XLOC_043884 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_043884
Unique NameXLOC_043884
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000002_pilon:3142049..3145664-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_043884 ID=XLOC_043884|Name=XLOC_043884|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3616bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000002_pilon:3142049..3145664- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGTGACAATGCCAACACTACCGCTGAAAAACGGAATCGCTTAGGCTCCAT GTCCAGAAGCTCCCCACTTACCTCAGCCTCATCATCGAACTCCTACCAAC GTCCTGCTTCACAACAATCAGGACAACAGCAGCAACCTCCAAAAGGTGTT GATCCTTTCATTTACAACATGTTGGCACAAAGCTGGGATCCAGTTATGGG TCAACCACCATGTCCCTTCCAATGCCCCTCTCCATGTCCATATCCATGTC AACAAAGTCAGATGATGGCTCCCATGCCAATGCCTATGCAACCTCCTTTC TGTCCATCAATGTGTCCACCTTCTGGTTGTCCCATGGGTTGCCCACAAAC AACTGGTATCACTGTGATCCCACCAACACCAATCTGCTCTAACCCATGTC TACCACCATCATGCCCATCCTCTTGCTTGGGAGCTGCCCGACCACAACAA ATGTGCCCACAGCCCTGCCAACCTCCAGCCTGCCCAAGTGGTTGCCCCTT CACCATGTCTGCTTTACCAGCCATGTGTCCAAGACCCTGTCCATCCAGCA ACTGTCCAACCGGATGCCCCATCACTTTAGACATTCCAGTATACGGACCA TCAGCTAATCCTCCACCCTCAGCTGCATCTGCCCCTCCTCTTGGTGGCTG CCCCAACCCTTGCCCTCACCCATGTCCACCAGGATGCATCGCCACACAAC AGACAGTGAACATTATGGCTTGCCCAACACCATGTCCTCCAAGCTCATGC CCAGCTCAATGTCAAAAACAATGTCCTCAACCATGCCAGGGAGCCTCTTG CCCTATGGGATGTCCACAGACAATGGCTTCAGCTCCTTCAATGTGCCCAC AACCATGTCAACCACCTGCTTGTCCTTCTGGGTGCATGCAAACTCAAATG ATGGCTCCACCACCAATGTGTCCACAACCCTGTCAACCACCAGCTTGTCC AATGGGATGTCCAGCAACTTCAATGGCTGCTCCATCTATGTGTCCACAAC CCTGCCAACCACCTTCTTGTCCTATCGGGTGTCAACAAACACCAAGACTT TACTTTTCACCTCAAAAAATGATGCAGACGTGTCCACAACCTTGTCAAGC TCCAGGTTGCCCGATGGGTTGCCCCATGACCATGGCTTCCATGCCTTCAA TGTGCCCACAGCCCTGTATGCCTCCATCTTGTCCAAATGGCTGTTTGCAA GCTGCACCGATGATGGGTGCTCCTCAAATGTGTCCTCAACCTTGTCAAGC ACCCTCCTGTCCAATGGGATGCCCACAAACCATGGCTTCCGCACCATCAA TGTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCACAA GGTGCCGCTATGATGATGCCTCCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGATGTG CCCACAACCTTGTCAAGCACCCTCCTGTCCAATGGGTTGCCCACAAACCA TGGCTTCCGCACCATCAATGTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGC CCCTCAGGATGTGCCCAGGGTGCCGCTATGATGATGCCACCTCCCATGAT GGCTGCTCCACAGATGTGCCCACAACCTTGCCAAGCTCCAGGGTGCCCTA TGGGATGCCCGCAAACCATGGCTTCAGCTCCAACAATGTGTCCACAGCCC TGTCAACAACCAGGCTGTCCTTCTGGATGTCAAGAGTCGCCACGATTTTA TTTCTCGCCAGAGAAGCTCCTTCAGCAAATGCCACCACCTCAGCCGATGA TGTGTCCACAACCTTGTCAAGCTCCAGGTTGTCCAATGGGTTGCCCCATG ACCATGGCTTCTATGCCTTCGATGTGTCCACAGCCCTGTATGCCTCCATC TTGTCCAACTGGCTGTATGCAAGCCGCTCCAATGATGGCTGCTCCACAGA TGTGTCCTCAACCTTGTCAAGCACCTTCTTGTCCAATGGGATGCCCACAG ACCATGGCTTCAGCTCCATCGATGTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATC GTGCCCCTCAGGATGTGCCCAGGGTGTCGCTATGATGATGCCACCTCCCA TGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCACAACCCTGCCAAGCTCCAGGGTGC CCTATGGGATGCCCGCAGACCATGGCTTCAGCTCCAACAATGTGTCCAAG ACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCCCAGGGTGCCGCTA TGATGATGCCACCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCACAACCC TGCCAAGCTCCAGGGTGCCCTATGGGATGCCCGCAGACCATGGCTTCAGC TCCATCGATGTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGAT GTTCCCAGGGTGCCGCTATGACGATGCCAACTTCCATGATGGCTGCTCCA CAGATGTGCCCACAACCCTGCCAAGCTCCAGGGTGCCCTATGGGATGCCC ACAGACCATGGCTTCCGCACCTTCAATGTGTCCACAGCCCTGTCAACAAC CAGGCTGTCCCTCTGGCTGTCAAGAGTCGCCACGATTTTATTTCTCGCCA GAGAAGCTCCTTCAGCAAATGCCACCACCTCAACCGATGATGTGTCCACA ACCTTGTCAAGCTCCAGGTTGCCCAATGGGTTGCCCCATGACCATGGCTT CTATGCCTTCGATGTGTCCACAGCCCTGTATGCCTCCATCTTGTCCAACT GGCTGTATGCAAGCCGCTCCAATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCTCA ACCTTGTCAGGCACCTTCTTGTCCAATGGGATGCCCACAAACCATGGCTT CGGCACCATCAATGTGTCCAAGACCATGCATGCCTCCCTCATGCCCCACG GGATGTGCACAGGGCGCGGCTATGATGATGCCTCCTCCCATGATGCCTGC ACCTCAAATGTGCCCACAACCTTGTCAAGCACCCTCCTGTCCAATGGGAT GCCCACAGACCATGGCTTCAGCTCCATCGATGTGTCCAAGACCATGCATG CCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCACAAGGTGCCGCTATGATGATGCA ACCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCAACCCTGCCAAGCTCCA GGGTGCCCTATGGGTTGCCCGCAAACCATGGCTTCCGCTCCAACAATGTG TCCACAACCTTGTCAACCACCAGGCTGTCCATCTGGCTGTCAAGAATCTC CAAGGTTTTATTTTTCTCCAAGTAAACTTCAACAGCAGATGCCAGCACCT CAAGCACCGGCCTGTCCGTCTCCTTGTATCCCGCCATTTTGCCCTGCAAA CTGTCTTATCCCATCATGTCCACAGCCATGTCAACCACCAAGTTGTCCAG CATACTGTCCTACCACAACTGCAATGACGCCATCCAGCTGTCCAACGCCT TGCCCGCCTCACATCTGTCCACAGGGGTGCACCGTAGTACAATCGACCGT TAACATGTGTCCACAGCCTTGCATGCCGCCATCTTGTCCAGGTGGCTGCC CTCAAACAACGAACATTTATCCTCCAATGTGTCCACAGCCTTGCCAGGGT AATATTTGCCCAAGTGGATGTGCTGCACGTCAGAAGAAAGATATAATTGA ACGACAGAGAGGTTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000002_pilon:3142049..3145664-

>XLOC_043884 ID=XLOC_043884|Name=XLOC_043884|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5364bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000002_pilon:3142049..3145664- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGTGACAATGCCAACACTACCGCTGAAAAACGGAATCGCTTAGGCTCCAT
GTCCAGAAGCTCCCCACTTACCTCAGCCTCATCATCGAACTCCTACCAAC
GTCCTGCTTCACAACAATCAGGACAACAGCAGCAACCTCCAAAAGGTGTT
GATCCTTTCATTTACAACATGTTGGCACAAAGCTGGGATCCAGTTATGGG
TCAACCACCATGTCCCTTCCAATGCCCCTCTCCATGTCCATATCCATGTC
AACAAAGTCAGATGATGGCTCCCATGCCAATGCCTATGCAACCTCCTTTC
TGTCCATCAATGTGTCCACCTTCTGGTTGTCCCATGGGTTGCCCACAAAC
AACTGGTATCACTGTGATCCCACCAACACCAATCTGCTCTAACCCATGTC
TACCACCATCATGCCCATCCTCTTGCTTGGGAGCTGCCCGACCACAACAA
ATGTGCCCACAGCCCTGCCAACCTCCAGCCTGCCCAAGTGGTTGCCCCTT
CACCATGTCTGCTTTACCAGCCATGTGTCCAAGACCCTGTCCATCCAGCA
ACTGTCCAACCGGATGCCCCATCACTTTAGACATTCCAGTATACGGACCA
TCAGCTAATCCTCCACCCTCAGCTGCATCTGCCCCTCCTCTTGGTGGCTG
CCCCAACCCTTGCCCTCACCCATGTCCACCAGGATGCATCGCCACACAAC
AGACAGTGAACATTATGGCTTGCCCAACACCATGTCCTCCAAGCTCATGC
CCAGCTCAATGTCAAAAACAATGTCCTCAACCATGCCAGGGAGCCTCTTG
CCCTATGGGATGTCCACAGACAATGGCTTCAGCTCCTTCAATGTGCCCAC
AACCATGTCAACCACCTGCTTGTCCTTCTGGGTGCATGCAAACTCAAATG
ATGGCTCCACCACCAATGTGTCCACAACCCTGTCAACCACCAGCTTGTCC
AATGGGATGTCCAGCAACTTCAATGGCTGCTCCATCTATGTGTCCACAAC
CCTGCCAACCACCTTCTTGTCCTATCGGGTGTCAACAAACACCAAGACTT
TACTTTTCACCTCAAAAAATGATGCAGACGTGTCCACAACCTTGTCAAGC
TCCAGGTTGCCCGATGGGTTGCCCCATGACCATGGCTTCCATGCCTTCAA
TGTGCCCACAGCCCTGTATGCCTCCATCTTGTCCAAATGGCTGTTTGCAA
GCTGCACCGATGATGGGTGCTCCTCAAATGTGTCCTCAACCTTGTCAAGC
ACCCTCCTGTCCAATGGGATGCCCACAAACCATGGCTTCCGCACCATCAA
TGTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCACAA
GGTGCCGCTATGATGATGCCTCCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGGGTGA
CAATGCCAACACTACCGCTGAAAAACGGAATCGCTTAGGCTCCATGTCCA
GAAGCTCCCCACTTACCTCAGCCTCATCATCGAACTCCTACCAACGTCCT
GCTTCACAACAATCAGGACAACAGCAGCAACCTCCAAAAGGTGTTGATCC
TTTCATTTACAACATGTTGGCACAAAGCTGGGATCCAGTTATGGGTCAAC
CACCATGTCCCTTCCAATGCCCCTCTCCATGTCCATATCCATGTCAACAA
AGTCAGATGATGGCTCCCATGCCAATGCCTATGCAACCTCCTTTCTGTCC
ATCAATGTGTCCACCTTCTGGTTGTCCCATGGGTTGCCCACAAACAACTG
GTATCACTGTGATCCCACCAACACCAATCTGCTCTAACCCATGTCTACCA
CCATCATGCCCATCCTCTTGCTTGGGAGCTGCCCGACCACAACAAATGTG
CCCACAGCCCTGCCAACCTCCAGCCTGCCCAAGTGGTTGCCCCTTCACCA
TGTCTGCTTTACCAGCCATGTGTCCAAGACCCTGTCCATCCAGCAACTGT
CCAACCGGATGCCCCATCACTTTAGACATTCCAGTATACGGACCATCAGC
TAATCCTCCACCCTCAGCTGCATCTGCCCCTCCTCTTGGTGGCTGCCCCA
ACCCTTGCCCTCACCCATGTCCACCAGGATGCATCGCCACACAACAGACA
GTGAACATTATGGCTTGCCCAACACCATGTCCTCCAAGCTCATGCCCAGC
TCAATGTCAAAAACAATGTCCTCAACCATGCCAGGGAGCCTCTTGCCCTA
TGGGATGTCCACAGACAATGGCTTCAGCTCCTTCAATGTGCCCACAACCA
TGTCAACCACCTGCTTGTCCTTCTGGGTGCATGCAAACTCAAATGATGGC
TCCACCACCAATGTGTCCACAACCCTGTCAACCACCAGCTTGTCCAATGG
GATGTCCAGCAACTTCAATGGCTGCTCCATCTATGTGTCCACAACCCTGC
CAACCACCTTCTTGTCCTATCGGGTGTCAACAAACACCAAGACTTTACTT
TTCACCTCAAAAAATGATGCAGACGTGTCCACAACCTTGTCAAGCTCCAG
GTTGCCCGATGGGTTGCCCCATGACCATGGCTTCCATGCCTTCAATGTGC
CCACAGCCCTGTATGCCTCCATCTTGTCCAAATGGCTGTTTGCAAGCTGC
ACCGATGATGGGTGCTCCTCAAATGTGTCCTCAACCTTGTCAAGCACCCT
CCTGTCCAATGGGATGCCCACAAACCATGGCTTCCGCACCATCAATGTGT
CCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCACAAGGTGC
CGCTATGATGATGCCTCCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCAC
AACCTTGCCAAGCTCCAGGGTGCCCTATGGGATGCCCGCAAACCATGGCT
TCAGCTCCAACAATGTGTCCACAGCCCTGTCAACAACCAGGCTGTCCTTC
TGGATGTCAAGAGTCGCCACGATTTTATTTCTCGCCAGAGAAGCTCCTTC
AGCAAATGCCACCACCTCAGCCGATGATGTGTCCACAACCTTGTCAAGCT
CCAGGTTGTCCAATGGGTTGCCCCATGACCATGGCTTCTATGCCTTCGAT
GTGTCCACAGCCCTGTATGCCTCCATCTTGTCCAACTGGCTGTATGCAAG
CCGCTCCAATGATGGCTGCTCCACAGATGTGTCCTCAACCTTGTCAAGCA
CCTTCTTGTCCAATGGGATGCCCACAGACCATGGCTTCAGCTCCATCGAT
GTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCCCAGG
GTGTCGCTATGATGATGCCACCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGATGTGC
CCACAACCCTGCCAAGCTCCAGGGTGCCCTATGGGATGCCCGCAGACCAT
GGCTTCAGCTCCAACAATGTGCCCACAACCTTGCCAAGCTCCAGGGTGCC
CTATGGGATGCCCGCAAACCATGGCTTCAGCTCCAACAATGTGTCCACAG
CCCTGTCAACAACCAGGCTGTCCTTCTGGATGTCAAGAGTCGCCACGATT
TTATTTCTCGCCAGAGAAGCTCCTTCAGCAAATGCCACCACCTCAGCCGA
TGATGTGTCCACAACCTTGTCAAGCTCCAGGTTGTCCAATGGGTTGCCCC
ATGACCATGGCTTCTATGCCTTCGATGTGTCCACAGCCCTGTATGCCTCC
ATCTTGTCCAACTGGCTGTATGCAAGCCGCTCCAATGATGGCTGCTCCAC
AGATGTGTCCTCAACCTTGTCAAGCACCTTCTTGTCCAATGGGATGCCCA
CAGACCATGGCTTCAGCTCCATCGATGTGTCCAAGACCATGCATGCCACC
ATCGTGCCCCTCAGGATGTGCCCAGGGTGTCGCTATGATGATGCCACCTC
CCATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCACAACCCTGCCAAGCTCCAGGG
TGCCCTATGGGATGCCCGCAGACCATGGCTTCAGCTCCAACAATGTGCCC
TCAACCTTGTCAGGCACCTTCTTGTCCAATGGGATGCCCACAAACCATGG
CTTCGGCACCATCAATGTGTCCAAGACCATGCATGCCTCCCTCATGCCCC
ACGGGATGTGCACAGGGCGCGGCTATGATGATGCCTCCTCCCATGATGCC
TGCACCTCAAATATGTGCCCTCAACCTTGTCAGGCACCTTCTTGTCCAAT
GGGATGCCCACAAACCATGGCTTCGGCACCATCAATGTGTCCAAGACCAT
GCATGCCTCCCTCATGCCCCACGGGATGTGCACAGGGCGCGGCTATGATG
ATGCCTCCTCCCATGATGCCTGCACCTCAAATATGTGCCCAACCCTGCCA
AGCTCCAGGGTGCCCTATGGGTTGCCCGCAAACCATGGCTTCCGCTCCAA
CAATGTGTCCACAACCTTGTCAACCACCAGGCTGTCCATCTGGCTGTCAA
GAATCTCCAAGGTTTTATTTTTCTCCAAGTAAACTTCAACAGCAGATGCC
AGCACCTCAAGCACCGGCCTGTCCGTCTCCTTGTATCCCGCCATTTTGCC
CTGCAAACTGTCTTATCCCATCATGTCCACAGCCATGTCAACCACCAAGT
TGTCCAGCATACTGTCCTACCACAACTGCAATGACGCCATCCAGCTGTCC
AACGCCTTGCCCGCCTCACATCTGTCCACAGGGGTGCACCGTAGTACAAT
CGACCGTTAACATGTGTCCACAGCCTTGCATGCCGCCATCTTGTCCAGGT
GGCTGCCCTCAAACAACGAACATTTATCCTCCAATGTGTCCACAGCCTTG
CCAGGGTAATATTTGCCCAAGTGGATGTGCTGCACGTCAGAAGAAAGATA
TAATTGAACGACAGAGAGGTTAAATGTGCCCAACCCTGCCAAGCTCCAGG
GTGCCCTATGGGTTGCCCGCAAACCATGGCTTCCGCTCCAACAATGTGTC
CACAACCTTGTCAACCACCAGGCTGTCCATCTGGCTGTCAAGAATCTCCA
AGGTTTTATTTTTCTCCAAGTAAACTTCAACAGCAGATGCCAGCACCTCA
AGCACCGGCCTGTCCGTCTCCTTGTATCCCGCCATTTTGCCCTGCAAACT
GTCTTATCCCATCATGTCCACAGCCATGTCAACCACCAAGTTGTCCAGCA
TACTGTCCTACCACAACTGCAATGACGCCATCCAGCTGTCCAACGCCTTG
CCCGCCTCACATCTGTCCACAGGGGTGCACCGTAGTACAATCGACCGTTA
ACATGTGTCCACAGCCTTGCATGCCGCCATCTTGTCCAGGTGGCTGCCCT
CAAACAACGAACATTTATCCTCCAATGTGTCCACAGCCTTGCCAGGGTAA
TATTTGCCCAAGTGGATGTGCTGCACGTCAGAAGAAAGATATAATTGAAC
GACAGAGAGGTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_043884XLOC_043884-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000002_pilongenomesc0000002_pilon:3142049..3145664 -
Properties
Property NameValue
Aaloc2143-2682:541
Aaloc1972-2139:878
Aaloc1396-1971:2054
Aaloc1-1395:3617