|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000056_pilon:1124795..1130589- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_043699 ID=XLOC_043699|Name=XLOC_043699|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5795bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000056_pilon:1124795..1130589- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTTCTTTTAGTTTCATATCATGCTGTTTCTTCATCACAGCTTTTGT
AACGGTATATCCATACCAGTATAGAAATGAAGAAAATACAAACTTGGATG
ATGGTATTCGAGATTTAGTAGCAGAAGAATTGCGGAATGAGGGGTTTTTA
GATGAAGATTTTTTGGCCAGGAGATCAGATTCAAGATTTGATGAAGAAGA
AGAAAATACGGTTGCAAGAGACGATGAGTTTTACCAAAATTTTGAAGAAA
GAAGCGAAAATAATTTTGTATCGGACGAAATGACTGGGAAACAGTCCAAT
CAAGATGTATGTCTAGCATTAAATACAGGCACTACTAGACCTAGCTATGT
GGGACGTATTGTAAGTGCTTTAGACCGTCTTATAATGCATTTTGAATACT
ATTCAGATCAATTGATTGCTGATGGTCTCTTTGGATTAAGATTCGCTGAA
GGTGCCCTCCAAGAACTACTCCGCAAGTTACCTAAAAGTGATCCATTTTA
CCATAAAGTTCATTCGACTTATGAGCGACTCAAAAGGTTGACTAAAGAAG
CTTACAAAAAGACCATGTCACATAAAAGGAAGTATGATTTAGAATTTGAT
GTCGCATTGAAGCAACCATACAACCATTTCTGGCCGATGAAAAGTTTAAA
AAGCGTGGCATATCATATTGATAGAGAAGGTAGGTTAATAAGTTTTTGTT
TTACTTATGACATTCTTATCAAGTCTTCTCAGTTTGGCCGGCAAACAGCA
ATTTTGTCAGACACTCATAAATAAATGTTTATTAATATGAACACGGTGTA
CAACAGCGAATTAGATTTCCACGTTACTTTCTTGTGGTAGAGCATCCGGC
TACGGTTCGCAAGGTTGTGGGTTCAACCCTCAGCCGGGTCATACCAAGGA
CTCTCAAAATGGTACTTGATGCCCAGCAATTAAGAGAAGGATCAAGGATA
AGTGGAGAAATCCACGTAGAAATAGTGGCGCCCTCCCGTACCTTCGGGTA
GATAGCTATCGAAAGACGAGCCTTCGGGTCGCCTCCGACTGCAGTCGCAG
ACTTACTACTACTTACTTAATGTCTACTCATTTACGTTTAATCTATAACC
TGCTTATCTCTCACCTCTGACGTACTGTATTCTTTATACAATTACATGTT
CACTTTTCAATTTTATTTTTATTCTTAGCACACATATTATTATACTAACT
TCATGTAATAAGAAAAAAAGCGATGTTCAAGGGGACTAAAAATTTTCTTC
GAATTAAAGAAATATTCGAATTAGGGAAGATATCCTTGCAACATACTAAA
TAACATCAGTGTTTTATTTCAAACTGCAGCATAATCTGAAAACTTCAAAA
TCCAGGAACCATTTTTTTTCTTTCAAAACTTTTATATTTATTGTATTTTT
ACCACTTTTATTTTTCAGGTTTGCATGATGATGGAAATTTTGATGAGATG
AAGAGCGATCAATGCATCACTCTAATGCTTGGGACAGCAAAAGAGTCAAA
AGGTCGTCAATGTGTCATCACAGATGAATGTTTGAAGATGGAACTGACTC
GTAAAACAAAAGGTTATGAAACCACTCACCAGTACCTTTACTTTATAGCA
GGATTCATCAATGGTAAGTATCAACAGTATCAATTGTTTTAGAAATTGAA
GAGATAATGGATTCTTCACCAAACAGCACCAGAGTCCGGAATCAATCGGT
AGTCCTTCCGAAGACGCCGTTGATCCCCGGGCAAGGCCCTGATTTTTACG
ATCATTTTTCTCTCTTTGATACTATTTTCTATTTCTATTTCTATAAATTA
ATCCAAAGAGTACATTATGTACATTTACCCGGATAACGGGATCCAAAGAT
TGAGATATCTCTGGCGCCAGAGGGTGGAATCCATCACCATCGGTCGAAGG
ATGATGATGAAGTATTAATAAGCTTGCTTTGAGCAATTCTATATATGAAG
CAGGCTCAGCATTTTTGTCATGACCTCACTTTTTATATATCAACCTGGCT
TATTCGACCGATAATCCAAATAACTCAAGTCCTGCAGGGGGGTTATTAAG
GCTCGGAGAATGTCGGATATGTGTGGACCGGAAAAATATAGGGGTAATTC
ATGTCCTTTGGAGTGACTTTTGTAATAATAATAATAATAAAACATATTTA
TAGTGGCTGGCCATGGAATAATTTTCAAACTTTTAGGCAGTTTGAAAATT
GTCTCAGCCAGGGGCCACTTTTGGGGGAAGGGGGGTAATTCTTTGTTGTT
TTTGTAACCTTTAGAGTAACTTGGGATTTTCAGAAGACAGACCCTTTCCG
TCGGCACATACCAAACACCTTTTTTACCTCTCCTTTCTCCATAGTGAATT
GGTTTATTAGTCACTGTTAAAGATTAAGTGGGACACCATCATTACAAGTA
CAATTAACTCGTGTTAAAGCATGGGAAAAACTTATTTTAATACAGTTTCA
TTTGTCCGTAGGCTGTGATCGGGAAATGGCAGAAGCTCTTGGTTCGAAGG
AGAAATTAATGTTTGAGATTGAACGTATGGCTGCCAATATTGCATATCAA
ATGTTAAATTTACATACCAACAATCAACATATGGTTGATCTCGATATCCA
GACGGAACAAGGTATGATCATCAACAGTTTACACCCCTGTCTCACAGCCC
CATTGAAGCTTTTTCCCAACGCAGCGGGGATAAACATTTCTATAGAAATA
CCTAATTGAATAAAATAAAAGCAGTCAATTTTCCATGCAAAATCTAGATG
AAAAAAATCAAGTTGCCGACGAACCTGTGCTTTATCAAATCCTTACAGTT
AGATGGATGTCAAAATTTTGTTACGATTTATGTTGAATCTGCATTCCAAA
CTAGAAATTCTGTTTCGAATATTTGGGATAATTTCACCAAATTCTATCAC
TAGTGAAGGCTCTATTTAAGTAGAACTATCTCTCAGGATAATTGAAAAAA
AAGAAGTTTTTTAATCATCTACTTTAGCGGCTGTATATTTCAGCCAGTTT
ACATTTTATGGGTTGTAGTTTCGATCCACAGTCACTGTAAACTCTGCAAA
AGTTGAATGGGTAGCTTAGATTGAGTTATATGATCGAGTGTCAAATATTG
TCCAAATTTTACCAATTTTAAGTGCTCTTTATTTTGCATGATATTGTCGA
TTTAGAGTAGTCTGAAAAATTAAGAACGCATTTAAGAACATTTTAGGCTG
AAAACTGCCAAAAAAATAAGCACATCCAGGCTCAGCCAAATTTTAGGTGT
TCTAATAAAAAAAAAACGTGTAGATCCGTGAAGGGATACTAAGATGTCTC
TAACCTGATGTGTAACCTAATTTTCTTTTCGCTGTTTTTCGCGAACAACC
GCAAAAACTGACTATGGCGTCATAATCGATGACGTCATAAAAGCTGAAAA
TTTCTCAAAGGATTGATTATCCGATTGTAAGATGTATCTCACTAAAGTCG
ATCATTTGACGTTAGCAGAAATTAGTAAGAAACGAAAAATCTTATTTTGT
GTTGACGTAATCAGAATTTCAAAAAAAATTCTTTAATGACGTCATCGATT
ATGACGTCATAATTAGTTTTGCGTTTTTTTTTCAAAAATCAGCGATAAAA
CAACTAAGTTACACACCAGGTTAGAAACTTTATCATATCACCCTTCATGT
TCAGTCATTTGTTTGGTCATTTTTTGTCGACTGATGCGATCTAAAAAAAT
ATGGTAATTTTCAGTTTTTGAGACATGTCATAATATACCCGATTGTGGTG
ATCTATTTCAGCATTCGATCTTCTAGGTCTAACACAAATAGAAAATAGAC
CGGGGGGAGCAGTCAGGCATATTGACCGACGAGTATGTGCGGCGGTTAAG
TGTATGTTTTTCAAAATATCAGAAATGGGTGGACTTTTGATAAATGCACT
GTATGGGTGAAAATTTCAGCAAATCTAGAGAAAATAGGAAATTTTTGCTC
GAAAATCTTGATTTTTTGCTCTAAAAGAGTTTAAAATCTGAAAAAATGCA
CTGTAAGGGTATGGATTTCACCGATTTTTTTTCTGCAGTTGGGAAAATGG
GATAGACTCCCACTCTACCAGCTCTGAGAAACCCACTAGATAATATACTT
GCTATACCTTACTTTACTTAACTTTTTCAAGGTCTAATGTGTGGTTTTAA
CTTTTTCAAGGTCTAATGTGTGGCTTGTATGGAATTGTGGATTGCACGAA
ACCGTTAATTGTGGAGAGATTTGTTTCTTATGTCAACGCAAAAGGTTGTA
CTCATTTGAAGAAAAATCAAAAGAAGAATGAAAAAAGGCAAGACGTTAAC
CTAGGTATGTTAAGATTCTGTTAATACCCAGGCGGCACACAACGTCAAAA
CAACGTCCATGTGACATTCATAACGTTCAAATAACGTTATTTGAACGTTC
GTTAAAACAACGTTGTGTGCCAGCTGGGTATTGACCTTTAAAAGGACCTT
TGAGGCTATTAGCTAAAACGAATCGTGATAACACACATTCGTCATGTCTC
ATCGGGCCACTCTTAACTTGCACAGGGGGGAATGGATTGCTAACTTATTG
ACCCTTTTATGTTGGAGTAATAGTGCGGCTTTGAGGGAGGAGAAACTTGG
TTTTTCTTTTGTTAAAAAATGCTGTACAAACAAATGCAAATTCTCTCCCT
AATTCGACAATCTACTATTCGAATCTTTCTATAGTTCGAACTAAAATATT
GGTCCCTTCAGCTGGAAAGTAGTAGTGTACATTGTAGTGTCGAGTCGAAC
CTTTCTCTAGTTCGAAGACAATTTTTTGTTCCTTGAAAATCGAATTAGGG
AGAGAGTTAAATTTATGCTTTAAACAATGTTGGATACTGTTATTAAGGGC
TCCGACCATAGTGAATTTTGAATATTTGCCACGTACAAAATATAAATTTC
TACTTGATGTAGCACACAAAACTGTGTCATGTTATACATTTTCTGTTAGG
CCAATTATCCAATTATCCGAGTCTGAAAATCTAAGAATGACAATGAAAAA
ATTTGATGAAGAGGAAAATGAAGACTTTTGCGAAGAAGAGTATTTCAACT
TTGAAGAACTTATTTTCGGCGAAGAAAAAAACATTTTGAAAAATCTTTTG
CGGCAGATGGTGTATCTTTTAACGAACTAAAGATAGATTTTCGGAAAATT
TATCTAAAAGCTTATTTGTCTCATGCTTTTTGACCAATTTTTCATCCCAA
TTTTTCATCCCAGTTTTTCATCCCAATTTTTGATAGAAAAACAGCCATAA
CTTTTGATGCATTGATTTAGAAAATGTTTCCGAAAAATTTCAAATAGATC
TATTCTTTGCGGACAGTTTAAAAAAAACTAAAAAAAGGTTAATTACCCAT
TAAAACTTGGCACTTTTTATGAAAGAAGGTAATGCAACATATTTTTAACG
TCTTTTTTAAGTTTATAGCGTCATTTTTGCAATTAAATTTTTAATCACTC
TAAGGGATTCGATTAAAAAACAATTTATAAAGGCATTTCTTTGTTAAAAG
TGTTAAAGAACCTAAAACATAACTTTTATGTCCAAATAATAAAATCAATT
TTTCGACTATGGTCAGAGCCCTTAAGTAAATCTTAGAGAATACGGTGGTT
TTTTTTTCGGTCCAAAAGGTTCTGTTAGAGCTTGGGTATGATCGGCAAAA
ACTTGCTAAATAAATGTTAGATGCATTAAGACTTATTTTTTCTATTCTAA
ATACCACAGGTGGATGTTCACAGCATCTGGATGCCTTGATGTCAGCTTTC
ATGGCTCTCAGTCTGAATACAGCTTTTCTGTTACCCTTGTGTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000056_pilon:1124795..1130589- >XLOC_043699 ID=XLOC_043699|Name=XLOC_043699|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2508bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000056_pilon:1124795..1130589- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTTCTTTTAGTTTCATATCATGCTGTTTCTTCATCACAGCTTTTGT
AACGGTATATCCATACCAGTATAGAAATGAAGAAAATACAAACTTGGATG
ATGGTATTCGAGATTTAGTAGCAGAAGAATTGCGGAATGAGGGGTTTTTA
GATGAAGATTTTTTGGCCAGGAGATCAGATTCAAGATTTGATGAAGAAGA
AGAAAATACGGTTGCAAGAGACGATGAGTTTTACCAAAATTTTGAAGAAA
GAAGCGAAAATAATTTTGTATCGGACGAAATGACTGGGAAACAGTCCAAT
CAAGATGTATGTCTAGCATTAAATACAGGCACTACTAGACCTAGCTATGT
GGGACGTATTGTAAGTGCTTTAGACCGTCTTATAATGCATTTTGAATACT
ATTCAGATCAATTGATTGCTGATGGTCTCTTTGGATTAAGATTCGCTGAA
GGTGCCCTCCAAGAACTACTCCGCAAGTTACCTAAAAGTGATCCATTTTA
CCATAAAGTTCATTCGACTTATGAGCGACTCAAAAGGTTGACTAAAGAAG
CTTACAAAAAGACCATGTCACATAAAAGGAAGTATGATTTAGAATTTGAT
GTCGCATTGAAGCAACCATACAACCATTTCTGGCCGATGAAAAGTTTAAA
AAGCGTGGCATATCATATTGATAGAGAAGATGGCTTCTTTTAGTTTCATA
TCATGCTGTTTCTTCATCACAGCTTTTGTAACGGTATATCCATACCAGTA
TAGAAATGAAGAAAATACAAACTTGGATGATGGTATTCGAGATTTAGTAG
CAGAAGAATTGCGGAATGAGGGGTTTTTAGATGAAGATTTTTTGGCCAGG
AGATCAGATTCAAGATTTGATGAAGAAGAAGAAAATACGGTTGCAAGAGA
CGATGAGTTTTACCAAAATTTTGAAGAAAGAAGCGAAAATAATTTTGTAT
CGGACGAAATGACTGGGAAACAGTCCAATCAAGATGTATGTCTAGCATTA
AATACAGGCACTACTAGACCTAGCTATGTGGGACGTATTGTAAGTGCTTT
AGACCGTCTTATAATGCATTTTGAATACTATTCAGATCAATTGATTGCTG
ATGGTCTCTTTGGATTAAGATTCGCTGAAGGTGCCCTCCAAGAACTACTC
CGCAAGTTACCTAAAAGTGATCCATTTTACCATAAAGTTCATTCGACTTA
TGAGCGACTCAAAAGGTTGACTAAAGAAGCTTACAAAAAGACCATGTCAC
ATAAAAGGAAGTATGATTTAGAATTTGATGTCGCATTGAAGCAACCATAC
AACCATTTCTGGCCGATGAAAAGTTTAAAAAGCGTGGCATATCATATTGA
TAGAGAAGGTTTGCATGATGATGGAAATTTTGATGAGATGAAGAGCGATC
AATGCATCACTCTAATGCTTGGGACAGCAAAAGAGTCAAAAGGTCGTCAA
TGTGTCATCACAGATGAATGTTTGAAGATGGAACTGACTCGTAAAACAAA
AGGTTATGAAACCACTCACCAGTACCTTTACTTTATAGCAGGATTCATCA
ATGGTTTGCATGATGATGGAAATTTTGATGAGATGAAGAGCGATCAATGC
ATCACTCTAATGCTTGGGACAGCAAAAGAGTCAAAAGGTCGTCAATGTGT
CATCACAGATGAATGTTTGAAGATGGAACTGACTCGTAAAACAAAAGGTT
ATGAAACCACTCACCAGTACCTTTACTTTATAGCAGGATTCATCAATGGC
TGTGATCGGGAAATGGCAGAAGCTCTTGGTTCGAAGGAGAAATTAATGTT
TGAGATTGAACGTATGGCTGCCAATATTGCATATCAAATGTTAAATTTAC
ATACCAACAATCAACATATGGTTGATCTCGATATCCAGACGGAACAAGGC
TGTGATCGGGAAATGGCAGAAGCTCTTGGTTCGAAGGAGAAATTAATGTT
TGAGATTGAACGTATGGCTGCCAATATTGCATATCAAATGTTAAATTTAC
ATACCAACAATCAACATATGGTTGATCTCGATATCCAGACGGAACAAGGT
CTAATGTGTGGCTTGTATGGAATTGTGGATTGCACGAAACCGTTAATTGT
GGAGAGATTTGTTTCTTATGTCAACGCAAAAGGTTGTACTCATTTGAAGA
AAAATCAAAAGAAGAATGAAAAAAGGCAAGACGTTAACCTAGGTCTAATG
TGTGGCTTGTATGGAATTGTGGATTGCACGAAACCGTTAATTGTGGAGAG
ATTTGTTTCTTATGTCAACGCAAAAGGTTGTACTCATTTGAAGAAAAATC
AAAAGAAGAATGAAAAAAGGCAAGACGTTAACCTAGGTGGATGTTCACAG
CATCTGGATGCCTTGATGTCAGCTTTCATGGCTCTCAGTCTGAATACAGC
TTTTCTGTTACCCTTGTGTTAAGTGGATGTTCACAGCATCTGGATGCCTT
GATGTCAGCTTTCATGGCTCTCAGTCTGAATACAGCTTTTCTGTTACCCT
TGTGTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000056_pilon | genome | sc0000056_pilon:1124795..1130589 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1171-1254:85 |
| Aaloc | 1027-1167:1634 |
| Aaloc | 877-1023:3333 |
| Aaloc | 682-873:4376 |
| Aaloc | 1-678:5796 |
|
