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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000400_pilon:127950..132209- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_043356 ID=XLOC_043356|Name=XLOC_043356|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4260bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000400_pilon:127950..132209- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CCACATTTCCAAGAAGGATTTAAAGCACCCATGAAAAAGGTTGACAATGT
GCTGAGAGATTATTGTGATGGAAAGGTCTATCAAGACCTACTGGAATCAG
GAATCATTGGAAGTAATACCATCACATTGCAGATGAATTCAGATGGAGTG
AAGATGTTCAATTCATGTAATTACTCAGTATGGCCCATCTATCTAAGAAT
CAATGAACTTCCTCCTGCATTAAGGTAAATACTCTGATTTTCAACAAATA
CATTTTAAAACACTTCTTCAGGAACTGTCAGGAAATTTGAATAGGAAGAA
AATTGGCTGAGTCGATTAGGTTAAACATTAATTAAAGACAAACTCAACAC
CGTAAACCTTCTCGCTTGTTTGGAATGAAATAATCTCATGCTTGTTTTGT
CTTGATCACTATATTTAAATAAAGGAAAATCGAGATTATGAAAAGGTCTC
CAATTTTTAAGGTAGTAATATTTGAGAAAAAAGGAAATTCCCACCAAAGT
TCAAAAGGAAAGGTAGAGTTTTAACAAAAATAGCCTGGAAGTCTATAAAC
CCCACCCAAATTGAAATATTTGATTACATTTAACAGATAGCCCAAAACCA
ACTTTCTCTCCCAAACTTCAAATTTCAAAAAACAAGGAAATAACCAAAAT
TCCCATATATTTGGACCATGATTGTAGGACCATAGCAAATTTTAGTTAAT
TATTTGTTGCTATATTTTGTAGAAAATATAGCTTCATCAAATTTGTCAAA
CAATATTTTGGAATATTTTACATTGTTGAATTTCAATTCTGATCATTCAG
GAAATTGAAAAAGTTCCGTGTTTTGGTTGGGATCTGGTTTGGAGAGGAAA
AACCTTACATGAGGAGTTTCTTGCGTCCTTTAGTTGAAATGTTAAAGCAA
TGGTACTTTCAAGGTAATGACAATGTTTGACCTGCCATAAATCTCCGGGG
GGGGGTACTTAAGCGAATGGAGGGTACGGCATGTCCCGCACTTAAGGGTA
CCTTTTTTTTTTCCATTTCCAAAGTCCCACTAGGAGTTGGAAAAAATCAC
CCTTGTATTGTAAGGCGCACGCCTAACCAACTGAGCTAACCATGCATTCT
TGTTTCTGGGATTCTTTTGAAAGCTTTTCCTCGAAAATAAAAATTTAGAT
TTTGTGACATAACTTTTTCATAAGCTTCAATAAGCAAAACCTGCCAGAAA
AACTTTTCACACTATTTTTATGCATTTTCATACCTAAGGTATCCAATTTA
CTTACAATGGAGAACAAAAATGTTACAAAGTTCTGTTGCTTAGCTCATTG
TTTGATCTCCCCGGTATGTTTTTTTTTCAATTGAAATAAATAAATTGATA
AGGTACTCTTGTAACCAAAGCATAGTGATTTGCCCTGATAGGAGCTCAAT
GTACCCAGACTTATTTATTACACTAATACTCAAGTATTTAACGTGCACAA
AAAAGACAAAAGGAAGAAAATTAAAAAAGAAAATTAAAACTAGCAAGGGG
TGATTTGTATTTGTATTTATCTTTAATCAAAGTTCATTTAAATAATATTA
ATCCAATCTCTTCTTATATTAAAGCAAAATGTCTAGTCCAAGAAACCGTT
CAGTTTAATGGATACTATGGGTGCAGTTACTGTGAAATCGAGGGAGAACC
CATAATGAAATTAAAAGGGACTAAATATGTCAAAACCTCGACAATTGTTT
TTCCTATGAAAACAATGGAATTACCATCAAAGCGGACAAAAGAAAAAACA
ATTGTACAAGCAATGGTATCATTGGAAAACAATTTAGTGGTAATCATGTT
TATCAAAACGTAATTTTATGAATAATCACATCAGAACGATATAGGTTATA
GATATTTCTAAAAATTGTTATAAAGCAAGATTTAAGATTTCATGTAGTAT
GAAAATCTACTTGTTTGTGAAAATTTAATGGTTTACACTTTTAATGAAAG
CTTTTTTCCTTTTCAGGTAAACGGTATTCGAGGCTTGTCTGTATTGGGTG
AACTTACATATTATGATATTATCTGGGGAGTACCTTTTGATACCATGCAT
GGAGCTTTTCTGGGTGTAACAAAGTATAGTAGTTCTTTCACTCCTTTCAT
ACAGGATGTATGTAATGTATTGTAATTTGATGTTTATTTTTATTTTGGTT
ATTTGAACTGAGTAATATCAAGTTAAACATTTCAGATCTTAAAATATATG
CAACCTAACAATTTGGCTAAAATAGATGGGAGAGTTTGCTTTGAAGCATA
TGTATAAAGATGACTTTATTTTTGAAAACGTAGTTTACCTTTGAAATAAG
GGAATTTTTAAAATTCAGGTTGGGATGGCATAAGGGGTTGGAGGGGTCTT
TCCCATAATGAAGCTTAAATTCTCTTGTTTTATTATTTTTAGAAGACTTC
TAGGCTTGTGGTTTGACACTGAAAACCATAAAAATGCATGGTACCTTGGA
AAGGTTTTGAAAACACTCGATTCTGTTTATCTCGCAATGACACCACCAGA
TGAAGTATCTAGGCAGCCAAGAAGCATTGTAAAACATCGAAATTACTTTA
AAGGTTATCAATTTAATACCAGATAATTATTTTCTTTGGGGTTTAGGGGT
TTTGTCGAATATTAATTCTTACATGTCAATTTCACCTCATTTCAACACTG
AAAGGACACTTTAACGAGAATCCTTTTTATGTTTAATAAATTTTTATGTT
TATCCTTTATTCAATTATACAATAAGATTATTTATAATTTGAGCTCCTCT
TTGATGATTGTACTACCCTATAACATGTGATATTTTGAAAGGTTCAAATG
TTGTTTATTTTTTATTTATAAAATATTAATAATAACTAGCCGGTACCCGG
CGTCGCACGCCGGTTTAACTGTTTGCTGAACGCATTTAAAGTCCTTTGGA
TGTTGGGAAGGTGGCATAAACACGATGAAATCAAAATTAAAGAGAAGAAT
TCTCTTCAAAGTTTGACTCTATCCCTCCTGGGTGACGTATCTTTTAACCA
TATTTTGAAAAAGATTTTTGTGGCAAAAATGATCAGAAAACAGAAAAAGG
GCGCCATTCCCAAATTACACCATACCGGCGACCAGCGACGTCCGAGACGG
CTTTGAAATTAGATTTTTTTGACTTGTCTTGTGATTATTATGTTTTATTT
TATATTTGTTCTTTTCTTTAACAGATTCTGTTTAAAAGATTTTCTTTTGT
TTTGAAAAGAATTCGAATGTCTCAAATCAAATAAGGTCGTTAATTACATT
CGAAAACATAAAACAAAAAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGACAAAGTCACAT
CTATCAATCAAAACAAAGTCTTTATAAAACGGCGCGAATCTGATTTAACA
CATTTGTGGAGCAAGAAACAAAAGTCATCTTTTAAAAGAACAAAACATTG
CTTGCGAAAACGAAAGTGACACACAAACAAAATGACATACAGACTACGGC
TATTAATATATAGATTATTATAATATTAATAATAGATTTCCTTGAGCCTT
ACTCTTGTGTACCTAATAGCCGGGGTTTGGAAAAAAATCTGAAAACTTAA
TAAGTAGGAGGTTGGAATCAAAATGTCCTGGGTGGAGAATTTTTAAAAAG
GAGACTAATACAGCAGAATTACCTTAAAGAAATTCAATAATTTAATTTTT
GTTATTTTTTCAAATTCAGCAAACGAATTTCGTAATTGGCTATATTATTA
TGGACCAGTTATTATGCTTGGTTTTCTGCCTGAACCATTTTACAGGTATA
CAGTCTATTCAAAAGACTATGGATTTTTAAATTGACTCCTCTTCAAAACT
ATAATAGTGATGTCACTATGGTTAGAAGGTTGAGGAACTTTCAAAGGTTT
CTTTGTCTTCTAAAACTTGTCTTTTGATTTAGATTTTGTGCAGCGTTCCC
AAAAATAAGCAATTTTGAACCCTTTCTTTGCGAAAAGGGGTGTAAAAATT
AATGGTAAAGGATTTAATTACAGTGACTCAAATCCAGGGGGCAGACATTC
TATATGAAAGCTAAAAAGGCCTTTGAATTGTTTGATATCCAATTACATTT
TATCGGTACTAAATAATTAAATTAATTTACTTCATGAGAAGTTCAAGAAT
GGTATTTATTGATAATGCGTGTCTCTTCTATTTTAGTCATTTTCTATTCC
TTGTCAAAGGGATATATACTTTACAAAAGCTATCAATAACACAAAATGAA
ATTGAATCTGCTGAGGAAGATTTAAAAGTATTCGTATTTCAAACAGATAA
ACTTTATGGT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000400_pilon:127950..132209- >XLOC_043356 ID=XLOC_043356|Name=XLOC_043356|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2190bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000400_pilon:127950..132209- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CCACATTTCCAAGAAGGATTTAAAGCACCCATGAAAAAGGTTGACAATGT
GCTGAGAGATTATTGTGATGGAAAGGTCTATCAAGACCTACTGGAATCAG
GAATCATTGGAAGTAATACCATCACATTGCAGATGAATTCAGATGGAGTG
AAGATGTTCAATTCATGTAATTACTCAGTATGGCCCATCTATCTAAGAAT
CAATGAACTTCCTCCTGCATTAAGCCACATTTCCAAGAAGGATTTAAAGC
ACCCATGAAAAAGGTTGACAATGTGCTGAGAGATTATTGTGATGGAAAGG
TCTATCAAGACCTACTGGAATCAGGAATCATTGGAAGTAATACCATCACA
TTGCAGATGAATTCAGATGGAGTGAAGATGTTCAATTCATGTAATTACTC
AGTATGGCCCATCTATCTAAGAATCAATGAACTTCCTCCTGCATTAAGGA
AATTGAAAAAGTTCCGTGTTTTGGTTGGGATCTGGTTTGGAGAGGAAAAA
CCTTACATGAGGAGTTTCTTGCGTCCTTTAGTTGAAATGTTAAAGCAATG
GTACTTTCAAGGAAATTGAAAAAGTTCCGTGTTTTGGTTGGGATCTGGTT
TGGAGAGGAAAAACCTTACATGAGGAGTTTCTTGCGTCCTTTAGTTGAAA
TGTTAAAGCAATGGTACTTTCAAGGTATCCAATTTACTTACAATGGAGAA
CAAAAATGTTACAAAGTTCTGTTGCTTAGCTCATTGTTTGATCTCCCCGG
TATCCAATTTACTTACAATGGAGAACAAAAATGTTACAAAGTTCTGTTGC
TTAGCTCATTGTTTGATCTCCCCGCAAAATGTCTAGTCCAAGAAACCGTT
CAGTTTAATGGATACTATGGGTGCAGTTACTGTGAAATCGAGGGAGAACC
CATAATGAAATTAAAAGGGACTAAATATGTCAAAACCTCGACAATTGTTT
TTCCTATGAAAACAATGGAATTACCATCAAAGCGGACAAAAGAAAAAACA
ATTGTACAAGCAATGGTATCATTGGAAAACAATTTAGTGCAAAATGTCTA
GTCCAAGAAACCGTTCAGTTTAATGGATACTATGGGTGCAGTTACTGTGA
AATCGAGGGAGAACCCATAATGAAATTAAAAGGGACTAAATATGTCAAAA
CCTCGACAATTGTTTTTCCTATGAAAACAATGGAATTACCATCAAAGCGG
ACAAAAGAAAAAACAATTGTACAAGCAATGGTATCATTGGAAAACAATTT
AGTGGTAAACGGTATTCGAGGCTTGTCTGTATTGGGTGAACTTACATATT
ATGATATTATCTGGGGAGTACCTTTTGATACCATGCATGGAGCTTTTCTG
GGTGTAACAAAGTAAACGGTATTCGAGGCTTGTCTGTATTGGGTGAACTT
ACATATTATGATATTATCTGGGGAGTACCTTTTGATACCATGCATGGAGC
TTTTCTGGGTGTAACAAAAAGACTTCTAGGCTTGTGGTTTGACACTGAAA
ACCATAAAAATGCATGGTACCTTGGAAAGGTTTTGAAAACACTCGATTCT
GTTTATCTCGCAATGACACCACCAGATGAAGTATCTAGGCAGCCAAGAAG
CATTGTAAAACATCGAAATTACTTTAAAGAAGACTTCTAGGCTTGTGGTT
TGACACTGAAAACCATAAAAATGCATGGTACCTTGGAAAGGTTTTGAAAA
CACTCGATTCTGTTTATCTCGCAATGACACCACCAGATGAAGTATCTAGG
CAGCCAAGAAGCATTGTAAAACATCGAAATTACTTTAAAGCAAACGAATT
TCGTAATTGGCTATATTATTATGGACCAGTTATTATGCTTGGTTTTCTGC
CTGAACCATTTTACAGCAAACGAATTTCGTAATTGGCTATATTATTATGG
ACCAGTTATTATGCTTGGTTTTCTGCCTGAACCATTTTACAGTCATTTTC
TATTCCTTGTCAAAGGGATATATACTTTACAAAAGCTATCAATAACACAA
AATGAAATTGAATCTGCTGAGGAAGATTTAAAAGTATTCGTATTTCAAAC
AGATAAACTTTATGGTTCATTTTCTATTCCTTGTCAAAGGGATATATACT
TTACAAAAGCTATCAATAACACAAAATGAAATTGAATCTGCTGAGGAAGA
TTTAAAAGTATTCGTATTTCAAACAGATAAACTTTATGGT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000400_pilon | genome | sc0000400_pilon:127950..132209 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 973-1095:124 |
| Aaloc | 898-969:590 |
| Aaloc | 736-894:1868 |
| Aaloc | 628-732:2295 |
| Aaloc | 415-627:2685 |
| Aaloc | 340-411:3021 |
| Aaloc | 226-336:3460 |
| Aaloc | 1-222:4261 |
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