XLOC_043725 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_043725
Unique NameXLOC_043725
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000028_pilon:1559968..1571221-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_043725 ID=XLOC_043725|Name=XLOC_043725|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11254bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000028_pilon:1559968..1571221- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AGGGCGGTCAAACTTTTGATCAAAGTGGTGGAAATAACCAACAGATGAAA AACATGAATAACCAACCAGGTACATCAGAATTGTTTGAAAGTCTACAGTA TTACAGTTTTCTGTTGTAATAAAACCATTTTGAATACAAAAGTTTAGGAA ACATTACCGTAAACAAACATTACGTACCTAAAAATCCATTCCTTCAAGTC TTCTAAAATTTCAAATTAAAGCCTGTACAAAAGACAAAGCAGTAATATTT GAGAATTTCTTTTCATCTGTAGGCTTCAACAATTCGAACAATGGAGGTGG TGTACAGCGCAATGACATGAACGTAGTCAGTAACGTCATGTTACAACGCC AAGGATCCAACGTTCAAATCAACCAACAAACCAACGTCAATGCAAATAAC CAAGGTTCGTAAAATGTTAGAATTCCTTGTTTGTATAAGCCTTTTACATT GAAAGCAACGGCTTAGGTATTGAATTGTGGTGTAAGTTTCCGAAAGTTGG TGTGATTTTTACCGCATGAAAATACAAAATGTCCGTGTTATTGTCACTTT AATTTTAAGGAAGGTGTGTTATTTTATTTAATCCTTTAAACTTCTAGGTA GTACTAGCTTTTCAACACAATTCACACAAAGTGGACCGCAGAACCAAAAC AACGTTTCCGGTCCTTTCCCCGCGGCTGCCGCTGCTGCTGCAGCAGTTGC GGCAGCAGCGGCCACAGCAACCGCTACAGCGACTGCTACAGCGACGCTTC AGATGCAAGAGCAGCCACAGCCCGACCAAATGAACAGAGGAGGTAAGATT AATTCGTAAAGACTTTTTAGCAACGGGGATAGTTCTCTTTATTGTATGCT TTGACTTTGACAATGATTCCTAACATTACAGCATAAATGGGAGATCTGTA ACAGTCAGTACTAACTGGCATGGAGATATGGCATTAGCCTTATATGTTTG ACAACGGTATAAAGTAATAATATCTCAAGTTTGAAGACTCGTTACTTAAA CTCCATTCCCTTTCAAACTTGACTTTTTTGTTCGTTCAGATATGATGGAT AATCAACAACAACAGTATCAGATCCAAGGGCAGACAAACGTACAAACGGG GCGCGGTATGATCAATAATACGATCAATGGAAGTATGAATAGACAGATGT TCAATAAACCAATGGGCTATATGATGAACAACCCAAATAATATGACCCAA TACATGACATCGCAACAGCGAAATTTCATGAATCAAGGTACAGAGACGAG ACTCTGAATCACCATTGTATTGCCCTTGTATTTCCTAATGCCGAATCTTG TTAGCCAAAATTTCATTTGTTTCTTATAACTATAAGATTTCAAGCTATTT CTTAGACTGCAAAAAAATAATTATTTGTGTTTCCAACCGTTTAAATTTTA ATTAATAGAATACAATTAACTAATGTAAATACAATTCGGAAATAAATACT GGTTGACTAAGTGGTCAATTAATACTAGACGGGCAAATATACACTCAATG AAAAACCCAAAAAATGTAGACCAAACGATAGACCTGCAAAATACCTGAAA AGACCATGAAGAACTTTTTAAATCGAATCCCAAATCTTACTTCTTTCTCC TTTATTTCCAACAGGAATGAACCGAAACATGATGAGTCGCTTTCAAGGTC CACAACTAAAGCGACCGCCAATGATGGGAGGTTACGGTAATAATATGATG ACAAGCCCAATGACGCCCGACCCGCCCAACGGTCAGTTTAGTCCATACGG ACCACCCGGTGGCATGAACAGATCTGGACCAGGATTTCCACCGCAGTATC AGCAGCCGCCTCCCGGGTACAACGGAAATAATTTCAATGCAAACATGGGC GGAGCAAATATGGGTGGGATGGGCGGTATGAATATGGGGATGAATAATAG 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TTTTTGCCGGAATTTATTTTTTTATATAAAATGCGTCATAAATTCTTCAA ATAAGTTCCGTTAAAAAAATGTCCGAATCATTACCTCACGCGGGAAAGTT TTCGTACTGTTTTAAACATTACGCCGCACATTTTTAAACATATATCTTTC TTTTTTTAATAGAAACGGAGAAAGAGTGTTTACGGCTGACGTTTAGCGTA GCGAACGGGATCGTTCTTCCACCCTTTCGACTTCAACACAATTTGGCTGT CAGCAATCACGCCTTTTCACTGAAACCACAAATCTATCAAACTCTCATGA ACAGGTGATTAGTATTACTTATCCTGTTTGTTTTGTTCTTCTGTTTATTT ACATTATTTGTTTATTTGTTTGTTTGTGGCGTTATTGGGCCAAAAGTTCA CGCCTCAGGCTGTTCCTTGCACTATTTCACAAATGTAGTTTTAACTGAAT AAGCTGAATCGCTCAAAAGGTTTAAACAAAGCTGAAAGGGGTGTTTACAA AATGACATTTACTTTTACGAGTTTTTAATAATACATAATGATTTAAACAA TTAATCATAAACTTTGACCGTCGTTACGCAATTAACGTCACTCAAAAAAA ATTTTGATTTGTCCCTTAATCTCATCTTAAGAAAAGAAAAGATTTGTAAC GTTTGGTTTTCGAAAAAAAGTTATAAGTTATTCTCTCTCTCTTTTTGTCA AGTGATCTGATTTCCTTCTCTTGAAGTGAGCGGATATTATGAATTAAACT CTAGTACTGACCACAAGAGTTTACAGTCAAATAGCAGGATATCACTTTTC TGTTTGTCCTCTTTTTTTTGAAACTTTTATCGATCAAGGCTTACATCATA TTTCTGAGTCGAGTCGTGTTCACACAACCTCAGTTATTAAATTCTTCGAA TTCGTTTCACTACTATGGTGTAAATCAAATTTTGATTGCAATGACCTCCT ATCGATAGAATAACGTGATTTGTTTTTAAATTAGCCAATCATCATTCACA GGGCAAACCTCCTCAAAATATATATTTTTGATAATGTTTGGCTTAACTTG ACCTTATTTACCCCCACATTATTGATATCCTAAGAAATAGATAATATGTT GGGAAATCATGTTAAATCAAGAAACTCGGTTGAATATAATGCTACTTAAT ATTAAAACCAGGTTTAACATGCTTAAAAAATGTTTATTTCCGAAACGAAT CCTTCCAAATAGAGAAAGGGAACTAACGGAACTAACAAAAAATGACAAAT GAGTTTTGGATACCTGTCATCACAAGTAAAGGATGATTGAAATTTGATCA CTATCTTACTCACAAGACCATCCACTGACTTTCTATCCCACTTTTTTTGA TGAAAGCAGATTAAAAGTGATAAAGCTCTAAAACGATTTGTTTTCGATAA CAACATTTTGCAATATGATACTTAATTCTCCTATTAGAAGTTCGACTGTT TGTCTTTTTCAAAAATTCCTCGTTTCTCTAAACTAAGCAAACTAACTAAC CCTAGCATTAACGTTTTATGATCTCGTTTCCATATTTTGAACGTTCTTTA TCTTCCCAAGATCACTTTTTTTGCAGCAATCGTTCCCCTTTATTAGACTA AGACTCGATAACCTTGAATATAGTCGATATTTTACGTGAATGGCAAAGTA ATCTAGGACTTTTAGACAGTGTTTTTATTTTTTCACGGGTCCACGGCCAG CAAGATCGGCTATATACGAACTAAACATGAAATAAACGGAACATTGGAAA GCTTTAGGCGTTGACCTCTCCGACATCGTTCCTTGCAGCGATAATTATCC CAGGAATTGTGTTTCATCTTTTTTACCATTGTGTCTTACTCTTTTTCTTA GGCCTGACCTTGAACTACAGTTCAAATGCTATCACCATGAGGACAAAACA ATGACAACCAATTGGCCACAAACAGTCAGTGTCAGTGTCAACAACACACC ACTCAACTTGGAACGAGGTGACTCGAAAACCTCACACAAACCACTTCTTC TTAAGGATGTTTGCAAAGCTGGCCGGAATACCATACAAATTAACGTTCTC GCTTGCTGTTGTGTAAGTCTTGAACCATGTTACCGCGTTTAGAACCCATT ATGCTCGAAACTATGAATTGACGCAATTCCCACCATTACAACCAGCTGTA ATCTTAAAGGGACTTTGGGGGAATTGCTTAAGTTCTTGTTCATTGAACCT CTTGAATATCACTCTTTAGTACTCTCTCTCTGGCTCTTTGCAATATACCA TCGTTCTTGGCATTCCCCTATGTCCGGTGCAGTTAACCAGAGATCATTTC TATTTCTTGCTTCATTATAATTATATTCAATGCCCAAAGTCGGTTATAGT CAAAGAAAAAAACTAATTATTCTTTCACGTGTTTTTCAGTCTCATCTTTT CGTTCTTCAATTGGTTCATCGTCCCTCCGTCAACTCAGTTCTTCAAGGCT TGCTCAAGAAACGCTTGCTTCCTGCTGAACATTGCATGAAAAAGAGTAAG TATTCACCATCCTTGGAGCTGGAAAAACGGATGTTGAAAAAATAAACTAA TAACAAAAGTTCTTGGAAATAATCTCCTAGACGGGACTCCTTTTAAGATC TAGTTTATACGGTCGGCTTTCTATATGTGGCGTTAAAAGTAAGAAAACTA TCCAGAAGAGACCGTCTAAACTAAGGCTAAACTGCATTGCTTTATAAAAA TGATAAAACTAAATGTTTTTGATCCATTCTCAGTTAAAATCAACTTCAAG TCATCTGCGACCAACTCGAACACGCCAGGTATGGACGATGGTATCGAGCA AACTGCAGTCAAAGTCTCTTTAAAATGTCCAATCACGTATCGATGTATCA CCATCCCAGCGCGCGGCCACGACTGCAAACACATACAGTGCTTCGATTTG GAATCTTACTTAAAATTGAATGTCGATAAAGGTTCATGGAAATGTCCTGT ATGCTCGTAAGCTCATTTTTATCTCATGGGAAAAGATATAAAGCTTTAAT GGATTGAACGCAAACCAGATATTCTTTAGCCTTTCTTTAGACTCTTTGGA CTTTGTCCCTATATCAGACATAATTAGACAGTAAAAAATATGGTTACAGT GATAATTACATGTCAATTAAATCTTGAAACGAGTTGAATCAGATTGCGAA ATCTAAGTAATGAACGACCTTTTGTTTCTTTCTCTCGTTCTTTAACCTTA TCCCCGCAGGTGCCTTAATTTAGGATGGAACTTTACTGATAAGTTTTTTC GAACCCTCTCTCTCATATAGTGACTTTAAACTTCAATCTTTAACATTCTT GCCTAACTTTCATCATACCAGTTTGTCATGCTTCTCTGTCCACTTCTATG GAATTTACTCTTTTCAACTGCTACATTATTGACTGCGGGTCCTGTGTCCT TTCTGATTTGTTACGGTTTCTGCATACAGCTTAAGAATTCACCATGTACG AGATTTACTAATTAGTGGATTGTTTTTTTATTTAGTAAAAACGCAATACT CGAAGGATTAGAGGTGGATCAATATTTATGGCAGATTATCACCACGCTAA TGAAGTAAGCCACATTTTCACCACAAGCTAATTGCCCTTCCAAATTTTTC TTTTCTTTCTTTTTAATGATCCTTCTCTCATTAAAACGCTTCATTTTTTT CTTTCTTCTACTTGAGTTTGCTTTTTTATAAGAACAGTTTGGGTGTATTG GTACTTATAAATTAGGTTTACCCCTGATTTTTTAATCTACCAAGTTTGTC TGAATCTTTATTGAGTGTCATGTATGAGAAACAATTTTCAATCCACCTCT TCAGGACGGACGTAGAAGAAGTGACGATCGACTCAAGCGCCTCCTGGAAG CCTGTTTCAACGCCCATCAAACAAGAAATCAAATCGGAAGATGACTCGAT GAGTTGTTCCGGAACACCCGGTCCTCCTCCCAAACGACTTCGCTCTGTAG ACAGCGCCATCGCTTCACCTATGTCAATCACAAACCCATCAACGCCTGGC TCATACAAGCCGCCAACGCCGGCTGCGCGGCCATGTACGCCGAGCTCGAC ACCGGGTCCGAAAACACCTCAACCTCAAGCGAATCCGTCAATAATGACAA GCTCAAACAACGACAGTAAATTCAGGGTGCCTTCACCTGCCATGCATCCT GCGTCGTCACAACCTCAACTACTTCGACAACAAAGTCAATCCATGACTTC ACCTAGCCCTGTGACGTGTAATCTAACGGCCGCACAAGGTAATTTCAATC CTCACTTCAATTCAAACTTTGTCTATTTTATCATTTTAGAAATGAAACTT TTAGAAGTAAAACTTGACGCGCGTGTCGCAGACTGATTCCTTGGTTTCGC GGTTTCCGCATGTGGAAATGACAAAGGTAAATATTTTCTTTCGATCTTTC GATCTTTCTTCGTATTTGTTTGTAAATTCCGTTCTTGTCTCTATTTTAGG AGGACCACCAACGTTAATGCGATCACCAGACGCCCCTCTGCCCCAGTCCA TACCACCAACTTCATCGCCGCCCACCATTTCCACTTCGTCCGCTCTCACC TCGCAAAACAGTGAATCTGCAAACGCCCGAACGCCCACGACGACGAGTGG TAGT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000028_pilon:1559968..1571221-

>XLOC_043725 ID=XLOC_043725|Name=XLOC_043725|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=7170bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000028_pilon:1559968..1571221- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AGTTGCGGCAGCAGCGGCCACAGCAACCGCTACAGCGACTGCTACAGCGA
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ATGACCCAATACATGACATCGCAACAGCGAAATTTCATGAATCAAGATAT
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GACCCAATACATGACATCGCAACAGCGAAATTTCATGAATCAAGGAATGA
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ATGATGGGAGGTTACGGTAATAATATGATGACAAGCCCAATGACGCCCGA
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AACGGAAATAATTTCAATGCAAACATGGGCGGAGCAAATATGGGTGGGAT
GGGCGGTATGAATATGGGGATGAATAATAGTATGGGAATGAGTGGAAATA
ATAGTATGGGAATGGGATCAAACATGGGGCTACCACCGCAATATAATAAT
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ACAACAAACTATGAACAATCAACAAAATGTGGTTAACCCTCAACAACAAC
AACAGCAACAACAACAACAACAACCACCGAACCAACAAGTTGGAAGTCCA
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ACTAAAGCGACCGCCAATGATGGGAGGTTACGGTAATAATATGATGACAA
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GCCGCCTCCCGGGTACAACGGAAATAATTTCAATGCAAACATGGGCGGAG
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GGAATGAGTGGAAATAATAGTATGGGAATGGGATCAAACATGGGGCTACC
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AACAGCCACAACAGCCACAACAACCACAACAACAGGTTTTTAATCAGCAA
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AACCCTCAACAACAACAACAGCAACAACAACAACAACAACCACCGAACCA
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GCAAATTAAATGGCAGTGGACGGCGCCACCACCCCAATCAACCCGAACGC
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GGTGACTCGAAAACCTCACACAAACCACTTCTTCTTAAGGATGTTTGCAA
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GATCTCATCTTTTCGTTCTTCAATTGGTTCATCGTCCCTCCGTCAACTCA
GTTCTTCAAGGCTTGCTCAAGAAACGCTTGCTTCCTGCTGAACATTGCAT
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CCCATCAAACAAGAAATCAAATCGGAAGATGACTCGATGAGTTGTTCCGG
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CCAACGCCGGCTGCGCGGCCATGTACGCCGAGCTCGACACCGGGTCCGAA
AACACCTCAACCTCAAGCGAATCCGTCAATAATGACAAGCTCAAACAACG
ACAGTAAATTCAGGGTGCCTTCACCTGCCATGCATCCTGCGTCGTCACAA
CCTCAACTACTTCGACAACAAAGTCAATCCATGACTTCACCTAGCCCTGT
GACGTGTAATCTAACGGCCGCACAAGGACGGACGTAGAAGAAGTGACGAT
CGACTCAAGCGCCTCCTGGAAGCCTGTTTCAACGCCCATCAAACAAGAAA
TCAAATCGGAAGATGACTCGATGAGTTGTTCCGGAACACCCGGTCCTCCT
CCCAAACGACTTCGCTCTGTAGACAGCGCCATCGCTTCACCTATGTCAAT
CACAAACCCATCAACGCCTGGCTCATACAAGCCGCCAACGCCGGCTGCGC
GGCCATGTACGCCGAGCTCGACACCGGGTCCGAAAACACCTCAACCTCAA
GCGAATCCGTCAATAATGACAAGCTCAAACAACGACAGTAAATTCAGGGT
GCCTTCACCTGCCATGCATCCTGCGTCGTCACAACCTCAACTACTTCGAC
AACAAAGTCAATCCATGACTTCACCTAGCCCTGTGACGTGTAATCTAACG
GCCGCACAAGGAGGACCACCAACGTTAATGCGATCACCAGACGCCCCTCT
GCCCCAGTCCATACCACCAACTTCATCGCCGCCCACCATTTCCACTTCGT
CCGCTCTCACCTCGCAAAACAGTGAATCTGCAAACGCCCGAACGCCCACG
ACGACGAGTGGTAGTGAGGACCACCAACGTTAATGCGATCACCAGACGCC
CCTCTGCCCCAGTCCATACCACCAACTTCATCGCCGCCCACCATTTCCAC
TTCGTCCGCTCTCACCTCGCAAAACAGTGAATCTGCAAACGCCCGAACGC
CCACGACGACGAGTGGTAGT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_043725XLOC_043725-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
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Properties
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