XLOC_043767 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_043767
Unique NameXLOC_043767
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000052_pilon:1707869..1709191-

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_043767 ID=XLOC_043767|Name=XLOC_043767|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=1323bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000052_pilon:1707869..1709191- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTAATTATTGCATACGGAGTGACATCTATATTACTGGTAATTGGGCT TGTGCTTGGGTTTCGATTATGGCAAGGAAAGAAGAACCAAGTTGTTATCA ACAATCCAGCCTTTGTCAATTTCCAACAAAAATATTTCCGTGTTTATTTC CTTGCATTATTAGCTGAATGGCTACAAGGACCGTATTTATATAAATTGTA TCATGATTATGGTTTTGTTGATCCTTTCATTGGGATTATTTATGTTTGCG GGTTTGTATCAAGTATTGTTTTTGGTACATACACTGGTATACTTACTGAC CGACTTGGTAGGAAAAAGGTGTGCGTATTGTTTACTATTTTGTATTCAAT ATGCTGCTTTACAAAGCTTTCTCATAATTTTTTTGTATTATGTCTTGGAA GAGTACTAGGTGGAGTATCAACTAGTTTACTCTTTTCTGCATTTGATTCT TGGTATATGTTTGAGCATACACAAGCTTATCAGTTCCCTACAGAATGGAT GGATGTCACTTTCTCAAAAGCTACCTTTTATAACAGTGTTATTGCAATCA CAGCTGGCTTTATTGCTAATTTGTTATCTGAATGGCTTCAATTTGGACCA GTTGCACCATTTTTATTTGCAATACCTTTTCTTGTTGTGGCTGGAGCACT GATTCAAGTCACCTGGTCTGAGAATCATGGAAGATCTGGCCAAGCTTGTA AAGGCTGTTTTGAAGGACTACGTCTCATTGTTATGAATCGTGGTATCTTC CTTATCGGTGCTGTTCAAGCAATGTTCGAAAGTGTCATGTACATTTTTGT GTTTTTATGGACGCCAGTTTTGCTGCCAGCTGAACCACCTCTTGGTGTCG TGTTTGCTTCTTTTATGTGCTCTATATGGATTGGAGGAAGCTTATTTGAA CATCTTGTAGCAAGAAAATATAAAATGACGACAATTGTTTGTTTTGTTGT CTATGGAGTCATGTTTGCTAATGGTGGAGCAGCTTTTGCTAGTGCTAATC ATCCCCGTACCTCGTATTTATTATTTTTAGTGATTGAACTACTTTGTGGT ATATACTTCCCAGCTATGGGTTACCTGAGAACCAAAGTGTTGCCAGCTGC ACATCATGCTGTTATAATGAACTGGTTTCGTGTACCGTTGAACGTGATTG CAAGTATAGTGTTATTGGTGTTACACGATAGTCACAGCCCACACGGTATC ACGCAAATGTTCACACTCTGTGCATGTCTTTTGATGGTTGGTGGTTTGTT TGCAACGTTATTGAAATTTACGGTGAATGATAATGAAATGAATGCGAATA CAGAAACAGAAGAATTGGCTTAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000052_pilon:1707869..1709191-

>XLOC_043767 ID=XLOC_043767|Name=XLOC_043767|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2646bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000052_pilon:1707869..1709191- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTAATTATTGCATACGGAGTGACATCTATATTACTGGTAATTGGGCT
TGTGCTTGGGTTTCGATTATGGCAAGGAAAGAAGAACCAAGTTGTTATCA
ACAATCCAGCCTTTGTCAATTTCCAACAAAAATATTTCCGTGTTTATTTC
CTTGCATTATTAGCTGAATGGCTACAAGGACCGTATTTATATAAATTGTA
TCATGATTATGGTTTTGTTGATCCTTTCATTGGGATTATTTATGTTTGCG
GGTTTGTATCAAGTATTGTTTTTGGTACATACACTGGTATACTTACTGAC
CGACTTGGTAGGAAAAAGGTGTGCGTATTGTTTACTATTTTGTATTCAAT
ATGCTGCTTTACAAAGCTTTCTCATAATTTTTTTGTATTATGTCTTGGAA
GAGTACTAGGTGGAGTATCAACTAGTTTACTCTTTTCTGCATTTGATTCT
TGGTATATGTTTGAGCATACACAAGCTTATCAGTTCCCTACAGAATGGAT
GGATGTCACTTTCTCAAAAGCTACCTTTTATAACAGTGTTATTGCAATCA
CAGCTGGCTTTATTGCTAATTTGTTATCTGAATGGCTTCAATTTGGACCA
GTTGCACCATTTTTATTTGCAATACCTTTTCTTGTTGTGGCTGGAGCACT
GATTCAAGTCACCTGGTCTGAGAATCATGGAAGATCTGGCCAAGCTTGTA
AAGGCTGTTTTGAAGGACTACGTCTCATTGTTATGAATCGTGGTATCTTC
CTTATCGGTGCTGTTCAAGCAATGTTCGAAAGTGTCATGTACATTTTTGT
GTTTTTATGGACGCCAGTTTTGCTGCCAGCTGAACCACCTCTTGGTGTCG
TGTTTGCTTCTTTTATGTGCTCTATATGGATTGGAGGAAGCTTATTTGAA
CATCTTGTAGCAAGAAAATATAAAATGACGACAATTGTTTGTTTTGTTGT
CTATGGAGTCATGTTTGCTAATGGTGGAGCAGCTTTTGCTAGTGCTAATC
ATCCCCGTACCTCGTATTTATTATTTTTAGTGATTGAACTACTTTGTGGT
ATATACTTCCCAGCTATGGGTTACCTGAGAACCAAAGTGTTGCCAGCTGC
ACATCATGCTGTTATAATGAACTGGTTTCGTGTACCGTTGAACGTGATTG
CAAGTATAGTGTTATTGGTGTTACACGATAGTCACAGCCCACACGGTATC
ACGCAAATGTTCACACTCTGTGCATGTCTTTTGATGGTTGGTGGTTTGTT
TGCAACGTTATTGAAATTTACGGTGAATGATAATGAAATGAATGCGAATA
CAGAAACAGAAGAATTGGCTTAGATGTTAATTATTGCATACGGAGTGACA
TCTATATTACTGGTAATTGGGCTTGTGCTTGGGTTTCGATTATGGCAAGG
AAAGAAGAACCAAGTTGTTATCAACAATCCAGCCTTTGTCAATTTCCAAC
AAAAATATTTCCGTGTTTATTTCCTTGCATTATTAGCTGAATGGCTACAA
GGACCGTATTTATATAAATTGTATCATGATTATGGTTTTGTTGATCCTTT
CATTGGGATTATTTATGTTTGCGGGTTTGTATCAAGTATTGTTTTTGGTA
CATACACTGGTATACTTACTGACCGACTTGGTAGGAAAAAGGTGTGCGTA
TTGTTTACTATTTTGTATTCAATATGCTGCTTTACAAAGCTTTCTCATAA
TTTTTTTGTATTATGTCTTGGAAGAGTACTAGGTGGAGTATCAACTAGTT
TACTCTTTTCTGCATTTGATTCTTGGTATATGTTTGAGCATACACAAGCT
TATCAGTTCCCTACAGAATGGATGGATGTCACTTTCTCAAAAGCTACCTT
TTATAACAGTGTTATTGCAATCACAGCTGGCTTTATTGCTAATTTGTTAT
CTGAATGGCTTCAATTTGGACCAGTTGCACCATTTTTATTTGCAATACCT
TTTCTTGTTGTGGCTGGAGCACTGATTCAAGTCACCTGGTCTGAGAATCA
TGGAAGATCTGGCCAAGCTTGTAAAGGCTGTTTTGAAGGACTACGTCTCA
TTGTTATGAATCGTGGTATCTTCCTTATCGGTGCTGTTCAAGCAATGTTC
GAAAGTGTCATGTACATTTTTGTGTTTTTATGGACGCCAGTTTTGCTGCC
AGCTGAACCACCTCTTGGTGTCGTGTTTGCTTCTTTTATGTGCTCTATAT
GGATTGGAGGAAGCTTATTTGAACATCTTGTAGCAAGAAAATATAAAATG
ACGACAATTGTTTGTTTTGTTGTCTATGGAGTCATGTTTGCTAATGGTGG
AGCAGCTTTTGCTAGTGCTAATCATCCCCGTACCTCGTATTTATTATTTT
TAGTGATTGAACTACTTTGTGGTATATACTTCCCAGCTATGGGTTACCTG
AGAACCAAAGTGTTGCCAGCTGCACATCATGCTGTTATAATGAACTGGTT
TCGTGTACCGTTGAACGTGATTGCAAGTATAGTGTTATTGGTGTTACACG
ATAGTCACAGCCCACACGGTATCACGCAAATGTTCACACTCTGTGCATGT
CTTTTGATGGTTGGTGGTTTGTTTGCAACGTTATTGAAATTTACGGTGAA
TGATAATGAAATGAATGCGAATACAGAAACAGAAGAATTGGCTTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_043767XLOC_043767-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000052_pilongenomesc0000052_pilon:1707869..1709191 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1-1323:1324