|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000015_pilon:260115..261480- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_043549 ID=XLOC_043549|Name=XLOC_043549|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=1366bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000015_pilon:260115..261480- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGAGCATGTGGCGGATATGGAGGCTACGGAAGTCAAGGTTACGGAATGGG
TGGAGGCTATGGTCAACAAGGTTATGGAATGGGTGGTTACGGCCAACAAG
GTTACGGTATGGGCGGCTACGGCCAACACGGTTACGGAATGGGCGGCTAC
GGCCAACAAGGTTACGGAATGGGTGGTTACGGCCAACATGGTTACGGAAT
GGGCGGCTACGGCCAACAAGGTTATGGTATGGGCGGCTATGGTCAACAAG
GTTACGGTTACGGAATGGGCGACTACGGCCAACACGGTTACGGAATGGGC
GGCTACGGCCAACAAGGTTACGGAATGGGTGGTTACGGCCAACAAGGTTA
CGGAATGGGCGGCTACGGCCAACAAGGTTACGGAATGGGCGGCTATGGTC
AACAAGGTTACGGAATGGGCGCTTACGGACATACTGGAATATGGAGGTAT
GGGTGGCTATGGAGGCTATGGTCAACAAGGCTACGGAATGGGAGGATACG
GTGGTTATGGTATGGATGGTGGCTACGGTATGGGAGGTTATGGTCAAGGG
TACGGTCATGGTCAAGGGTACGGTCATGCTGGATATGGAATGGGAGCAGG
ATATGGTGGAGCTTACGGTGGTTATGGTGTGGGTGGTGGCTATGGAGGCT
ACGGAAACATGGGTGCACCAGCCCTAGGAGCACCAGCTCAATCAACTGGT
CCAAAATATCCAGGACCTAACCCACCTGCATTGACGTTACCACAAAAAGC
CAAAGCACGTCAATTGATCATTACTGAAGATGATGAGGATGACACCAGCT
CGCGAAGAAAAGACATCCCAAAAGACGGTCATCATTTACATCGTCTGTTA
GTCTTGCCAGGAGAATGTGAAGGTGATCATTGTACTACCAACTTCCCAGT
ACACGGAGGACGTGGTGGTGGTTGTCAAGGTGCTGGATGTGGTGGATACG
GTCACCAAGGCTTCGGTGGAAACTGGGATGCAGCTGATTGTGGTCATTCA
GATTGTGGAGGTTTGGGATTTGGTAACGGATACGGTGTTGGTTGTGGAGG
CGGTGATTGTGGTGGTTTCCATGATATTCATCATCGTCCAATCGGATGTC
CCGAATACAACTCACCAGACTCGCCATGTTTAACTTACCCATACGGTAAC
AATGTTGGTTTCGGATTTCCAGGAAAATTCCACAGCCACCATCCAGTTTT
GTTGCACCCAACACATCAAGAAACAGCCCATCATAACATCCATTTATCTG
GTCGAAGCCATGGTGGGCGACACGGACGTCGCCATAGCGGAGATTTGATC
GTATTACCACATTACGGGCATACTTGTTGTGGAGGTGCTGGATGGAATCC
ATACTGGGGACATTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000015_pilon:260115..261480- >XLOC_043549 ID=XLOC_043549|Name=XLOC_043549|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2298bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000015_pilon:260115..261480- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGAGCATGTGGCGGATATGGAGGCTACGGAAGTCAAGGTTACGGAATGGG
TGGAGGCTATGGTCAACAAGGTTATGGAATGGGTGGTTACGGCCAACAAG
GTTACGGTATGGGCGGCTACGGCCAACACGGTTACGGAATGGGCGGCTAC
GGCCAACAAGGTTACGGAATGGGTGGTTACGGCCAACATGGTTACGGAAT
GGGCGGCTACGGCCAACAAGGTTATGGGAGCATGTGGCGGATATGGAGGC
TACGGAAGTCAAGGTTACGGAATGGGTGGAGGCTATGGTCAACAAGGTTA
TGGAATGGGTGGTTACGGCCAACAAGGTTACGGTATGGGCGGCTACGGCC
AACACGGTTACGGAATGGGCGGCTACGGCCAACAAGGTTACGGAATGGGT
GGTTACGGCCAACATGGTTACGGAATGGGCGGCTACGGCCAACAAGGTTA
TGGAGGTATGGGTGGCTATGGAGGCTATGGTCAACAAGGCTACGGAATGG
GAGGATACGGTGGTTATGGTATGGATGGTGGCTACGGTATGGGAGGTTAT
GGTCAAGGGTACGGTCATGGTCAAGGGTACGGTCATGCTGGATATGGAAT
GGGAGCAGGATATGGTGGAGCTTACGGTGGTTATGGTGTGGGTGGTGGCT
ATGGAGGCTACGGAAACATGGGTGCACCAGCCCTAGGAGCACCAGCTCAA
TCAACTGGTCCAAAATATCCAGGACCTAACCCACCTGCATTGACGTTACC
ACAAAAAGCCAAAGCACGTCAATTGATCATTACTGAAGATGATGAGGATG
ACACCAGCTCGCGAAGAAAAGACATCCCAAAAGACGGTCATCATTTACAT
CGTCTGTTAGTCTTGCCAGGAGAATGTGAAGGTGATCATTGTACTACCAA
CTTCCCAGTACACGGAGGACGTGGTGGTGGTTGTCAAGGTGCTGGATGTG
GTGGATACGGTCACCAAGGCTTCGGTGGAAACTGGGATGCAGCTGATTGT
GGTCATTCAGATTGTGGAGGTTTGGGATTTGGTAACGGATACGGTGTTGG
TTGTGGAGGCGGTGATTGTGGTGGTTTCCATGATATTCATCATCGTCCAA
TCGGATGTCCCGAATACAACTCACCAGACTCGCCATGTTTAACTTACCCA
TACGGTAACAATGTTGGTTTCGGATTTCCAGGAAAATTCCACAGCCACCA
TCCAGTTTTGTTGCACCCAACACATCAAGAAACAGCCCATCATAACATCC
ATTTATCTGGTCGAAGCCATGGTGGGCGACACGGACGTCGCCATAGCGGA
GATTTGATCGTATTACCACATTACGGGCATACTTGTTGTGGAGGTGCTGG
ATGGAATCCATACTGGGGACATTGAGAGGTATGGGTGGCTATGGAGGCTA
TGGTCAACAAGGCTACGGAATGGGAGGATACGGTGGTTATGGTATGGATG
GTGGCTACGGTATGGGAGGTTATGGTCAAGGGTACGGTCATGGTCAAGGG
TACGGTCATGCTGGATATGGAATGGGAGCAGGATATGGTGGAGCTTACGG
TGGTTATGGTGTGGGTGGTGGCTATGGAGGCTACGGAAACATGGGTGCAC
CAGCCCTAGGAGCACCAGCTCAATCAACTGGTCCAAAATATCCAGGACCT
AACCCACCTGCATTGACGTTACCACAAAAAGCCAAAGCACGTCAATTGAT
CATTACTGAAGATGATGAGGATGACACCAGCTCGCGAAGAAAAGACATCC
CAAAAGACGGTCATCATTTACATCGTCTGTTAGTCTTGCCAGGAGAATGT
GAAGGTGATCATTGTACTACCAACTTCCCAGTACACGGAGGACGTGGTGG
TGGTTGTCAAGGTGCTGGATGTGGTGGATACGGTCACCAAGGCTTCGGTG
GAAACTGGGATGCAGCTGATTGTGGTCATTCAGATTGTGGAGGTTTGGGA
TTTGGTAACGGATACGGTGTTGGTTGTGGAGGCGGTGATTGTGGTGGTTT
CCATGATATTCATCATCGTCCAATCGGATGTCCCGAATACAACTCACCAG
ACTCGCCATGTTTAACTTACCCATACGGTAACAATGTTGGTTTCGGATTT
CCAGGAAAATTCCACAGCCACCATCCAGTTTTGTTGCACCCAACACATCA
AGAAACAGCCCATCATAACATCCATTTATCTGGTCGAAGCCATGGTGGGC
GACACGGACGTCGCCATAGCGGAGATTTGATCGTATTACCACATTACGGG
CATACTTGTTGTGGAGGTGCTGGATGGAATCCATACTGGGGACATTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000015_pilon | genome | sc0000015_pilon:260115..261480 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 355-1131:778 |
| Aaloc | 346-354:802 |
| Aaloc | 229-345:922 |
| Aaloc | 1-225:1367 |
|
