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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000256_pilon:112968..119441+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_043774 ID=XLOC_043774|Name=XLOC_043774|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6474bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000256_pilon:112968..119441+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
caacaaaaatacaaaaaaaaatacaaaaataattcttcTCCTACGACAAG
AATCATAACATCGACAATGGCAGACTTGGTGACTTCTGGACAAATCGTGT
TGTTGGTATGGGGTGCATCTCCACCACCATCAAACATGGAGAACTATGTC
AACGAATTGAGAACAAAGACTGGTGCAGATGGTTTCGTCCAAGTGGAGAA
CGCTGAAATGCTCCTGCAATGTAAACTTGATAATTTGTTTTATCTATCTA
ATCGAAATCTTGTCAGCAAAATTGCTCAGGATCCcgatttgttcttttaa
acTCAAAGACTTAAATATACATGGCTCTTATATTCAGAATTAAACATTTA
TTTGTCAACAAGTAAACAAATACATTACTGTCAGTTTCACCGTAATGACA
GTAATGTATTTCTTTACTTGTTGACAAATAAATGTTTGATTCTAAATCAG
CTCTActtggtatagagcactttgcACTACAAAGATTACCTTCATGTTTC
TGGCTTTCATATTCATAAATTTAAAACTGTTCTTTCgcttaaaatataaa
atttttataGCCATAAATTGTTGTTTCAAGTGAAAGTCACAACAAATTGC
TGTCTTAGTATTCAAATATTCACCCATGTTGGAATTGAAACAATCGAATG
AAACCTTTGAAACTTTGTTTCATTCGTCGATAAAGTGATCAACAATTTTT
ATTTATCCTTTTTCCTTTACAGCAAAACATGACAAATCCAAATTCGATGC
TGTTTTATCAGGGACCATTTCACCAGAAGCAGGCTTCCAACATTCTGATG
AAATCTTAGccgaaattcttaaaacattgAAACCGAATGGACAATTATTC
ATAAATGATGGGAAAGGTTTGACAGAAGGAGTTTGAATAAATTTTCGTCT
GTTTTCCGTTTTAATCCACGTCTTTAAACTTGTTTTTACCTCTTTGATAT
ATCAGCTTCTTTAACCATAGTCATGTATCCTCAActtgttcatttttcaa
aaataataattttttgagcGTGtttttttGATGGGGACGAGATTTTGCAT
CTCAAACAATATTGATTAGAACAATTTTAGCCGATTAGACTTCTGGAACC
CTCAGATTTTGTTGATCAAACTTATTTGGCCTATGCATGATGCAAATGAT
ACTGGAGTTGAGCCCAGTACGGTTCGCACGTTCGACTGTTAAGAATAGCA
CTGCCTTaatattgacaacaaaaatTCTATTCAACTCAACCTTTTTCCct
ataaaaacataaacaaaattacataaaacaaaaTGATTGTGTTACTTAGC
TGTTAGAAGTAAATTCTTCCAGTGTTTTTATACGTATTTTTTCTTTCTAT
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GGCTATACTACCATACAAATTGtattcttgtttttttatattagcgtgat
tatgtatcggagatattctacggctacggttgcggggctgcccatacggg
tcgtcaccaaaggcgacatgtcgttgtctactttgctctgtacgggaaaa
acaccaaaacaccgtctaagcaaagtcgacataatgccgtacgtcaaata
tcgaacttgctttcacccgccattacttgccttactcgccatttccctcg
ccactttagccgtagccgtagagaattccagatacataatctcgctatta
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CGATATAACTTTttatcgtcaacatgaaaaatatgagaatCTAACTGGCT
AATAGAGAAGCGATGTTTCCCGTATTTCAACAAAGGCTCGGAAAAAATta
gaactcgaaaaatatatcccatattattatatacctgtaggcaaaaacag
ccattgaataattcctgatataccatggctattataccacggtagaattt
tttttcacattttgcattcaaagtttgatttttttgtcgctcttgttgtt
atcaaagaaattcattaaaaaaaatctattgtGAATTTCATGAAcaattt
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Taatgttttttggtttttgcctctaggtatataataaaacatatattcaa
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actcggctcCGCCTcattgaatattacatcacctcgggttaataaatctc
aataaccaacttttacccattgaatatctgcttattgtACTCTGTATTGT
CCTTGCAATAACTATTACATATAATTTGAGTTTACAAAATATATCATTGT
CCAAAGTTTATTTATTGGATCGTTTGATATCAACTCTCATTGTGTATTTT
GTATAAATCAAAAACGTAAAATCACATTTTCTTCTAACAATATTTCGATC
TTTGCAGAACtttatcaagttttttttttgattcattGATCCACGTAAAT
CTTTGTCTTTTAATGTTCGATCTATATTTTGTATACTTACTTTCCAGAAA
GAAAACTCAACATCGTCAGATTATCAGGTACTTCATTGTGGagaatcatt
ttttgaaattattttttacttctaGGAAGTATTCTCTATTTTCCAATaag
gttaaaaaaaataattctttcaaaaattacaaaataccaactttaaccct
ttaactgccgttcgtgttttttaaggttcgacctatttgccacggaaaaa
aaagaaggttcgacctattcgCCAGATATCGGCATATGTCGACAAAAGCA
GCCACAGAGATTACCATCACattttagctttattttctgaaaaatataag
aaataaaagtgatataTGTTTACTttaagtgaaatatttccatattgtac
gagcaaatgtctgataactggtttatcggtgacccaaaaaatgcactttt
tgtgttggagggcacttttgtagcaaagtgacgttagattgcttctaccg
ctacaatgcaacaacatcttttcgtcaatttatattttgtacatgtaaaa
tacaagatatattgtactctttttaaccaatcagattgcagatatttttt
ggattgcCGATaagtataattatgaaaaacatctttgaaacatattttaa
ttattcaaactGTGCTATTTAATGAAATCTAGTTCAAAATCAAACTACCA
ATGAACTTAAAGAAAAAACCTCTGGCAAATAAGTCGGGATCTCTCAGCGG
CACTGAAAGGGTTAAAGATGgtttaaaacagttttttgagTGTTAGATTT
TCTTCGAAACTTTGTAAGCTTTAAAAATATATTCTCTTTTTCACAGATCA
AATGTCAGAAACCAAATTTCGAAGTTGGAAAATCAAACAAACTCTCATTT
GCTaaaaaaaGTATGAACATACacatttcttataagaaaaaactatgtaa
gaacaaaggcttcgatagccgaaatatcaagaataagataagaacaattt
aaggctttttGGACACTAAAACACCCAGTTTGttagtaaaataacaaaag
cactgaaaataagaacatgttaagaacatttttaagccttATAACTCAAA
ATATTAATTAATGTTAAAGTTTTCCTCGAAAGGAAATTGAACCTTTTTTG
AATCCGTCCTCCTTCTTCTTAAGGATCTCCAACTAAAAGGTGTTAAACTT
TTCTAATCCTAATAGGATCAGATGAAGCTGATTCAGTCCTCCTAAAGCTA
GACAGGATACCCgttctgtatttttataatctgatgtatacaggacgggt
atgacctgtgaggcagatttctgcctcaaaaactTGACAGTggaaaattc
gaatttagcgctgtcctcacttactaaaataaaaaccaaatttcggaagt
tgcgctctctctaagaaagtgtgaccagtaaaagaataacaaaatttgat
tggctatgttttcaaccgttattaggatctgggaaattcaaactctcagc
ccattccatgctatatatttcgccatcagcatatagaataagaaatcata
gcatggatctgcAGGCTATCCTAAAGCAGAATGAAACCaattattcttca
ttttttgcacttttcagctcaaaacaAAGATGTTGTCAGCATATGGACGT
TATCAGCAAACgatacaaatgatgaaaatgtggtaaataaaaaatcattt
ggTATTGTTCATAATTGATAGATTGATTCAGTTGTTTCTCATTTGCATAC
TTTAGATTAGATCAAAGGTACTCTTTGAAGCCCAAGAGCCTGTAAGAACT
TAGGCTACGTCGTATCTATCTCGTTCCCAGCGTAAAACTCTTActagagt
aaggcctaaaagcctgaatctttcttttttgtagACTAGTTTAGAACCCA
GGTATCAAATGAGTGTAAAGATAGCTTTGTAGATCTACATTGTCCACTCG
ATCTGAGCCAAGTTCAGCCTACCCTTAACAGTGCAGATCATAGCATAAAA
GGAGAGCATAGCATAAAGGTTCAACTTCCAGCCCGGTTTTATCATAGACT
CATAAAGATAATTTTAAAGCCTCCTTTCTGGTTGATATGAGTAagcaagt
aagtaagtaagtctgcgaccgcagtcggaggcgacccgaaggcttctctt
tcgatagctgtccacccgaaggtaggagagggcgccactttttctccctg
gatttctccacttactcttgatccttctcttaattgctgagaatcaagca
gagaggcatcaagtaccattttgagaatctttggttgaacccacaacctt
gtgaaccggatgctctaccaccggttgaaatgtttttttatgatcTTCAT
TCATAGGCAATCATTGATTCTGACGCACTGTTAGACGAGAACGATTTGAA
AAAACCTGATCTTTCTGGAATCATAAGTATACAacttgaaaatacttttt
tcaaccaaacaccagcttgcacacaacgttattttaacgtttatctaacg
ttcacaacgtccatacaaCGTCAGATTAACGTTGTGTCCCAGCTGGGACA
GGATTGATACAATCAAACACTTTTTCCTCGTTCTGTAAAAATTGCAATCT
TTTGAAAATCGCTATTTGAATTCCAAAAAACAcagatttcaattttcttt
tcgtttCAATCTTTGTCTTTGTAATTGTTTGTCATATTGTCGAAAATTTT
TAACTACTTAAATACTGTTTCCTTCTTTCCTAGCTGATTGTGGTACAAGC
AAATCTGGTAAACGAAAAGCTTGCAAAGGATGGTATGTACGGATTTTTGA
ATTAGCACCTGTTGTAAGCTTTTAATACGAGGCATTCTAATTTTCCATTA
TATAATTAACAAAttctttttacaaataaaaatcaTCAATTAAAACATGG
AATTTAAAGTGTTGATAATTAATTATCTGTCGGAGCACTCTTTATTGTGG
TATAAGAAATTATTAAGCAATATTAAGACATGTTTAATTTTTATGTAGCT
GTGCAGCACATGTTTGGCTAAGTTatgtaatttccgccattatggtaGCA
AGCGTTCGATTCGCGTAAAGGAAtcgcctctacagattcgaatgCGTGTT
TCAGTTTTCGTGGTGGAAATTACGTAacctaaaaaacaaaacataagtCT
CGACACCTCTTTTTTGTGCTAGTTCTACTCCGACTCTACTAATGGAAGAG
AGTACTTTTTGTTTGAGTGAAAAATCTGTAAGAGCATGTAATGGCTTGTC
AGCAAAATGTACAAAGGCTCTAGCTTGTGGAGACCTTGGCttaaattttc
agccttaaagttgccaaaatgatgttttttctCTGAAAAGATACCCATGA
AGAAGTAGGATATCCTACTTAAGAGTAGTTTTCAAAAACTACTTCATTCT
CcattattttccaaaaactatttaattcttcattatttttcagCTCTTGT
GGGTTAAAAGAAGAATTATCCGGTGAAGCTGCACCTGCCGTCAAATCTGC
TTGTGGAAGTGTAAGGAAAAATATAATGTAGGCGGTTTCTACGTGACAGA
GAGCTAACCTAATCTAAAGTTAAACTATTTCAAACTTCGTAGAAGGGCAA
TATCGACTTAAAAGTCtttgtctttttatattgttttttttgagagcttt
ggtataatttttttttataaaagatgtCACAGGTCTTAAGGGTTTGCCCC
TGCtattaagaaataaataacgagattgccaATTATTATCTTGAATGATC
ATTACATCCAGACTAATCTACTCTTCCTACCATTATATATCCATTTTTAT
GTTTTAGTGTTACCTTGGAGACGCATTCCGTTGTGCAAGCTGTCCGTATC
TTGGCATGCCTCCTTTCAAATCTGGTGAACAAATTACGTTATCTGATCGC
CAGTTGCAGCCGGATGTTTATTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000256_pilon:112968..119441+ >XLOC_043774 ID=XLOC_043774|Name=XLOC_043774|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1776bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000256_pilon:112968..119441+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
caacaaaaatacaaaaaaaaatacaaaaataattcttcTCCTACGACAAG
AATCATAACATCGACAATGGCAGACTTGGTGACTTCTGGACAAATCGTGT
TGTTGGTATGGGGTGCATCTCCACCACCATCAAACATGGAGAACTATGTC
AACGAATTGAGAACAAAGACTGGTGCAGATGGTTTCGTCCAAGTGGAGAA
CGCTGAAATGCTCCTGCAATcaacaaaaatacaaaaaaaaatacaaaaat
aattcttcTCCTACGACAAGAATCATAACATCGACAATGGCAGACTTGGT
GACTTCTGGACAAATCGTGTTGTTGGTATGGGGTGCATCTCCACCACCAT
CAAACATGGAGAACTATGTCAACGAATTGAGAACAAAGACTGGTGCAGAT
GGTTTCGTCCAAGTGGAGAACGCTGAAATGCTCCTGCAATCAAAACATGA
CAAATCCAAATTCGATGCTGTTTTATCAGGGACCATTTCACCAGAAGCAG
GCTTCCAACATTCTGATGAAATCTTAGccgaaattcttaaaacattgAAA
CCGAATGGACAATTATTCATAAATGATGGGAAAGCAAAACATGACAAATC
CAAATTCGATGCTGTTTTATCAGGGACCATTTCACCAGAAGCAGGCTTCC
AACATTCTGATGAAATCTTAGccgaaattcttaaaacattgAAACCGAAT
GGACAATTATTCATAAATGATGGGAAAGATCGGCCGTTGGATAAATTGAA
GTCCACTCTCACGATGACCGGCTATACTACCATACAAATTATCGGCCGTT
GGATAAATTGAAGTCCACTCTCACGATGACCGGCTATACTACCATACAAA
TTAAAGAAAACTCAACATCGTCAGATTATCAGAAAGAAAACTCAACATCG
TCAGATTATCAGATCAAATGTCAGAAACCAAATTTCGAAGTTGGAAAATC
AAACAAACTCTCATTTGCTaaaaaaaATCAAATGTCAGAAACCAAATTTC
GAAGTTGGAAAATCAAACAAACTCTCATTTGCTaaaaaaactcaaaacaA
AGATGTTGTCAGCATATGGACGTTATCAGCAAACgatacaaatgatgaaa
atgtgctcaaaacaAAGATGTTGTCAGCATATGGACGTTATCAGCAAACg
atacaaatgatgaaaatgtgGCAATCATTGATTCTGACGCACTGTTAGAC
GAGAACGATTTGAAAAAACCTGATCTTTCTGGAATCATAAGCAATCATTG
ATTCTGACGCACTGTTAGACGAGAACGATTTGAAAAAACCTGATCTTTCT
GGAATCATAACTGATTGTGGTACAAGCAAATCTGGTAAACGAAAAGCTTG
CAAAGGATGCTGATTGTGGTACAAGCAAATCTGGTAAACGAAAAGCTTGC
AAAGGATGCTCTTGTGGGTTAAAAGAAGAATTATCCGGTGAAGCTGCACC
TGCCGTCAAATCTGCTTGTGGAAGTCTCTTGTGGGTTAAAAGAAGAATTA
TCCGGTGAAGCTGCACCTGCCGTCAAATCTGCTTGTGGAAGTTGTTACCT
TGGAGACGCATTCCGTTGTGCAAGCTGTCCGTATCTTGGCATGCCTCCTT
TCAAATCTGGTGAACAAATTACGTTATCTGATCGCCAGTTGCAGCCGGAT
GTTTATTGATGTTACCTTGGAGACGCATTCCGTTGTGCAAGCTGTCCGTA
TCTTGGCATGCCTCCTTTCAAATCTGGTGAACAAATTACGTTATCTGATC
GCCAGTTGCAGCCGGATGTTTATTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000256_pilon | genome | sc0000256_pilon:112968..119441 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 772-888:6358 |
| Aaloc | 706-771:5995 |
| Aaloc | 658-702:5286 |
| Aaloc | 586-654:4907 |
| Aaloc | 523-585:4170 |
| Aaloc | 457-519:3397 |
| Aaloc | 427-456:2598 |
| Aaloc | 367-426:1362 |
| Aaloc | 223-363:725 |
| Aaloc | 1-219:1 |
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