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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000094_pilon:558285..564233- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_043477 ID=XLOC_043477|Name=XLOC_043477|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5949bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000094_pilon:558285..564233- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAGATAGACCTTGATTATGAAGTGCATTGTCACCCAGAAACCAACACTCA
ACTAACACCGGTCGTCATTTCACATGCATTGTATGGCTGCAAAAGTGATT
GGTCTTCTATTGGTAAAGAACTCAACTACATCACTAAAAGAAAGGTAAAT
TCCAGTCCCCTAAGAGTGTACCTTAAGGATTAATTTTCGCGTGGAATTTC
GAGAATCTAAAAGTTTCGCGTGGATTAAAGCTCTCTTTCATCTAATTGTT
TCACTTTATTAAGGTTTTTGGCCGAAATTCTGATTTTAAAATTTTCGCGA
GGACTAAGTTTCGCAAAAATTACCAAAATTCGCGAAAATCGCGAAAATTA
ATCCAAACCAAATTTAATCCACTTAAGGTACCCGAAAGTCTCGACACCGT
GTCATAGAGTGATAAAAAAATCGCGTGTTGAGATAAGGATAGGCTTGGAA
ATAATGGGCTTCTATTCACGGTATGCGTCATTACAATTACAATGTCTTCT
GACATTACATCACGGATCCGATTACATCACAGATGATTGGTTGTAAGAGA
CGTAAAATCAGTCAATACGTCATTTTCAACCAACCAGTTGTTGGTTCCGT
GGAAGACATTGCACAATGATACATATCATGAATAGTATTTTGTGTATTTC
AGATATACTGTACGGTGGGTGACAGACTTTTTAATATTTAATATTTTTGC
TTTAAAGTTTTTAAATCTCAAGTAACCGTCCTGGAAAATGAAGACTGGCC
TAAAACAGTACTGTAAAATAAAAACTGTAATGAGGCTAAGTAGGAATTTT
AGTAGGGGAATTGCTGGTTTCGGGTTGGGGAGTTGCCAGTTTTGAGTTTG
GGGAGTGACTAGTTTCGAGCTACCGGAAAGAAAAGCATGTTTTTTTTAAA
AGCACTGACCTTTATAAAAAAACTTGAACTCTGGACCCTGAACTTTGGTT
GGCTAGAATCGAAGAACTACCTCCAAGGCTTTTATCTTGACGAAGTTAAC
GTCCGTTACAGGGAGGTAAACGTGAGAAGATATCGATGCACAGAGTTTAC
TGCCGGAGTTTCGAAGACCTCTAATTCTAATTCCTTTAGAAAGCAAAACC
CGTTCACGAATTTTCTCACTTCTTTAAGATTATTCTTTTTAAGCAGTGAC
AATTCTTGGACTATACATCATTATACCTAGTGGTATACCCCAGGTATACA
ACCATGGACAAAGGGATTTCCCTGTGAAATCACAAATGATTTTTAAGCGC
GTTAAACTTCAGTTGGGAAGTAGAGTTTTAACTCTGAGTTTAAACATGAG
ACTTAAGACTTACGACCTTAGGATCTTAAGATTTAAAAGCTCAAATTTGC
TCCAATAAGGTTTGGAATATAGCCTAGAAGCCACTGGACCCCTCCAAAAT
CGAAATATTCAATGATAGAAAGCGGAAGGGCTAAAATTGCAATTTTCGCC
CGAAGTTTAAATTTGAAAAATGTTAAAATACGCTAAAATCTCAATATCTT
TCGACCATGATTGTATCTAGTGGTATACTCACTGACTTTTATATACCCTG
GACCAAGCTTCTCAATCCCAGCCAAGGAAAATCTTTGATCGGAGTTTTTT
GAAAATTGGTACCCTACTGGCGGTACTACTCGATAGCGGTGTAAATGCAT
CGAGAGCGCTAGGTCTACTTTTCCTCGAATTCTTTTGATGATGTAGCGGC
GTTAGACGTTAATTTTTAACATTGCAATGGCTTCTCCTCGGGTACCAATT
CCAAAAAAACTCCAATCAAAGATGGCAGATATTGCTTGGTCCAGGGTTAT
ATAAAGGTCAGTGGGTATACTCCATTAGTATTACCCAAGATGTGAAAAAG
AGATAATTTTCCGAATTCTTACCATCACCCTCAGGTGGTATGTTACGACG
CTGTGAACCATGGTTGTAGCAGTAGTCATGAAGATATGGCTTATAAAGAC
ATGGCGCTAGATCTGGTCATCTTGTTGGAGAAACTTAACCTTCCAACTGT
TAGTTGTATTGGTAAGTTGTTGTATTGGTAGTGTTTTGTGGAAGATTGGA
CCATTCCATTTTGTATCCATAGAGGGGGTGGGCGCACATTTCCAAAGGGT
AATCGGAGAAGAATTTTCCAGGGGGTTCTAAACGAGTATTTTAGGTAAAG
GTTTAATCTAAAATTTCCAGGGGTAAAAGACTCATTTTAATTCGTCCACC
CTGACTTTTAAGGTATGAAAATAATTTTTGCAAGGCTTCTTTTGCAAATT
TTGCCATCGTCCAGGGGGTATCCACACATTTCTAAGAATCTGTTTTTGCC
TTGAAAATGTTCGTCCACCCCCTGTATGGAAATTTGATTTTTGTCCATGA
CAAATCCTTCCCCTTTACTAATAGGTTTTGTCCTAATCAATCCTAATTGT
AGACATCCTTGACTAAAAGTCTAATGACCGATGAAACCCTCTTTTGTTGT
AAAACCCCTCTTTTGTTATATGCTTTGACACAATTCTAGGTTTTTGTATT
CCTGAGAGTTCAGGTAACGCTGTTTTGTCACTTTGTGCCTCAAATTGTTC
TTATCCTGTTCTTATTTACAGGAAGTAACTAAGGTATTTTAGGCATTATA
CCCAATTTGTTTAATACTTTGACCCCTTGAATTGCTTGAAATTGAGTAAT
TTCAGACTCAGCATTGTTCTTAAATTGGTCTTATTTTTTGGTGATTTTGA
GCCTCATTGTTCTTATAAAATTGTTCTTATAACTATATCACCTATCTTGT
TGATTCTTCGTAGGCCATCGTATGGGCGGTAAAACTTTAATGACACTAGC
CTTGACGCAACCAGAACGTTTTGAACAAGTGGCCATTATCGACATCGCGC
CTAGTGCTGAAATCCTGATTGAGAATACAACCAAGGATTTGGAGAAGCTG
GCGAACCTTCAGTTGTACAAATTCCAATGTAAAGAAGATTTGGAGGCTTA
TTTGAAAGAGCAACAACTTGTAAGGCTTTCTTTGTATACACCCAAATCTA
GTTAATAGCGAGTTTATGTATTTGCTCTTTTGAGGATGGTAGAGTGATTG
AAACAATTTGGAATAACCTGCACTTCTGACCCGCAAAATCGAGGACGGTA
AAACTGCTGATTTACCGTCGTTCTCAGTCGGTTAGGATGTAGACAATTAG
AACCTTACCGTCTCCGTCACAGAAAAACACAGATACATAAACTCGGTAAT
ATCTATCCAATGCCCTCCCAAGATGTTTCCTATAGGAAAGAAATAAGAAG
ATGCTCGAAGGTTTAAGCCTTATTTTAAGTTCATTCCTTATTAAACCTCG
GAATAGGTTGCACTAAATTCTGTCTCCAATTGACGGAAATAAATGAACGC
TAACTACCAAAATAGCAAAAAAAGGTTATGTTTACTTTAATTTTTTACAC
TGTTGTATTCAAATTTCGATTCTTTTGTTCATGGGGATGATGCATAGAGA
ATCACGTGTGCTTAAAACGTACAAGATCCCTGTTCTAGGCTGGACTAAGT
CATTTAGACGCCTCTGCAGTGGAACCAACCGCTCGAGTTTTCGCTCTTAA
TTTTTGTCCAAATTTGTGTAGATTGTCGGTTCATCTGCATTTACGGTTTC
CAATCGCTCTGGTATGTGTTACGGATAGGAAGTGTTCATACTCACTTTGG
AATGTTTCGGAGCAAGAAAACGGAGCAGTTCCATTCCGATGAAAAAAAAG
TGAAGCGAAACCGTTTCGATTGGTTTTGCCTTTTTAACGTCTTCTTTTTT
GACGCTTTTAATTATGACTTTCACACTTGTTTACGGGACCGTTTCGTTAC
GGAACGATACGGAACCGTAATATCTGAACATAGTCTTAGCACAACTTTTT
GGACCTACCCCGGTGGAGGTCCTATAAATTAACCTGTGTTTGTTCGTTCG
TCCGTTCGTTCGTCTGTTACCAACTTTTCTCAGGATTGAATCATAGGAAT
CTTTTGATTTTTGGTACAAAGGTGGAAAATGGTGGTGGCCAAAATGTGAC
GGAGCCCGATTTTCGAGAAAAAAAAATTTTTGGGCAAATTTGGGCCAAAA
AACGGCTAAAAAACAGGTTTTTTGGACTTTGTGGAAAAATGGATCATTAA
TTTTTTTTGATTTTTTGCATGAAAGTAGGGTACCATCATAGGTAAAAGAT
GGCTCAAGCAGAATTTTGCAAAAAATTTTTGTTGGCTCAAAAAACGCATG
TTTATCTATAAGAATTACTATTAATAAGCATACATCAATGTTCTTAGTCA
AATTACTCAATTTTTTTATGAGATAGATGTTTTTTTTGCTCATGAGGGCT
TACTTTTGAAGAATATGTGTGTTTAAGACAGGAAATTTTAGTTGCTTGGC
GTGTTCTCATAGAAAAACTGGCCAAATTCGATATTTTTTTATAAGCACAT
TATCAATTACTTAGGTATTAGCTTTTCTCGAGATTGGCTTTTTCATTCTT
TATGATATTTTGCACAAATATGTATAACCATAAACCTTCGAATGTGACGG
AGTCTGATTTTCAAATAAAAATGTTATTGGGCAAATTTGGGCCAAAAAAC
CGGCTAAAAAACGGGTTTTTGGACTTCGTGAAATAATGGATCATTGTTTT
TTTCTGATTTTTTGCATGAAAGTAGGTAAAAGATGGCTCAAGCAGATTTT
TGTAAAAAAAGAATTTTTCGGCTCAAAAAACGCATCTTTATCTATAAGAA
TCACTATTAATAAGCATACATCAATTTTGTAGCCGAATTACTCAATTTTT
TATGAGATAGATGTTTTTTTGCTCACGAAGTCTTGAATATGAAAGAATTA
TTTCAAGAGCATGAAATCTGGTTTCTAAAAGTTTTTTTTATAAAAAAACA
AACGACTAATTTAAATAGATCGTTACTTTTTGTGTTCTGAATGATTGTTT
AATGGTCACGTCACGTAGATATCAATTATAAATGTGTTAAATGCATAACC
AGGTAGGTCCGTAAAAGTATCACTTGTTCTTTCTCCTTTCGCTTCAGGAT
TTGCGTTTGATGCGTTCCATCTTATTCAGTATAATTCAACGTAACGATAA
ATTGAACTTAACCGTCAACCTCGCCAACGTCCGCAAAAATTATCAAGATG
TGTTGGCGTTCCCGCCCTTCCAACCAGACGTCACTTTTAACGGCCCATCA
CTCTTCATAACTGGTTTCCAGTCCCTTGAAAAGTTGTAAGTTTTTTAAGG
AACAGATAGGTAGTTAGACATGGTGTTTCAAGAGCTGCTGGCATACTAAT
AGATTCGTGCTCCTACACTATAGGTCTGTGATTCACACTAGGATATTTCA
AGAGCTAAGCACCAGTTTGCAGAAATCTTATGTAAATGTATACATGTTTT
TTTAAGCATACAGGCTCGGAGATGCTTAGTTCAGGGCTTGTCAAGGCAAA
TGCTTCCAAAGGATGTTTATATCCAAGGCAAAACTTTAGGGAAAATCCGA
AAAATTGCAGCCAAAAACAGGCAAAATCAGGAAAATTCATTTTTCATAGG
CTTAGGGTAATGCTTAGTACATGCTTAATTTTTGCTATATCTAAGCCTGT
ATATGCTTTTAAGTGCAATATGCTGATAAAAAACATATAGGATGGCTGAG
TAATTAAGTGACGTAGTCTTCCATACGCTGAAAGAATTTCTGACAATGCT
TGTAAGAAAAAAAATATTTTTACAGTAGTGTAAAATGAAATTACCGTAAA
CTTCACAAAAAAAATTTCCAGAATGGTTATAGGTATAAATCACATATTTC
CTTACTTTTTAATTTTAGTTTGGGGGATTTTCCATGGGTATACAAGCGAT
TCCCAAGTGCAAAGATCCAATACCTACCAGAACTTGATCGCTGGTTACAT
TTGGAACGTCCTGACAAATTACTGGAAATTTTCGGTGAGTTTTTCATGGA
GAGAGAAGATACGAGCAATGAAAAACGAACAATGTCAATCTCTGGGTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000094_pilon:558285..564233- >XLOC_043477 ID=XLOC_043477|Name=XLOC_043477|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1692bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000094_pilon:558285..564233- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAGATAGACCTTGATTATGAAGTGCATTGTCACCCAGAAACCAACACTCA
ACTAACACCGGTCGTCATTTCACATGCATTGTATGGCTGCAAAAGTGATT
GGTCTTCTATTGGTAAAGAACTCAACTACATCACTAAAAGAAAGAAGATA
GACCTTGATTATGAAGTGCATTGTCACCCAGAAACCAACACTCAACTAAC
ACCGGTCGTCATTTCACATGCATTGTATGGCTGCAAAAGTGATTGGTCTT
CTATTGGTAAAGAACTCAACTACATCACTAAAAGAAAGGTGGTATGTTAC
GACGCTGTGAACCATGGTTGTAGCAGTAGTCATGAAGATATGGCTTATAA
AGACATGGCGCTAGATCTGGTCATCTTGTTGGAGAAACTTAACCTTCCAA
CTGTTAGTTGTATTGGTGGTATGTTACGACGCTGTGAACCATGGTTGTAG
CAGTAGTCATGAAGATATGGCTTATAAAGACATGGCGCTAGATCTGGTCA
TCTTGTTGGAGAAACTTAACCTTCCAACTGTTAGTTGTATTGGCCATCGT
ATGGGCGGTAAAACTTTAATGACACTAGCCTTGACGCAACCAGAACGTTT
TGAACAAGTGGCCATTATCGACATCGCGCCTAGTGCTGAAATCCTGATTG
AGAATACAACCAAGGATTTGGAGAAGCTGGCGAACCTTCAGTTGTACAAA
TTCCAATGTAAAGAAGATTTGGAGGCTTATTTGAAAGAGCAACAACTTGC
CATCGTATGGGCGGTAAAACTTTAATGACACTAGCCTTGACGCAACCAGA
ACGTTTTGAACAAGTGGCCATTATCGACATCGCGCCTAGTGCTGAAATCC
TGATTGAGAATACAACCAAGGATTTGGAGAAGCTGGCGAACCTTCAGTTG
TACAAATTCCAATGTAAAGAAGATTTGGAGGCTTATTTGAAAGAGCAACA
ACTTGATTTGCGTTTGATGCGTTCCATCTTATTCAGTATAATTCAACGTA
ACGATAAATTGAACTTAACCGTCAACCTCGCCAACGTCCGCAAAAATTAT
CAAGATGTGTTGGCGTTCCCGCCCTTCCAACCAGACGTCACTTTTAACGG
CCCATCACTCTTCATAACTGGTTTCCAGTCCCTTGAAAAGTTGATTTGCG
TTTGATGCGTTCCATCTTATTCAGTATAATTCAACGTAACGATAAATTGA
ACTTAACCGTCAACCTCGCCAACGTCCGCAAAAATTATCAAGATGTGTTG
GCGTTCCCGCCCTTCCAACCAGACGTCACTTTTAACGGCCCATCACTCTT
CATAACTGGTTTCCAGTCCCTTGAAAAGTTTTTGGGGGATTTTCCATGGG
TATACAAGCGATTCCCAAGTGCAAAGATCCAATACCTACCAGAACTTGAT
CGCTGGTTACATTTGGAACGTCCTGACAAATTACTGGAAATTTTCGGTGA
GTTTTTCATGGAGAGAGAAGATACGAGCAATGAAAAACGAACAATGTCAA
TCTCTGGGTGATTTGGGGGATTTTCCATGGGTATACAAGCGATTCCCAAG
TGCAAAGATCCAATACCTACCAGAACTTGATCGCTGGTTACATTTGGAAC
GTCCTGACAAATTACTGGAAATTTTCGGTGAGTTTTTCATGGAGAGAGAA
GATACGAGCAATGAAAAACGAACAATGTCAATCTCTGGGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000094_pilon | genome | sc0000094_pilon:558285..564233 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 685-864:181 |
| Aaloc | 496-681:953 |
| Aaloc | 292-495:3185 |
| Aaloc | 163-288:4066 |
| Aaloc | 19-162:5950 |
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