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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000348_pilon:221955..230154- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_043881 ID=XLOC_043881|Name=XLOC_043881|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8200bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000348_pilon:221955..230154- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGAAAATAATGATCCCAAGTTTCTACTCGTCACCGCGAACGTGGGTTC
ACTCTTCGAGGAGGTAGGGCTATACACAATTTTTCATTTAGTTTCCAATC
ATTAAAATGTATTAATGATTAGTTTCGACTTTTTTGCTTTCATACATAAT
TAGTTATGTCCACCTTTTTCATGAGCTATTGTTAGGCTTTTCCAAAAAAA
GATTTCACCAACTTAATGATATTTTTGAAGTTTCGTTTGTACAGTTTGCA
GCACTTTTTAATTAAAAATAGCTGCTTTATGGCTTTAGTGGACAGGAAGT
GTGCAATAGTCTGATAGTAAACAGTATTGAATGTAAGGAGCTGCTATATC
ATATCAATTGACAAGAACCTATTTTTGATTTAGTATTTGCACCTTCCACA
TTATTGTGCTACTCAATTTTAAATGATTTCTAATAGCCCGTGTTTGGTTT
TGCTTTGGAAGGAGGAGGGGAACAACATATTTATTTCGTTGTTTGTACAT
TTAGGTAGTAGCAAGTATATGTTGGTGACTAAAATAGACCTTTTGCTAGT
ATTTGTGATGTCAAGTTAAAAAGTTAAAAACTCCTGTTTTGATACTTGAC
TCGACTGGAGTTTTTATTTTTTAACTTATACAAAATGACATTGGATAGCA
AAAGGTCTATGCTATCCTTGATTTGCTTAGTTGTTGTCATTTTCTGTAAA
AATTTCTTCTTCTTCTAACATTTCAGTATGGAGAAGAGCTGCGTGCAAAT
TGGATATCTGCATTCCATAAGGTATTATTGTTTTCATTACTGCAAGATCT
TTTCGAGCTACAAAATAGGATAAAATTCCAGCCCTCAAAGATCCTGTTAG
TTGAATATAGTAATCCTGCATTTTTTATCCCTTTTCTCTGAAAAGAGTGT
GTCAGATAAAAATTTAAAATTAGAATTATATAGAAGGTTAAAAAATCACT
GATTAAAACATATTTTAGGTTTTAATTCTGAATCATTCAAAATTCTTTCT
AACAAAATAGAGGGCTTTTAAAATATTGGGATTAAAACTTATCAGTATCA
TCTATTTCTGTTTCTGTTTCATGATATGATAATTCACAGGAGGTTTGCAA
AACCTATTCTCACAAATAAAGGGATAGCCTTGATCCTATAATATGAAACA
TGAATTATAATATTTAGGATTTTGAAAATAATAGTTGTGACTATGTAACT
AAATTCATCATAATCTTTTCATTCTCATTATATAGCTAATTTCAGAAAAC
GAGCCTGCTCTGATTGCTCTTCATTTACAAGAAGTTGGAGGGAAAAGTCA
TGATGTTTCTCAAGATATTGTCAAAAACTTTTTCCAGTTAGTTTTAATTG
ATGCATTTTATAAATCACTTGAAAAATTATATTCACTAAATCTCTACAAA
AAAGTTGAATAAAAAGTACATACACCATACACCCTACCCCCTTGATATTT
AATTGTCATTTTTCAACTTGAAATGAACTCTATGTATCTCTATCTCTCTC
TAAAATTAAGAATTTGCATATTGCATGCTTATAACTCAAACTCAATGTTA
AAGGTTTATTGTAAATTGGTGGTCTACAATCCCAATCTAATTCTGTCACT
CTTCTTTAGAGATAGAAGGTTAGAATCACTGATTGAAAAAATTTTCTTTT
CTTAGCAGCCTACTGTATAGGAAAAATCTTTTCAAATCAGGGATCCCCAT
CCTAACTTTTTATATCTTTCTCATCCCTAAAGAAGGATGTCAGAAAAAGA
AAAGGAGTTGTGCTGATAAGATCAACTTACACAGTACCCTTTAAATGTGA
CAACTTTGTATGACTGAGTCTATTTTTTTTATGTATAAATAATAACTTTT
CTTTTGCCAAACAGGGATTTATATGAGCCAGAATATTTCGATGATTATTA
CAGTGTCCAAAGTTTTGTAGATGAAGAATATGTTGATGTCAAATACACTG
TAAGATTTTTTGATTTGTTTTTATCGAATTTGTTTTATATTAATATTTGA
ACAAAATGAAATTTAATTTTATTACTGAGAAACTCTTTAGCCCTAACCAT
CAAGCAGAGTCTCACACCTTAGAGTCTTTTTTTCTCGGGAGATTTCAGCG
AATGACCACACATTTGGCATTGATTCCTTTAAAAGAGATTATTTCCCATT
ATGAAATTTTTAAGTACAGACATAACAATAAATATTATATTAAATCATTT
TTTTTTCAATTCATTGAAACAGCTTTTTTTAAGTCAATTTTCTTGCCATA
CTGGTCAAACACTAGGAAAGCCAACCTTTTAGATCATTTTTAAGCTTCAA
GGGAATCAAATTTTAGAGTAAAGAATGCAGTTTTCAAGGGTCAATCACTT
TAAGAGTGTTCCTCTTAAAACATAGTATTATTTTCTCACGTAAGATATAT
TTGATCTACAGGCAATGGGATGTTCTTATTTCATTCATAAATCCTTGAAA
GGACACCTTCAACAATGGAATTTTCACGGTATGTTTATCTTTCAATTGAT
TTGTAAACAATATATGATGCAAGCTTAACATTGGATTGCTTTCCCTTGTC
AAACAAATTAATCAACTGTTTGTTTTGTTACGCTTTTCTACTACTACTGT
GTTTACCTTTATCAAAACCCTGGAATAGTTTTTATCAGAACTCTGGAATA
GTTTTAACCTCAGGCTTATTTTACAACTAAGTGATAGTTCTATTACCCAA
TGGAGGTGCTATTTAAGCAAAATGAATTTTCATTAAAAATTTCATTGTAA
TGATAGCAGGTGAATCAGTTTTACCCACTATTCTTTTCACAGAAATTAAT
AAAATGTTCTAAACACTGTTACTGTGCCTTTTATGTCATTTAAAAGAAAA
CTAAAATAGGTTATTTATCAATCAAACAATCTTTTATTTTAGATTGATTG
TATTTTCCTTCATAACAAAACTTGTCTAGGGTCATAGTGAAAAATGAGCC
AACACAAATATTAAAATGAGATCTTTTTTGTGTATAACCTAAAGATTCCA
TCAATGAAGGTTTTTTTGCCAAAGAACTAGCAAAATCAATTTTGGTTTTA
TACTCAAACAACTCTATCTTTGAATAACATGCTTATAAATGAAATAAAAT
AAATCCTTCAAGTCCTATGAGAAAATTATTGGGTAAAAAGGTTGATAAGA
AACTCACACTTTAAATTTTGAATTATTTTTATTCTTCTATAGGGGTAATT
TCTTGTTCGTTAATATGAGATCATTTAAACATGATCACATTTCCAGCCCT
GTGAATTCAGACAAAGTCATATCGGCACGCAAGTGCCGACCAAAACGGGC
CGTAAGCCGGCAAAATTTTGCCGACCTAGAGGTCATTTTAGGTCGGCAAA
GCCGTCCTAAGTAGCTTGTTTAGGTCGGCAAAGACGAACTAACAAATTCA
GCTGCTCTATAATTGTGTTAATAAGTTTTATGTTTTATAAAGAGAATGGA
ATAAGGCTCGATTATCATGTGTTATCAAATGATAACACAATTTTAGATTA
ACCTAACAAATAATATTTTTCCTCATCGGCTTTGCCGACCCAAAACATTT
CTTTTGTCGGCACGCCTACCTAGAGTGTAAATTACGTCGGCAATTTAAAG
CCGACTTCAGCTCAAGTTACGTCGGCTTGCATGTCGGCATTGCCAAATGC
CGACCTGGATTCACAGGGCTGCATTTCTGCCTTTGCACTGTCAGAGTTTC
TTTGTGTGGTTGAGTGTTTTTATGTTCTAAATCGTCATTTACCAGGCAAA
ATTCCAAGCATTAGTCACTGGCCGTTTTTTGGATTAGAAATTGAGTTTTG
ACCGATTGTAACCACCATAAGTGGTCGATGCTTGTCAAAGGCCCTCGAAA
CATGTTAGGGATGTCTCTTAACCTTTCGTGAAATATTTATTTTCAAGGAA
TTTTAATCATAAAGAGAATTTAGAAATAAAGGAGTTTTAATCATGAAGGG
AAAATAATTCTGTCATTGTTCACCATCTACATATTATTTTCAACATTTTT
GTGATACAAAGACAAAAATAGAATTCTTCAAATATTGATTTTCAAAACTC
AATTGAGTATTTTGGCCATTAAACGGCCACAAAAAAGTGCTTGGAATTTT
CACTGTTTACCAATATATATGTAGGCAAAATGTTTTTTTAAGCTCCCTGT
TCCTTTTAGAGAAACGTTTTGTGGTTGCTGCTGAGGGAAGAGAAATAAAC
CAAATCACTTCAGATACGCTATTTTTACAGAAATACAAATTCCCATTATC
CTGTTATTCAAAAGTAAGTCTTTCTGTCTCTTTTACTAACAGAAAGTTAT
ATTTTAAAGTACACTTTCATTGAATTTTCAGATCTTTTAAATTTTGAATT
TGTATTTGCTGAAGAAACAGCATGAGAAATAAAAAAAAAAATTATTTTTC
AGAGCAGCATCAAATTCAATGTTTTTGGATGTATTTTGTAATGTTTTCCC
CGCCAATTTCTTTATTCAAATTGGTATCACGTCTTATGTCTATTGAGTTA
GAAAGACTTTTATACCTTCTACTTTTAAAGAGTTTTCTGTGCTTAACTTG
TCTCTTTATTGTTTTTTAGAATCAAACTAGACTTCCAAGGAAAGGATTCA
CATGTAGCAAATGGAGGCTATTTAACAAAGTTTTTGTGCTTTTGAACATT
CATTTAACTCATGATGCCTGCAATATTGAAATTACAAGACAGGTAAAACA
GGGGAACTATTTTCTTTGTCATTTGAGAAACCTTTCAAAACTATATTTTC
TCTTTCTACTTTTTGGATTAAGTTTTGATACAAGTTGTAAGATTCTTTAT
ACTAATTGTAAAATTTAATAAGATTAGAAAAAATTATTATTTATGACAAG
TTTTAATAGCATTGCATTATAGAAATGAATTTATCTCAAGCCATTTTAAG
TTTTGATTTTTTTGTTACAGTCACCAACCAAATATTCAGGATACAGGAGG
AGGTCACTTGAATACATGCTTGACAGGTATGACATAGAACTCTTGTAATT
ATGTAACTGAGATTGAGAATTGATCAATAAATTTTTTTACTGAACACCAT
GGTTATCCTCAGGGTTTCTGCCGGATCTGAAAAACATTGAAAATCCATTA
AATTTTGTTAAAAAAGGGAAAAACCCTTGAAAAAATATGACTCAAAAACA
TTGAAAATTCACTAAATTTGGTAAAAAAGCCTTGAAAATGGGGAAAAATT
CTGCCGATTCTGGATACCTGTTTCGTTCGTTTCATTCTGGGAATCTTTTA
TTCTAGTTTCTTTTATGCTTGAGATATTAAATGGGTTAAACAAGTATAGT
TGATTATAATATCTTAGATACACACGTTCTTTTGATTTTCATTTCTTCAT
TTTCAGACTGAAAACATTACAGAGTGACCATCAGATGATGTTTGGTGATT
TCAATGTTCGGCCGGATACAAAAGCTCTTTTAGAGGTTTGTTAAAATGAA
ATTTTGAACTTTAGTAGGTGATGTCATGAATGGCTGGGTGATCATTATGT
TATGTAGATTATGTTTTAGCTTCTAGACATTCACCAGTTCGTCTTCTTAT
CTATTCATCTTTTTTTTCGCTTATATAAAGCAGTGGAAATTATTGCCTTT
TTTTTAAATGTGCATGTAAAAACTTATGAATACTGAAATCCCATTAATTT
TTGCCGCCTGTTTTTGTACACTAGGTTTCACAAAAATTATAAGGTGTGCG
AATTAGTAATCGTAATAAATGTGTAGAAATCTCTTCTAAGGGCTCTTTTT
AAGGGATGTAAGTGGGTGGGATGTACGATCCAGCTAGTATGCTGGTATTT
GTGTCTTTTTTGCCCTCTTTACCTATGTTTTTTTCAAAAACACTCAAAAA
ATGGCCCCGAAATTGCAAGATGCGCCAAAATCAATAGAATTATAGGTATG
CGTTTTTAGATATTTTTCCGAATTAGGCACAAAATTTATCAGCCATCTCC
TCCATTTTCCTAGTATTTGATGGACAGTAAAGCAGTGCGCCATACATTGG
GTGCTGAGAGTGAAGATGCCAAACCACATACTGTCATTTATAGAAGTTGC
AATGGATCTACTAAGGTATCTTTTCAAGTACAGTGGACTCTCTCTAATTC
GATATTCAAGGGACCAGAATGTTTTTCAAATTTTAAAGCCTAAGTTTAAA
AAATATGCAAAATGATTTTCTCCATTTGTAGACTCCGAGAATAAAATTTC
AGGATATCTGTTTTTACTGGTTTTGAGATCAACTGACTGTATGTTATACC
ATCAACAATTTTGTGTTATTTAGGATCTGTTGAGAATCAAGGAGCGATTA
TTCGAGTTCAGTGATTACGAAGCTTTCGATGGATCTCATCAAACGGAAAT
CTTAAAGTTTGATAAAGAGCTGGATTGGCTATTAAACGATAAATTTGCCG
AATTACCGATCAGTTTTCGTCCAACGTAAGTGTATTAGTAATATTATTTT
ATGGAGGTTTTCTTTGAAGAACATAAGAACAGAATATTAAGAACATCGAC
AGGCTTCAAAAAAATTGGATGTTTTTATTAAAAAAAATGTGGTTTCTTCC
TCGTTTTTTGGGCTTTTTGTTTTTCTCGCTTTTTGCATTTCTCGTGAATG
AAGAATTCGTTCACTAAATTTCCCTGTCCATACATTTTGTCTGATATTAT
CTGTAAAGATTCATTTTGGCTTAATTTATTCAAATCATCAATTAATTATA
CTGATTAATATAAAGATTTTACTTTCCTTTTACTTTTCCCCATAATAGTT
ATCCTCACAAGGAAAACCCGAAAGATATTGGAACATATTCCTTCGCTAAC
GTCAGGTAAAAAAAATATGTTTGAGAAAAATTCATTTGTGAGAAATTTTC
CGCGATTATAAGACGGGTTTTTCGTTCGAGCACATATGTGTGTCGGCTAC
ATGAAAAATATAAAGATAAGTAATATTTTAAAAGAGAGAAACAGTTTCAA
TCAATCAGAAAAGGAAAATATCCATATTGAAAAAAAACTGTCATAAACTT
CACCAAAAAGGAAATTATTTTTATCAAATTTCTTCCCACTTCAAGTTTTC
TCACATGCATCAATATTTTTCCAAAGCCTTTGACCATGAAAGATTCATAG
AAAATGCATCAAAGCAAACACTATTTTTTGTAAAAAAACAAAAAATTGTA
AAAGCAGCAAATAGACAAAACAAAAATAAAGCAATTGTTTCTGGTGAAAT
CTCTGTCATCTTTACGTGACTTCATCGCAGCTTTCAGACTTAGCTGAATT
CATATTCATCGCTTTTTCATGACAATTTTTCGTTGATTACAGTACTCTAT
ATTATCATTACATTTTCTTTGTGTATGAGAAAGAAATCTTCTTTTGTAGA
TGTCCTTCATGGTGCGACAGGATACTTATTGATCAAGAACTAGACAATCA
ACTATCTGTGAGTTTTATGTTTTTTTAAGTCTCAATAAGGGTACGAGTTC
GACAGCGTGACGTTATTAGCCCGTTTTTTCCGTTGGTTTTTCGGTGCTTG
AAGAAAATAGTGCTCAAACATGCCATATGGTGATATGATATGGATTTTAG
TAATTTTTACTGTAGGTGTTGACCTAAGAAAACCTAACCTAAGAAAATGC
GTCGGTATTCGATTTTCACGCCCCCTCCAATAATACCTTAGTACTTCCGT
TTCTATAAATTCATTACATAGTGTTTATGTTTGCAAACACATTGTTTTAA
TGTGGGGTTTTCATATCGATTTCGCATCCCTAAAAGATCACAGTTTTGGA
AGCTCAAACACTATGTCCATCATGTTGTGAATGGTTTATTAAAAATCACT
GAACAAATTTAATGAATAATGATTAAATTCGGGAAGAATATCCGAAAAGA
AATCATTTGAAAAAGTTTCAAATCTTTGACTTGTCGACTACTCTTTTCAT
CGATAGAAATCTACAATGGTTTACGACACGTTTGGTGAAGATGTTGCATT
GGGCGATCATAAGGTATGTTTGATTATGGATTTCTTTTCATTGCTATTTA
TTCCTTCGATTTTACGTTGAAGTAATCAATTTCGCTGTAAAAAGGCGAAA
AAGGTTAAATTTTTCTTTTTGACCCCTAGCCCAATTTATTACACATCTTG
TTTACGCTTTGTGTGTTTACTTTTAAACTCTTTTTTCTCTTTATTTTAGC
CTGTGTTCTTGGCGTTACATTTCACTTCTGGTTTGCAGGCAAACCATTGA
Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000348_pilon:221955..230154- >XLOC_043881 ID=XLOC_043881|Name=XLOC_043881|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2400bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000348_pilon:221955..230154- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGAAAATAATGATCCCAAGTTTCTACTCGTCACCGCGAACGTGGGTTC ACTCTTCGAGGAGATGGAAAATAATGATCCCAAGTTTCTACTCGTCACCG CGAACGTGGGTTCACTCTTCGAGGAGTATGGAGAAGAGCTGCGTGCAAAT TGGATATCTGCATTCCATAAGTATGGAGAAGAGCTGCGTGCAAATTGGAT ATCTGCATTCCATAAGCTAATTTCAGAAAACGAGCCTGCTCTGATTGCTC TTCATTTACAAGAAGTTGGAGGGAAAAGTCATGATGTTTCTCAAGATATT GTCAAAAACTTTTTCCACTAATTTCAGAAAACGAGCCTGCTCTGATTGCT CTTCATTTACAAGAAGTTGGAGGGAAAAGTCATGATGTTTCTCAAGATAT TGTCAAAAACTTTTTCCAGGATTTATATGAGCCAGAATATTTCGATGATT ATTACAGTGTCCAAAGTTTTGTAGATGAAGAATATGTTGATGTCAAATAC ACTGGATTTATATGAGCCAGAATATTTCGATGATTATTACAGTGTCCAAA GTTTTGTAGATGAAGAATATGTTGATGTCAAATACACTGCAATGGGATGT TCTTATTTCATTCATAAATCCTTGAAAGGACACCTTCAACAATGGAATTT TCACGGCAATGGGATGTTCTTATTTCATTCATAAATCCTTGAAAGGACAC CTTCAACAATGGAATTTTCACGAGAAACGTTTTGTGGTTGCTGCTGAGGG AAGAGAAATAAACCAAATCACTTCAGATACGCTATTTTTACAGAAATACA AATTCCCATTATCCTGTTATTCAAAAAGAAACGTTTTGTGGTTGCTGCTG AGGGAAGAGAAATAAACCAAATCACTTCAGATACGCTATTTTTACAGAAA TACAAATTCCCATTATCCTGTTATTCAAAAAATCAAACTAGACTTCCAAG GAAAGGATTCACATGTAGCAAATGGAGGCTATTTAACAAAGTTTTTGTGC TTTTGAACATTCATTTAACTCATGATGCCTGCAATATTGAAATTACAAGA CAGAATCAAACTAGACTTCCAAGGAAAGGATTCACATGTAGCAAATGGAG GCTATTTAACAAAGTTTTTGTGCTTTTGAACATTCATTTAACTCATGATG CCTGCAATATTGAAATTACAAGACAGTCACCAACCAAATATTCAGGATAC AGGAGGAGGTCACTTGAATACATGCTTGACAGTCACCAACCAAATATTCA GGATACAGGAGGAGGTCACTTGAATACATGCTTGACAGACTGAAAACATT ACAGAGTGACCATCAGATGATGTTTGGTGATTTCAATGTTCGGCCGGATA CAAAAGCTCTTTTAGAGACTGAAAACATTACAGAGTGACCATCAGATGAT GTTTGGTGATTTCAATGTTCGGCCGGATACAAAAGCTCTTTTAGAGTATT TGATGGACAGTAAAGCAGTGCGCCATACATTGGGTGCTGAGAGTGAAGAT GCCAAACCACATACTGTCATTTATAGAAGTTGCAATGGATCTACTAAGTA TTTGATGGACAGTAAAGCAGTGCGCCATACATTGGGTGCTGAGAGTGAAG ATGCCAAACCACATACTGTCATTTATAGAAGTTGCAATGGATCTACTAAG GATCTGTTGAGAATCAAGGAGCGATTATTCGAGTTCAGTGATTACGAAGC TTTCGATGGATCTCATCAAACGGAAATCTTAAAGTTTGATAAAGAGCTGG ATTGGCTATTAAACGATAAATTTGCCGAATTACCGATCAGTTTTCGTCCA ACGATCTGTTGAGAATCAAGGAGCGATTATTCGAGTTCAGTGATTACGAA GCTTTCGATGGATCTCATCAAACGGAAATCTTAAAGTTTGATAAAGAGCT GGATTGGCTATTAAACGATAAATTTGCCGAATTACCGATCAGTTTTCGTC CAACTTATCCTCACAAGGAAAACCCGAAAGATATTGGAACATATTCCTTC GCTAACGTCAGTTATCCTCACAAGGAAAACCCGAAAGATATTGGAACATA TTCCTTCGCTAACGTCAGATGTCCTTCATGGTGCGACAGGATACTTATTG ATCAAGAACTAGACAATCAACTATCTATGTCCTTCATGGTGCGACAGGAT ACTTATTGATCAAGAACTAGACAATCAACTATCTAAATCTACAATGGTTT ACGACACGTTTGGTGAAGATGTTGCATTGGGCGATCATAAGAAATCTACA ATGGTTTACGACACGTTTGGTGAAGATGTTGCATTGGGCGATCATAAGCC TGTGTTCTTGGCGTTACATTTCACTTCTGGTTTGCAGGCAAACCATTGAC CTGTGTTCTTGGCGTTACATTTCACTTCTGGTTTGCAGGCAAACCATTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000348_pilon | genome | sc0000348_pilon:221955..230154 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1150-1200:52 |
| Aaloc | 1093-1149:295 |
| Aaloc | 1036-1092:851 |
| Aaloc | 979-1032:1452 |
| Aaloc | 826-975:1928 |
| Aaloc | 724-825:2238 |
| Aaloc | 646-723:2844 |
| Aaloc | 589-642:3281 |
| Aaloc | 466-588:3632 |
| Aaloc | 364-465:4040 |
| Aaloc | 295-360:5790 |
| Aaloc | 211-294:6336 |
| Aaloc | 109-207:6966 |
| Aaloc | 64-108:7475 |
| Aaloc | 1-63:8201 |
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