XLOC_043536 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_043536
Unique NameXLOC_043536
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000015_pilon:264163..277110-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_043536 ID=XLOC_043536|Name=XLOC_043536|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12948bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000015_pilon:264163..277110- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AACTAGAGTTTCGTTGCTCTTTACAAACTCAGTGACGAACAGTTGAACGG TGGACACTGTCAGATGGTTTTCCATGCAATTTTCGGCGATAGATTTTTCG TTTTAACCTCCCAAACCTCCTTTGACCTTTAAAAAATTTTATTATCTTAC CTGCTTCTGCTTTATCTTTCACAAAAGTTCTAAGTCTTCTTTACTCATCA TGTAAATTAATCTCACTTTGCAGCTATCAGATAACTGGTTTTCTAAAAGT CCTACTGTATATACATCGTTCATACAAAAAAGATAAAACCCATCACTACT CCTTGAACTCTTTTTGGGACCTACCCCGGTGGGGTGGAGGTTCTAAAAAT TAACCTGTGTTTGTTTGTTTTTCTGTTACCAACTTTTCTCAGGATTAAAT TAATTTGATTTTTGGTACAAAGGTGCAAAATTTTTGGGCACATTTCAGCC AAAAAACAGCTAAAAAAGGGTTTTTAAGGCTTTGTGAAAAATTGGATCAT TAATTTTTTCTGATTTTTTGCATGAAAGTAGGGTAACATCATTGGTAAAA GATGGCCAGGGCAGGTTTTTGCAAAAAAAAAATTTTAGCTCAAAAAATGC ACAGTTAAAAGATATAATTATAATATTGATATAGATTGGGTTTAACACTT TACAATTTAGATAAGGAAAGTGCTTTGTATCTCTTTTTGTTGACCTTATG AATAAAACTATATCAATTATAGTTGAACAAAAGAATTGTTAAAAACCCTA AGGCAGAAATTTCACTAGGGCTTCAGGGACACAAACTGAAAACAATTGTC TTTCGATGTCAATGTTGAAAAGTTTAAGTATTATATTTATGTAAAGTATT TCAAAAAGTTTTTCTTTCTTTCAGCAACCTCAGATCATCCTTTTGAAAGA AGGAACAGATACATCTCAAGGTATTCCACAACTTATTGGCAACATCAATG CATGCGAGGTTGTTGCCGAAGCCATTAGGACCACCCTTGGTCCACGTGGT ATGGACAAATTGATTGTCGATGCTAATGGCAAATCGATCATATCAAATGA TGGAGCCACAATTGTTGGCCTTCTTAATATTGTCCACCCAGCTGCAAGAG CTTTAACAGATATCGCCAAATCACAAGATGCTGAGGTAATCATGTTTGAT GGATTGTTTGTAAATAGAAATTATGTTGCAAAAGAAGGATTTTTAGTTAA CCTAATGTAAATCGAGGATAAACAACATTCAGTCAATAAAACGTTTTTTC GACTTTTTTTAAGGTTGGGGATGGAACAACCAGTGTCATCTTATTGGCAG TAGAATTCTTACGACAAATCAAACCACTTGTTGAAGAAGGCGTTCACCCA CAAATTCTCATCAGGGGTTTCCGTAAAGCAACGCAACTGGTAAGATTTTT TGTCGAAACTGAATATGATTTTATAATGTATTATGATATTCTTTTTTGCT TTTATGTGATAGACCTTTTAAAAGAGCGATGGCTGTAATTTTTAATTTAA ATGACCCATGATGAATTTTAAATGCACTAACTGACTTGGAAAATTATCTG CTTTGGGAATAAGCCATTTTGTTCTTTATCAATAAACTTAGTGGAAGAGA CATTGCGACATGATACTAAATGTTTGTTTACACACTGAAAACGTTTTGAC TTCTATTATTCATGATAAATTTCTGTGTGCAACAAGTGACTTTTAGTGTT CTTGGTGTATTATTTCTCGTGGAAAATTATCTGCTTTGGGAATAAGCCAT TTTGTTCTTTATCAATAAACTTAGTGGAAGAGACATTGCGACATGATAAA AAATGTTTATTTACACACTGAAAACGTTTTGACTTCTATTATTCATGATA AATTTCTGTGTGCAACAAGTGACTTTTAGTGTTCTTGGTGTATTATTTCT CATGGAAAATTATCTGCTTTGGGAATAAGCCATTTTGTTCTTATATCAAT AAACTTAGTGGAAGAGACATTGCGACATGATACTATACTAAATATTTATT TACACACTTAAAACATTTTGACTTCTATTATTCATGATAAATTTCTGTGT GCAACAAGTGACTTTTAGTGTTCTTGGTGTATTATTTCTCATGGAAAATT ATCTGCTTTGGGAATAAGCCATTTTGTTCTTTATCAATAAACTTAGTGGA AGAGACATTGCGACATGATACTATACTAAATATTTATTTACACACTTAAA ACATTTTGACTTCTATTATTCATGATAAATTTCTGTGTGCAACAAGTGAC TTTTAGTGTTCTTGGTGTATTATTTCTCATGGAAAATTATCTGCTTTGGG AATAAGCCATTTTGTTCTTTATCAATAAACTTAGTGGAAGAGACATTGCG ACATGATACTAAATGTTTGTTTACACGCTGAAAACGTTTTGACTTCTATT ATTCATGATAAATTTCTGTGTGCAGCAAGTGACTTTCTGGGTTCTTGGTG CATTATTTCTCATGGAAAATTGTCTGCTTTGGGAATAAGCCATTTTGTTC TTTATCAATGAACTCAGTGGAAGAGACATTGCGACATGATACTATACTAA ATATTTATTTACACACTTAAAACATTTTGACTTCTATTATTCATGATAAA TTTCTGTGTGCAACAAGTGACTTTTAGTGTTCTTGGTGCATTATTTCTCA TGGAAAATTATCTGCTTTGGGAATAAGCCATTTTGTTCTTTATCAATGAA CTTGGTGGAAGAGACATTGCGACATGATACTATACTAAATATTTATTTAC ACACTTTAAAAACATTTTGACTTCTATTATTCATGATAATTATTCATGAT AAATTTCTGTGTGCAACAAGTGACTTTCTGGGTTCTTGGTGCATTATTTC TCATGGAAAATAATCTGCTTTGGGAATAAGCAATTTTGTTCTTTATCAAT GAACTTGGTGGAAGAGACATTGCGACATGATACTTGATCTTGCATGATAA GTTATATATTTTATACTGTTTTATATCCAGTAATAGCTAAAGTTTTTCCC TTTTTTCATCTTAACGATTTATTTTCTTGCATGAAATAAATAGAAATAAT AAAAACTAAAAAGTTAAAAATTAACACATATTTATCTTCTCTATTCCCAG GCTCTTGCTGAAATCTCCAAAATCGAAGAACGAATCAAGAAAGACGACCC AGAGTAAGCACAAACTCAATTCTTTTACTTCTGCATAGGCATTAACTTTG TATAATAAACTGGTTTCAAAATATTGCAAGCCTGCTTCGTCATAGCATCG TGATATCAAATATTTATCGCAAAAGTTCAAGTGAAATAATGCGATAAATA TTTTTCGGGCTTCAAGATCTTTCTGTAATATTTTTTTGAGTCTTTAAATG CGATTATAAATGATGACTATAGAATAAATGAAATGGTTATAATATAAAGT ACAATACCATAAATTTCGTGAAGGCGTTCGCGCAAAACCTTATCTTATTA AGTATCTATTTTACACACTTTTGACTTCAGAGAGATGAAAAACTTACTAC AGAGGTGCGCAGAAACAGCCCTCAACTCTAAACTTGTTGCTCGCCACAAG GAATTTTTCTCTAAAATGGTTTGCGAAGCTGTCATGTATTTGGATGAGCT ATTACCACTCAATATGATCGGTGTCAAGAAAGTTCAAGGTGGTGCTCTAG AAGTAAGTTCGGAAATGGTTGTATTTGTTGTCTGCTATATAGAACCTTAT TCTCTGGTGATATGACATACGACATGGTGGATAGACCTTATTTTTTAATC TTTACCCATCGCGCTTGCTTTTGTTTGAAATTATTATTGAAACTGGATCG ATGTTAAGTTATGTATACTTTTTTCCTCTAATAACAGGAATCACAACTTA TTCAAGGTGTCGCCTTCAAAAAGACGTTTTCATACGCTGGATTTGAAATG CAGCCCAAAAAATACACAACACCCAAAATCGCTCTATTGAACGTCGAATT AGAATTGAAAGCCGAAAAGGAAAATGCTGAAATTCGCGTCGATAATGTTG AGGTAGGTGAAAGATGAATGACCATTCTGAACACCTTAAGTTACCCACGG TGGTGGTCTTTTTTCTAAAAATGCCAAATGCAGTGTTATCGAACTCTGGA TATATAATACCCCCTGTGATCAGCTGTGATTTGACTGAAACTGTCGATTT AGATTGAACGTTTTTGTGTTTTTTTTTTTAGGAATACCAAAAAATCGTAG ACGCCGAATGGAATATTTTATACGAAAAATTGGATAAAATCGTAAAAAGT GGTGCTAAAGTTGTTCTTTCCAAACTACCCATCGGAGATGTTGCGACACA ATATTTTGCAGACCGTGATGTATTCTGTGCAGGTCGTGTAGTGGAAGAGG ACCTGAAGCGAACCATGAAGGCATGTGGCGGATCCATTCAAACAAGTATT CATTCGCTGACCGAAGATGTCCTTGGTACTTGCGAAGATTTCGAAGAAGT ACAAATCGGTGGTGAAAGGTTTGTATATTTGAGAAAAGATTATGCACAGG CAGACCCCTCACGTGTTGAAAACTAATACACGTTTTTTTTTTTATAAGGA ACACGTTTATAAGGAACTCGAGGCTGAAAATGGTTCAAAAAATAAGGAAT TGTTAAGGAACTGCTCAGGCTGAGAATAAGTGGATTTGAAAATAATGTAC CTTATTGGGACTAATTTGACCAAATTTTGATCTTTCAAGGGGCAAAAAGT TCAAAATTTCCTATGTAGTAAGGAACTCCATAAGGAACTTTGAGACTGAA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000015_pilon:264163..277110-

>XLOC_043536 ID=XLOC_043536|Name=XLOC_043536|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3324bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000015_pilon:264163..277110- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCGGCTGCAGCTGGAGGACCAAGATTCGCTAATGGAATGATGGCGGC
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TCAGATCATCCTTTTGAAAGAAGGAACAGATACATCTCAAGGTATTCCAC
AACTTATTGGCAACATCAATGCATGCGAGGTTGTTGCCGAAGCCATTAGG
ACCACCCTTGGTCCACGTGGTATGGACAAATTGATTGTCGATGCTAATGG
CAAATCGATCATATCAAATGATGGAGCCACAATTGTTGGCCTTCTTAATA
TTGTCCACCCAGCTGCAAGAGCTTTAACAGATATCGCCAAATCACAAGAT
GCTGAGGTTGGGGATGGAACAACCAGTGTCATCTTATTGGCAGTAGAATT
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TCATCAGGGGTTTCCGTAAAGCAACGCAACTGGTTGGGGATGGAACAACC
AGTGTCATCTTATTGGCAGTAGAATTCTTACGACAAATCAAACCACTTGT
TGAAGAAGGCGTTCACCCACAAATTCTCATCAGGGGTTTCCGTAAAGCAA
CGCAACTGGCTCTTGCTGAAATCTCCAAAATCGAAGAACGAATCAAGAAA
GACGACCCAGAGCTCTTGCTGAAATCTCCAAAATCGAAGAACGAATCAAG
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AGCCCTCAACTCTAAACTTGTTGCTCGCCACAAGGAATTTTTCTCTAAAA
TGGTTTGCGAAGCTGTCATGTATTTGGATGAGCTATTACCACTCAATATG
ATCGGTGTCAAGAAAGTTCAAGGTGGTGCTCTAGAAAGAGATGAAAAACT
TACTACAGAGGTGCGCAGAAACAGCCCTCAACTCTAAACTTGTTGCTCGC
CACAAGGAATTTTTCTCTAAAATGGTTTGCGAAGCTGTCATGTATTTGGA
TGAGCTATTACCACTCAATATGATCGGTGTCAAGAAAGTTCAAGGTGGTG
CTCTAGAAGAATCACAACTTATTCAAGGTGTCGCCTTCAAAAAGACGTTT
TCATACGCTGGATTTGAAATGCAGCCCAAAAAATACACAACACCCAAAAT
CGCTCTATTGAACGTCGAATTAGAATTGAAAGCCGAAAAGGAAAATGCTG
AAATTCGCGTCGATAATGTTGAGGAATCACAACTTATTCAAGGTGTCGCC
TTCAAAAAGACGTTTTCATACGCTGGATTTGAAATGCAGCCCAAAAAATA
CACAACACCCAAAATCGCTCTATTGAACGTCGAATTAGAATTGAAAGCCG
AAAAGGAAAATGCTGAAATTCGCGTCGATAATGTTGAGGAATACCAAAAA
ATCGTAGACGCCGAATGGAATATTTTATACGAAAAATTGGATAAAATCGT
AAAAAGTGGTGCTAAAGTTGTTCTTTCCAAACTACCCATCGGAGATGTTG
CGACACAATATTTTGCAGACCGTGATGTATTCTGTGCAGGTCGTGTAGTG
GAAGAGGACCTGAAGCGAACCATGAAGGCATGTGGCGGATCCATTCAAAC
AAGTATTCATTCGCTGACCGAAGATGTCCTTGGTACTTGCGAAGATTTCG
AAGAAGTACAAATCGGTGGTGAAAGGAATACCAAAAAATCGTAGACGCCG
AATGGAATATTTTATACGAAAAATTGGATAAAATCGTAAAAAGTGGTGCT
AAAGTTGTTCTTTCCAAACTACCCATCGGAGATGTTGCGACACAATATTT
TGCAGACCGTGATGTATTCTGTGCAGGTCGTGTAGTGGAAGAGGACCTGA
AGCGAACCATGAAGGCATGTGGCGGATCCATTCAAACAAGTATTCATTCG
CTGACCGAAGATGTCCTTGGTACTTGCGAAGATTTCGAAGAAGTACAAAT
CGGTGGTGAAAGATACAATTTGTTCCGTGGATGTCCGAACGCGAAAACTG
TGACTTTGATTTTGAGAGGCGGTGCTGAACAATTTATCGAAGAAACTGAA
CGTTCCTTGCATGATGCTATCATGATCGTCCGAAGGGCACTCAAGATACA
ATTTGTTCCGTGGATGTCCGAACGCGAAAACTGTGACTTTGATTTTGAGA
GGCGGTGCTGAACAATTTATCGAAGAAACTGAACGTTCCTTGCATGATGC
TATCATGATCGTCCGAAGGGCACTCAAGAACGACGCAGTAGTAGCAGGTG
GAGGTGCAATCGAGATGGAATTGAGCAAATTCTTACGTGAATTTTCTCGA
AACATCGCTGGCAAAGAACAACTCATTATCTCTGCTTTCGCCAAAGCCTT
GGAAGTGATTCCTCGACAATTATGTGATAATGCTGGTTTTGATTCTACGG
CCGTTCTCAACAAACTTCGACAAAAACACGCTACAGAACGACGCAGTAGT
AGCAGGTGGAGGTGCAATCGAGATGGAATTGAGCAAATTCTTACGTGAAT
TTTCTCGAAACATCGCTGGCAAAGAACAACTCATTATCTCTGCTTTCGCC
AAAGCCTTGGAAGTGATTCCTCGACAATTATGTGATAATGCTGGTTTTGA
TTCTACGGCCGTTCTCAACAAACTTCGACAAAAACACGCTACAGGAGGAA
AATGGTTTGGAGTTGATATCATGAGTGAAGATATTGCGGATAATTTCGAA
GCTTTTGTTTGGGAACCCGCCATTGTTCGAAAAAACGCCATTACCGCCGC
ATCAGAAGCTGCCTGTCTCATCCTTTCAATCGATGAAACTGTTCAAAACC
CGAAATCCGATATGAGCGGAAATGATAACCCGATAACAGGAAAACGTGGA
GGACGTTAAGAGGAAAATGGTTTGGAGTTGATATCATGAGTGAAGATATT
GCGGATAATTTCGAAGCTTTTGTTTGGGAACCCGCCATTGTTCGAAAAAA
CGCCATTACCGCCGCATCAGAAGCTGCCTGTCTCATCCTTTCAATCGATG
AAACTGTTCAAAACCCGAAATCCGATATGAGCGGAAATGATAACCCGATA
ACAGGAAAACGTGGAGGACGTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_043536XLOC_043536-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000015_pilongenomesc0000015_pilon:264163..277110 -
Properties
Property NameValue
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