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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000046_pilon:1529495..1537528- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_043359 ID=XLOC_043359|Name=XLOC_043359|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8034bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000046_pilon:1529495..1537528- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) TTAGAAGTCGAGTACATCATGATGTTGCAATTATTCATCGCTATTTATTT
GGCATCAGGATGTTTTGCAGACATTCTAGGTAGGCTGTTTATAATAAAAA
CGCCTTCAAAGGAATCAGTTTAAATGTTTTCAACTCACGGGGCAAGGAGA
AAAATCAAGGAACCAAATGATATGGAAGATTGTTAACCCTTTAAGTGCCA
CGGTCATTTTCTTCTAAGTTTTTTAAAGAAAATCGCTAGTTCAAACTTTA
AAGGCTTATATCTCGAGATCTAGAAGGAGTTAGAAGCTTGTTCATAGCTC
GTTGGATAGTTTAGAGTCTTCTCTTTCTTTAAGGCCGCTGCGCGGACCTG
TCTAAATGATTTAAAGATGCCCAATGGTAAAACTACAAATTAGTTCGCTG
TAGGAAAGAATCAAGTAAAACAGGGCCAAATTTTGAGGTTCTTGGATCAC
TCGTTGACCAAAAATGGTGAAAAAACGGTCAAAATCTTAAAAGAGTGGAT
TTTTGTCAAATTTTTGCATTTTTCTTTGCATTTTTGGCTTAAAATTTCGC
TAGAAAGACTCCTTTAGATTTTTCTTTTTGCTTGACCATGAAGCCCAATC
CAATTCCTACGAGTTGGACCAAAAATGACGATTTCTAACTTAAACTGGGA
ATTACAGGAGGGCTTCGCCCTCCAACATAGCCCATGTCTGATATATACGA
CATTGGCATTTACAGGGTTAATTTGAAGGAAATGTCAAATTTGATTTCAG
AACTTTATATGGTTGAAATAATTTTTCATGTTATGAAATTTTTGAATAAT
TCATGTGAATAAAGTCATTTGTAGGGGATCTTAACTTGGCCTGTGCAGCT
GCTGGTACTTAGAAATTTGTTAAAATTAGCTCTAAATAAGTAATTTCAAC
TCATATCTCCTTAAAGGAATTTTTTCAATATGAAAGATATTAAAGTTGGT
TTGAAAAAAAAAATTGACTAGAAATTTACCAAATAGTGACTCTTTTTGAA
TTAGTTTTCTCTCCTTTAAAGTTGAAATGATCTCAAATATTTTTCAGACT
GTGGTAATGGTTCCAAACTAAGCCGTATTGGATGTTTCACAAAGAATGAT
AATGCCCCTACCAAGTTCATAATGAGAAAGCCAGTTTATGGTGATGGATC
AATAAAGAAGTATTTCCTTTTTCTTCAAATAGTCATAGCTTAAAAGATCA
GGGTGAAATGAAACCTTCCGGCGAGTTAAGGAATTCTTTACAGCCAATTT
TCAAAATTCTGCCCTTTAGCTCCAATCATAGGCCAGGCTAAGCTTGTCCT
TAAATTTTCTTCTCTTTTGCATTTATGTATGTCTTTTAAAGTCCAGCGAT
TATTTCTAATTGCAGTTTGGCTTGTGAATGTGCAGGAAAAGCAAAAGAAG
GAGCACTAGTTCTATCGAACTACGAGGAATGTTCTGAAATTAAGGCTGCG
GATCACGGGAGTCATTATCCTGGTCAAAGTTCATACGAGAAATGTTTCAA
CTCAGTCTTTCAAAATTGTGAAAAGGGTCAAAATTGTATTGGTACCATTT
GTTCCGTTTACATTTATGCAAAAGTAGGTATGTATCAAGTTGCATTTAGC
CTGAGATCAGGTCGCGAATTGTTTTCTGTTCACCACGCTAAAGCTCTAAA
CGAATGGGTGAAAACAAACGATCTGAAAAATATTCAATCTCGATTTACTT
TTAAACCTATAAGATTTTACTATTTCAAAGCGAAAACAAGCTCTCTCTCT
GATTAAACTCCCGAAAAGTTCTTGTAGAATTTAATTCGCCATAACATTAT
AACAAATCAAAGGCTTTATATTACTGAAAAGACACAATTAGTAATAAGAG
ATTTGAACCATATATCGCTCTGTTTAGTTTTCACTCAGTTATACCAGGTG
AAACATTTTGCCACTATGCCATGGCAAGGGATACTCAGTAGTATACAGAA
CATTCCCTACAATTTTACATTTATTGAAATTAAGGCGGTGGTTACACGTA
GCCGGGGTGAAATTCACCCCGGGGTGAAATAAAAAAAAAATTCACCCCGG
GGTGGAATTCACTCCGGTCTATAAAGAAAACACTGTTTCTGTATACCCGT
ATTTAGGCGGGGTGAAATCGTTTTTACGCGGGTTGAACTCACCCCAGGGT
TGATTTCACCCCGATCCTGAAATCTTTAAAAAAATTCTAAAAATGAAGAT
TTAAATGGAAGAAGATAAAAAGATCTTGTAGAAAAGTGCTATAACTATCA
TTTTCACTGAAGTGAATCCTTGATCATCGAACGTCATCACTGTGAAAAAA
ATTCTCAAAAATAATTATTTGTCAAAAGATATCAAACAAAGTTATAAGCT
GATTGACGTCTAAAAACGTTGTTTTCTGCTGTTTTCTGCTGTTTTTTGAG
GTCAATCACTTATTAACTTTGCATCATAACTTTATATTGAATAAATATTT
TAGTAAAATTTCTTCACAGTGATGACCTCCTAAGATCAAAAAATCTCTCC
AGTGAATATGAAAGTTATAGCACTTTTCTACAAGATCTTCATTTTTTTCT
TCTTTATTTTCATCTTCATTTTTAGAATTTTTTTAAAGATTTTTTTATTT
TAAATTGCTTCACTCACAAATATCTCTCTAATGATACCAAATTTATAAAG
ATTGGAGAATTCCTTCAAAAGTTATAGGTAAAAGAAAAAAAAGTGCACAC
TTATCGTAAACAGACTTTACGTTTTCACGCCGGGGTGAAAATAAGTTAAA
ATTTTCACCCCGGACTGAAAAATAGGGTTTTCACCCCGCCTTTCGCCGAC
GTGTATCCCAAAATGATTTTCACCCCGGGGTGAATTATTTTTCCATTTCA
CCCCGGGGTGAATTTCACCCCGGTTACGTGTAACCACGTTTTGATAAACA
ATAAAGTCAAAATTGTCCCAACCGTTCCCTTAAGTTCAGTGTTTGGCGAC
TATATTGTCTCTATCAAATTAAACTATTCTTAAGAATCCTTTAAAATCAA
TTTTAGTTGATGGAAAATGGAGTACATGGTCTGCTGTCGGAGGATGTAAT
AAAAAATGTGGTCCAGGGCGCCGACGATTCACAAGAAATTGTAATAATCC
AAAGCCTGCTTTTGGTGGAAAATCATGCGTAGGACCGAAAATCAAATTCG
ATTCCTGCAACAATGGAGCGTGTATTCCAGGTATTCTTTTTTAATCACGG
TGTAAATCACTTTTGATTGAGTGTATTTTATTGTAGGAGATGTATATATA
TGACCCTGTCTCACAGCTCCAATGAAACTTCTTCCCGTATTGGGGATGAG
AAGTTCTATCGAAATCCAAATGAATTCAATGAGGATAGTAATTCTATTGC
TCTAAGGTGAAAATATCCAGTGGAGATGGTTTTTCGTAGTGCAATTTTTT
CTCATCGAATTTCAAATGGGGATGAAAACAAAATCCATTTCTCAGTGGGG
TTGAAATTTTTGGGGTATTTTTCCCACGGGGGACGAAATTTCGGCCAAAT
CTTCCAGTGAGTTGGGGGTCCCACCAAGTCTGTGACACAGGGGTGTATAT
TGCCTATATTGTATTTAAAATACTTCGCATCAAACCTAAACATTGGCCAA
AATTGTCTAATTGCCCCGCGGGGCTTTTGTTGGTTCTCGCAGTGGGCTTG
TTCGCCAGAAGAATATTCATGTTCATGTTCATGATGTTGTTTCTTTCGAT
TCTGAGCGGGCCGCGGCGGTTAAAGGATGCTCGCGCGCACCTCTCGTTTT
ATCTATTTTGTTGTGAATTTTATTAATTCCCACGTTTTAGTTCTTACAAA
GTAAACAATGGATGGCGCATAACATGAGCATTTTTATTTTTCTTATAAGC
ATCTACTTTATAAGCATCAAATCAATAACTCTTTATAGACGGTGATATAC
CCTTCGGTAATTAGTTCTTACAAAGTAAACGGCGCATAATTTGGGCATAT
TCATTTTTCCTATGATTTTTCTTATAAGCACCTACTTTAAAAGAATCAAA
TTAATAACTCTTGATAAAAAGCCATACATTTTTCGGTAATTAGCTCTTAC
AAAGTAAACAAGGGACAGTGCACAATATGAGCATGTTTATTGTTCTTATA
AGCATCTAGTTTATAAGTTTCAGATCAATAACTCTTGATCAACAGCTTTA
TACCTTTTGGTATAGTTCTTATAAAGTAAACAAGGGACAGTGCACAATGG
GAGCATTTTTATTTGTCTTATAAGCACCTACTTTATAAGAATCAAATCAA
TAACTTTTGATAAACAGCCATATATCTTTCGGTCCCGGGGGGGGGGGCAG
CTGGGCAAAAGGACCGACGGGTATGTGCGGGTCCTAAGGGTACCTTTTCC
AATATGTTTAAAATGCACTGTAAGGGTCGGAAAAACTAGAGATGCACTGT
AAGGGTAGAAATTTCAGAAAATTCTTGAAAAATCTAGATATTTTGACCAA
AAATGCTAGAATTTTGACCATTTTTTGCACGAAAGGGATCGAAAATTGGG
GGAAAATGCACTCTAAGGGTATGATTTTCACTGATTTTTGCTGCACTGTA
AGGGTGCAATTTTAAAAGCCAATTTTTGGCCCGCACATACCGTCAGTCCG
CAAACCCAGTGCCCCCCCGGGCTTTCGGTACAGCGAATAGAAATTTCCAG
CTGTGCGCTTATTGGATGGCGCTCCAATAAAACGATCTGGTGGAATGCGG
CCTTCAAACGTTCATTCTCGATTATGAATGCGTTCGCGGGGCATTCATAG
CGACAGCTACTTGCTAGTAAATATCAATGAAATAAGTAGTAGTTATCCTG
TATTGTACGACCGAGTAAAAGTGTGATAACTGGTTTATCGTCAGCTTGAA
AAATATTAACAAACTTTTCTCTCTTCATTTTATTTGTGTTCTCTTTCTTC
TTTGTTTTGGTTTTTCACAAATCAACATCAAAACATTAAAATCTTCGAAA
ATGCGATTCGAATGCTCGAATTAAGATATTAAAATATAAATAAGTTTTGT
GAGTATTGAGAGGAAAAAAGAAAACATTCCTGAGAATAACTTTCGAGATA
AGATACAAAAATGAATTCAAATATGATCTCTCGTTTACAAGACCCCTTTT
TGAACGCGGTCTTGTATGTGTACGGTACAATATAAAATACAGCATTTATG
TATGCGTTTTTATATCTCAAGCAGACGACGACATTGAGAAAAGTCACCAA
AATCTGATTAAAAGTAAAGTCTGTCTCAATATAGTTTGCAGTGGAGACAA
AAAAGGCTGTAACTTTTGATAGAATTCGAATTAGAAAACAGTTTTGTGCT
CGTTTGAAAGATAATCCAGAGTGGAATATTTGCAAAAAAGAAAAATCTTT
AAAAATGGAAAAAAGAAGATGAAAAAAGAAGAAGAATAAAATCAACTTCT
TATAGATTAATGCTGTGATCTTCATTTTTATATCAGAGGTTCTTTAATCT
TAGAACGTCATAAATGGGAAAGAAATCAAAGAATATTTGTTTAGTCAAAA
AATACAACTTAATACTTTGCTTTGGTCGAAGGGCACTTTTTTGTTGTTTT
TAGGTGGTTTTCGAAAAGTTAAGATCAATCTATCTTTGATCTAGTCTAGC
TTGGAAAGCTTGTAATAAGTTAAACAAGATATGGCACTCTAATTTGTTTA
ACGTTCTCAAACTTCAAGCTTTTAGAAGTCTTGTCGAGCCCATTCTTCTT
TATGGCTCAGAGACTTGGACTATGACAAAAACCATGCTGAAGAGCCTGAT
GGCTGTTATACAAACCTTTTGAAAAGAATACAGAATCTTGATTGGCGCAA
CCACCCAACCCTTCACGAGATCTATCATGGACTCCCAAAAATTCCTTCTG
TCTTGACAAGCAGCATGCTCTCTTTCACAGGTCAATGTTTCCGTGCACAA
AATGAAATCGTATCTGAAATCCTACTTCGGTGTCCTGCTGGCCCTAAGCG
CTCGAAAAAGCACACACTTCTTGATATTTGGAAACGAAAAACAGGAATAG
AGATTGAGGAACTGAGTACTGCAATGGCTGATCGCAAACTGTGGATTGAT
AGTTTATTCTTTGTTTCCTAGGTGATGATAATGAGGATGCGTTTTTAGCC
AATCAGATTGCTCATATTTCTCATGTTGACGATAAAGGATGGAAAATTCC
AAACGTTGTATATTTTTCTTTGTCTTTTGATGTTTTTTTAACTTTATACC
CCTGTCTTTGTGCCTTACCAAGAACCCAGACTGTTTTCAAAATAAAAATA
ATATACCACCTTTCTTTCTTTTTAGATTTAAGAAACCAAGGACAAAATTG
TTGGAAAAAACCTACCTATTTCTGTGGTAAAAAAGGTCTTTGCAGTCGAA
AAGGATGGGGTCGATGGCAAGACGCTGCATTCCCCTGCGTTAATAGGCAC
TGTTGTACTGAGCCAGCTCTTGTTAAGAACCTAGGTAAGATTAATTTTTC
ATTGACCTTAAAACTATTAGGAGTTTTAAGAATTTTGCAGAAATTTAGAC
ATTCCCTTCATTTAAGCTCAGGGAATATAATAGATAGCCAGTGGATACAA
GACGTCGAATTTGGTTGGAACAAAGTAATTTTATAAAACGTTGAAGCTAC
CCGCAACAAAAACAATATGCTATCCAAAAGAGGGTTCCGTTAACTTGCAT
GAGAAATGAGGTGCCAAAATTCTGCATCTTTATACTACAGTTCTGTATTT
TCATAACAAAATTATATTTAAGGCTCAAATTGCTGGTCGAAGTGTGGTAG
AAAGGGTGGTTACTGTCCTGGATTTTGTGGCGTGAACGGGCGTTGTTGTC
GAAGAGGATGGAATGATGCTGGGTGCGCAGGAATGGCAACGCCGTGTAAT
GGGAAGCATTGTTGTACAACTAAAAGACGAGATGTCCAAAATAGCGGTTG
GTTCATAGTGTATTTACAGGGTGTCCCGAAAAAAAAGTTACGTGTTCGAA
TATGATTCTGAGTAGAAGGTTGTTGCGTGTGTTTAACAAAATGTAAGAAA
ATGTATACCACCACAATAATTGTTTTTACAACAGTCGTTATGATAAAAAA
GAATTAACTTTCTTTACAATTTTCATGACGTTAAAGTTATTGAGAATTGT
TTTTTGTAAACGCCATTCATAAAAGATGTCTCATGACAATTAATATGAGG
GGGGGGGTTGTACTTTTTCGGTGTGACGGGATTGGCCCTTTTTTAGTACG
GTATTACGGGATTTGACGAAAAAAGAGACGGGAAAACGGTATTTTAAAAT
CAGACGGTGACGGTATTTAGGTACATTTTTGCCCTGTACAAGCCGGTGTG
ACGGTGTTGTTATTTTTCCAATTTTCGGGATTACGGGATTCAGCAAAATT
TTTGACGGGAAAACAGTATTTCGAACCCCTACAAACCCCCCCCCATATGA
CATAGAGAAAAACTTTGATAAAAATAGCAAATTCAGTGAAACACACACAA
GAACTTTCTTTCTATAGAAGTGGTACGCCTTGATTTTTTCGGGACACCCT
GTAAAAGATTTTGGCTTTTTATCTTTGAAACTGTCGGTGTAGATTTAGCA
TAATACAGTTGGCATTCCCAAACTTGAATTTCAAGGGGCATTTTATTTTC
ATAAAGTAAGGGAGCCTAATGAATAGTAGAGTATCGTTTTTAAGAGTTTC
TTGTCGGCAGTGACTTTAAATTATTGAATAGTAGAACATCGAAATTAGAG
AGTGTCAAATGTATTCCTGAAAAAGTGGTTCTAAAAAAGCTCTAATAACT
TAAAGAATATTTAGAACCAGAAATTCGAGTTCATTTTCCCATTCCAACCA
ACCAATCAACGTTCATTTAACGTTATATGTTTTACTCTGTTTTCTCATAC
AGGTAAAAACTGCTGGTGGAAATGTAACAAGAAAGATGGGGAATGCTCGA
CAGGTTTTTGTGGTAAAGACGGAGTTTGTTGTCGACGTGGTTGGGATACT
TACAGATGTATCCGGACTACTGGTGCATGCAGACACAAACATTGCTGTGT
CGGTACAGCGGCTATGGGAATCCAAAAACCTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000046_pilon:1529495..1537528- >XLOC_043359 ID=XLOC_043359|Name=XLOC_043359|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2184bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000046_pilon:1529495..1537528- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) TTAGAAGTCGAGTACATCATGATGTTGCAATTATTCATCGCTATTTATTT GGCATCAGGATGTTTTGCAGACATTCTAGTTAGAAGTCGAGTACATCATG ATGTTGCAATTATTCATCGCTATTTATTTGGCATCAGGATGTTTTGCAGA CATTCTAGACTGTGGTAATGGTTCCAAACTAAGCCGTATTGGATGTTTCA CAAAGAATGATAATGCCCCTACCAAGTTCATAATGAGAAAGCCAGTTTAT GGTGATGGATCAATAAAGAAACTGTGGTAATGGTTCCAAACTAAGCCGTA TTGGATGTTTCACAAAGAATGATAATGCCCCTACCAAGTTCATAATGAGA AAGCCAGTTTATGGTGATGGATCAATAAAGAATTTGGCTTGTGAATGTGC AGGAAAAGCAAAAGAAGGAGCACTAGTTCTATCGAACTACGAGGAATGTT CTGAAATTAAGGCTGCGGATCACGGGAGTCATTATCCTGGTCAAAGTTCA TACGAGAAATGTTTCAACTCAGTCTTTCAAAATTGTGAAAAGGGTCAAAA TTGTATTGGTACCATTTGTTCCGTTTACATTTATGCAAAAGTAGTTTGGC TTGTGAATGTGCAGGAAAAGCAAAAGAAGGAGCACTAGTTCTATCGAACT ACGAGGAATGTTCTGAAATTAAGGCTGCGGATCACGGGAGTCATTATCCT GGTCAAAGTTCATACGAGAAATGTTTCAACTCAGTCTTTCAAAATTGTGA AAAGGGTCAAAATTGTATTGGTACCATTTGTTCCGTTTACATTTATGCAA AAGTAGTTGATGGAAAATGGAGTACATGGTCTGCTGTCGGAGGATGTAAT AAAAAATGTGGTCCAGGGCGCCGACGATTCACAAGAAATTGTAATAATCC AAAGCCTGCTTTTGGTGGAAAATCATGCGTAGGACCGAAAATCAAATTCG ATTCCTGCAACAATGGAGCGTGTATTCCAGTTGATGGAAAATGGAGTACA TGGTCTGCTGTCGGAGGATGTAATAAAAAATGTGGTCCAGGGCGCCGACG ATTCACAAGAAATTGTAATAATCCAAAGCCTGCTTTTGGTGGAAAATCAT GCGTAGGACCGAAAATCAAATTCGATTCCTGCAACAATGGAGCGTGTATT CCAGATTTAAGAAACCAAGGACAAAATTGTTGGAAAAAACCTACCTATTT CTGTGGTAAAAAAGGTCTTTGCAGTCGAAAAGGATGGGGTCGATGGCAAG ACGCTGCATTCCCCTGCGTTAATAGGCACTGTTGTACTGAGCCAGCTCTT GTTAAGAACCTAGATTTAAGAAACCAAGGACAAAATTGTTGGAAAAAACC TACCTATTTCTGTGGTAAAAAAGGTCTTTGCAGTCGAAAAGGATGGGGTC GATGGCAAGACGCTGCATTCCCCTGCGTTAATAGGCACTGTTGTACTGAG CCAGCTCTTGTTAAGAACCTAGGCTCAAATTGCTGGTCGAAGTGTGGTAG AAAGGGTGGTTACTGTCCTGGATTTTGTGGCGTGAACGGGCGTTGTTGTC GAAGAGGATGGAATGATGCTGGGTGCGCAGGAATGGCAACGCCGTGTAAT GGGAAGCATTGTTGTACAACTAAAAGACGAGATGTCCAAAATAGCGGCTC AAATTGCTGGTCGAAGTGTGGTAGAAAGGGTGGTTACTGTCCTGGATTTT GTGGCGTGAACGGGCGTTGTTGTCGAAGAGGATGGAATGATGCTGGGTGC GCAGGAATGGCAACGCCGTGTAATGGGAAGCATTGTTGTACAACTAAAAG ACGAGATGTCCAAAATAGCGGTAAAAACTGCTGGTGGAAATGTAACAAGA AAGATGGGGAATGCTCGACAGGTTTTTGTGGTAAAGACGGAGTTTGTTGT CGACGTGGTTGGGATACTTACAGATGTATCCGGACTACTGGTGCATGCAG ACACAAACATTGCTGTGTCGGTACAGCGGCTATGGGAATCCAAAAACCTT GAGTAAAAACTGCTGGTGGAAATGTAACAAGAAAGATGGGGAATGCTCGA CAGGTTTTTGTGGTAAAGACGGAGTTTGTTGTCGACGTGGTTGGGATACT TACAGATGTATCCGGACTACTGGTGCATGCAGACACAAACATTGCTGTGT CGGTACAGCGGCTATGGGAATCCAAAAACCTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000046_pilon | genome | sc0000046_pilon:1529495..1537528 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 913-1092:181 |
| Aaloc | 739-909:1311 |
| Aaloc | 580-735:1758 |
| Aaloc | 406-576:5027 |
| Aaloc | 193-402:6669 |
| Aaloc | 82-189:6986 |
| Aaloc | 1-78:8035 |
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