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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000072_pilon:311895..319859+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_043216 ID=XLOC_043216|Name=XLOC_043216|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7965bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000072_pilon:311895..319859+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CCCGATTTCGTTTCCAAGAGCACTCCGAAAACAATATGGCCGCcgaaaat
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CACTTCCTTATTCAATTGCTGGTCACTTCCATAAAGCAGgttgctatttt
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GTTTTCAGCATTTCCTGTGTTCCTGGGATTCCCATAAATAAACTCTAAAC
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ttgtataatttgttcaacacatatttttcaacaaaagatttgCCATAACT
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TTAACAGTCGACTTCAACAGGACATTCAGTGTttctaaaaactttgaaaa
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cgggggtaagagaattaaaaatttttaagtaAATTCCACAATTGgattag
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GTTCCAACAAAAATCTTGATCAAACCATAgttcgaaaaaaataatttgtc
cCTCCCCctccctttcttaagggggggggggtgacaccttccgaaaaaat
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AGAGTATTTTCAAGCACTcctatgaaatttggtcttcatgaaaggaagtt
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CCAGGCTTGATCTTATTTTGTAGAACTAATGGTTTATTGTAGCTCAGaga
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AGTCCTCATGGATCATCAACTAATAGTAAGTGCTGCCATTTACTTATTGC
GCAGACCATGTTCACAGGTAATAGTTTCGTTTTGCTctgaaatgaaatga
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TTGCTTAATTAGGCTTTTTTAGAAATGCCCTGTTGAAAATAAGAGTGCAT
TTGCCAAATCTCTATGGCGTTATTTCCAGAAAGTTCATATATAATGAGAT
AGAGGGAGAAAGAAAGTTGAATGTTGAATTAATGCCGAGTAAATTTCATA
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cccattttctttaaaagtggATACCCAGGGGAGGGGTATGCAGCGTCGAG
CTTTCGAAAAATCCTTCTATAAACTCTAGAGTAGTTTTCATAAACATCTA
AAGTTCATTCACTTTGAATATGTGTGATCTGCGTTGCAACAATATGGAAA
CCACTTTCAAAGGAATAAGTCTGACTAATTACGCTGAGTTGGTTTCCACA
TTGTAtcaaaaaagagtgcacacttaaaacGAGTAGACTTTAATCTTCAT
TATAAAATCAAGGCTTTGGATGAATTCAGCTCTTTAAAAGCTTGATCTTA
ATATGACCCTGACTACAATTCTTCGCCACTTTCATTTGAAACCTTTTAAA
TCTCAAATTTGTCTTGTCTTTGTAGGTGATAACAATGAGTTGAAACTGAT
GCGTAAAGTAAAATCTTTGGAAAAAGAACTTCACAATGTCAAAACGGAAT
TGAATTCGGCGAGAGACCAGAATAAAGAACTAATGGAACTTGTACAGCAa
agtcaaaatcatgaaattaggtaaatcaaatattttttttaaacaataca
tCAAGTTAATTACAAGATCACTGCCTTGTTTCTACAAGCATCAACTCTTG
ATATTCATTTTGAATCAGTAAGGGAAAATACCCTATTAGCACGCCATCTC
CTAAATTTTGTACACTGAATACAAGTGCAATATCTACAAAGGGTCCCTCA
AATTGTTACTTTGTCTTATTAAAAGTGTCTCTTTGACACAAAgcctgtct
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TAGAATTGTACCATGATCACCATTTTCATATCTTAAACTGTTATCACTGA
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TTATGGCCATCATGCTTATCACCCATGCTTATCTTTGGAAGGAAGGAATT
GTACATACCTTAGGGACATTTAAAAACAAGTTTGGTAAAAATTTGGGCAT
TGGAGCTTGGGAAGGGAAGTTTTTTCACACTATGTAGTGAGAAAATGGAT
GCTTAGAAATTCCAAATTTGAAAAGGATTGCGCGACGCACTTAAGACGTT
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CGTTAATTTAATGTTCATCATCTGCGGCCGTAGCATGAAGATAGACCATT
CAGATACGCTGCGCAAGGTTGCATGTTCGACCCCCAGACGGTTCATACCC
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gaagagacggatcaaggttATATGGAGAAATCCATGAAAAGGATTGGCGC
CCTCCCCTTACTTTGGGTAGAAAGCTCaagaaaagggagcctttggTCGC
CCTGATCGATTCAACATTCATAACTTTTCCATTGCAGGTTGGTTGTCTTT
CGGACAGGTGTAATCAAAACACCAATTTCACTTTACCCATTATTCATAGC
AATCGACGAAAACTGTAAGTCCACTcttaatcttttatttttcctttcat
GGATGTGAGTTTACTTTAACAAATATACGGGCTTGAATTTTGGTAAAGTC
TGACAAATTAATCTCAGTTTCATAGACATAATGAATAcacctaccttatc
ggccaaaacttagtcggccgtaattttagtcggccctcattttagtcacc
aagccaaaatttagtcactgagggccgactaataattaagaccaaATACT
TAagaattactctcgggtacttaatagccgtcccccccccccgcgaatta
atttttcgaaaattttccacccAggacattcttattccaacccccccccc
ccccccccccccgttataatttttgggaaaaatgttttgaaagttccctt
ttttgtcctaattcagctgtattagcctccttttcaaaaattttccaccc
aggacatttttattccaacccccctcccgcttattaagttttgagctttt
ttttcaaccccccggctattaggtacccgagagtaagatCTTAATTATAA
accttttaatttggcccaaattgttAGTCGGCCCAAACTTTTAGTCAGCC
CTCATTTTattcaccaagccaaaatttagtcacttagggccgactaagtt
ttggccgataaggtatcaaTACTAAAGTCCCAAGGGGTTTCGATTCGAGC
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TCAAATGAACCATGGCATGGCAGGTGGccgaaaatgttttaaaaagcaaa
ttcaaattgacaatttttcttttcagaagaTATTTCTTCTTTAATGTAAT
ATTTTTAATCATTGACGTCATTTGTGACCCTGGTAATCTCAGACGAAGTC
CCCTTGTGGTGTTAGGCTTAGTTAAAAATAGCTTTGTTACAagtgaacaa
aaataaaacataacctTCACTGGGAATGGACTCAAAATACACAATCGCTA
TTAAAAAAGTAGCTGCAAAATTGGCAAACTTCGATCCTTGTCCCCTTTTG
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TAACAATTATTCGTTGAGATGTAAACGAACCAAAGCTGTTCAAATGCAAA
ACAAACGGCCTCAAAAAGACCTCTCGTTGTCTCTTTTATCCAAACAAAAT
TTTATGACGCAGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000072_pilon:311895..319859+ >XLOC_043216 ID=XLOC_043216|Name=XLOC_043216|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2538bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000072_pilon:311895..319859+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CCCGATTTCGTTTCCAAGAGCACTCCGAAAACAATATGGCCGCcgaaaat
tttagagaaaaatgacCGGTGGAAACTCTTGAATCAAAGGGTTAAAAGAT
CACTTCCTTATTCAATTGCTGGTCACTTCCATAAAGCAGCCCGATTTCGT
TTCCAAGAGCACTCCGAAAACAATATGGCCGCcgaaaattttagagaaaa
atgacCGGTGGAAACTCTTGAATCAAAGGGTTAAAAGATCACTTCCTTAT
TCAATTGCTGGTCACTTCCATAAAGCAGATGCTGCTATGGAAACTATATC
ACCCGACCACCAGGTTATCGTAAGCACACCACCACCGCTAACTACTCCAT
TTAACTTATCCATCAACTCTAACACACACCAGCATATTCTGCCACCCATC
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TAATCCAATAATCtctaaaaacattgaaaattttaatacaGGATCCATAA
GAAGTGTACCTTTAACTAAACAGTCTGTACTCTCAGAACAGTGTACTCAG
ACTTCAGCACAGTCCTCTCGACAATCTTCCAGCTCTTCTCTAAGTTCAAG
TAAACAGACACCACCGCGAACGTCAGGAAGCAGTAGGAAACACGATTTAA
AATCACTTTATgacaagaaaattgtttttctccAAACATCCCATGGTGAA
GTGCTTGGCGATTTGCAAGAAGAAGTTGATcaattaaaattagaaaataa
agATGCTGCTATGGAAACTATATCACCCGACCACCAGGTTATCGTAAGCA
CACCACCACCGCTAACTACTCCATTTAACTTATCCATCAACTCTAACACA
CACCAGCATATTCTGCCACCCATCAAAAGTCTGCCCTCTTGGAATCGCCA
TCGAATTGGTTTAGCTAAACCTTGTAATCCAATAATCtctaaaaacattg
aaaattttaatacaGGATCCATAAGAAGTGTACCTTTAACTAAACAGTCT
GTACTCTCAGAACAGTGTACTCAGACTTCAGCACAGTCCTCTCGACAATC
TTCCAGCTCTTCTCTAAGTTCAAGTAAACAGACACCACCGCGAACGTCAG
GAAGCAGTAGGAAACACGATTTAAAATCACTTTATgacaagaaaattgtt
tttctccAAACATCCCATGGTGAAGTGCTTGGCGATTTGCAAGAAGAAGT
TGATcaattaaaattagaaaataaaggTTTACAATTTAATCTAGTTATGA
CAAGAGGCAACTTGGATAAATTGAGTAAATCACTTTCAAACAGTCCTCAT
GGATCATCAACTAATAgTTTACAATTTAATCTAGTTATGACAAGAGGCAA
CTTGGATAAATTGAGTAAATCACTTTCAAACAGTCCTCATGGATCATCAA
CTAATAGTGATAACAATGAGTTGAAACTGATGCGTAAAGTAAAATCTTTG
GAAAAAGAACTTCACAATGTCAAAACGGAATTGAATTCGGCGAGAGACCA
GAATAAAGAACTAATGGAACTTGTACAGCAaagtcaaaatcatgaaatta
gGTGATAACAATGAGTTGAAACTGATGCGTAAAGTAAAATCTTTGGAAAA
AGAACTTCACAATGTCAAAACGGAATTGAATTCGGCGAGAGACCAGAATA
AAGAACTAATGGAACTTGTACAGCAaagtcaaaatcatgaaattaggccT
AAATCCTCCATCAAGTTCAATAAtaagaaaacgttgaaaaagaGTGCCAC
TACATCACGTCTACCAGCAAACTATCATAAGAAGATCTCGCCACGTGCTA
GTTACCAGACCTTTGAGAATGACTCAAAAGAAAACGAGgccTAAATCCTC
CATCAAGTTCAATAAtaagaaaacgttgaaaaagaGTGCCACTACATCAC
GTCTACCAGCAAACTATCATAAGAAGATCTCGCCACGTGCTAGTTACCAG
ACCTTTGAGAATGACTCAAAAGAAAACGAGGTTGGTTGTCTTTCGGACAG
GTGTAATCAAAACACCAATTTCACTTTACCCATTATTCATAGCAATCGAC
GAAAACTGTTGGTTGTCTTTCGGACAGGTGTAATCAAAACACCAATTTCA
CTTTACCCATTATTCATAGCAATCGACGAAAACTGTCTGGTCgtaacaac
aataacaaaaaatcaCGTGACACCGATGAGCCAATCACATTGCCCATTTT
ACAACCGTTTCCACATCCAAATAACAATTATTCGTTGAGATGTAAACGAA
CCAAAGCTGTTCAAATGCAAAACAAACGGCCTCAAAAAGACCTCTCGTTG
TCTCTTTTATCCAAACAAAATTTTATGACGCAGTAAGTCTGGTCgtaaca
acaataacaaaaaatcaCGTGACACCGATGAGCCAATCACATTGCCCATT
TTACAACCGTTTCCACATCCAAATAACAATTATTCGTTGAGATGTAAACG
AACCAAAGCTGTTCAAATGCAAAACAAACGGCCTCAAAAAGACCTCTCGT
TGTCTCTTTTATCCAAACAAAATTTTATGACGCAGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000072_pilon | genome | sc0000072_pilon:311895..319859 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1072-1272:7765 |
| Aaloc | 994-1068:6588 |
| Aaloc | 853-993:5875 |
| Aaloc | 709-849:5278 |
| Aaloc | 619-705:4438 |
| Aaloc | 145-615:3728 |
| Aaloc | 4-141:1 |
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