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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000026_pilon:383210..389883+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_043460 ID=XLOC_043460|Name=XLOC_043460|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6674bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000026_pilon:383210..389883+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAAGCTACCAATCAAGTTTTTGCTATGAAAACATTGAATAAATGGGA
AATGGTAAAAAGAGCTGAGGTAttctgattttctttttgtttcatttaCC
TTAGTTGTTTCCCTTGGGGGCAAGTTACTCACAAGCAGCAAGGcttaaaa
gaaattgtaataTTTACTTCTTATAGGCAAAACTGATTCTATACTTTTAG
CTGTCTTCGTTTCAAAATAAGTAAAGACCCTGAgttttaaagcactttga
atttcaaaaatgtttaaaaagatGATTGGTGTGTGTATAATTCTTCAATA
TTTTGTGTTGAGTTTGCAGAatcataaatgtatataaaattggTTTCTAT
TCTCTTTCATTAAAAGACGGCTTGCTACAGAGAAGAACGTGATATTCTTG
TGTTTGGTGATAAAAGGTGGATAACAAAACTACATTATGCATTTCAAGAT
TCTGGTAATTTGGTGAGTATGCTTTGGAGTTGCAAAATAGTGGTATAATT
CTGTTTTTTATGCCCTAAACCTGAAATGAACCCTTGATTAGAAATTACTC
aaagtgtgcagaggggtccagccccccagcatttttcagggggggggcta
agggAAATAAACCccggctaaattctagaaacatagcccccatcttcaca
aagcaaaatatctaagaaattttgcatgcaaATTGGCGATAAATTCATTG
CACCGCAGAAAAAGCTCTGCtcccagttctattacacaacactcagcctt
ccctagcaagctagcccccagtattttttgGAGAAATACAGCCCCCACTC
AaacaaaaatggtttagcccccctCCCCAAGCTCaggggggtgcattcta
tggTACTGTGGTACCTAAAATAAGGTTCAGATTTTAAGACTTTTTactaa
acaatagaaaaaattcaTCTAAAACTTAATTAgaattcaaattaaaatct
GTTAGCATGTTCATcccttttcaatgatttttagaATATCCTTTTACTTT
TTTCCTTATAGTACTTCGTCATGGACTATTATAGTGGTGGAGATCTGTTA
ACATTGTTGAGTAAATATGAAGATCATTTGCCTGAAAGCATGATGAAATT
CTATGTGGCAGAGATTATTCTGGCGATCAATTCAATACATGAAATGAATT
ATGTTCACAGGTAcagttgaaatctttttttaaattccagCCTTGATGAG
CCATTCCAAGAAAACATCAACCAACACCTCTATCAGTGGTGTTGGTTGCT
TTGAACAAAATGACGTTTTATCTGAACTAGACAGTTTTGTTGACTTTTGT
AAAAAGAAAGAAGTCGACAATACCATCATTACAGACATAAATGTTAAAAC
ATTGGCATatatcaaaaaatgtaaaaaacagAAGTCACCACGGCACCTTC
AATTAACCAAACAGTATCTCAAACAAAATAATCTTTTGGCTATCCCATTT
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ATTAAATGCGATCGTGAACTTGCCACAGTTTGAAAAGGTTTTGCCGAAAA
GGAAAAATGAACGAAATCCTATCTTGAAAGAAGAAGACCGCGTCGTCAAG
TGCCTGTCAGATCTTCACATAAAGAATAAGATATCAGAGAAACTTTTCAA
GAAACTAAAACCCATCGGTAGTCAACCACCTCGCTTGTATGGCCTAGCGA
AAGTCCATAAAAATGGTTTACCGGTCAGACCAGTACTTTCAATGCCTGGC
TCAGCTTACTACAACATCGCAAAACAAACCGCCGAATGGCTTTCCGTTGT
CAACGAATGCTGCATCAATACATCTTCGAAATCCATCTCCGATAAATTGG
ACGAAATTGTTTTGAAAGCTGACCATGAACTTGTTAGTTTCGATATCGTA
TCTTTGTACACTAACGTTCCAGTTCTTGAAGCCATCGATGTTTGTGCTGA
TCTTTTATATTCTGGAGAATACAAAAAGCCTCCAGTTGATAAAGAAACTT
TCATCgaactgttgaaaatttgcagTGAAAACGTAATAATGCTAACACAC
GATGGTCTTTACAGACAAAAGGATGGTTTGGCGATGGGCAGTCCCCCAGC
ACCAATGCTGGCAAACGGCTGGTTGAGTACGTACGATCCTATTATAAAGG
AGGATGCTATGATTTATGAAAGATACGTGGACGACATCTTACGTGACATT
CATAAAGATAAGATCGATGACACTCTCGAGAAAATCAACACATTGAACCC
AGAGTTTCTTAAATTCACCGTCGAACACGAATCTGACGATAAGATCGCGT
TTCTTGACATGGAAATACACAGAACTGTTAACCGACTCCAGTCCACTTGG
TTTACCAAGTCGACCGATACGGGTTTGATGATGAACTATCTTGCCCTTGC
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TCAGAGCTTGCAGtaattttataacttttcatGAAAGTATCGAAAAAGCA
AAGGTGATTTTGGAGAGAAATCAGTACCCTAAAGAGTTCGTTGATAAAAT
TGTTGAGGAAACTTTAAATAAACTAGTTGGTAAACAGGAATCAGTTGAAA
AAGAAACAActgatgaaaatgatgaaactGAAAAGCATTTGTTCAAAATt
caatatcggggaaaaatttctgATGAGTTCAAAAATTCTTTGGGAAAAAT
TAATGCTCCATGTCAAGttgtttttaaaactaaaaaattaaaaaccgtTT
TGCCAAGTTTAAAACCATCTGTCCCGACTTCGTTAAAAAGCTCTCTGGTT
TATCAAATTAAATGTCCACGCTGCAGTGCGTGCTATGTCGGTTTCACACG
CCGACATCTTATCAGCAGAGTAAAGGAACACGGACAACCGAAAAAACCGG
TGGCAAGACACATGGATGCTTGCAACCACACCCTAGATATGGATGACGTC
AGTATTTTAGCACGTAGCACTCGTACAAAAAACGTCGAGGCTCACTTATT
GACTCTTGAGGCTCTTTTTATTGCACAATTAAAGCCTTCTATTAACACGA
GAGACGAATACAAAAGCCATGAATTGGTCATAaaactattttgatttttt
ttttttgtcacttgAGAATTAGCTCTCATTTAATTAGGTTTTGtaggttg
tttttttcaatcaaattttttcaatcaattttttttttctctttacagTA
GGTTATGTGTAGTTGTAGTGTGAGATGTATATGATGTTTTTACTCTAGAT
TTTAATCTTgtttttattctaatttttagCCTGATGATGATCTTAAAAAT
GATCGaaatatattgcaaaaaataaaaatcaaaaggatTGTTGGTTCCTC
TTTATGAGATCTATCAGTGGGGGGCAATCGCTTTGTGcaaatgcgtgaat
gggctttggCATTTGCGTGAAAAATTAGTGTGACTAAGTGAATAAGGTCA
GCTGGGACTCATCAGTGCTATCAAATGATGCATGGGTCCTACCTACTGAT
ATCCAGTCAAAAAAGTGTGATACAATGTACCAGAATGTACCCCTTATTTA
AAAATGCTAATTTTGTGATAATTTCAGAGATATCAAGCCAGACAATGTGT
TAATAGATGTGAATGGTCACATAAAGTTGGCAGATTTTGGATCTTGTTTG
CAGATTGGACCTGACGGTTATGTAAGTAAGGCTTTTACTGATACTAAAGC
TTCTTTGTAAAGATTACCTACTATAAAACTCCACCTTGAAATTGGGATTT
AAgtttaagttttaaaaattattttccaagaGACCAGACCCCATTACTCG
ATAAATTCGTTAATCAAACAACTCAAACTTACTCAAACTTACTCTCGAAC
CTACTTGAACAAGTAAAGTCCGAGTAATTCCTTTACTTgaacttttggaa
attttcaaaaattggtgaGGAGTTCCAAAagtttgagaaattcaattgaA
GAAAAGTTCGATAAGTTTGATTAGTTTTACGAGCCTCACCGGTAAAATTT
AGgagcaaaaagaaattaaatcttCCTATTTTATCAGATGGTATGCTATG
GTTGAACTAGAATTGgcagattttcaattttcaactttattCGAACTTCA
CTCAAAACTTTTAATATACCTAATTACTGGAacttatatttttgaaaaat
tttgaggaGTTTGAGTAATTTGTTTACTCGAAGTTAACTTGTTTGAGTAA
GTTTGAATAAGTTCGGAGTAAAAAAGTGGTTTGGGATCGAGTAATGGGGT
CTGGAAGAGAATATTTGAAACATGTCTCTAATGTTTTTCATTAGAATGTT
ATGTTAATCAgaacttttttacatttttaaacaGGTCAAATGTTCAGTTG
CAGTTGGAACACCAGATTACATTAGTCCTGAAATTTTACAGGTAAGTTCT
TTTGGAGGATTAGAGGGTTATGTTGTGTTGAACAAAACAGCCTAACGCTT
GATttcctaaaaattaaaataattggtgtgatttttcaacctttttacaa
aagtcttgaaaaaattaGAGAGTTAAAATTGGATGGGAATAAAAAGATCT
GTCTAATTTTTCAACAGGCAATGGAAGATGGTAAAGGTCAATATGGAAAA
GAATGCGATTGGTGGTCACTGGGTATTTGTTGTTATGAAATGATATATGG
GGAAACACCATTCTACGCTGAATCGCTCATTGAAACCTATGGACAAATCA
TGGATCATAAGGTATTTTATAGAAACTGATGAAAGGGATCtttttttCAA
CTCTTCTTTTAACTCAGCAAACGGCCAACATGACAAAGTACAAATTATGT
TTGAGAGTTTAAAATTCTCTCTCTTTTAAAAAGGAAAGACTCGATTTTAc
tttttaacactttttattcagagtaaattcaaatttccagaCGATTATGA
AGTATCAGATAGTTGCAAGAACCTTTTATCCAGGTAATCCGTACTCAGAT
TCTATCATTCCTTGAGGCTCAAGTTTCCTATATATAACCATGTAAAATAG
TTACATAACCACCCTCCCATAGTGGAGTGaaatgaagtattttttttaaa
agatttttgcctTGTGGAGGTACCAGAATGATATTGATATTAGTCTCTTC
TAATTAATCTCTCctaattgcatttcgcgggtttcaattttcgcggtttt
gcccttatttggacaaatttctttcactttcctaggggttttgcaattct
tttgatagaattggaaaaaattgtatttcgcagGTTCAAATTTTTGTGGC
TTTGCCAAATAACCGCGAAAAACACTAAAATCAATTcacgtgaaaattag
ttccaataaggtaaatAATGATTTTAATGATTTACATGCATTAATATTGC
TCTAAATAATTTCAGTTTGGTTTGTGATGCTGATAAGAGGCTTGGTAAAA
GAGGACTTCACGATTTCAAGCAACATTCGTTTTTCAATGGAATCGATTGG
AATAATATTTTAGATAGTAAGTAAAACCGATATGATACTGCTAGCTGAgt
acatatttttttggaaaaatggatGCACGTGTAGCTTCTGGCTTTTCCAT
GGACTGGACTGCACTGACAAGTGGCCTAATGTAATATGGCAGACTCCATT
TTTCGGCTTTGTTTGAGCATGCAATCCATTCCACTAGATACAATCATTtt
attgaagaaaaacaaacagaaaatcaTGACCAAGTGATAATTTATAAAAC
TTATTGTAGCTCTTTAAATCTCAAAGgggtttttgaaataaatttcgttt
tgttgtttttatggaatttttaaCAACTAAAGTGAACACTTTTAAGATGC
AAAATCCTCTAGTCTCCTCACTGGTCTCTTAGAGCCATAGAAAACATCAG
AAATCAAAGTTCAGtcaaaaataaactatatttcTACTACATTTGGatca
attgaattgaatttttaattCTTACCGTAGAATCAAATTTTTGTAACTAC
TAGTCGCTTGTTATTCGACAGGCCTTGACTGGTATGTTTAGTCTTTTTGC
TACTTTAACGTTTGCCATTGCATGCCCTTTTTTGAGAGATTAAATAAGAA
ATCTAACATTATTTTAGTGAAgtaaaaactacaaaaaataaatttgaatc
ttcaaaaaattatatttaaccTACCTTACCAAATACTTTCTGTACAACCC
TATTCAAATAGTCCATTGCAAGTCTTTTTCTCTTGTTCATGTCAAATTTC
ATGTTGCCAAACGCTCTGCAAATAATCTTAAAGCTCTTCATGAATCCTGa
caagatgtaagattgttatTTTCCTGTTGAGAAGATCTCCCTTAGATAAG
ACAAGGTCaatcactttatttttttgagacGTATATTTAATTGATTTCCC
TGTTACCTGCATGCTATTATCATAAGGAATAGGTAGATCTGTATCATTAT
CaatttgttttgagaaaatctttaaaatacaTTTCAGTGAGTGTAGATAA
TTCAATAGCGACTGTCTTTTGCAGAGCGTCTTTTATTGACGTGCCAGAAA
AACTGTGACAAAATTTGCTGCACTGGTATTGACGCTTCTTGCTTGTCAGC
TGATGGTTATCTTTTTCTACTTTTCTCTTTCTCAGTAACGCCGCCTTACG
TGCCCGAACTGGATGGTCCAACCgacgtttcaaattttgatattgacGAT
CTGATGGAAGCAAAAACACAGGTA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000026_pilon:383210..389883+ >XLOC_043460 ID=XLOC_043460|Name=XLOC_043460|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1722bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000026_pilon:383210..389883+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAAGCTACCAATCAAGTTTTTGCTATGAAAACATTGAATAAATGGGA
AATGGTAAAAAGAGCTGAGATGAAAGCTACCAATCAAGTTTTTGCTATGA
AAACATTGAATAAATGGGAAATGGTAAAAAGAGCTGAGACGGCTTGCTAC
AGAGAAGAACGTGATATTCTTGTGTTTGGTGATAAAAGGTGGATAACAAA
ACTACATTATGCATTTCAAGATTCTGGTAATTTGACGGCTTGCTACAGAG
AAGAACGTGATATTCTTGTGTTTGGTGATAAAAGGTGGATAACAAAACTA
CATTATGCATTTCAAGATTCTGGTAATTTGTACTTCGTCATGGACTATTA
TAGTGGTGGAGATCTGTTAACATTGTTGAGTAAATATGAAGATCATTTGC
CTGAAAGCATGATGAAATTCTATGTGGCAGAGATTATTCTGGCGATCAAT
TCAATACATGAAATGAATTATGTTCACAGTACTTCGTCATGGACTATTAT
AGTGGTGGAGATCTGTTAACATTGTTGAGTAAATATGAAGATCATTTGCC
TGAAAGCATGATGAAATTCTATGTGGCAGAGATTATTCTGGCGATCAATT
CAATACATGAAATGAATTATGTTCACAGAGATATCAAGCCAGACAATGTG
TTAATAGATGTGAATGGTCACATAAAGTTGGCAGATTTTGGATCTTGTTT
GCAGATTGGACCTGACGGTTATAGATATCAAGCCAGACAATGTGTTAATA
GATGTGAATGGTCACATAAAGTTGGCAGATTTTGGATCTTGTTTGCAGAT
TGGACCTGACGGTTATGTCAAATGTTCAGTTGCAGTTGGAACACCAGATT
ACATTAGTCCTGAAATTTTACAGGTCAAATGTTCAGTTGCAGTTGGAACA
CCAGATTACATTAGTCCTGAAATTTTACAGGCAATGGAAGATGGTAAAGG
TCAATATGGAAAAGAATGCGATTGGTGGTCACTGGGTATTTGTTGTTATG
AAATGATATATGGGGAAACACCATTCTACGCTGAATCGCTCATTGAAACC
TATGGACAAATCATGGATCATAAGGCAATGGAAGATGGTAAAGGTCAATA
TGGAAAAGAATGCGATTGGTGGTCACTGGGTATTTGTTGTTATGAAATGA
TATATGGGGAAACACCATTCTACGCTGAATCGCTCATTGAAACCTATGGA
CAAATCATGGATCATAAGagtaaattcaaatttccagaCGATTATGAAGT
ATCAGATAGTTGCAAGAACCTTTTATCCAGagtaaattcaaatttccaga
CGATTATGAAGTATCAGATAGTTGCAAGAACCTTTTATCCAGTTTGGTTT
GTGATGCTGATAAGAGGCTTGGTAAAAGAGGACTTCACGATTTCAAGCAA
CATTCGTTTTTCAATGGAATCGATTGGAATAATATTTTAGATATTTGGTT
TGTGATGCTGATAAGAGGCTTGGTAAAAGAGGACTTCACGATTTCAAGCA
ACATTCGTTTTTCAATGGAATCGATTGGAATAATATTTTAGATATAACGC
CGCCTTACGTGCCCGAACTGGATGGTCCAACCgacgtttcaaattttgat
attgacGATCTGATGGAAGCAAAAACACAGGTATAACGCCGCCTTACGTG
CCCGAACTGGATGGTCCAACCgacgtttcaaattttgatattgacGATCT
GATGGAAGCAAAAACACAGGTA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000026_pilon | genome | sc0000026_pilon:383210..389883 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 775-861:6588 |
| Aaloc | 673-771:5367 |
| Aaloc | 610-669:4872 |
| Aaloc | 466-609:4568 |
| Aaloc | 409-465:4335 |
| Aaloc | 316-408:3579 |
| Aaloc | 166-312:1012 |
| Aaloc | 70-165:367 |
| Aaloc | 1-69:1 |
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