XLOC_043633 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_043633
Unique NameXLOC_043633
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000093_pilon:1272816..1286137-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_043633 ID=XLOC_043633|Name=XLOC_043633|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13322bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000093_pilon:1272816..1286137- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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ATGTCTGCAATATAACTGTGACATATTTATAGTTGGTGATTTTTTGTGTA GCATTTAAGATATGCTATGCAGATGTAGATTTGTAGGAGTTGTAGTTTTA TTTTCTATTTCCACAATTTTAATGTCTGCAATATAATTGTGACATATTTA TAGTTGGTGATTTTTTGTGTAGCATTTTAAGATATGCTATGCAGATGTAG ATTTGTAGGAGTTGTAGTTTTATTTTCTATTTCGACAATTTTAATGTCTG CAATATAACTGTGACATATTTATAGTTGGTGATTTTTTGTGTAGCATTTT AAGATATGCTATGCAGATGTAGATTTGTAGGAGTTGTAGTTTTATTTTCT ATTTCCACAATTTTAATGTCTGCAATATAACTGTGACATATTTATAGTTG GTGATTTTTTGTGTTGCATTTAAGATATGCTATGCAGATGTAGATTTGTA GGAGTTGTAGTTTTATTTTCTATTTCGACAATTTTAATGTCTGCAATATA ATTGTGACATATTTATAGTTGGTGATTTTTTGTGTAGCATTTTAAGATAT GCTATGCATATGTAGATTTGTAGGAGTTATAGTTTTATTTTATATTTCGA CAATTTTAATGTCTGCAATATAATTGTGACATATTTATAGTTGGTGATTT TTTGTGTAGCATTTTAAGATATGCTATGCAGATGTAGATTTGTAGGAGTT GTAGTTTTATTTTCTATTTCGACAATTTTAATGTCTGTAATATAACTGTG ACATATTTATAGTTGGTGATTCTTTGTGTAGCATTTTAAGATATGCTATG CAGATGTAGATTTGTAGGAGTTGTAGTTTTATTTTCTATTTCGACAATTT TAATGTCTGCAATATAATTGTGACATATTTATAGTTGGTGATTTTTTGTG TAGCATTTTAAGATATGCTATGCAGATGTAGATTTGTAGGAGTTGTAGTT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000093_pilon:1272816..1286137-

>XLOC_043633 ID=XLOC_043633|Name=XLOC_043633|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2676bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000093_pilon:1272816..1286137- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TCATTCATGATAATATAGCTAGCATTTTAGATTGTGTCAATGATCCCATT
GATCATCCAGATTCCATACATCAACTTGAGAGATCAAAGGCAGACCTCCT
TGTTATTGTAAGTGGGAGAGATGCCAATTGGCCAACCGAAAGATATGCAC
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ATGCCTTTACGATAAACATCCACTAGTACCCTTACCAGGGACTATGGTCT
TTTTTGGTGGCGAGGATAAAAGAAAAATGTCTGATGATTATATTGAAGTA
TGGAGGGATGTAGTACAGTATTTCAACAAGTCCTTTGGAATGATTGAAAA
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TGGATTTTATAATGGTCACATTGACAAGTTTGAAGGTAAGACTTCAATTG
CTAAAGCCCAGATTACACGATATTTAGCTCGCAACATTGAAAGAATTAAT
TTACAAAATTTCAATTTTAAAGGGACTCTTTTTGTGCCAGAGCGTGCTAC
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TGAAAGAGCATTTTGCTTCATACTTGGCTCACCAAGGCTTCGTTACATTA
GCTCTGGCTTTCTTTGGAGTTGAAGGTTTACCAAAAACGTACACAGAAAC
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ATGACTCTGTGGATCCAGAGAAAATTGGTGTTTTAGGATCTTCAAAAGGC
GGTGATATCGCTTACGCAATGATGTCACATTTACCACAAATCAAAGCTGT
GTGTTGCATGAATGGTTGTATAGCGTCTATGGCCACACAAACAATCTATA
AAGGTGAAGTTACAGAGATGATCCCAGCTGATCCTGCGAGCCTGAAGTTC
ATTCATGATAATATAGCTAGCATTTTAGATTGTGTCAATGATCCCATTGA
TCATCCAGATTCCATACATCAACTTGAGAGATCAAAGGCAGACCTCCTTG
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CTTGCAAAAGAGAAGATGGACAAAGTTGGTAAAACCAACTATCAAATTAT
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GCCTTTACGATAAACATCCACTAGTACCCTTACCAGGGACTATGGTCTTT
TTTGGTGGCGAGGATAAAAGAAAAATGTCTGATGATTATATTGAAGTATG
GAGGGATGTAGTACAGTATTTCAACAAGTCCTTTGGAATGATTGAAAAAA
CAAAACTGATAGTAAGCAAACTGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_043633XLOC_043633-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000093_pilongenomesc0000093_pilon:1272816..1286137 -
Properties
Property NameValue
Aaloc91-1338:1249
Aaloc1-90:13323