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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000042_pilon:1801484..1810323- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_043259 ID=XLOC_043259|Name=XLOC_043259|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8840bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000042_pilon:1801484..1810323- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGTAAAGGAGAAAGAGGCTAGTTATAAACGCAGCCTTTTGGCTTCGAT
CACCAGTAATGAAACGGTAGAAGGCGATACTCAAGAATCATGCAAAGATG
AGATGTTGGACGATGATTGTGATGACTCAAGGTTCAGGTTAGTCTGAAAA
GGATTATTTCATACTTTTTATCCAGGCTCTATATGGCCCTTTCAGGCTCT
ACCACCCAAATCTTGATATATGCAACTGGTCTTTTACCAGTGATCTATGT
TTACTGCAATTCGGACAATTCATAAGTGATGATTTTTTAGAAAAACTTCC
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CTTACGCTTGGACGAAATTTTTTATAATTTTATTCCATGTTGACTCTCAC
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ACTAAACTGTTTAACCCTTTGAAAATAAGCTAGCTAGCATATTTTAAAAA
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ATTACAAAGTAAAATCGATAAAAAAGATATTTTCTTGGTTGTAAAGCTGG
AGATAATCCATCTTTAGAATGTCTAAGAAGACTTTTGTAACCATTTTTGT
ATATATACGGTAGATATGTGGAAATCAGAAGTGGTACGCCTGACAATATA
TACTGACACCACTAGAAATAACTTAATTGAGGTATAGGGAGACAGGGGAT
TGGGTCAAATGACGCAAAATGTCTGCATCCAAGAGGGGATATTATATGCA
ATTACTTCAGATATTTAACGTTATACAGTTTTTTGTGTAAGATAATTGAT
AGGTGTGAGTCAAGGCTCGTAAAGAAAAGCAAAATTATATGGAAATATTC
TGTTCATAGGACACTTCATAGTCAGAGACACTTCAACTCAGACTCATTCT
TGCATTTCGAGACATGATAACTTGCAATTTATCAACACACGTAACTCTAT
CCTTTGAAAGCTACAGTTGATACAACGTTTTGTGACACCTAAGGTATTAA
AGGGTCAAATGTGTAAAAAGAACCATCTTATGTGTGGTCTAATACAAACA
ATGGCTTCTTTATTTATTTTTTGACCCAGTATTTTTGCTTGGCATGAGGG
TAGTTTTGAAGAAAATTCATCAGTACTATTCGAACTATTCTGACTTCAGC
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CCCGTTGCTTAGCTACTAACTCAAATCTACTTTTCATAATTTCTACTACT
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GATGACTTGAATTGACGATAAACATATCAAACTCTATGATGATTGAAATT
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ATTTCAACCCCATGAAAATGGGGTGGCACTAAAATGCTAATTTATATAGT
CTACATAACCGAGTCAAATTAATGTTACAAATTAAGTAAAAGTAAAGCTA
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CTGATGAAAATACAGTAGCAACTCCCTTGTTTCAAAAGAACTGTTTCAAA
GAACAAAAAAATAGGAGAGGAAGGAAGGAGGGTGAGGGGAACCTTTTTGA
AATATGAAACTTTTGCAATAAGACACATTGCAAGGGGTGAATTTCACTTT
GATGTTTACAAGTTGGTTTGTTTTTGTAAAGCATACCAAACACTTGGTTC
GAAAGCGGGTGTGGTCAATCGCCATATGAGGTTCAGAATGTTCGTCTTCT
TGGCATACAAGCATTATGTAACATTACTTCAATATATGTACTTAAAAAGG
ATTCGGTTCAACTTTTAACACTAAACATCTCAAGTTATCAAATTGACGCG
TTATTGATGCAAAACAAAGGCGTCCCTCATTTAACCTTTTTTAAAATCTG
AAGTAAGGACAACTCAAGCCTGAAGATAAAACATGTCATTGCACACGGCA
TTTTATTAAAAGGGGCACATAACTGAAAAATAAATATATTTTGAATTAGT
TGCCTAGCACCACATAATAGGCGTTTCAGTAGTGCTATAAATGGATATAA
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GTTAGATATCTTTTGAGCAAGAATGCCTCTATCATATATTGCATTTAAAA
AAAGAGTCAATAGGATTACTTTAATTTGTAGGAGTATAGTTATTTTAAGG
GCAATCTGGTAAATTGCGAAACGTCAACCTTTATAGAGGAGCCCTGGACT
CGACAATTCATCAAACTGTTTAGAGTCTAGGGGGATATTTCGTACGAAAA
TCGTGGTGTTACCGATAAATTAAGTCCCTTCTTAAAATGGTCTAGGAAAT
ATTCAGGGAAATTTAGTCCCCGAAAATTTCCCCCCGGGATATTTCCGCTC
TCAATATTGCCACCCAGAAATTTCCCGGGGAAATTTTCCTGTCACTAAGA
GGCTAACAGTAGCAGGTGACAGACACGGCATAAAACAATCTTTCAGAGGG
GGAGCGAAACTGCTCCAACTGCTGTGATTTCTTCCTGTAAGAAAATTTTA
AGCCTGAATAGAAACTAAGCATTCGTTTGATCTGTTTGTAAACAGTTTTG
TCGGGGGAGAAAATATGTCAATTTTAAAGTGCAGCACTATTGTTTTGAAA
AAGTACATTTTTCTTTAGAATATCCCAAAAGTCAACAAAGACATACCTCT
AAGCAAAGGAGGTATAAAATTCAAGACATAAATCTTTTTGAAAGTTTAAG
AGGCACGTCAACACGTCAAACAGGTCAAAGAGAAATCAAGGGACGTGTCA
AAATAAAAACTTGACTCTGTGAAAAAATTTTAATATTCCTCATTTTAACG
AGTACTTTAAGCTACTTCCAAATAAACCATTTAGGAGAATTTACTTTGGG
AATCGAAAATTCCCCGCATTAAAAGAGATTTCAAAAACATGAAACGTTTA
TATTGATGTGTCTGACAGGGTATGATATTAATAACAAAAACATTGAGCTT
ATAAGTGGAATAGCATAAGCCAAAACATGTGACTGTTATTCACAGGTCCT
TAAGTAGAGTCAAATTTTCAATAATTGAATTTACATTACATGATAGGGGT
CTAAACATTAACGAGAAATTAGTTTTAAACAATAATGAGCTTTCTTAATT
GACGACTAAAACCTTACATAAGCAGAATCGAGAAATGCTTAATCGGTCCC
AGATCCCATTTTAGCCTCTATTCGCAGAAAGTCAGTATCAATGTACGATA
ATTACCTATTTAACGATCACAATTAGCGGTATTTGTAATGCAACTTATTA
ACCAGTGTGTCATTTTACGCTATTTAAACAACCGTTTAGCATGTTAATAG
TAAATCACCGTCCTAATTAACGTGACACGTGACCAGCACCATAAGGCAAC
ATAATTCTTATTCTTTAATACATACAGTTCTCTCTCTAATTTGGACCTTA
AGGGATCAATATTTTTCTTTGAATCGGAGAAGGTCTTTCGTTTAAAGTAT
AAACTATATGATTTGCCAATAAATGCTTAACACCTTGAGCTCGCTTTTTC
AATATAATTTTGACTCTCTATGAGTCGGTTTTGGGAGGTTCCTTCTACAC
ATACCTCCCGTCTGCTGACCTTGATCCACTGGGCTTAACAGAGGCAGATA
AACACTCTTGGACAAATCCACCCTCAAATGTCCGTAACAAGGGTGACTGG
TAGCAAGAGGGTGTACTCAAAACTAATTAATTAGGACTATTTTCATTATT
ATTCATTATAAATTCATTAATATATAAATATAAATATCTCATTTTCTTTT
CTTTTTTCAGCTTCAATTCGTTTTGTCAAGAATGGGTGGATTTTTGTCTG
GCACTGAACGGATTCTTCGAGAAATTATTTTACAAACTTGGATTTCTTTT
GGCATCGAATCCAACATTGACTGTCATATTTGGTGTCATTGTACCACTTT
TTCTAACAGGTGGTTTCTTCAGATTCAAAATGTTACAGAGAACTGAGGAC
TTATATATTCCAGAGAAAAGTCAAGCATTTGAGGATCTACGGCGAGCTGA
GAAATTCTTCCCAGTGCGAGTCAAAGCAGAACAATTTATTGTGAAACCTC
ATAATAGAGATCGTATATTCCATCAAGATACTTTTAGAATACTTTTACAA
ATCCATCAAAATATAACTCGATTACCAAACTTTCACCAAGTATGCATTAA
GAATCATTTTCAACATTGCACCGTACTGTCACCTTTAGAAATCTTTAAAT
ACGATGCTACAAACTTTATACACATTAAACCAACTTTAGACATTGTTTTC
AATAACAAATCAATCATATTGAGTAATGGACGCCAAGCTTTTACAAGTTT
CCCGTATTATTTCGGACAATTTCAATTTGACCATCAGCGAAGGTTAATAT
CAGGAGCTGAATCAATCCACAGCGTATATCTTGTCAAAGACCCAATCGAT
GAAGACATATACAACGATTTAGATAAATTCGACCGATATTATACTCAATA
TATGGAGAAAACGAAAACCGAGTTGAAAAGTAAGGGTTTTGATTTGATGT
ATACGTCAGCTTTGGGGATAGAGACATCGATATCTGAATCAGCAATGCAA
GAAGTGATGTTAATCCCTGTCGCTTTTATCCTAATGACCATCTTTTGTGC
AATCACATTATTGCGTTTCAAGAATCAAGTTGGCGGTCATTTCATGGTGG
CTTTCTCTGGAATTATTTGTTTATTTCTTGGTATTGGATCGGCTTTCGGA
CTCATCATGATGTTCGGTCAACCATATATCGCATTCGCTGGTGTCTTACC
CTTTCTTGTTCTTGGAGTCGGTATCGATAACATTTTCATCATCATTCATG
CAATAGATCGTCAGGATCCTGAGATCCGTGGACCATATAGAGTCGCCAAA
GCTTTGAGTCAAATCGGTGCTTCGATTACTATGGCAACTATGACAACAAT
TGTCGCTTTTTTTGTTTCCATGTTCACGTATTTCCCGGCTATTCGTTATT
TTTGTTTTTACGCTGGTTTGAGTATTTTGTTTTGCTACATACAGGTGCTG
ACGGTTTTCATATCCTTGTTGTCTTTTGACGTACGACGGATTGAGAATAA
ACGACGTGACGTCATTTTCTGTTTCACTGAGAAGCTGGAGGGAGATGTAT
GGGAAAGAGCAAAAGATCGCGTTTCATTAAAGGTAAATTTTACGAAGCAA
ATTAATGGCGAGAGCGATAAAGTTTTACTTAGGCTAAAGCTCTGATTCAT
GCTTTACAAAATGCACTAAATCCGTAATGTAGTAGCTAGTCATAGGTCTT
TAAAGTGTGTCTTCTCTTAGCTCTGACTCTTCAACGGGGATATTGATGAT
AAGAGAAGATTGTCTTTCATTTTGAGTTCTTATAATCTGTCTCTTTTTAT
TTCAGCTGATGAAGATTTACTCGCGATTCTTGTTGAAAACACCAGTCAAG
TACACCCTCTTCACTTTATCCTTGGTCATGACCGGTCTTGGAGTCATTGG
TGCTATGCATATCGATCAAAGTTTCGATAAAGTTGTTTTATGTGCTCCCG
AATCTCCATACGTTGAGTTTTACAATTATTTCAATCGAGCTTTCCCGATC
GGCGATGAAGTCAGTGTTATTGTGGATACGCCATTAAATTATGGTGACCC
TCAGATTCAACACCAGTATTCGTCACTTAGTCAAGTCTGCCAAGAGAACA
GACACGTTAAACATGCTTCAATGAATTGGATGTCCGCTCTCCGTGATTGG
TCAACTAAAACACAGACCAACATCACGGGTCCGCATTTTATACCTGCTTT
ACATGGTTTCCTTAAAATGAATCCGTTTTTCTACCCAGATGTAATTTTTG
ATAATCGGGGAAATATCAAAGCCAGTCGTATGATCATGTATTTGAAAGAT
AATACCGATTCGGATTTCCTGAAAAAAGCGATGTTAACGTTACGCTCCGA
TTTACGGGAGAAAAATGATTTACCGGTTTACGCAATATCATACGCTTTCA
TTTTTTACGAGCAATACGCTGTCATTCTACAGAACACCATTCGTAACATC
GCCATATGCGCGACAGCCATCCTCGTAATTACGCTACCATATTTAGTGAA
TCCGAAAGTGACTTTACTGGTGTTCTACGGCTTTATCAGTCTCATGTTTG
AGTTATTTGGAATTATGTATGTTTGGGGCGTTTCACTGAACGCCCTCAGT
ATGATTATTTTGGTGATGGGAATCGGATTTTCCGTAGATTACTCTGCTCA
TATTGCGCATGCGTTTGTGAAGTCGAAGAAGAGGACAGCACGTGAAAGAG
TTTATGAAGCTTTAGAGACGATGGGATCCAGTGTTGCCATGGGAGGTACG
TAATTATCATTGGACTAGGAATTCCATTCGAATCTTTTCATAGTTCGAAC
TAAACTTCAATCGACGCCTTCCTTGGAAAACCTTTCTAAAACAACTCTTT
ATTCGAACTTAAAACCCATAATTTGAAGAGATCTATTACTCCTTTGAACA
TCTTTAAAATGTTAATAAGACCCACAAATTTTGAACCAAGATGCAAATTA
TCTCAAAAACTATCATTTCTCGTGCAACAATCAACCTCGTCGGAAATTTC
CTGTGGTTTTTAGCTAACACATATTACTTCCAGAATCAACTTAACCATTT
TTGCAGTAAAAAGACTCTTTTGTCTACGGATTTTAAAACTTAAATCAAAA
TCATCTTTTTTAATTTAGGAGTATCGACATTTATTGGAGTGATGGTAAAA
GCATTTGCTGTCAACGAGATTTTCAAAATATTTTTCAAAATGGTTTTTGG
AATTGTCATCCTTGGTTTAGTGCATGGCTTGATCATCTTGCCAATCCACT
TAGAATGTGAGTAACGTTGCTTTACTAAATTAGGGTAAAATTCCACTCCC
CACTTTACCAGATTAAAATCCAAACCAATCCCTGTTAAGGAGGTCTTACA
GGTTTCCAAATATATTCCCCGGTTTTGTATACGTAAAAAAGAATTCACAC
CTAGATCTTCTATATACTCTTCTACAGTTGGTATTTGACGAGCATTTTTA
TCTACATTAAGGAAATTAATTTTTGCAAGAACTAATTCCGAACAGCAAAG
ATCTTGAAAATCTTTAATTTTGATGGGAACTAATTTTGCCGAATGACAAG
ATAAATTTTAGGGGGCTATTTTGGCAAAATGCAAAAAAAACTAATATTGG
CGAGAACTGAACAACGAGTGATTAAAATATTTAATTTCGAACTCGCCAAA
TTCACCAAAATTAGTTCTAACCAAAAAAGGTTCCCTTAATGTATTTTGGC
GAGAACTGATTTTGAAAAAAACTCACTGAATTAGTTATAATGTGGGGGGC
GTACGAGGGTTGCCATCACCGAAATACCGACAGATTTTTCTTAAATCACC
GCACTACCGACAAAATTTTCCTAAAACACCGACACCGACGTCTTTTAGAG
CAAGCTTAAGATTTTTATTCTTAGTACGAATGCTCAATATCACGAGCGCA
GTAGTGCACTAGTTTAGTTTTTCTTGGAGAAAACTATCGCCGATTCAGCA
TGTTTCTCATTACATTGTCTTTAAAACGCTTTAACCAGACAGGGTCGCAA
ACCGATTGGAACAAAGCCACGCCGGGTAAAAGAAGGCACAAGCATGGTTT
GCGCCGACAGAAAAATATTTCAGGAAATCTCATTTGTCTAAAAATGCTCT
CTTTTTCACAAAACTAGTCATTTTACTACGCCATCCAGATAAATAGTTCG
TTTGATTTAGGCTGAAACTATACTGGTATTGAAAGCCTGCAAAGAGAGCT
CTGCAAGGGGAGGACCACAGGAAGTATTTTATATTGAAAGGCAATTGAGA
TATGATTCGAGGGCCAACCATGGTTTGGCCCGAGGAGCCAAAATTTGAAA
TTTAAGGTGCCAGAAATGCTGAAAAACGCATCTAAATCATAGGCTAATGG
ATTATTCCGTAAAATGAAAGAATTTAACGATTGTTGATTTTTGATGAGTG
CTGCATTCGAGACCTCGAGAAATTCTGCTAACTTAGCTTTCTTTACCTGT
TACCCACTATTATGATTGTTTTCATAAAGTGCACATTTCCCGTAAAGAAG
TGGTTAAGAAACACCATTATGCACACAATTTTAAAAAGAGGATGAGACAG
GGTAGCTACCAAAAATAGCCATATTATAGCTACAATTCTACTCGTCATAG
CTACAATTCTTGTATAGATAAGATATTCAATAGCTGAAATGCAGATTCAA
AAAATTTATGAGATCGTTTGAAATATGCAGATTCACCGCCAGTATTTCTC
GAATCACCGAAATACCGACCCAAAAAATCAATTTTACCGTCACCGCAAGG
CATGTCCAACACCGAAATACCGACACTTTTTACTTAAAACACCGAAACAC
CGACGCAAAAAAGGGTCAATACCGACACACCGACAAACCCGTACGCCCCC
CCCTATAATTAGTTCTGCCAAGGTAGCTTTAAAATTAGTGAATCTTCATG
AATTCTTAAAAGTTTTTTTCTCTTTTTCTTTATAGTGTTTTGCAGAGGAG
ATGTGATTTTGAGTCATCACGTCAGTTACCGAGGTAGCAAAGAAACCAAC
ATCAAGAAAGACCAAGACAAAAAAATGCTCAATGGGAATGGTTTACTGCA
CCATGAAGAACAGAATGGAAATATAGATCAACCAGTTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000042_pilon:1801484..1810323- >XLOC_043259 ID=XLOC_043259|Name=XLOC_043259|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5484bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000042_pilon:1801484..1810323- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGTAAAGGAGAAAGAGGCTAGTTATAAACGCAGCCTTTTGGCTTCGAT CACCAGTAATGAAACGGTAGAAGGCGATACTCAAGAATCATGCAAAGATG AGATGTTGGACGATGATTGTGATGACTCAAGGTTCAGATGGTAAAGGAGA AAGAGGCTAGTTATAAACGCAGCCTTTTGGCTTCGATCACCAGTAATGAA ACGGTAGAAGGCGATACTCAAGAATCATGCAAAGATGAGATGTTGGACGA TGATTGTGATGACTCAAGGTTCAGCTTCAATTCGTTTTGTCAAGAATGGG TGGATTTTTGTCTGGCACTGAACGGATTCTTCGAGAAATTATTTTACAAA CTTGGATTTCTTTTGGCATCGAATCCAACATTGACTGTCATATTTGGTGT CATTGTACCACTTTTTCTAACAGGTGGTTTCTTCAGATTCAAAATGTTAC AGAGAACTGAGGACTTATATATTCCAGAGAAAAGTCAAGCATTTGAGGAT CTACGGCGAGCTGAGAAATTCTTCCCAGTGCGAGTCAAAGCAGAACAATT TATTGTGAAACCTCATAATAGAGATCGTATATTCCATCAAGATACTTTTA 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GTTTCAAGAATCAAGTTGGCGGTCATTTCATGGTGGCTTTCTCTGGAATT ATTTGTTTATTTCTTGGTATTGGATCGGCTTTCGGACTCATCATGATGTT CGGTCAACCATATATCGCATTCGCTGGTGTCTTACCCTTTCTTGTTCTTG GAGTCGGTATCGATAACATTTTCATCATCATTCATGCAATAGATCGTCAG GATCCTGAGATCCGTGGACCATATAGAGTCGCCAAAGCTTTGAGTCAAAT CGGTGCTTCGATTACTATGGCAACTATGACAACAATTGTCGCTTTTTTTG TTTCCATGTTCACGTATTTCCCGGCTATTCGTTATTTTTGTTTTTACGCT GGTTTGAGTATTTTGTTTTGCTACATACAGGTGCTGACGGTTTTCATATC CTTGTTGTCTTTTGACGTACGACGGATTGAGAATAAACGACGTGACGTCA TTTTCTGTTTCACTGAGAAGCTGGAGGGAGATGTATGGGAAAGAGCAAAA GATCGCGTTTCATTAAAGCTGATGAAGATTTACTCGCGATTCTTGTTGAA AACACCAGTCAAGTACACCCTCTTCACTTTATCCTTGGTCATGACCGGTC TTGGAGTCATTGGTGCTATGCATATCGATCAAAGTTTCGATAAAGTTGTT TTATGTGCTCCCGAATCTCCATACGTTGAGTTTTACAATTATTTCAATCG AGCTTTCCCGATCGGCGATGAAGTCAGTGTTATTGTGGATACGCCATTAA ATTATGGTGACCCTCAGATTCAACACCAGTATTCGTCACTTAGTCAAGTC TGCCAAGAGAACAGACACGTTAAACATGCTTCAATGAATTGGATGTCCGC TCTCCGTGATTGGTCAACTAAAACACAGACCAACATCACGGGTCCGCATT TTATACCTGCTTTACATGGTTTCCTTAAAATGAATCCGTTTTTCTACCCA 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Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000042_pilon | genome | sc0000042_pilon:1801484..1810323 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 2590-2742:154 |
| Aaloc | 2452-2586:1971 |
| Aaloc | 1510-2448:3286 |
| Aaloc | 139-1509:4880 |
| Aaloc | 1-135:8841 |
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