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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000072_pilon:97431..99590+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_043247 ID=XLOC_043247|Name=XLOC_043247|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2160bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000072_pilon:97431..99590+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTAAGCACTGACCCAGATTACCATATGAAATATTTCTCATTCATTTCATT
AATCCAtactcacttttttagaaaacataAATATCACACGAAAAAGGGAA
AAATGCACCTCCTAAAGAAATTACTTATACTGCTCCAGATGCACCATACA
AATACATTTTATGTCGATTCAATGAAGACTATGACATTGTCTCAGAATTA
CAAACCCATTGAAGCACAATTTTGGCAGCGTTACAGTTTTGTTATCGTTC
AATCACATACACAACATCAAAACAGTACACTTTCATATAATGCGCACACT
GAATATGGACAAAGCTACCAATCTTTGAATTCAGGATTAATCCAAAGAAT
TGATGACTCTTATAGTCGAAATGTCGAGATGTATGTTAAAAGTAGTAAAG
CTGAGATGGTAAATGCAGTATTACTAGCAGTACCGGTTGAAAACCGATAT
CCAATACCAGGAGGCTGTTGCCTAACATGTGCACTGGAGAATGACCCTAA
TATTAAAATCAAGTATGACGAGTTTaCAAGTGTGACATTCCATAGAGCAA
GCAAATACTACTCATCACAATCAACACCAGGCTGTGACAACTCTGAGAAG
CCAGCTACCTATGATTTGGTGTATGATGTGTATTATTATTACATTGATCA
GAATAATTATGAAGAAGATGCACTTTTTGATGCTTTGTATGCCATGTCCA
CACCCACCAGGATACGTTTAAACGGTATCAAATTAACTACGATCAAATCA
CAAGAGTCGTTATCAGTAGATATTGAAACATTATTTGCACAAGGCATTGT
TTTGAATGTCATTGTTAGTGATTCTAGCTCTGGAACCGATTTGGAGACAG
CCTATGTACCAGCTGCAGTTTATGCTTGTAATTTTACTGCTAGTGAAGAT
TCGCCAAATAATTGCCAAGCTAGAGGATCAACAACCGTACTCATATTTTG
TATTTCATTTGCTGTACTTGGTTTCCTCTTATCTGTTGCTGGATTCAAAT
GCTTTCGTTTATTTGTGTTTTCAAGTGGCGTGGCTTTTTACTggtttatc
attttcattgtaATGTCTAGATACCTGGACCCCAATGAAGAGAGTCGCCA
AGACACTCTCATGATATCTTTCCTAATATCTTTGGTTGGTGGTGGATTTA
CTTTGTTTTTGTATGGATTtgagaaatgtttttatttagtaTTCCACAAA
ACATGTTTGGTATTTGGAATGTTCTTGTCAGCTATCATTTTCTACACACC
GTTTGGTTATTTTGAAGTCTGGAATGAAGATTACCGATTCATTTTGATGT
TTGCCTGTTTTGCACTCTTCTTTAGTATGGTATGTTTGTTTATACCTAAA
GCTGCTTGTTATTTGAGTTCCAGCTTAATAGGGTCCTTTGCGGTTATCAT
GGTACCAAACTACTTTCTCAGAGGAAATATGCAATATATCATTTTGACTA
TTGTTAACCGTATTACTGTATTTAAATTTGGGTATCTTTACCTTCGCCGA
CCGTATGATCAAGTAGAATACATTCTCACAGGTGTTTGGGGAGGACTTTT
CATTCTTGGTTGCATTATCCAATATTGTACCACCAAGGATCAGGACTTCC
AGTACTCTGGTAAACAGCTACGTCACAAAGTATGGTCAAAGATCGGTGAA
AGTGTTAATCTAAGTAAGAAGAATAAATCGAGGAAGCAGAAAAATATACG
TCGACCTGTACCAGCACGCCAATACCAACGCTCTCCACCACCACAAGAGG
AACGTAGACCTCTGCTGGCTGATGATCACTTGCAACCGACTTTTGGCGGT
TATGGTGGCTTTGATGAGCCTCCTCAGCAGGTTGTTGAACATTACCCAGA
ACACCATCAACCGTTATTGCATCAGCCTTTATTTGTTGGATACGTCTCAT
CAACTGAAGTTGAACCTACAGCTCCAAGACCGTCAGCTCCAGTGCAACAT
TCACCACCCAATTCTGCGCCACCTCCTTATCAATTCACTGATAACACAAC
CAACCAAGATTTAgattcaatcaataatcaaaatgTTGACCAGAATCTTA
TTGATTTTGATGAGAGACCacttcaaaatgttgaacaTCTTGTTTTGAAT
GATGAAGACCAACGTGCTACATACAGGAAACCTAGTGAGAGATATCCCAA
AGTTGTTTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000072_pilon:97431..99590+ >XLOC_043247 ID=XLOC_043247|Name=XLOC_043247|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4320bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000072_pilon:97431..99590+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTAAGCACTGACCCAGATTACCATATGAAATATTTCTCATTCATTTCATT
AATCCAtactcacttttttagaaaacataAATATCACACGAAAAAGGGAA
AAATGCACCTCCTAAAGAAATTACTTATACTGCTCCAGATGCACCATACA
AATACATTTTATGTCGATTCAATGAAGACTATGACATTGTCTCAGAATTA
CAAACCCATTGAAGCACAATTTTGGCAGCGTTACAGTTTTGTTATCGTTC
AATCACATACACAACATCAAAACAGTACACTTTCATATAATGCGCACACT
GAATATGGACAAAGCTACCAATCTTTGAATTCAGGATTAATCCAAAGAAT
TGATGACTCTTATAGTCGAAATGTCGAGATGTATGTTAAAAGTAGTAAAG
CTGAGATGGTAAATGCAGTATTACTAGCAGTACCGGTTGAAAACCGATAT
CCAATACCAGGAGGCTGTTGCCTAACATGTGCACTGGAGAATGACCCTAA
TATTAAAATCAAGTATGACGAGTTTaCAAGTGTGACATTCCATAGAGCAA
GCAAATACTACTCATCACAATCAACACCAGGCTGTGACAACTCTGAGAAG
CCAGCTACCTATGATTTGGTGTATGATGTGTATTATTATTACATTGATCA
GAATAATTATGAAGAAGATGCACTTTTTGATGCTTTGTATGCCATGTCCA
CACCCACCAGGATACGTTTAAACGGTATCAAATTAACTACGATCAAATCA
CAAGAGTCGTTATCAGTAGATATTGAAACATTATTTGCACAAGGCATTGT
TTTGAATGTCATTGTTAGTGATTCTAGCTCTGGAACCGATTTGGAGACAG
CCTATGTACCAGCTGCAGTTTATGCTTGTAATTTTACTGCTAGTGAAGAT
TCGCCAAATAATTGCCAAGCTAGAGGATCAACAACCGTACTCATATTTTG
TATTTCATTTGCTGTACTTGGTTTCCTCTTATCTGTTGCTGGATTCAAAT
GCTTTCGTTTATTTGTGTTTTCAAGTGGCGTGGCTTTTTACTggtttatc
attttcattgtaATGTCTAGATACCTGGACCCCAATGAAGAGAGTCGCCA
AGACACTCTCATGATATCTTTCCTAATATCTTTGGTTGGTGGTGGATTTA
CTTTGTTTTTGTATGGATTtgagaaatgtttttatttagtaTTCCACAAA
ACATGTTTGGTATTTGGAATGTTCTTGTCAGCTATCATTTTCTACACACC
GTTTGGTTATTTTGAAGTCTGGAATGAAGATTACCGATTCATTTTGATGT
TTGCCTGTTTTGCACTCTTCTTTAGTATGGTATGTTTGTTTATACCTAAA
GCTGCTTGTTATTTGAGTTCCAGCTTAATAGGGTCCTTTGCGGTTATCAT
GGTACCAAACTACTTTCTCAGAGGAAATATGCAATATATCATTTTGACTA
TTGTTAACCGTATTACTGTATTTAAATTTGGGTATCTTTACCTTCGCCGA
CCGTATGATCAAGTAGAATACATTCTCACAGGTGTTTGGGGAGGACTTTT
CATTCTTGGTTGCATTATCCAATATTGTACCACCAAGGATCAGGACTTCC
AGTACTCTGGTAAACAGCTACGTCACAAAGTATGGTCAAAGATCGGTGAA
AGTGTTAATCTAAGTAAGAAGAATAAATCGAGGAAGCAGAAAAATATACG
TCGACCTGTACCAGCACGCCAATACCAACGCTCTCCACCACCACAAGAGG
AACGTAGACCTCTGCTGGCTGATGATCACTTGCAACCGACTTTTGGCGGT
TATGGTGGCTTTGATGAGCCTCCTCAGCAGGTTGTTGAACATTACCCAGA
ACACCATCAACCGTTATTGCATCAGCCTTTATTTGTTGGATACGTCTCAT
CAACTGAAGTTGAACCTACAGCTCCAAGACCGTCAGCTCCAGTGCAACAT
TCACCACCCAATTCTGCGCCACCTCCTTATCAATTCACTGATAACACAAC
CAACCAAGATTTAgattcaatcaataatcaaaatgTTGACCAGAATCTTA
TTGATTTTGATGAGAGACCacttcaaaatgttgaacaTCTTGTTTTGAAT
GATGAAGACCAACGTGCTACATACAGGAAACCTAGTGAGAGATATCCCAA
AGTTGTTTAGTTAAGCACTGACCCAGATTACCATATGAAATATTTCTCAT
TCATTTCATTAATCCAtactcacttttttagaaaacataAATATCACACG
AAAAAGGGAAAAATGCACCTCCTAAAGAAATTACTTATACTGCTCCAGAT
GCACCATACAAATACATTTTATGTCGATTCAATGAAGACTATGACATTGT
CTCAGAATTACAAACCCATTGAAGCACAATTTTGGCAGCGTTACAGTTTT
GTTATCGTTCAATCACATACACAACATCAAAACAGTACACTTTCATATAA
TGCGCACACTGAATATGGACAAAGCTACCAATCTTTGAATTCAGGATTAA
TCCAAAGAATTGATGACTCTTATAGTCGAAATGTCGAGATGTATGTTAAA
AGTAGTAAAGCTGAGATGGTAAATGCAGTATTACTAGCAGTACCGGTTGA
AAACCGATATCCAATACCAGGAGGCTGTTGCCTAACATGTGCACTGGAGA
ATGACCCTAATATTAAAATCAAGTATGACGAGTTTaCAAGTGTGACATTC
CATAGAGCAAGCAAATACTACTCATCACAATCAACACCAGGCTGTGACAA
CTCTGAGAAGCCAGCTACCTATGATTTGGTGTATGATGTGTATTATTATT
ACATTGATCAGAATAATTATGAAGAAGATGCACTTTTTGATGCTTTGTAT
GCCATGTCCACACCCACCAGGATACGTTTAAACGGTATCAAATTAACTAC
GATCAAATCACAAGAGTCGTTATCAGTAGATATTGAAACATTATTTGCAC
AAGGCATTGTTTTGAATGTCATTGTTAGTGATTCTAGCTCTGGAACCGAT
TTGGAGACAGCCTATGTACCAGCTGCAGTTTATGCTTGTAATTTTACTGC
TAGTGAAGATTCGCCAAATAATTGCCAAGCTAGAGGATCAACAACCGTAC
TCATATTTTGTATTTCATTTGCTGTACTTGGTTTCCTCTTATCTGTTGCT
GGATTCAAATGCTTTCGTTTATTTGTGTTTTCAAGTGGCGTGGCTTTTTA
CTggtttatcattttcattgtaATGTCTAGATACCTGGACCCCAATGAAG
AGAGTCGCCAAGACACTCTCATGATATCTTTCCTAATATCTTTGGTTGGT
GGTGGATTTACTTTGTTTTTGTATGGATTtgagaaatgtttttatttagt
aTTCCACAAAACATGTTTGGTATTTGGAATGTTCTTGTCAGCTATCATTT
TCTACACACCGTTTGGTTATTTTGAAGTCTGGAATGAAGATTACCGATTC
ATTTTGATGTTTGCCTGTTTTGCACTCTTCTTTAGTATGGTATGTTTGTT
TATACCTAAAGCTGCTTGTTATTTGAGTTCCAGCTTAATAGGGTCCTTTG
CGGTTATCATGGTACCAAACTACTTTCTCAGAGGAAATATGCAATATATC
ATTTTGACTATTGTTAACCGTATTACTGTATTTAAATTTGGGTATCTTTA
CCTTCGCCGACCGTATGATCAAGTAGAATACATTCTCACAGGTGTTTGGG
GAGGACTTTTCATTCTTGGTTGCATTATCCAATATTGTACCACCAAGGAT
CAGGACTTCCAGTACTCTGGTAAACAGCTACGTCACAAAGTATGGTCAAA
GATCGGTGAAAGTGTTAATCTAAGTAAGAAGAATAAATCGAGGAAGCAGA
AAAATATACGTCGACCTGTACCAGCACGCCAATACCAACGCTCTCCACCA
CCACAAGAGGAACGTAGACCTCTGCTGGCTGATGATCACTTGCAACCGAC
TTTTGGCGGTTATGGTGGCTTTGATGAGCCTCCTCAGCAGGTTGTTGAAC
ATTACCCAGAACACCATCAACCGTTATTGCATCAGCCTTTATTTGTTGGA
TACGTCTCATCAACTGAAGTTGAACCTACAGCTCCAAGACCGTCAGCTCC
AGTGCAACATTCACCACCCAATTCTGCGCCACCTCCTTATCAATTCACTG
ATAACACAACCAACCAAGATTTAgattcaatcaataatcaaaatgTTGAC
CAGAATCTTATTGATTTTGATGAGAGACCacttcaaaatgttgaacaTCT
TGTTTTGAATGATGAAGACCAACGTGCTACATACAGGAAACCTAGTGAGA
GATATCCCAAAGTTGTTTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000072_pilon | genome | sc0000072_pilon:97431..99590 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 529-2163:526 |
| Aaloc | 1-525:1 |
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