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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000002_pilon:3924424..3929840- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_043656 ID=XLOC_043656|Name=XLOC_043656|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5417bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000002_pilon:3924424..3929840- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAATATCACACCAGCATCATTAAATGGATTTCGATCAGCAGCGCCACA
TCAAAATAAAGGACAACTTCAGGTGAAATTTTGTATACAAACTTTTGGGC
TACTAGGTATCTTACATAGGGGAGGAATCTTCAATAACCTGTGTTATTTG
GCCATTCCATTTTAAGTCGAACATTTCCAAGGGGTATAAAGGAATATTTT
TTCATTTTTCGAGGGGGTAAAAGACTGATTTTAGTTCGTCCACCCTCACA
CAAGGTATAAACAGATTTTTCCCAACGGTTCTTTTTCAAATTTTGCAATT
TTCCAGCTGGGTATCCACAATCTTCTAAGAATCACTTTTTTATCTTGAAA
AGATTCTTCCACCCCTGTATGGGAATTTAATGGAACAGCCTATTGTTGAT
AAGAAATTTTGAGTGAAATCAACGAACTGTAATGTACTACTATTTTGAAC
GTTGCTTAATATTCACCATTTTGATTATAAGGTATTACTTATAAAGGTTC
TCTGATGAAAGAGTGCTCCATTCATTAACATAGATCCAAATATCGATTTA
ATATGATGCTTGATGCTTTGAAAGGTTTGTTTTAATTTTGTAGGTTATCT
TTGGGCCAATGTTCTCGGGCAAAACGTAAGATATTTTATTTATGCCTTTA
CTTTTTCCACATACCCCATCTAATGTCACACAATGTTTTGTTAGAGGGTG
GTAGGAGACTGCTCATCTAACGTTTCCAGACCATCTAAAAAGAACGACAA
ATAACTATTAAAAAGCGACAAAAGGAACGACAAACCCTAACCATAATTAT
CAAAGAACGACATATTTCGCCGTTGAAATGTGTTCAACTTTTTTTTTCGA
GCCCGCGCTACATTTTTATGACGTAATCTTTTTTCCAAGTAAAAAGGATT
AAAGCCAAGAGATGCAATCGCAGCGCGCGCAAGTGGAGAACGGCCTTTAC
ACTGTCCTTCATATCATTTTTAGAACTGAACTGCTACGTAGGATAAAACG
GTATGAAGTAGCGGCTTATTCATGCTTGGTGATCAAATACGAACATGACA
AACGATACAGCGATGATGGCGTTGCTACACATGACAGGTTTGTGTTTTTT
TCACTCGAACATTTACATTTCTAAAACACTACATTACATAATAAAGACTA
CACTACGTTAAGCCAAAAGGATTTACGTTATCGGCCCTTTTTACGCCGGC
CCTTATTGGCGTTATTTTTGGGCTCGTGGCGTAATAAGGGCCGGTGTTAA
AAAGGCCGGCGTAAAATGGGCCAAAATCTTGCAATTTTTACCTAAAGCGG
CGTTAATTTTTGACCATTCTTACACAATTTAAAGGATTTTAGGCATGATT
AAAGGATGAAAACTATCCATTTTTTACTCTATATACAAAACTTTACGAAA
GTAAATGATTTTCAATGGAATTTTCAACAGTTTAATACTGAAAGATAACA
TTTTAATGTAAATTTTAGTTAATAATTACGGTTTTGAAGCCTGAATAGCG
ATTTTTACAAGTTTTGGCGTTATTTACGGCCCTAATTGGTGTAAGCCCAA
AATTAGGCTTTGGCGTAAAAGGGGCCGGCGTTCAATTAGGGCCGGCGTAA
AAAGGGCCGATAAGGTACATAGTAGGCCTGGTTCATAACAAAAAACATCA
AAAACGTGCAAAATTGGAACAAAGCACCAAATTTGGACAGACATACATGA
TACCCTATGGATTGATATTAGAAGGGCGGCCCAGGAAAAAAAAAATTTAA
GGATCCCCCTTTATTTTTAGACCCATTTATTGAAAACCTAGGCTAGAGCC
CAAGGGCCCAATTTTTATAGAAATTTAAACTCATTTTAGGCCAAATCAAA
TAACTCCCGTTCGGTACAGAAATCGACCATACTCGCTTAAAAGTCTTCTA
CATAGTTTATCGAGAGCTTTCAGATTCTATAATTGGTTTTTAAATTTGTG
TACTGCTGAAGTCAAGTACTAAAGGGTTTTATAAATTTAATACAAATATC
TCCGTTCGACCACATGAAAGAGCCTGAAGTTTTGAGTATATTTTTGAAAA
ATAGATGGCGAAAACGAGCAAGACTACTCCCTGTATTATTTGGTGTCCGG
AAGGGGTTCGATATCTTCATTTCTTTTCATATTATTTTTTCAGACAAACA
TTCAAGGCAATTTCTTGTTCGAGGTTACAAGATGTTGTTAATATTGCAGT
GAAATACGAAGTTATTGGTGTTGATGAAGGCCAATTTGTAAGAATCTCAG
TCATTTCAATGTTTTGAATATAGTGGAGTCTACTTGAACTTCTATAACCA
GCTATAACTTCTCTTCCTAAAGCTTTTTCTCTAGAATTTCTCCTTTAACT
CGAACAACCATGGTCCCTCAGTTAACAATATCTTAACAATAATTCGAAAT
TTCCTTAACTCGAACAAATTTCTGTACTTCTTGCGTGTTTAAGTTAAGGA
GACTCCCCTGTATATCTTATAATGCTTAGGGTATGTATAGAACGAGCTAC
TATTCAAGCTAGATAATAGGCCCATCGGGACCCCATACCCACTTGAAAAT
TTGGTCAAGAAATCCTCCCACATAGGAATATTAATCCCCACTGAAAATTT
ATAATAAATCTACATCCCCACTGGGAAACGTAAAAATACTCCAAAATACA
ATTTATAATTTCTACCTTTTAAAAACAAGAGATATCTCTCCCAATGGGCT
TTATTTGCGAAAATTATAACATTCTCACCAGGTCACTGAGGCAGGGGTGT
AAGAAAATTTCATAGAAAGTACATTAAAGGAAGAAACTTTGGCGGAAAGA
AAATTTGGCGGATTTGGCGGATTTGTCTGAAATCCGCCAAATTAAGGTTT
TTCGACCATCCGCCAAATTTAAAAATTCCCGCCAAATTTAATTCTTCTCT
TTTTATGTCCGATGTTTTCATACTGATTTCAGATTTAAAAATCCATCATC
CGCCAAATTAAATTCTCGCCAAAATTAGCATTTTCCCTGATCCACCAGAT
TAAATTTCCTTACGAAAAAACTTTTTCAGCCATCCGCCAAATTAAATTCC
CGCCAAAAGTTCTTCCCAAAAGGTTCCAAGCAAGTACAAAGTAGTTATGT
TATATTATGTAGCTATTATAGCAATTGCTGTCTTTGCCACCGTACTTTCC
TACCTCCTTTATTTGTAGTTCCCTGATGTTGTCGAATTTTGTGAAAAGAT
GGCTAAGCTGAAAAAGACGGTAATTGTAGCTGCTTTAGATGGAGATTTTC
AACGAAAGGTTAGTTATTTTCTAAATACTATACATGTTTTTTTATAAGAG
CAAACTATATAAGAACATATGGCTTCAATGACCGAATTCTTAAGTGCAAG
TTAAGAACATTTTAAGGCTTTCTTGACTCTAAAACACCCGATTTTTTTGG
AAAATTAACAAAAATATTGACATCATGGTGAAATTAAGAACATGTTAAGA
ACATTTTTTCTTATAAAAAAATGTTTATTAGCAAATTTAGGCGTGTGATT
GGGCTATTCTAAACAAAAATTATACAGGGGTTTTGGCAAACTTTTACTAA
CCGCACTATTAATTTTGAATAACTTGTGCCCTGGAAGTCTAGGGTAGAAC
CCGCTAGAAGTTGAAATTTTTTTGGAAATGGGCTAGAAGACATCTATTGA
CGTCAGTTGATGAAGAGACCCCTCTAGAAACTCTGGAAGCCCTAACAATG
ACCCGCTTTGATAAACTGAAAAATGAACAATGAACAAAATATTATTGGAA
AATCGACCCCCTGGTTTAAAAATGGAATAGCCCATTGGATAAGTTGATTC
AAGAGTTGCTGAGTGTGAATATTTTTGACTTCTTTCGAGTCCAAACCAAA
AAATAGTAACACATAATTGTAACAATTTTTTCTTTTTCTAGGCATTTGGT
AATATTTTACAATTGGTACCACTAGCAGAAAGTGTTGTCAAATTGAGTGC
AGTTTGTATGAATTGTTATGGCGAAGGATCTTTCACCAAACGACTAATAA
GTGATACTACGGTAAGTCAGAGAGATTCCTTTTTTTCTAAATAAACACAT
TCACTACCTTAAGGGAACTTAATTTGGCGGGAACTAATTTTGACGGATTT
GACGAATTTAGACGAAATTCGCCAAAATTAGTTCCCGCCAAAATTAAATA
TTTTGCTCACTCGCCAATATAAGTTCCCGCCAAAATTAAATTTTTTTGTT
TCCTTGCCTAAATAACCCCCGAAATTCCACAAAATTGCTCAACATAAGGC
AAAAGAGAACATATTTACGCTGTCATTCGCCAAAATTAGTTCCCACCAAA
ATTTAAAAAATTCACTATTGGCCAAAATAAGTTCCCGCCGAAATTAAAAA
ATTTTAGGAAAATTTCTGCCCGCCAAAATTAATTCCCGCCAAAAAAAGTT
CCCTTAAGGTAATTCACATTACTGCAGTCGTTTATAATAAGCAGATATTC
AATGGGTAAAAGTTGGTTATTGAGATTTATTAACCCGAGGTGATGTAATA
TTCAACGAGGCGAAGCCGAGTTGAATATACATCACCGAGGGTTAATAAAT
CCAATAACCAACGAAAACCTATTGAATATATGTTTTATTATATACCTAGA
GGCAAAAACAAAAAATTAGTTATGTCAATAGTCAAACGTTTCACTTAAAA
CACTCCCATAATCGAACGTTCGAATGTTTTTCTTTTTTAATGATTTTCTT
AATTACTTTGAGTCCTAAAATTTGTTCATGAAATTGACAATAGATTTATT
TGAATGAATTTCTTTGATAACAAAAAGAGCGACAAAAAAACTCAAACTTT
GAAAGCAAAATTTGAAAAAAAAATTCTACCGTGATATAATAGCCATGGTA
TATCAGGAATTATTCAATGGCTGTTTTTGCCTACAGGTATATAATAATAC
GTGTTATACAGTAATATAGGTATTATATGATAATACGATAACTGTTACGG
GATAATATCAGTGCGTATAAAAATAAAAAAAAATTTAAAAAATCTTGTAT
TGTAACCGAAGTTACGAATGAGCAGTACATGTTTTTTTCCATAAGCATAA
CGTTTATAAGCATACGCAGGCTCAGATTTTGGTACCTTAGCATTCTATTG
TTCTTAAACAATATGGCCATTTTTTAAGAACAATAGAATGCTAAGCATAA
TGCGAGCCTGGTGTGCACCCCTCTATTACCACTTTAGCAAGTTGAGAAAT
GATATTGTTTTTCTTGATTTATTTCCAGATCGAAGTTATCGGTGGAGCAG
ATAAATATATGGCAGCTTGTCGAGATTGTCACTCTCAAAATCTAGATATC
GACACTTTAGAACGTCAAAAGGAGAAAGTCCGACAACGACGTAAACCTTT
ACTTTCAATGGAAAATATTTCGACCGGTGTTCTTTTCCACCATCGTACCG
AGAATGCAAGCTTTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000002_pilon:3924424..3929840- >XLOC_043656 ID=XLOC_043656|Name=XLOC_043656|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1422bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000002_pilon:3924424..3929840- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAATATCACACCAGCATCATTAAATGGATTTCGATCAGCAGCGCCACA
TCAAAATAAAGGACAACTTCAGATGAATATCACACCAGCATCATTAAATG
GATTTCGATCAGCAGCGCCACATCAAAATAAAGGACAACTTCAGGTTATC
TTTGGGCCAATGTTCTCGGGCAAAACGTTATCTTTGGGCCAATGTTCTCG
GGCAAAACAACTGAACTGCTACGTAGGATAAAACGGTATGAAGTAGCGGC
TTATTCATGCTTGGTGATCAAATACGAACATGACAAACGATACAGCGATG
ATGGCGTTGCTACACATGACAGAACTGAACTGCTACGTAGGATAAAACGG
TATGAAGTAGCGGCTTATTCATGCTTGGTGATCAAATACGAACATGACAA
ACGATACAGCGATGATGGCGTTGCTACACATGACAGACAAACATTCAAGG
CAATTTCTTGTTCGAGGTTACAAGATGTTGTTAATATTGCAGTGAAATAC
GAAGTTATTGGTGTTGATGAAGGCCAATTTACAAACATTCAAGGCAATTT
CTTGTTCGAGGTTACAAGATGTTGTTAATATTGCAGTGAAATACGAAGTT
ATTGGTGTTGATGAAGGCCAATTTTTCCCTGATGTTGTCGAATTTTGTGA
AAAGATGGCTAAGCTGAAAAAGACGGTAATTGTAGCTGCTTTAGATGGAG
ATTTTCAACGAAAGTTCCCTGATGTTGTCGAATTTTGTGAAAAGATGGCT
AAGCTGAAAAAGACGGTAATTGTAGCTGCTTTAGATGGAGATTTTCAACG
AAAGGCATTTGGTAATATTTTACAATTGGTACCACTAGCAGAAAGTGTTG
TCAAATTGAGTGCAGTTTGTATGAATTGTTATGGCGAAGGATCTTTCACC
AAACGACTAATAAGTGATACTACGGCATTTGGTAATATTTTACAATTGGT
ACCACTAGCAGAAAGTGTTGTCAAATTGAGTGCAGTTTGTATGAATTGTT
ATGGCGAAGGATCTTTCACCAAACGACTAATAAGTGATACTACGATCGAA
GTTATCGGTGGAGCAGATAAATATATGGCAGCTTGTCGAGATTGTCACTC
TCAAAATCTAGATATCGACACTTTAGAACGTCAAAAGGAGAAAGTCCGAC
AACGACGTAAACCTTTACTTTCAATGGAAAATATTTCGACCGGTGTTCTT
TTCCACCATCGTACCGAGAATGCAAGCTTTTAAATCGAAGTTATCGGTGG
AGCAGATAAATATATGGCAGCTTGTCGAGATTGTCACTCTCAAAATCTAG
ATATCGACACTTTAGAACGTCAAAAGGAGAAAGTCCGACAACGACGTAAA
CCTTTACTTTCAATGGAAAATATTTCGACCGGTGTTCTTTTCCACCATCG
TACCGAGAATGCAAGCTTTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000002_pilon | genome | sc0000002_pilon:3924424..3929840 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 523-711:190 |
| Aaloc | 403-522:1527 |
| Aaloc | 313-402:2250 |
| Aaloc | 220-312:3274 |
| Aaloc | 106-216:4444 |
| Aaloc | 73-102:4825 |
| Aaloc | 1-72:5418 |
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