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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000145_pilon:635639..641058+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_043656.2 ID=XLOC_043656.2|Name=XLOC_043656.2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5420bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000145_pilon:635639..641058+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgaatatcACACCAGCATCATTAAATGGATTTCGATCAGCAGCGCCACA
TCAAAATAAAGGACAACTTCAGGTGAAATTTTGTATACAAACTTTTGGGC
TACTAGGTATCTTACATAGGGGAGGAATCTTCAATAACCTGTGTTATTTG
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CAgtcatttcaatgttttgaatatAGTGGAGTCTACTTGAACTTCTATAA
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GGAGACTCCCCTGTATATCTTATAATGCTTAGGGTATGTATAGAACGAGC
TACTATTCAAGCTAGATAATAGGCCCATCGGGACCCCATACCCACTTGAA
AATTTGGTCAAGAAATCCTCCCACATAGGAATAttaatccccactgaaaa
tttataataaatCTACATCCCCACTGGGAAACGTAAAAATACTCCAAAAT
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GCTTTATTTGCGAAAATTATAACATTCTCACCAGGTCACTGAGGCAGGGG
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TCCTACCTCCTTTATTTGTAGTTCCCTGATGTTGTCGAATTTTGTGAAAA
GATGGCTAAGCTGAAAAAGACGGTAATTGTAGCTGCTTTAGATGGAGATT
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tggaaaattaacaaaaatattgacatcatggtgaaattaagaacatgtta
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ATTGGGCTattctaaacaaaaattatacaGGGGTTTTGGCAAACTTTTAC
TAACCGCACTattaattttgaataacttgtGCCCTGGAAGTCTAGGGTAG
AACCCGCtagaagttgaaatttttttggaaatgggCTAGAAGACATCTAT
TGACGTCAGTTGATGAAgagacccctctagaaactctGGAAGCCCTAACA
ATGACCCGCTTTGATaaactgaaaaatgaacaaTGAACAAAATATTATTG
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ttcaatgggtaaaagttggttattgagatttattaacccgaggtgatgta
atattcaacgaggcgaagccgagttgaatatacatcaccgagggttaata
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cttaattactttgagtcctaaaatttgttcatgaaattgacaatagattt
atttgaatgaatttctttgataacaaaaagagcgacaaaaaaactcaaac
tttgaaagcaaaatttgaaaaaaaaattctaccgtgatataatagccatg
gtatatcaggaattattcaatggctgtttttgcctacaggtatataataa
tacgTGTTATACAGTAATATAGGtattatatgataatacgataactgtta
cgggataatatcagtgcgtataaaaataaaaaaaaatttaaaaaatcttg
tatTGTAACCGAAGTTACGAATGAgcagtacatgtttttttccataagca
taacgtttataagcatacgcagGCTCAGATTTTGGTaccttagcattcta
ttgttcttaaacaatatggccattttttaagaacaatagaatgctaagca
taatgcgagcctggtGTGCACCCCTCTATTACCACTTTAGCAAGTTGAGA
AATGAtattgtttttcttgatttatttcCAGATCGAAGTTATCGGTGGAG
CAGATAAATATATGGCAGCTTGTCGAGATTGTCACTCTCAAAATCTAGAT
ATCGACACTTTAGAACGTCAAAAGGAGAAAGTCCGACAACGACGTAAACC
TTTACTTTCAATGGAAAATATTTCGACCGGTGTTCTTTTCCACCATCGTA
CCGAGAATGCAAGCTTTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000145_pilon:635639..641058+ >XLOC_043656.2 ID=XLOC_043656.2|Name=XLOC_043656.2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1422bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000145_pilon:635639..641058+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgaatatcACACCAGCATCATTAAATGGATTTCGATCAGCAGCGCCACA
TCAAAATAAAGGACAACTTCAGatgaatatcACACCAGCATCATTAAATG
GATTTCGATCAGCAGCGCCACATCAAAATAAAGGACAACTTCAGGTTATC
TTTGGGCCAATGTTCTCGGGCAAAACGTTATCTTTGGGCCAATGTTCTCG
GGCAAAACAACTGAACTGCTACGTAGGATAAAACGGTATGAAGTAGCGGC
TTATTCATGCTTGGTGATCAAATACGAACATGACAAACGATACAGCGATG
ATGGCGTTGCTACACATGACAGAACTGAACTGCTACGTAGGATAAAACGG
TATGAAGTAGCGGCTTATTCATGCTTGGTGATCAAATACGAACATGACAA
ACGATACAGCGATGATGGCGTTGCTACACATGACAGacAAACATTCAAGG
CAATTTCTTGTTCGAGGTTACAAGATGTTGTTAATATTGCAGTGAAATAC
GAAGTTATTGGTGTTGATGAAGGCCAATTTacAAACATTCAAGGCAATTT
CTTGTTCGAGGTTACAAGATGTTGTTAATATTGCAGTGAAATACGAAGTT
ATTGGTGTTGATGAAGGCCAATTTTTCCCTGATGTTGTCGAATTTTGTGA
AAAGATGGCTAAGCTGAAAAAGACGGTAATTGTAGCTGCTTTAGATGGAG
ATTTTCAACGAAAGTTCCCTGATGTTGTCGAATTTTGTGAAAAGATGGCT
AAGCTGAAAAAGACGGTAATTGTAGCTGCTTTAGATGGAGATTTTCAACG
AAAGgcATTTGGTAATATTTTACAATTGGTACCACTAGCAGAAAGTGTTG
TCAAATTGAGTGCAGTTTGTATGAATTGTTATGGCGAAGGATCTTTCACC
AAACGACTAATAAGTGATACTACGgcATTTGGTAATATTTTACAATTGGT
ACCACTAGCAGAAAGTGTTGTCAAATTGAGTGCAGTTTGTATGAATTGTT
ATGGCGAAGGATCTTTCACCAAACGACTAATAAGTGATACTACGATCGAA
GTTATCGGTGGAGCAGATAAATATATGGCAGCTTGTCGAGATTGTCACTC
TCAAAATCTAGATATCGACACTTTAGAACGTCAAAAGGAGAAAGTCCGAC
AACGACGTAAACCTTTACTTTCAATGGAAAATATTTCGACCGGTGTTCTT
TTCCACCATCGTACCGAGAATGCAAGCTTTTAAATCGAAGTTATCGGTGG
AGCAGATAAATATATGGCAGCTTGTCGAGATTGTCACTCTCAAAATCTAG
ATATCGACACTTTAGAACGTCAAAAGGAGAAAGTCCGACAACGACGTAAA
CCTTTACTTTCAATGGAAAATATTTCGACCGGTGTTCTTTTCCACCATCG
TACCGAGAATGCAAGCTTTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000145_pilon | genome | sc0000145_pilon:635639..641058 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 523-711:5232 |
| Aaloc | 403-522:3895 |
| Aaloc | 313-402:3172 |
| Aaloc | 220-312:2148 |
| Aaloc | 106-216:976 |
| Aaloc | 73-102:594 |
| Aaloc | 1-72:1 |
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