|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000002_pilon:3142049..3145664- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_043884 ID=XLOC_043884|Name=XLOC_043884|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3616bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000002_pilon:3142049..3145664- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) GGTGACAATGCCAACACTACCGCTGAAAAACGGAATCGCTTAGGCTCCAT
GTCCAGAAGCTCCCCACTTACCTCAGCCTCATCATCGAACTCCTACCAAC
GTCCTGCTTCACAACAATCAGGACAACAGCAGCAACCTCCAAAAGGTGTT
GATCCTTTCATTTACAACATGTTGGCACAAAGCTGGGATCCAGTTATGGG
TCAACCACCATGTCCCTTCCAATGCCCCTCTCCATGTCCATATCCATGTC
AACAAAGTCAGATGATGGCTCCCATGCCAATGCCTATGCAACCTCCTTTC
TGTCCATCAATGTGTCCACCTTCTGGTTGTCCCATGGGTTGCCCACAAAC
AACTGGTATCACTGTGATCCCACCAACACCAATCTGCTCTAACCCATGTC
TACCACCATCATGCCCATCCTCTTGCTTGGGAGCTGCCCGACCACAACAA
ATGTGCCCACAGCCCTGCCAACCTCCAGCCTGCCCAAGTGGTTGCCCCTT
CACCATGTCTGCTTTACCAGCCATGTGTCCAAGACCCTGTCCATCCAGCA
ACTGTCCAACCGGATGCCCCATCACTTTAGACATTCCAGTATACGGACCA
TCAGCTAATCCTCCACCCTCAGCTGCATCTGCCCCTCCTCTTGGTGGCTG
CCCCAACCCTTGCCCTCACCCATGTCCACCAGGATGCATCGCCACACAAC
AGACAGTGAACATTATGGCTTGCCCAACACCATGTCCTCCAAGCTCATGC
CCAGCTCAATGTCAAAAACAATGTCCTCAACCATGCCAGGGAGCCTCTTG
CCCTATGGGATGTCCACAGACAATGGCTTCAGCTCCTTCAATGTGCCCAC
AACCATGTCAACCACCTGCTTGTCCTTCTGGGTGCATGCAAACTCAAATG
ATGGCTCCACCACCAATGTGTCCACAACCCTGTCAACCACCAGCTTGTCC
AATGGGATGTCCAGCAACTTCAATGGCTGCTCCATCTATGTGTCCACAAC
CCTGCCAACCACCTTCTTGTCCTATCGGGTGTCAACAAACACCAAGACTT
TACTTTTCACCTCAAAAAATGATGCAGACGTGTCCACAACCTTGTCAAGC
TCCAGGTTGCCCGATGGGTTGCCCCATGACCATGGCTTCCATGCCTTCAA
TGTGCCCACAGCCCTGTATGCCTCCATCTTGTCCAAATGGCTGTTTGCAA
GCTGCACCGATGATGGGTGCTCCTCAAATGTGTCCTCAACCTTGTCAAGC
ACCCTCCTGTCCAATGGGATGCCCACAAACCATGGCTTCCGCACCATCAA
TGTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCACAA
GGTGCCGCTATGATGATGCCTCCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGATGTG
CCCACAACCTTGTCAAGCACCCTCCTGTCCAATGGGTTGCCCACAAACCA
TGGCTTCCGCACCATCAATGTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGC
CCCTCAGGATGTGCCCAGGGTGCCGCTATGATGATGCCACCTCCCATGAT
GGCTGCTCCACAGATGTGCCCACAACCTTGCCAAGCTCCAGGGTGCCCTA
TGGGATGCCCGCAAACCATGGCTTCAGCTCCAACAATGTGTCCACAGCCC
TGTCAACAACCAGGCTGTCCTTCTGGATGTCAAGAGTCGCCACGATTTTA
TTTCTCGCCAGAGAAGCTCCTTCAGCAAATGCCACCACCTCAGCCGATGA
TGTGTCCACAACCTTGTCAAGCTCCAGGTTGTCCAATGGGTTGCCCCATG
ACCATGGCTTCTATGCCTTCGATGTGTCCACAGCCCTGTATGCCTCCATC
TTGTCCAACTGGCTGTATGCAAGCCGCTCCAATGATGGCTGCTCCACAGA
TGTGTCCTCAACCTTGTCAAGCACCTTCTTGTCCAATGGGATGCCCACAG
ACCATGGCTTCAGCTCCATCGATGTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATC
GTGCCCCTCAGGATGTGCCCAGGGTGTCGCTATGATGATGCCACCTCCCA
TGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCACAACCCTGCCAAGCTCCAGGGTGC
CCTATGGGATGCCCGCAGACCATGGCTTCAGCTCCAACAATGTGTCCAAG
ACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCCCAGGGTGCCGCTA
TGATGATGCCACCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCACAACCC
TGCCAAGCTCCAGGGTGCCCTATGGGATGCCCGCAGACCATGGCTTCAGC
TCCATCGATGTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGAT
GTTCCCAGGGTGCCGCTATGACGATGCCAACTTCCATGATGGCTGCTCCA
CAGATGTGCCCACAACCCTGCCAAGCTCCAGGGTGCCCTATGGGATGCCC
ACAGACCATGGCTTCCGCACCTTCAATGTGTCCACAGCCCTGTCAACAAC
CAGGCTGTCCCTCTGGCTGTCAAGAGTCGCCACGATTTTATTTCTCGCCA
GAGAAGCTCCTTCAGCAAATGCCACCACCTCAACCGATGATGTGTCCACA
ACCTTGTCAAGCTCCAGGTTGCCCAATGGGTTGCCCCATGACCATGGCTT
CTATGCCTTCGATGTGTCCACAGCCCTGTATGCCTCCATCTTGTCCAACT
GGCTGTATGCAAGCCGCTCCAATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCTCA
ACCTTGTCAGGCACCTTCTTGTCCAATGGGATGCCCACAAACCATGGCTT
CGGCACCATCAATGTGTCCAAGACCATGCATGCCTCCCTCATGCCCCACG
GGATGTGCACAGGGCGCGGCTATGATGATGCCTCCTCCCATGATGCCTGC
ACCTCAAATGTGCCCACAACCTTGTCAAGCACCCTCCTGTCCAATGGGAT
GCCCACAGACCATGGCTTCAGCTCCATCGATGTGTCCAAGACCATGCATG
CCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCACAAGGTGCCGCTATGATGATGCA
ACCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCAACCCTGCCAAGCTCCA
GGGTGCCCTATGGGTTGCCCGCAAACCATGGCTTCCGCTCCAACAATGTG
TCCACAACCTTGTCAACCACCAGGCTGTCCATCTGGCTGTCAAGAATCTC
CAAGGTTTTATTTTTCTCCAAGTAAACTTCAACAGCAGATGCCAGCACCT
CAAGCACCGGCCTGTCCGTCTCCTTGTATCCCGCCATTTTGCCCTGCAAA
CTGTCTTATCCCATCATGTCCACAGCCATGTCAACCACCAAGTTGTCCAG
CATACTGTCCTACCACAACTGCAATGACGCCATCCAGCTGTCCAACGCCT
TGCCCGCCTCACATCTGTCCACAGGGGTGCACCGTAGTACAATCGACCGT
TAACATGTGTCCACAGCCTTGCATGCCGCCATCTTGTCCAGGTGGCTGCC
CTCAAACAACGAACATTTATCCTCCAATGTGTCCACAGCCTTGCCAGGGT
AATATTTGCCCAAGTGGATGTGCTGCACGTCAGAAGAAAGATATAATTGA
ACGACAGAGAGGTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000002_pilon:3142049..3145664- >XLOC_043884 ID=XLOC_043884|Name=XLOC_043884|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5364bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000002_pilon:3142049..3145664- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) GGTGACAATGCCAACACTACCGCTGAAAAACGGAATCGCTTAGGCTCCAT GTCCAGAAGCTCCCCACTTACCTCAGCCTCATCATCGAACTCCTACCAAC GTCCTGCTTCACAACAATCAGGACAACAGCAGCAACCTCCAAAAGGTGTT GATCCTTTCATTTACAACATGTTGGCACAAAGCTGGGATCCAGTTATGGG TCAACCACCATGTCCCTTCCAATGCCCCTCTCCATGTCCATATCCATGTC AACAAAGTCAGATGATGGCTCCCATGCCAATGCCTATGCAACCTCCTTTC TGTCCATCAATGTGTCCACCTTCTGGTTGTCCCATGGGTTGCCCACAAAC AACTGGTATCACTGTGATCCCACCAACACCAATCTGCTCTAACCCATGTC TACCACCATCATGCCCATCCTCTTGCTTGGGAGCTGCCCGACCACAACAA ATGTGCCCACAGCCCTGCCAACCTCCAGCCTGCCCAAGTGGTTGCCCCTT CACCATGTCTGCTTTACCAGCCATGTGTCCAAGACCCTGTCCATCCAGCA ACTGTCCAACCGGATGCCCCATCACTTTAGACATTCCAGTATACGGACCA TCAGCTAATCCTCCACCCTCAGCTGCATCTGCCCCTCCTCTTGGTGGCTG CCCCAACCCTTGCCCTCACCCATGTCCACCAGGATGCATCGCCACACAAC AGACAGTGAACATTATGGCTTGCCCAACACCATGTCCTCCAAGCTCATGC CCAGCTCAATGTCAAAAACAATGTCCTCAACCATGCCAGGGAGCCTCTTG CCCTATGGGATGTCCACAGACAATGGCTTCAGCTCCTTCAATGTGCCCAC AACCATGTCAACCACCTGCTTGTCCTTCTGGGTGCATGCAAACTCAAATG ATGGCTCCACCACCAATGTGTCCACAACCCTGTCAACCACCAGCTTGTCC AATGGGATGTCCAGCAACTTCAATGGCTGCTCCATCTATGTGTCCACAAC CCTGCCAACCACCTTCTTGTCCTATCGGGTGTCAACAAACACCAAGACTT TACTTTTCACCTCAAAAAATGATGCAGACGTGTCCACAACCTTGTCAAGC TCCAGGTTGCCCGATGGGTTGCCCCATGACCATGGCTTCCATGCCTTCAA TGTGCCCACAGCCCTGTATGCCTCCATCTTGTCCAAATGGCTGTTTGCAA GCTGCACCGATGATGGGTGCTCCTCAAATGTGTCCTCAACCTTGTCAAGC ACCCTCCTGTCCAATGGGATGCCCACAAACCATGGCTTCCGCACCATCAA TGTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCACAA GGTGCCGCTATGATGATGCCTCCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGGGTGA CAATGCCAACACTACCGCTGAAAAACGGAATCGCTTAGGCTCCATGTCCA GAAGCTCCCCACTTACCTCAGCCTCATCATCGAACTCCTACCAACGTCCT GCTTCACAACAATCAGGACAACAGCAGCAACCTCCAAAAGGTGTTGATCC TTTCATTTACAACATGTTGGCACAAAGCTGGGATCCAGTTATGGGTCAAC CACCATGTCCCTTCCAATGCCCCTCTCCATGTCCATATCCATGTCAACAA AGTCAGATGATGGCTCCCATGCCAATGCCTATGCAACCTCCTTTCTGTCC ATCAATGTGTCCACCTTCTGGTTGTCCCATGGGTTGCCCACAAACAACTG GTATCACTGTGATCCCACCAACACCAATCTGCTCTAACCCATGTCTACCA CCATCATGCCCATCCTCTTGCTTGGGAGCTGCCCGACCACAACAAATGTG CCCACAGCCCTGCCAACCTCCAGCCTGCCCAAGTGGTTGCCCCTTCACCA TGTCTGCTTTACCAGCCATGTGTCCAAGACCCTGTCCATCCAGCAACTGT CCAACCGGATGCCCCATCACTTTAGACATTCCAGTATACGGACCATCAGC TAATCCTCCACCCTCAGCTGCATCTGCCCCTCCTCTTGGTGGCTGCCCCA ACCCTTGCCCTCACCCATGTCCACCAGGATGCATCGCCACACAACAGACA GTGAACATTATGGCTTGCCCAACACCATGTCCTCCAAGCTCATGCCCAGC TCAATGTCAAAAACAATGTCCTCAACCATGCCAGGGAGCCTCTTGCCCTA TGGGATGTCCACAGACAATGGCTTCAGCTCCTTCAATGTGCCCACAACCA TGTCAACCACCTGCTTGTCCTTCTGGGTGCATGCAAACTCAAATGATGGC TCCACCACCAATGTGTCCACAACCCTGTCAACCACCAGCTTGTCCAATGG GATGTCCAGCAACTTCAATGGCTGCTCCATCTATGTGTCCACAACCCTGC CAACCACCTTCTTGTCCTATCGGGTGTCAACAAACACCAAGACTTTACTT TTCACCTCAAAAAATGATGCAGACGTGTCCACAACCTTGTCAAGCTCCAG GTTGCCCGATGGGTTGCCCCATGACCATGGCTTCCATGCCTTCAATGTGC CCACAGCCCTGTATGCCTCCATCTTGTCCAAATGGCTGTTTGCAAGCTGC ACCGATGATGGGTGCTCCTCAAATGTGTCCTCAACCTTGTCAAGCACCCT CCTGTCCAATGGGATGCCCACAAACCATGGCTTCCGCACCATCAATGTGT CCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCACAAGGTGC CGCTATGATGATGCCTCCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCAC AACCTTGCCAAGCTCCAGGGTGCCCTATGGGATGCCCGCAAACCATGGCT TCAGCTCCAACAATGTGTCCACAGCCCTGTCAACAACCAGGCTGTCCTTC TGGATGTCAAGAGTCGCCACGATTTTATTTCTCGCCAGAGAAGCTCCTTC AGCAAATGCCACCACCTCAGCCGATGATGTGTCCACAACCTTGTCAAGCT CCAGGTTGTCCAATGGGTTGCCCCATGACCATGGCTTCTATGCCTTCGAT GTGTCCACAGCCCTGTATGCCTCCATCTTGTCCAACTGGCTGTATGCAAG CCGCTCCAATGATGGCTGCTCCACAGATGTGTCCTCAACCTTGTCAAGCA CCTTCTTGTCCAATGGGATGCCCACAGACCATGGCTTCAGCTCCATCGAT GTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCCCAGG GTGTCGCTATGATGATGCCACCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGATGTGC CCACAACCCTGCCAAGCTCCAGGGTGCCCTATGGGATGCCCGCAGACCAT GGCTTCAGCTCCAACAATGTGCCCACAACCTTGCCAAGCTCCAGGGTGCC CTATGGGATGCCCGCAAACCATGGCTTCAGCTCCAACAATGTGTCCACAG CCCTGTCAACAACCAGGCTGTCCTTCTGGATGTCAAGAGTCGCCACGATT TTATTTCTCGCCAGAGAAGCTCCTTCAGCAAATGCCACCACCTCAGCCGA TGATGTGTCCACAACCTTGTCAAGCTCCAGGTTGTCCAATGGGTTGCCCC ATGACCATGGCTTCTATGCCTTCGATGTGTCCACAGCCCTGTATGCCTCC ATCTTGTCCAACTGGCTGTATGCAAGCCGCTCCAATGATGGCTGCTCCAC AGATGTGTCCTCAACCTTGTCAAGCACCTTCTTGTCCAATGGGATGCCCA CAGACCATGGCTTCAGCTCCATCGATGTGTCCAAGACCATGCATGCCACC ATCGTGCCCCTCAGGATGTGCCCAGGGTGTCGCTATGATGATGCCACCTC CCATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCACAACCCTGCCAAGCTCCAGGG TGCCCTATGGGATGCCCGCAGACCATGGCTTCAGCTCCAACAATGTGCCC TCAACCTTGTCAGGCACCTTCTTGTCCAATGGGATGCCCACAAACCATGG CTTCGGCACCATCAATGTGTCCAAGACCATGCATGCCTCCCTCATGCCCC ACGGGATGTGCACAGGGCGCGGCTATGATGATGCCTCCTCCCATGATGCC TGCACCTCAAATATGTGCCCTCAACCTTGTCAGGCACCTTCTTGTCCAAT GGGATGCCCACAAACCATGGCTTCGGCACCATCAATGTGTCCAAGACCAT GCATGCCTCCCTCATGCCCCACGGGATGTGCACAGGGCGCGGCTATGATG ATGCCTCCTCCCATGATGCCTGCACCTCAAATATGTGCCCAACCCTGCCA AGCTCCAGGGTGCCCTATGGGTTGCCCGCAAACCATGGCTTCCGCTCCAA CAATGTGTCCACAACCTTGTCAACCACCAGGCTGTCCATCTGGCTGTCAA GAATCTCCAAGGTTTTATTTTTCTCCAAGTAAACTTCAACAGCAGATGCC AGCACCTCAAGCACCGGCCTGTCCGTCTCCTTGTATCCCGCCATTTTGCC CTGCAAACTGTCTTATCCCATCATGTCCACAGCCATGTCAACCACCAAGT TGTCCAGCATACTGTCCTACCACAACTGCAATGACGCCATCCAGCTGTCC AACGCCTTGCCCGCCTCACATCTGTCCACAGGGGTGCACCGTAGTACAAT CGACCGTTAACATGTGTCCACAGCCTTGCATGCCGCCATCTTGTCCAGGT GGCTGCCCTCAAACAACGAACATTTATCCTCCAATGTGTCCACAGCCTTG CCAGGGTAATATTTGCCCAAGTGGATGTGCTGCACGTCAGAAGAAAGATA TAATTGAACGACAGAGAGGTTAAATGTGCCCAACCCTGCCAAGCTCCAGG GTGCCCTATGGGTTGCCCGCAAACCATGGCTTCCGCTCCAACAATGTGTC CACAACCTTGTCAACCACCAGGCTGTCCATCTGGCTGTCAAGAATCTCCA AGGTTTTATTTTTCTCCAAGTAAACTTCAACAGCAGATGCCAGCACCTCA AGCACCGGCCTGTCCGTCTCCTTGTATCCCGCCATTTTGCCCTGCAAACT GTCTTATCCCATCATGTCCACAGCCATGTCAACCACCAAGTTGTCCAGCA TACTGTCCTACCACAACTGCAATGACGCCATCCAGCTGTCCAACGCCTTG CCCGCCTCACATCTGTCCACAGGGGTGCACCGTAGTACAATCGACCGTTA ACATGTGTCCACAGCCTTGCATGCCGCCATCTTGTCCAGGTGGCTGCCCT CAAACAACGAACATTTATCCTCCAATGTGTCCACAGCCTTGCCAGGGTAA TATTTGCCCAAGTGGATGTGCTGCACGTCAGAAGAAAGATATAATTGAAC GACAGAGAGGTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000002_pilon | genome | sc0000002_pilon:3142049..3145664 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 2143-2682:541 |
| Aaloc | 1972-2139:878 |
| Aaloc | 1396-1971:2054 |
| Aaloc | 1-1395:3617 |
|