCTCAAGGCTAAGCAATTCACT
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CAACGAGCTCGAAGTTAACAAGAAGTTGAGAGATGAATTTTTGTTACAAC
ATATTTTCCTTGGCATCTTACAACACAACGATCAAGACAACAACTCAAGA
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GAGTGATGGCAAACCGATTGTTTCCCGACCGGACGAATCGGTTTATGCTA
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TGAAAAAGTCAACGAGCTCGAAGTTAACAAGAAGTTGAGAGATGAATTTT
TGTTACAACATATTTTCCTTGGCATCTTACAACACAACGATCAAGACAAC
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TTGAGAAATGTAGAGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_043892XLOC_043892-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000111_pilongenomesc0000111_pilon:460982..473058 -
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