XLOC_043359 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_043359
Unique NameXLOC_043359
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000046_pilon:1529495..1537528-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_043359 ID=XLOC_043359|Name=XLOC_043359|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8034bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000046_pilon:1529495..1537528- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTAGAAGTCGAGTACATCATGATGTTGCAATTATTCATCGCTATTTATTT GGCATCAGGATGTTTTGCAGACATTCTAGGTAGGCTGTTTATAATAAAAA CGCCTTCAAAGGAATCAGTTTAAATGTTTTCAACTCACGGGGCAAGGAGA AAAATCAAGGAACCAAATGATATGGAAGATTGTTAACCCTTTAAGTGCCA CGGTCATTTTCTTCTAAGTTTTTTAAAGAAAATCGCTAGTTCAAACTTTA AAGGCTTATATCTCGAGATCTAGAAGGAGTTAGAAGCTTGTTCATAGCTC GTTGGATAGTTTAGAGTCTTCTCTTTCTTTAAGGCCGCTGCGCGGACCTG TCTAAATGATTTAAAGATGCCCAATGGTAAAACTACAAATTAGTTCGCTG TAGGAAAGAATCAAGTAAAACAGGGCCAAATTTTGAGGTTCTTGGATCAC TCGTTGACCAAAAATGGTGAAAAAACGGTCAAAATCTTAAAAGAGTGGAT TTTTGTCAAATTTTTGCATTTTTCTTTGCATTTTTGGCTTAAAATTTCGC TAGAAAGACTCCTTTAGATTTTTCTTTTTGCTTGACCATGAAGCCCAATC CAATTCCTACGAGTTGGACCAAAAATGACGATTTCTAACTTAAACTGGGA ATTACAGGAGGGCTTCGCCCTCCAACATAGCCCATGTCTGATATATACGA CATTGGCATTTACAGGGTTAATTTGAAGGAAATGTCAAATTTGATTTCAG AACTTTATATGGTTGAAATAATTTTTCATGTTATGAAATTTTTGAATAAT TCATGTGAATAAAGTCATTTGTAGGGGATCTTAACTTGGCCTGTGCAGCT GCTGGTACTTAGAAATTTGTTAAAATTAGCTCTAAATAAGTAATTTCAAC TCATATCTCCTTAAAGGAATTTTTTCAATATGAAAGATATTAAAGTTGGT TTGAAAAAAAAAATTGACTAGAAATTTACCAAATAGTGACTCTTTTTGAA TTAGTTTTCTCTCCTTTAAAGTTGAAATGATCTCAAATATTTTTCAGACT GTGGTAATGGTTCCAAACTAAGCCGTATTGGATGTTTCACAAAGAATGAT AATGCCCCTACCAAGTTCATAATGAGAAAGCCAGTTTATGGTGATGGATC AATAAAGAAGTATTTCCTTTTTCTTCAAATAGTCATAGCTTAAAAGATCA GGGTGAAATGAAACCTTCCGGCGAGTTAAGGAATTCTTTACAGCCAATTT TCAAAATTCTGCCCTTTAGCTCCAATCATAGGCCAGGCTAAGCTTGTCCT TAAATTTTCTTCTCTTTTGCATTTATGTATGTCTTTTAAAGTCCAGCGAT TATTTCTAATTGCAGTTTGGCTTGTGAATGTGCAGGAAAAGCAAAAGAAG GAGCACTAGTTCTATCGAACTACGAGGAATGTTCTGAAATTAAGGCTGCG GATCACGGGAGTCATTATCCTGGTCAAAGTTCATACGAGAAATGTTTCAA CTCAGTCTTTCAAAATTGTGAAAAGGGTCAAAATTGTATTGGTACCATTT GTTCCGTTTACATTTATGCAAAAGTAGGTATGTATCAAGTTGCATTTAGC CTGAGATCAGGTCGCGAATTGTTTTCTGTTCACCACGCTAAAGCTCTAAA CGAATGGGTGAAAACAAACGATCTGAAAAATATTCAATCTCGATTTACTT TTAAACCTATAAGATTTTACTATTTCAAAGCGAAAACAAGCTCTCTCTCT GATTAAACTCCCGAAAAGTTCTTGTAGAATTTAATTCGCCATAACATTAT AACAAATCAAAGGCTTTATATTACTGAAAAGACACAATTAGTAATAAGAG ATTTGAACCATATATCGCTCTGTTTAGTTTTCACTCAGTTATACCAGGTG AAACATTTTGCCACTATGCCATGGCAAGGGATACTCAGTAGTATACAGAA CATTCCCTACAATTTTACATTTATTGAAATTAAGGCGGTGGTTACACGTA GCCGGGGTGAAATTCACCCCGGGGTGAAATAAAAAAAAAATTCACCCCGG GGTGGAATTCACTCCGGTCTATAAAGAAAACACTGTTTCTGTATACCCGT ATTTAGGCGGGGTGAAATCGTTTTTACGCGGGTTGAACTCACCCCAGGGT TGATTTCACCCCGATCCTGAAATCTTTAAAAAAATTCTAAAAATGAAGAT TTAAATGGAAGAAGATAAAAAGATCTTGTAGAAAAGTGCTATAACTATCA TTTTCACTGAAGTGAATCCTTGATCATCGAACGTCATCACTGTGAAAAAA ATTCTCAAAAATAATTATTTGTCAAAAGATATCAAACAAAGTTATAAGCT GATTGACGTCTAAAAACGTTGTTTTCTGCTGTTTTCTGCTGTTTTTTGAG GTCAATCACTTATTAACTTTGCATCATAACTTTATATTGAATAAATATTT TAGTAAAATTTCTTCACAGTGATGACCTCCTAAGATCAAAAAATCTCTCC AGTGAATATGAAAGTTATAGCACTTTTCTACAAGATCTTCATTTTTTTCT TCTTTATTTTCATCTTCATTTTTAGAATTTTTTTAAAGATTTTTTTATTT TAAATTGCTTCACTCACAAATATCTCTCTAATGATACCAAATTTATAAAG ATTGGAGAATTCCTTCAAAAGTTATAGGTAAAAGAAAAAAAAGTGCACAC TTATCGTAAACAGACTTTACGTTTTCACGCCGGGGTGAAAATAAGTTAAA ATTTTCACCCCGGACTGAAAAATAGGGTTTTCACCCCGCCTTTCGCCGAC GTGTATCCCAAAATGATTTTCACCCCGGGGTGAATTATTTTTCCATTTCA CCCCGGGGTGAATTTCACCCCGGTTACGTGTAACCACGTTTTGATAAACA ATAAAGTCAAAATTGTCCCAACCGTTCCCTTAAGTTCAGTGTTTGGCGAC TATATTGTCTCTATCAAATTAAACTATTCTTAAGAATCCTTTAAAATCAA TTTTAGTTGATGGAAAATGGAGTACATGGTCTGCTGTCGGAGGATGTAAT AAAAAATGTGGTCCAGGGCGCCGACGATTCACAAGAAATTGTAATAATCC AAAGCCTGCTTTTGGTGGAAAATCATGCGTAGGACCGAAAATCAAATTCG ATTCCTGCAACAATGGAGCGTGTATTCCAGGTATTCTTTTTTAATCACGG TGTAAATCACTTTTGATTGAGTGTATTTTATTGTAGGAGATGTATATATA TGACCCTGTCTCACAGCTCCAATGAAACTTCTTCCCGTATTGGGGATGAG AAGTTCTATCGAAATCCAAATGAATTCAATGAGGATAGTAATTCTATTGC TCTAAGGTGAAAATATCCAGTGGAGATGGTTTTTCGTAGTGCAATTTTTT CTCATCGAATTTCAAATGGGGATGAAAACAAAATCCATTTCTCAGTGGGG TTGAAATTTTTGGGGTATTTTTCCCACGGGGGACGAAATTTCGGCCAAAT CTTCCAGTGAGTTGGGGGTCCCACCAAGTCTGTGACACAGGGGTGTATAT TGCCTATATTGTATTTAAAATACTTCGCATCAAACCTAAACATTGGCCAA AATTGTCTAATTGCCCCGCGGGGCTTTTGTTGGTTCTCGCAGTGGGCTTG TTCGCCAGAAGAATATTCATGTTCATGTTCATGATGTTGTTTCTTTCGAT TCTGAGCGGGCCGCGGCGGTTAAAGGATGCTCGCGCGCACCTCTCGTTTT ATCTATTTTGTTGTGAATTTTATTAATTCCCACGTTTTAGTTCTTACAAA GTAAACAATGGATGGCGCATAACATGAGCATTTTTATTTTTCTTATAAGC ATCTACTTTATAAGCATCAAATCAATAACTCTTTATAGACGGTGATATAC CCTTCGGTAATTAGTTCTTACAAAGTAAACGGCGCATAATTTGGGCATAT TCATTTTTCCTATGATTTTTCTTATAAGCACCTACTTTAAAAGAATCAAA TTAATAACTCTTGATAAAAAGCCATACATTTTTCGGTAATTAGCTCTTAC AAAGTAAACAAGGGACAGTGCACAATATGAGCATGTTTATTGTTCTTATA AGCATCTAGTTTATAAGTTTCAGATCAATAACTCTTGATCAACAGCTTTA TACCTTTTGGTATAGTTCTTATAAAGTAAACAAGGGACAGTGCACAATGG GAGCATTTTTATTTGTCTTATAAGCACCTACTTTATAAGAATCAAATCAA TAACTTTTGATAAACAGCCATATATCTTTCGGTCCCGGGGGGGGGGGCAG CTGGGCAAAAGGACCGACGGGTATGTGCGGGTCCTAAGGGTACCTTTTCC AATATGTTTAAAATGCACTGTAAGGGTCGGAAAAACTAGAGATGCACTGT AAGGGTAGAAATTTCAGAAAATTCTTGAAAAATCTAGATATTTTGACCAA AAATGCTAGAATTTTGACCATTTTTTGCACGAAAGGGATCGAAAATTGGG GGAAAATGCACTCTAAGGGTATGATTTTCACTGATTTTTGCTGCACTGTA AGGGTGCAATTTTAAAAGCCAATTTTTGGCCCGCACATACCGTCAGTCCG CAAACCCAGTGCCCCCCCGGGCTTTCGGTACAGCGAATAGAAATTTCCAG CTGTGCGCTTATTGGATGGCGCTCCAATAAAACGATCTGGTGGAATGCGG CCTTCAAACGTTCATTCTCGATTATGAATGCGTTCGCGGGGCATTCATAG CGACAGCTACTTGCTAGTAAATATCAATGAAATAAGTAGTAGTTATCCTG TATTGTACGACCGAGTAAAAGTGTGATAACTGGTTTATCGTCAGCTTGAA AAATATTAACAAACTTTTCTCTCTTCATTTTATTTGTGTTCTCTTTCTTC TTTGTTTTGGTTTTTCACAAATCAACATCAAAACATTAAAATCTTCGAAA ATGCGATTCGAATGCTCGAATTAAGATATTAAAATATAAATAAGTTTTGT GAGTATTGAGAGGAAAAAAGAAAACATTCCTGAGAATAACTTTCGAGATA AGATACAAAAATGAATTCAAATATGATCTCTCGTTTACAAGACCCCTTTT TGAACGCGGTCTTGTATGTGTACGGTACAATATAAAATACAGCATTTATG TATGCGTTTTTATATCTCAAGCAGACGACGACATTGAGAAAAGTCACCAA AATCTGATTAAAAGTAAAGTCTGTCTCAATATAGTTTGCAGTGGAGACAA AAAAGGCTGTAACTTTTGATAGAATTCGAATTAGAAAACAGTTTTGTGCT CGTTTGAAAGATAATCCAGAGTGGAATATTTGCAAAAAAGAAAAATCTTT AAAAATGGAAAAAAGAAGATGAAAAAAGAAGAAGAATAAAATCAACTTCT TATAGATTAATGCTGTGATCTTCATTTTTATATCAGAGGTTCTTTAATCT TAGAACGTCATAAATGGGAAAGAAATCAAAGAATATTTGTTTAGTCAAAA AATACAACTTAATACTTTGCTTTGGTCGAAGGGCACTTTTTTGTTGTTTT TAGGTGGTTTTCGAAAAGTTAAGATCAATCTATCTTTGATCTAGTCTAGC TTGGAAAGCTTGTAATAAGTTAAACAAGATATGGCACTCTAATTTGTTTA ACGTTCTCAAACTTCAAGCTTTTAGAAGTCTTGTCGAGCCCATTCTTCTT TATGGCTCAGAGACTTGGACTATGACAAAAACCATGCTGAAGAGCCTGAT GGCTGTTATACAAACCTTTTGAAAAGAATACAGAATCTTGATTGGCGCAA CCACCCAACCCTTCACGAGATCTATCATGGACTCCCAAAAATTCCTTCTG TCTTGACAAGCAGCATGCTCTCTTTCACAGGTCAATGTTTCCGTGCACAA AATGAAATCGTATCTGAAATCCTACTTCGGTGTCCTGCTGGCCCTAAGCG CTCGAAAAAGCACACACTTCTTGATATTTGGAAACGAAAAACAGGAATAG AGATTGAGGAACTGAGTACTGCAATGGCTGATCGCAAACTGTGGATTGAT AGTTTATTCTTTGTTTCCTAGGTGATGATAATGAGGATGCGTTTTTAGCC AATCAGATTGCTCATATTTCTCATGTTGACGATAAAGGATGGAAAATTCC AAACGTTGTATATTTTTCTTTGTCTTTTGATGTTTTTTTAACTTTATACC CCTGTCTTTGTGCCTTACCAAGAACCCAGACTGTTTTCAAAATAAAAATA ATATACCACCTTTCTTTCTTTTTAGATTTAAGAAACCAAGGACAAAATTG TTGGAAAAAACCTACCTATTTCTGTGGTAAAAAAGGTCTTTGCAGTCGAA AAGGATGGGGTCGATGGCAAGACGCTGCATTCCCCTGCGTTAATAGGCAC TGTTGTACTGAGCCAGCTCTTGTTAAGAACCTAGGTAAGATTAATTTTTC ATTGACCTTAAAACTATTAGGAGTTTTAAGAATTTTGCAGAAATTTAGAC ATTCCCTTCATTTAAGCTCAGGGAATATAATAGATAGCCAGTGGATACAA GACGTCGAATTTGGTTGGAACAAAGTAATTTTATAAAACGTTGAAGCTAC CCGCAACAAAAACAATATGCTATCCAAAAGAGGGTTCCGTTAACTTGCAT GAGAAATGAGGTGCCAAAATTCTGCATCTTTATACTACAGTTCTGTATTT TCATAACAAAATTATATTTAAGGCTCAAATTGCTGGTCGAAGTGTGGTAG AAAGGGTGGTTACTGTCCTGGATTTTGTGGCGTGAACGGGCGTTGTTGTC GAAGAGGATGGAATGATGCTGGGTGCGCAGGAATGGCAACGCCGTGTAAT GGGAAGCATTGTTGTACAACTAAAAGACGAGATGTCCAAAATAGCGGTTG GTTCATAGTGTATTTACAGGGTGTCCCGAAAAAAAAGTTACGTGTTCGAA TATGATTCTGAGTAGAAGGTTGTTGCGTGTGTTTAACAAAATGTAAGAAA ATGTATACCACCACAATAATTGTTTTTACAACAGTCGTTATGATAAAAAA GAATTAACTTTCTTTACAATTTTCATGACGTTAAAGTTATTGAGAATTGT TTTTTGTAAACGCCATTCATAAAAGATGTCTCATGACAATTAATATGAGG GGGGGGGTTGTACTTTTTCGGTGTGACGGGATTGGCCCTTTTTTAGTACG GTATTACGGGATTTGACGAAAAAAGAGACGGGAAAACGGTATTTTAAAAT CAGACGGTGACGGTATTTAGGTACATTTTTGCCCTGTACAAGCCGGTGTG ACGGTGTTGTTATTTTTCCAATTTTCGGGATTACGGGATTCAGCAAAATT TTTGACGGGAAAACAGTATTTCGAACCCCTACAAACCCCCCCCCATATGA CATAGAGAAAAACTTTGATAAAAATAGCAAATTCAGTGAAACACACACAA GAACTTTCTTTCTATAGAAGTGGTACGCCTTGATTTTTTCGGGACACCCT GTAAAAGATTTTGGCTTTTTATCTTTGAAACTGTCGGTGTAGATTTAGCA TAATACAGTTGGCATTCCCAAACTTGAATTTCAAGGGGCATTTTATTTTC ATAAAGTAAGGGAGCCTAATGAATAGTAGAGTATCGTTTTTAAGAGTTTC TTGTCGGCAGTGACTTTAAATTATTGAATAGTAGAACATCGAAATTAGAG AGTGTCAAATGTATTCCTGAAAAAGTGGTTCTAAAAAAGCTCTAATAACT TAAAGAATATTTAGAACCAGAAATTCGAGTTCATTTTCCCATTCCAACCA ACCAATCAACGTTCATTTAACGTTATATGTTTTACTCTGTTTTCTCATAC AGGTAAAAACTGCTGGTGGAAATGTAACAAGAAAGATGGGGAATGCTCGA CAGGTTTTTGTGGTAAAGACGGAGTTTGTTGTCGACGTGGTTGGGATACT TACAGATGTATCCGGACTACTGGTGCATGCAGACACAAACATTGCTGTGT CGGTACAGCGGCTATGGGAATCCAAAAACCTTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000046_pilon:1529495..1537528-

>XLOC_043359 ID=XLOC_043359|Name=XLOC_043359|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2184bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000046_pilon:1529495..1537528- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTAGAAGTCGAGTACATCATGATGTTGCAATTATTCATCGCTATTTATTT
GGCATCAGGATGTTTTGCAGACATTCTAGTTAGAAGTCGAGTACATCATG
ATGTTGCAATTATTCATCGCTATTTATTTGGCATCAGGATGTTTTGCAGA
CATTCTAGACTGTGGTAATGGTTCCAAACTAAGCCGTATTGGATGTTTCA
CAAAGAATGATAATGCCCCTACCAAGTTCATAATGAGAAAGCCAGTTTAT
GGTGATGGATCAATAAAGAAACTGTGGTAATGGTTCCAAACTAAGCCGTA
TTGGATGTTTCACAAAGAATGATAATGCCCCTACCAAGTTCATAATGAGA
AAGCCAGTTTATGGTGATGGATCAATAAAGAATTTGGCTTGTGAATGTGC
AGGAAAAGCAAAAGAAGGAGCACTAGTTCTATCGAACTACGAGGAATGTT
CTGAAATTAAGGCTGCGGATCACGGGAGTCATTATCCTGGTCAAAGTTCA
TACGAGAAATGTTTCAACTCAGTCTTTCAAAATTGTGAAAAGGGTCAAAA
TTGTATTGGTACCATTTGTTCCGTTTACATTTATGCAAAAGTAGTTTGGC
TTGTGAATGTGCAGGAAAAGCAAAAGAAGGAGCACTAGTTCTATCGAACT
ACGAGGAATGTTCTGAAATTAAGGCTGCGGATCACGGGAGTCATTATCCT
GGTCAAAGTTCATACGAGAAATGTTTCAACTCAGTCTTTCAAAATTGTGA
AAAGGGTCAAAATTGTATTGGTACCATTTGTTCCGTTTACATTTATGCAA
AAGTAGTTGATGGAAAATGGAGTACATGGTCTGCTGTCGGAGGATGTAAT
AAAAAATGTGGTCCAGGGCGCCGACGATTCACAAGAAATTGTAATAATCC
AAAGCCTGCTTTTGGTGGAAAATCATGCGTAGGACCGAAAATCAAATTCG
ATTCCTGCAACAATGGAGCGTGTATTCCAGTTGATGGAAAATGGAGTACA
TGGTCTGCTGTCGGAGGATGTAATAAAAAATGTGGTCCAGGGCGCCGACG
ATTCACAAGAAATTGTAATAATCCAAAGCCTGCTTTTGGTGGAAAATCAT
GCGTAGGACCGAAAATCAAATTCGATTCCTGCAACAATGGAGCGTGTATT
CCAGATTTAAGAAACCAAGGACAAAATTGTTGGAAAAAACCTACCTATTT
CTGTGGTAAAAAAGGTCTTTGCAGTCGAAAAGGATGGGGTCGATGGCAAG
ACGCTGCATTCCCCTGCGTTAATAGGCACTGTTGTACTGAGCCAGCTCTT
GTTAAGAACCTAGATTTAAGAAACCAAGGACAAAATTGTTGGAAAAAACC
TACCTATTTCTGTGGTAAAAAAGGTCTTTGCAGTCGAAAAGGATGGGGTC
GATGGCAAGACGCTGCATTCCCCTGCGTTAATAGGCACTGTTGTACTGAG
CCAGCTCTTGTTAAGAACCTAGGCTCAAATTGCTGGTCGAAGTGTGGTAG
AAAGGGTGGTTACTGTCCTGGATTTTGTGGCGTGAACGGGCGTTGTTGTC
GAAGAGGATGGAATGATGCTGGGTGCGCAGGAATGGCAACGCCGTGTAAT
GGGAAGCATTGTTGTACAACTAAAAGACGAGATGTCCAAAATAGCGGCTC
AAATTGCTGGTCGAAGTGTGGTAGAAAGGGTGGTTACTGTCCTGGATTTT
GTGGCGTGAACGGGCGTTGTTGTCGAAGAGGATGGAATGATGCTGGGTGC
GCAGGAATGGCAACGCCGTGTAATGGGAAGCATTGTTGTACAACTAAAAG
ACGAGATGTCCAAAATAGCGGTAAAAACTGCTGGTGGAAATGTAACAAGA
AAGATGGGGAATGCTCGACAGGTTTTTGTGGTAAAGACGGAGTTTGTTGT
CGACGTGGTTGGGATACTTACAGATGTATCCGGACTACTGGTGCATGCAG
ACACAAACATTGCTGTGTCGGTACAGCGGCTATGGGAATCCAAAAACCTT
GAGTAAAAACTGCTGGTGGAAATGTAACAAGAAAGATGGGGAATGCTCGA
CAGGTTTTTGTGGTAAAGACGGAGTTTGTTGTCGACGTGGTTGGGATACT
TACAGATGTATCCGGACTACTGGTGCATGCAGACACAAACATTGCTGTGT
CGGTACAGCGGCTATGGGAATCCAAAAACCTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_043359XLOC_043359-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000046_pilongenomesc0000046_pilon:1529495..1537528 -
Properties
Property NameValue
Aaloc913-1092:181
Aaloc739-909:1311
Aaloc580-735:1758
Aaloc406-576:5027
Aaloc193-402:6669
Aaloc82-189:6986
Aaloc1-78:8035