|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000015_pilon:617610..619445- Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_043561 ID=XLOC_043561|Name=XLOC_043561|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=1836bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000015_pilon:617610..619445- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCGGCACAATTCTCTTTAGATGGAGTAAAAGGTGAAATGTACGTTGA
CTCTAATCATGCAAAATTTCTAGCACATACTTTGAACGACCTCAGAAAGT
CAAAGAAAATGTGTGATTTGATTTTAATATCTCCACCAAAAGAATTTTTT
GCCCACCGAAATGTTGTATGTGCTGCAAGTCCTTACATTCTGGAACGGTT
AACAGTCACAAGTCCAGCAGAAAAAGAGAGCTTTGACTCAAATAGCACTT
CTCTTGGTTCAAGGATTGAAATTAAAACCATAAGTGCTGATGTTTTTGAG
GATATTTTAAACTTTATTTATATTGGTGAAGTGTGTGTCAGTGAAGAAAA
TGTTAGAAAACTCATTGCTGCATCTGAAATTTTGCGTATGCAAAAACTTA
AAGAACTGACATGTCGATTCTATGAGAAAAGACTTTGTCCAGCTAATTGT
CTTTCAATTGCTGCTCTTGCCAATGAATTCAATTGTGATTCACTGAGGAA
AGCTGCTGACAAATTCATTCTTGATCATTTCTTAGAAGTCAGCAAGTTTC
ATGAGTTTCAGGGTCTTGATATTGAGCATCTTATCAGCATACTTCAATCT
GATGAGATCAATGCCAATAGAGAAGAACAAATTTTTACTGCTGCTATGGA
ATGGATGCATTATGATTTGCCAAATCGGAAAGTGTACATAAACAAACTTT
TGAGTTGTATCAGACTTTTATTACTCAGTAAATACTTTGTAATTGATGTT
CTTGAAAAAGATGAAATTCTCATGGCTAACCCTGATTGTAAAGATCTCAT
TCAAAATTGCAAAAATGTTTTAACACTGCCTGACCGAAAGCATATGTTTT
GCCACAATAATCTTGGTAAACCAAGAGATTTTTCAGATATTTGTGAAGTG
ATTTTAGCATGTGGTGGTAATCAAGAAAGAATGAGCTCAAATGAAGTGTT
ATGTTATGTGCCAAGCCAAGATTTCTGGTATCCTTTAGCACCACTTATGA
AATCAAGATATAAAAGTTCATCTGCTGTCCTCAACAATGAAGTCTATTGT
ATTGGAGGAATGTTTGAGGGAATCTCACCAATCAAGAATATTGAGAGATA
TTCATTTGCAATGGATAGGTGGATTGATAGCTCTCCATTCCCTGATCCAA
TTTCGGGTCATGTCAGTTGTGTGTTTAATGGTGAAATTTATGTCATTGGG
GGTAGTGAAGATGACACTATTTCAAACAATGTTTGGAAATATTCTATTAA
AAGAGGTGTTTGGATGGAAGTGAAAAACCTTCTCATTCCCCGACGTGATG
CTACAGTTGCTGTCCATAATCAACTTTATGTTATTGGTGGTTATGGCCCA
GATGGTCAGTCATTGGCAAGTGTTGAGCGCTTTGACCCTTATCAAAATCA
ATGGGCTAAAATATTTCCAATGAATTCTCCCAGGGCTTTCGCAAGTGCCT
GTTGTATTGGAGATCGTATCTTTGTTTTTGGTGGTGAATATGCTGGTTGG
TCATATTACCGTACAGCTGAAGTTTTTGACATCAAAACAGATGAATGGAA
TAGTATCTCTGATTTCTCTGTCCCTCGTGCCCACATGGGAATAGCTGCAT
ATCATGGAAAGATATATTTAGTTGGTGGAATGGTTTCGGCAGAAAGTGTC
GTGGACCAGTATGGTGTAGATGAGGAAGAGTTTGTCGATGTTAATGAAAC
CAAAGTTGTTGAATGTTATGACACTGTCAAAGGGGTTTGGTCTAAAGCTT
GTTCCCTTCCTATGGCAACTGCAGGGGCCAATTGTGCAGTTATCAGCACA
TCTAACATCGTTTTGAGTCAAAGATGTGGGTTTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000015_pilon:617610..619445- >XLOC_043561 ID=XLOC_043561|Name=XLOC_043561|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3672bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000015_pilon:617610..619445- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCGGCACAATTCTCTTTAGATGGAGTAAAAGGTGAAATGTACGTTGA
CTCTAATCATGCAAAATTTCTAGCACATACTTTGAACGACCTCAGAAAGT
CAAAGAAAATGTGTGATTTGATTTTAATATCTCCACCAAAAGAATTTTTT
GCCCACCGAAATGTTGTATGTGCTGCAAGTCCTTACATTCTGGAACGGTT
AACAGTCACAAGTCCAGCAGAAAAAGAGAGCTTTGACTCAAATAGCACTT
CTCTTGGTTCAAGGATTGAAATTAAAACCATAAGTGCTGATGTTTTTGAG
GATATTTTAAACTTTATTTATATTGGTGAAGTGTGTGTCAGTGAAGAAAA
TGTTAGAAAACTCATTGCTGCATCTGAAATTTTGCGTATGCAAAAACTTA
AAGAACTGACATGTCGATTCTATGAGAAAAGACTTTGTCCAGCTAATTGT
CTTTCAATTGCTGCTCTTGCCAATGAATTCAATTGTGATTCACTGAGGAA
AGCTGCTGACAAATTCATTCTTGATCATTTCTTAGAAGTCAGCAAGTTTC
ATGAGTTTCAGGGTCTTGATATTGAGCATCTTATCAGCATACTTCAATCT
GATGAGATCAATGCCAATAGAGAAGAACAAATTTTTACTGCTGCTATGGA
ATGGATGCATTATGATTTGCCAAATCGGAAAGTGTACATAAACAAACTTT
TGAGTTGTATCAGACTTTTATTACTCAGTAAATACTTTGTAATTGATGTT
CTTGAAAAAGATGAAATTCTCATGGCTAACCCTGATTGTAAAGATCTCAT
TCAAAATTGCAAAAATGTTTTAACACTGCCTGACCGAAAGCATATGTTTT
GCCACAATAATCTTGGTAAACCAAGAGATTTTTCAGATATTTGTGAAGTG
ATTTTAGCATGTGGTGGTAATCAAGAAAGAATGAGCTCAAATGAAGTGTT
ATGTTATGTGCCAAGCCAAGATTTCTGGTATCCTTTAGCACCACTTATGA
AATCAAGATATAAAAGTTCATCTGCTGTCCTCAACAATGAAGTCTATTGT
ATTGGAGGAATGTTTGAGGGAATCTCACCAATCAAGAATATTGAGAGATA
TTCATTTGCAATGGATAGGTGGATTGATAGCTCTCCATTCCCTGATCCAA
TTTCGGGTCATGTCAGTTGTGTGTTTAATGGTGAAATTTATGTCATTGGG
GGTAGTGAAGATGACACTATTTCAAACAATGTTTGGAAATATTCTATTAA
AAGAGGTGTTTGGATGGAAGTGAAAAACCTTCTCATTCCCCGACGTGATG
CTACAGTTGCTGTCCATAATCAACTTTATGTTATTGGTGGTTATGGCCCA
GATGGTCAGTCATTGGCAAGTGTTGAGCGCTTTGACCCTTATCAAAATCA
ATGGGCTAAAATATTTCCAATGAATTCTCCCAGGGCTTTCGCAAGTGCCT
GTTGTATTGGAGATCGTATCTTTGTTTTTGGTGGTGAATATGCTGGTTGG
TCATATTACCGTACAGCTGAAGTTTTTGACATCAAAACAGATGAATGGAA
TAGTATCTCTGATTTCTCTGTCCCTCGTGCCCACATGGGAATAGCTGCAT
ATCATGGAAAGATATATTTAGTTGGTGGAATGGTTTCGGCAGAAAGTGTC
GTGGACCAGTATGGTGTAGATGAGGAAGAGTTTGTCGATGTTAATGAAAC
CAAAGTTGTTGAATGTTATGACACTGTCAAAGGGGTTTGGTCTAAAGCTT
GTTCCCTTCCTATGGCAACTGCAGGGGCCAATTGTGCAGTTATCAGCACA
TCTAACATCGTTTTGAGTCAAAGATGTGGGTTTTAAATGGCGGCACAATT
CTCTTTAGATGGAGTAAAAGGTGAAATGTACGTTGACTCTAATCATGCAA
AATTTCTAGCACATACTTTGAACGACCTCAGAAAGTCAAAGAAAATGTGT
GATTTGATTTTAATATCTCCACCAAAAGAATTTTTTGCCCACCGAAATGT
TGTATGTGCTGCAAGTCCTTACATTCTGGAACGGTTAACAGTCACAAGTC
CAGCAGAAAAAGAGAGCTTTGACTCAAATAGCACTTCTCTTGGTTCAAGG
ATTGAAATTAAAACCATAAGTGCTGATGTTTTTGAGGATATTTTAAACTT
TATTTATATTGGTGAAGTGTGTGTCAGTGAAGAAAATGTTAGAAAACTCA
TTGCTGCATCTGAAATTTTGCGTATGCAAAAACTTAAAGAACTGACATGT
CGATTCTATGAGAAAAGACTTTGTCCAGCTAATTGTCTTTCAATTGCTGC
TCTTGCCAATGAATTCAATTGTGATTCACTGAGGAAAGCTGCTGACAAAT
TCATTCTTGATCATTTCTTAGAAGTCAGCAAGTTTCATGAGTTTCAGGGT
CTTGATATTGAGCATCTTATCAGCATACTTCAATCTGATGAGATCAATGC
CAATAGAGAAGAACAAATTTTTACTGCTGCTATGGAATGGATGCATTATG
ATTTGCCAAATCGGAAAGTGTACATAAACAAACTTTTGAGTTGTATCAGA
CTTTTATTACTCAGTAAATACTTTGTAATTGATGTTCTTGAAAAAGATGA
AATTCTCATGGCTAACCCTGATTGTAAAGATCTCATTCAAAATTGCAAAA
ATGTTTTAACACTGCCTGACCGAAAGCATATGTTTTGCCACAATAATCTT
GGTAAACCAAGAGATTTTTCAGATATTTGTGAAGTGATTTTAGCATGTGG
TGGTAATCAAGAAAGAATGAGCTCAAATGAAGTGTTATGTTATGTGCCAA
GCCAAGATTTCTGGTATCCTTTAGCACCACTTATGAAATCAAGATATAAA
AGTTCATCTGCTGTCCTCAACAATGAAGTCTATTGTATTGGAGGAATGTT
TGAGGGAATCTCACCAATCAAGAATATTGAGAGATATTCATTTGCAATGG
ATAGGTGGATTGATAGCTCTCCATTCCCTGATCCAATTTCGGGTCATGTC
AGTTGTGTGTTTAATGGTGAAATTTATGTCATTGGGGGTAGTGAAGATGA
CACTATTTCAAACAATGTTTGGAAATATTCTATTAAAAGAGGTGTTTGGA
TGGAAGTGAAAAACCTTCTCATTCCCCGACGTGATGCTACAGTTGCTGTC
CATAATCAACTTTATGTTATTGGTGGTTATGGCCCAGATGGTCAGTCATT
GGCAAGTGTTGAGCGCTTTGACCCTTATCAAAATCAATGGGCTAAAATAT
TTCCAATGAATTCTCCCAGGGCTTTCGCAAGTGCCTGTTGTATTGGAGAT
CGTATCTTTGTTTTTGGTGGTGAATATGCTGGTTGGTCATATTACCGTAC
AGCTGAAGTTTTTGACATCAAAACAGATGAATGGAATAGTATCTCTGATT
TCTCTGTCCCTCGTGCCCACATGGGAATAGCTGCATATCATGGAAAGATA
TATTTAGTTGGTGGAATGGTTTCGGCAGAAAGTGTCGTGGACCAGTATGG
TGTAGATGAGGAAGAGTTTGTCGATGTTAATGAAACCAAAGTTGTTGAAT
GTTATGACACTGTCAAAGGGGTTTGGTCTAAAGCTTGTTCCCTTCCTATG
GCAACTGCAGGGGCCAATTGTGCAGTTATCAGCACATCTAACATCGTTTT
GAGTCAAAGATGTGGGTTTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000015_pilon | genome | sc0000015_pilon:617610..619445 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1-1836:1837 |
|
