|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000021_pilon:888301..894730+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_043228 ID=XLOC_043228|Name=XLOC_043228|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6430bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000021_pilon:888301..894730+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAGGACATTTCATTTTGGAAATCTGAACTAGATAGACAATATAAAGAAAC
AGAAGATGAAATAAAACGAATGATTGAGTATAAAAATCGCTTAGAAGTAG
CTCTGAATGCCACTGAAATACCATTGCACATTGCTAAAGAGTGCcttcaa
aacagacaaaaaagaATGTCAATAGATCTTGTTCATGATGATGTAGAAGT
TCAATTACTAAAGGTATAAATTAACTCTTTTAAACGCACATCATATCAAC
CCGCCCTGCTGTCAACAAGGTGTTGCACCACCAGAATGGCACCTGTGCTG
AAAAGTTTTATTAAGACAGTAAGACTGGACAAACGTATCTGGTTTTTCTC
TAAGTGTTGCACTATATACATTAAATTTTGGCACCCAAACAAACACAGTC
ATGCTTAACAAAACCAGCAGGCGTTACtaatcgatataataatcgattaa
aatcgattataattgatagctaatcgataattaatcgattgattaaGAAC
AATAATCTATAGCTAAtcgatactcacaattttttagcGCTCACTAAATT
ATCACCatagatttttaatcgataatatcGTACAGTGTTAATAATTGATA
ATATTGATATAATCAATACTCACAtttttttAGGCaccgattatttatcg
attattgtttttaatcaatatttaATCAATCGATTAATTATCGAAATAGC
TATTGATTTTATGGATTAGTAACATCTGGTTAAAACTGTAGGCATACACT
AAGACGACCACGGTAGAGTATATATACACCTAATATACTCAGATATTTTA
CTTGTGCCAAGGGATTGATGTCTTGGaatagttgtttgggagaacgcAAC
GgTctattgaataacaaattacttcacatattaatgacgtcatcattaaa
aacagtcCTGCTGGAGTAACTACCGAGAgatggggtaacttgcatcagcg
gaggttaacatgcatagccctcgctcaaatgaatgacctggatAGAGATA
GATATCCTATGTCCTACCCACaatggagtaggaatcacaacACAAGCAAA
CATTACGCGCCATGGTgtggtgtataccacgacactcgaactacacggga
gaacagatgtcctcgcaggtgtagaacctcttaagtgtctcagcacacca
caatgtctggaatatctacccatactcttgtatcagagttatggtactca
attcccctcacatggcatgggttgataCAGGCGGAGCATTCACATGCCAA
CAAGTGAAttgtaccgtaacttggtctaatgtctaCATCCCTCGTCAtaa
ttcgacacccttttctagagctgaaaaataaaaaaaagattgaaattatt
tttctttgcttagtggtaaggaagaaagaagggtgtcgaaattagaagac
cgATGTCGAGactagaccaacttacggtagtgcCACGGTGAGTATCGAAC
TCTGGCCTCCTTGACAGAAGTCAAGcacaatagccactataccagccaca
catacatactacatatacatactaataataataataataataataataac
gaatgttttaagtggctggctccgaaaaattctagagcttttagacagct
caagaattgtttccacgaagggccactacgaacagaacaagaacagtaac
aaaaaggaacaggaaaattggattttaaatAATTGGAGAATTAGGTGAAG
AAATGTTTTCTTGCTCTACTCTTGAAAGACACAATCGATTCAGCATCACG
GCATTCCCTGGGTAGGTTATTCCAGATAGGAATTGTAGAGCTTGCGAAGG
TTTTTGCTTCAAATCTGTTTCTGTTTTGCCGTACTGCTAAATTATTCTGA
GCGGCTAATCTAGTGTAGTGGTCGTGAATACTAGGATACTACTACTAGGA
ATcgcctggctggtcattaaaacaaaaatggtagagtagagctgcgagtg
gagctgtgtagttcatttgttttgaaattttgctgctttaattggtcagt
catttgatggctatggcaagtttccctccacagatgcaagttacctgact
ttaCCAGACTTTATGggtagttattcaaaagactgttgcATTCTCGCAAA
CGACTACGCTAAGAGCGTGACGATTTTCTCAGCGACAAAGACTTTTCTGA
AGTTAattcaaaagtctttttttaatttaaaattacCTCTTATTAATTGT
ACAGCTCctctttGCATAgaaattctttttgggaTAGAAATATTTCAATC
AAtagcatagctgtcaacttcatCTCACAAAAGAGAGCTCGaagtcagaa
aaattttccctgataCTGTAATCCAATTTCTCCAATTTGGATTATTGGGA
ATTTGgggaatttttttcgggaaatcaGTGAAATCAGCaaatttttcgta
aaaaaaaatttgccaaaatcactgttttgggaaatttttgccattccatt
ttcaaaaattttggatgaatTCCGAAATAATTTCAggaccgaaggaattt
tgcccgatttccaaaattccgaagaaaaaagggtcaatctccgcaattcc
gaaataccgtacgcccccactgccaatgcgggagagttgacagtTATGCA
ATATGTAGAGGGAGAGCGGAGAGTATATGATTTGTTCTGGTGGACCCGTT
CTTATGCTGCAATCCTGACACAAGGGTCCTCATATTATCTCAGGAATCTG
CGAGTTTGTAGATTAAGGATGCTCATTTGTTTAGGGGCTTTTTACACTGT
TGAGGGACCCTTGAAAGGTTATGTATGTGaattgaatgtttttaaaacCA
ATGTTATAATGATGTTATGTCTCAGTATACTCAGGTATACAGTAAGGTCT
AAGTATGCTAATAGTTGtttgatgtttcatttttaatggttttcaaatgt
caaaaataattaGACAGGGAGATTTCTCTCGATGAGTTGATAAGAGAAAT
agggtcacttttgaaatttagacCACATGATCCTGACTtatgacctctaa
agtccaaaaaatgacgattttgatgatgtcattaCTGAGAGGGATAAATT
GGAACGTCAACGAGCTAATCATTTAGCCCTGATTAGTATGTTTAAACCAA
CCGTTGAGGAGATATAacgattttaataaaaatttatttaaagatcgaaa
aaaagtgctgacCCTCAGCAAAGATAAGGGTTATAAACGATTTTATCTGG
GCCTGTATCTCGCCAACGGCTGATCTAAACATATTAAACCATATATTATA
AACCTTACATTGAAACACTAAAATTGTAAGATGCACATAACAATCTAAGA
CtgttcaaaaatttattttgataaaaggaaGGTCACATCAACTcaagatt
ttcttaaaaatttccattaaaataaaaaaagtaaacaaacatcTAATAGT
TTTCCTGGTAACTGTAATTGCAATTGACAGCCAACTGAActggttttttt
ttcggttttgTAAGaccaatttcattaaaattttaaactttactGTACAG
ACACCAATTTactttattattcgttttattttaAGGAGGTAGAAATTATC
GAGGGTGTCCAAGCAATGCTGAGAAGAACTTTAGACCAAGCAACAGAACA
AATCAGGTTAGTAATTTCGTCTTATTCTCTAACTAAAGTCTAATAAAACT
AACTGGAAATAGTagagtaagtaagtatattgaacaaaaactggggaata
aaagttattttagaTAATGCATGAGAAAGTGGAAGAAAACCCTACACCGA
GTTGGTAAAAGGTAAAATTTCAACTGAGATATACAAAAGATTTCATAACT
TCATGGAGCTAACAATAACTTCTATGGAAtgtaacttttttaataattgt
CAATGTTTCACCAAAGTTTGGCACGGACTTTATTTACTCACTTCTCACAA
AAAGCTCTGTGTATAgggggggCCCTGTATAGGTCTGTAGATTGTCTGCT
TATGGTTAATAAAAAGGGAATTTGTCTTAACCCGGGTTCTAAAGATAGAA
ACAGACGTTCCCTGTCCTTGATCTAAAGAAGTATTTTTATTCCTTTTAGA
TTACTTCGATCTGCAAACCACTATCTTGGCAAGGATATCGGTGATAAATT
TTCTGCATTAGGTATTGATGATCATTGTGCTGGGTTAGGCAACGATTCCC
CACAGAAATATTTTGCTCCTGGTGCTGTCAAAGTTCAAGCAAAGTATGTA
TCTCTATTTACCATGGCTGAGTCATTTTTCTGGATATAACAtcgaataaa
aaaagaaaaatttcatgtgGCCAATCAGTGCTAGACGCTagaggctgtaa
cttttgatagaatttcaaTCACATAGTTGAAAAGATATGGAATCAAAGAG
TGaaacataatgaaaataaaatgtaaaaaaatcatagcaaatttgaaaaa
tgcagatgaagatgaaaaaaaatcaacttcttatAAAATTGAGCAATAAT
TACCATTTTTGCCCCAGCAAATAGCAAAAATCACTTTtcatgtgaaaaag
tgaaactGTTAATTAGAGAACAGTTCTTCAAGATCTCTCTTTCCTactat
tttcatcttcattttttagatttttttcgaaatttactGAAAATTTTCCA
CACAATGTCTTGTCAACAAGCACGaactaattttattcaaattctacCAT
AAAAGTGAGtacgaagtttttttttttgaaaaaaaaacatggaatttcAA
TCCTCATCCTCATCCAATTTTGGTTCcttatttttattcccactcGCTGA
AAAAATCTACCGTGTCTGAGAGaagagtttttttctatttttctttccat
tttctttcttcACTTAGCTCCATAACCACAGAagaatgggaaaaattttc
caataaaaatGTCTTGAAAGCTGAACGTGAACGAAATTCTGCCGTCACTA
TTGAGTCAATGATTGAAGAAATTTTACAAGAGACTTTTGAAGACCAACAA
AAACAATGTGATAACGTCAACTTGGCCTTCGAAAAACGTATTGAAGAGAC
TTCAAAAGCTAAAGCAAAGCTTGAAGACCATCTAGTAAAGGTAATTCAAA
CACGTATCCGTGgtcttttaaaaatcaaaaaacgtATTTTGAAATCTTAG
TACCTTTAATTTTAACCTGGACACGAAGCGCTCTTGTGGTGATAAATCTA
TATAATAATTTCCTTACTTGTCAAAAACGTTTACCATTTTGAAACACATT
TTGGATTCATTTTTATCGGAAATTGTAATTTAGATCTATTCCAGTGTTTT
GGCGTCAAAAGGCAAAAAGTCAACCTTCTAGACTATATAGCCTAgcttgg
aaagcttgtttttcACTGTTTAAAGACATAAACATTCTCATCTAGGTTAA
CCAAGAAATTACTGATATGGAATCAAATATCGATATGTTGAACCAAGCTA
TTAATGGCAAATTGTCACCCATGCAAGTGTCACAAACCAGATTGGACACA
CGAGCTCACCGCCCTAATGCTGAACTTTGTCGTGACCAAGTCCAATATAA
ACTGATCAGTGAGGTATCGATCTAGATTGTCGTCtttataagatttttaa
aatcagCATGTATTTTATTCACAAACAAATTTCactcaatttcatatttt
caaattctatATTCTGATTCATGTTTTTTAACACCAGGCTGAAATCAATT
TggcatttaaaattttaaaatgttggAGGGGTTGTTTTTAACTATTTTTT
TTTCTTACAAAAAATTCTGAATTGAAACTACCGCCTTAAATGTTACTCTT
CAAAGCTCGAAATCTGCTGAAAGACCACTTACCTGTATTAAAACCCCAGG
CTAAACTTATCCTTggtggaaatttaatttggcggatggccgaaaaagct
TTTTCAGAGAAGATTCCATTTGGTGGGATTAAATACACTATTGTCAAAAA
ACGCCATTTAATaaaaaaaCTGTCGAAGGCCTGAAATAGAGATGCCTTAG
ATTTTTACAAggtacttcactaattggtcatttaaagtgatatggatgac
gcgttctttagaaaaagtaataagattcttttattacatcttaacgacca
accaaatcaaataagagcttgtaaaaactccagcttgtcccctgaaatag
cacacatttgggggaataaatacaataatttaaattcggtgggaacttaa
tttggcggattatTGACCAAACCCATCATCATTTTTtcggccaaaatttc
tttcctcaAGTTAATATCTTCCTCTCTCCTAAATTTTGCAGGTTGGTGAA
ATCAGTGAGAACATCGAGCGCTTACAACAAGCATTGCGTGAATCAGAAGA
TAACTTGAAAGGATTAAGTCGTCAACAATTACGCTTAGAAGAAGATATCG
AAATTAAAGCCAACACCTTATTCATTGACCGGGATCAAAACATGACAATA
CGTAAGCAAATCCAACACcaaaaatattaa Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000021_pilon:888301..894730+ >XLOC_043228 ID=XLOC_043228|Name=XLOC_043228|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2016bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000021_pilon:888301..894730+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAGGACATTTCATTTTGGAAATCTGAACTAGATAGACAATATAAAGAAAC
AGAAGATGAAATAAAACGAATGATTGAGTATAAAAATCGCTTAGAAGTAG
CTCTGAATGCCACTGAAATACCATTGCACATTGCTAAAGAGTGCcttcaa
aacagacaaaaaagaATGTCAATAGATCTTGTTCATGATGATGTAGAAGT
TCAATTACTAAAGAAGGACATTTCATTTTGGAAATCTGAACTAGATAGAC
AATATAAAGAAACAGAAGATGAAATAAAACGAATGATTGAGTATAAAAAT
CGCTTAGAAGTAGCTCTGAATGCCACTGAAATACCATTGCACATTGCTAA
AGAGTGCcttcaaaacagacaaaaaagaATGTCAATAGATCTTGTTCATG
ATGATGTAGAAGTTCAATTACTAAAGGAGGTAGAAATTATCGAGGGTGTC
CAAGCAATGCTGAGAAGAACTTTAGACCAAGCAACAGAACAAATCAGGAG
GTAGAAATTATCGAGGGTGTCCAAGCAATGCTGAGAAGAACTTTAGACCA
AGCAACAGAACAAATCAGATTACTTCGATCTGCAAACCACTATCTTGGCA
AGGATATCGGTGATAAATTTTCTGCATTAGGTATTGATGATCATTGTGCT
GGGTTAGGCAACGATTCCCCACAGAAATATTTTGCTCCTGGTGCTGTCAA
AGTTCAAGCAAAATTACTTCGATCTGCAAACCACTATCTTGGCAAGGATA
TCGGTGATAAATTTTCTGCATTAGGTATTGATGATCATTGTGCTGGGTTA
GGCAACGATTCCCCACAGAAATATTTTGCTCCTGGTGCTGTCAAAGTTCA
AGCAAACTCCATAACCACAGAagaatgggaaaaattttccaataaaaatG
TCTTGAAAGCTGAACGTGAACGAAATTCTGCCGTCACTATTGAGTCAATG
ATTGAAGAAATTTTACAAGAGACTTTTGAAGACCAACAAAAACAATGTGA
TAACGTCAACTTGGCCTTCGAAAAACGTATTGAAGAGACTTCAAAAGCTA
AAGCAAAGCTTGAAGACCATCTAGTAAAGCTCCATAACCACAGAagaatg
ggaaaaattttccaataaaaatGTCTTGAAAGCTGAACGTGAACGAAATT
CTGCCGTCACTATTGAGTCAATGATTGAAGAAATTTTACAAGAGACTTTT
GAAGACCAACAAAAACAATGTGATAACGTCAACTTGGCCTTCGAAAAACG
TATTGAAGAGACTTCAAAAGCTAAAGCAAAGCTTGAAGACCATCTAGTAA
AGGTTAACCAAGAAATTACTGATATGGAATCAAATATCGATATGTTGAAC
CAAGCTATTAATGGCAAATTGTCACCCATGCAAGTGTCACAAACCAGATT
GGACACACGAGCTCACCGCCCTAATGCTGAACTTTGTCGTGACCAAGTCC
AATATAAACTGATCAGTGAGGTTAACCAAGAAATTACTGATATGGAATCA
AATATCGATATGTTGAACCAAGCTATTAATGGCAAATTGTCACCCATGCA
AGTGTCACAAACCAGATTGGACACACGAGCTCACCGCCCTAATGCTGAAC
TTTGTCGTGACCAAGTCCAATATAAACTGATCAGTGAGGTTGGTGAAATC
AGTGAGAACATCGAGCGCTTACAACAAGCATTGCGTGAATCAGAAGATAA
CTTGAAAGGATTAAGTCGTCAACAATTACGCTTAGAAGAAGATATCGAAA
TTAAAGCCAACACCTTATTCATTGACCGGGATCAAAACATGACAATACGT
AAGCAAATCCAACACcaaaaatattaaGTTGGTGAAATCAGTGAGAACAT
CGAGCGCTTACAACAAGCATTGCGTGAATCAGAAGATAACTTGAAAGGAT
TAAGTCGTCAACAATTACGCTTAGAAGAAGATATCGAAATTAAAGCCAAC
ACCTTATTCATTGACCGGGATCAAAACATGACAATACGTAAGCAAATCCA
ACACcaaaaatattaa
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000021_pilon | genome | sc0000021_pilon:888301..894730 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 826-1014:6242 |
| Aaloc | 658-825:5346 |
| Aaloc | 436-657:4819 |
| Aaloc | 292-432:4051 |
| Aaloc | 220-288:3536 |
| Aaloc | 7-219:1 |
|
