XLOC_043209 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_043209
Unique NameXLOC_043209
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000072_pilon:234457..245969-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_043209 ID=XLOC_043209|Name=XLOC_043209|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11513bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000072_pilon:234457..245969- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GATTATTTTAGTTTTGATTATTGTTATTAATTTGTACATATTGATTTCAT AGGTCAATTTGGTTAACAAACAAATTGAAGGAATGGTTAGTGGGTATGAA GCCAGCAAGATGATGCCAGCAATGTCACTTTTTGATTTCAAGTATTAAGC TTTTTTCTTAATATATACGTAAAATGTTTTTGTTTTGAATAATTCTCCTG TTGAAAGTTGTGATATGAGCTATTATGACCTTTTGAGGTTCACATTACTT GCAGGAATCATTTACTCAATGATCATCCTTATTTCATAATTTCTTGTTTT CTTTATATCACTTCAATAAAAGACCTTTAATTTATGCTAGACCCTAAGCC TGATTTTCTGAGGGGCATAACTTAATTTTGACTGATGCCCTAATAGAGTT TTCTGTTCTGTATTTCGTGTTTCCTACTTGAATCAAAGGAATTTCGAGGC TGAAATTCTCTGAAAAAATAAGGAATATCAAGGCTTTGATCTGAGTTAAG CTTCTTATAAAAAGAAAAGAAGAAAATAAAAAATTAAATAAACAATAATT TAAAACGACTGTATTCACTTCATTGTAATACATAAGGGCAATATTCATGA TTAAACAATAAAACCCCATTTTCCTACCAAAATACAGGAACTGAATTTTC TCTAAATACAAAAGAATATTTTCCTTTGAAAAAATGGATGAATAGAAATA TTTAAGGAAATTATTGCCTCTGAACAGGACAAATAGTAAATCACTATGGG TCATTGACTCTTACTAAATGGTATTTTGAACCTTGTTTTTTTTCAGACTT CTCAACTTATTTGGTGATTTGGAAGATTTAGAACAAGCTTTGAAAAAGAA AAACTTGAAGAAAGTTCTTGGATCAGGTTCATGTTCTGCACTTATCAAAT TATTCCCTAACAATGCTGAGCTTGCAATTTCACACGTTACTTGGAATGAT 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AATTAAATATATCACCCTTCAAAACTATCGTGTTCCAATACACCCTGCAG GCAGTTTCTCAATCCCGGTCAACCAAAATCTTTTTTTGAAAGTTTTTTGA ATTTTTAGAAAGTGGGATTCGATGTGGGTGTAAATAGACCGAGAACACGA ATAGATCCATCTTTCCTTGAATACTTGTACATACAATATACACATCTGCA ATATAATAATCGATCAAGACCATTCTCCTCACCTAGTGCCATGCATTTTG TTCGTTTTCATAACACAAATTACCGGCGCCGAAATATCTTTTGCTTTTTA GTACCCCAAATTTTGGATAATGATTTTGTTGGTTAAATATTCGGTCAAAT TTTCCCAATTTTGCTTCTTTTTATACTAAAAGGTCACTCAAGAAACAACA ATCGGCAATTCTAACAACGATTTATGGAAACACGTTGTTCCACAAACTGT TTTCGAGTTCGTCCGAACAGTTGTTGCAAACCGCCTCGCGCCAACGGGTG GAAGATGGGCGGAACTTTTCGAACGCCATAACAGTGGGACCTATAATAAC CAATGGATGATCTTGAATTATAATTTATTCACTCCGGGAAAGCCGTTGCA ACCGGACACCCTCTGGATTTTAGAGCAACTTCCCGGTACCGTACATATGG CAGATATGACAATGTTTTTAGTAGATCATGGATACTGGCCAAGTTTTAAT GTGCCGTAAGTACTATAGGGCTATAAGCACTTTTTCGAAACTCATTATTA TCTTTTCACCAAGAAATCTTTACGAGATGCTTTTTTCACGAATTGAATTC TTTGAAGCACCTTTGAGCAATGTAGACTTCTCTAAAATTATCAATTTTAG GTTAAGATTAGGTCTATAATTAATCTTCTAAATGGCATTTGTTACTTAAT AGTCGAACGTGCGCAACGCACTGGGCTCAACTTCAGTGGCTTTCAAATCA TTCATAGGCCCAATTGTAGACCCCCAGATATTCACCCAAGGAACAAGTGT GCCAAATTTCAGCGAAATCCGACCATTTTTGAAGTCTCCAGGCTGCCCCA AAGTTTTAGCCTCGTTTTGGCGAAAAACTCGTCCCAAGGCCCCAAAAATC AAAATTTTTGAAAAATGAAAAAAACACCCCCAGATATTCACCCAAGGAAC AAGTGTGCCAAATTTCAGCCAAATCCGACCATTTTTGAAGTCTCCAGGCT GCCCCAAAGTTTTAGCCTCGTTTTGGCGAAAAACTCGTCCCAAGGCCCCA AAATCAAAATTTTTGAAAATGAAAAAAAAACACCCCCAGATATTCACCCA AGGAACAAGTGTGCAAAATTTCAGCCAAATCCGACCATTTTTTTTGAAGT CTCCAGGCTGCCCCAAAGTTTTTAGCCTCGTTTTGGCGAAAAACTCGTCC CCAGGCCCCAAAAATCAAAAATTTTGAAAAATGAAAAAAAACACCCCCAG ATATTCACCCAAGGAAGGAACAAGTGTGCCAAATTTCAGCCAAATCCGAC CATTTTTGAAGTCTCCAGGCTGCCCCAAAGTTTTAGCCTCGTTTTGGCGA AAAACTCGTCCCAAGGCCCCAAAAATCAAAATTTTTGAAAAATGAAAAAA ATGCCCCCAGATATTCACCCAAGGAACAAGTGTGCCAAATTTCAGCCAAA TCCGACCATTTTTGAAGTCTCCAGGCTGCCCCAAAGTTTTAGCCTCGTTT TGGCGAAAACTCGTCCCCAGGCCCCAAAAAACAAAAATTTTGAAAAATGA AAAAAACACCCCCAGATATTCACCCAAGGAACAAGTGTGCCAAATTTCAG CCAAATCCGACCATTTTTGAAGTCTCCAGGCTGCCCCAAAGTTTTAGCCT CGTTTTGGCGAAAACTCGTCCCCAGGCCCCAAAAATCAAAAATTTTGAAA AATGAAAAAAAACACCCCCAGATATTCACCCAAGGAACAAGTGTGCCAAA TTTCAGCCAAATCGAACAATTTTTGAAGTCTTCAGGCTGCCCCAAAGTTT TGGGACATACACACACACAGACACACACACAGACACACATTCTCAGATTC TAACTCAACTGAAGTTGAGAACTAAGACCATGTTCAGACACGGTTCCATA TCGCTACGAAACGAAACGATTCCGACAAGTGTGAACGTCAAAATTCGAAA CTTAAAAAAAGGAGACTTTGCAAAGCAAAATGGATCAAAACAGTTTCGCT CCACTATTTTACTCGGAATTAACCTGCTCTGTTTTCTTGCTCAGAAACGT TCCGAAACCAATATGAACACTTCCTATCTGTAACAAAAACCATACCGAAG CGATATGAAACCTTAAAACGTCTGAACATAGTCTAAGATATCTATTTGAG TTTATTTTTCACCTATAAATACCCTTTTATATTATGTTCCACATTAGATA TTTCCCTTACATCTATAACATCAGTGGTGTAACTGCAGCTAAAGAAAAAT ACGGAAGTTGGTTCGATTATGACTTGAACCCGAGATCACAAATCTTCAAG AGAGATCACGAGAAAGTGGTTGATATGCAAACGCTAGTCAAACTTATGAG GTATGAAGGTTTCTAATCATACAGTTTTAAGCCCGGATGGGGCTAGAGAG GAATCTTCAATCTTCAGATTTGCGCTGCGCTGTATTTAAAATGACTGATT GAATCTATCCCCTTCTTTGTGTTTAAGCGGCATATTTTTCGAAATCAGTC CGGCGTCTGCGTGGAAACCACACGAGACACGCGTTTAAGATAGGAAAAAA GTGACTTCAAGAGTTTAGAATCTAGCACCTTCGGGGCTTTGAAATCAGTG TTTCTAATGAGCTTTTATTCAAATCTTCGTCCAGATGAATATCGTCAAAC TATTAGATAGTTTACATTTAAACCTGTGACTTAGAAATGAAGGTTTTTCA GGTTCGAATTACTGGTCACGTTTTTTCTTAGTTGTTAGCAGAATCAGTTC GTAAGAGGGATCCGATTCAGTTTTTGAGCTCATTTAAATTCAAAACATAG CTTCCTTACATTTAGAGGAATATCAATTTCCTTCTGTCAAAACAAGATTA TACTCGTTTTCATCTTATTTGGCGCTGCAACCAAATAAAGAAAGAAATAT CATTTACTCAAAATACTAACATTACGTATATTCTGAGTTTTTGTACCTGG AGGTCCTATAAATTAACCTGTGTTCGTCCGTTCGTCTGTTACATACTTTT CTCGGGATTGAATCATAGCAATTTTGTGATTTTTGGTACAAAGGTGCAAA ATGGTGATTACCAAAATGTGACGGAACCCGATTTTCGAAAAAGAAATTGG CTCAATTTGGGCCTAAATGATGCCCAAAATAGGGTTTTTTGGACTTTGTG AAGAATCTGTTCATTAGTTTTTCCTAATTTTTTGTTGTACAAAGACGTAG AATTACAGTGTGCTAAATATGAAAAGGCTCATTTTTCGAGAAAAAAATTT TCGGCAGCAACTTTTTAAAAATTTTTAAATTATTCAGTTTTTGTTTCTAC ATTGCCTTCATTAAACTTCTATTATTCGTTTTAAAAACAGGTAGGTCCCT AAAAGTATCGCTTGTTTTGTTTTAATTTTTTGGTTCACACAACCTTTGGC TTTTTATGTTTGATTTGTTACTGTAGATGGGTATTAATGGAAGTAAATTA AAAGTTTGAGAATTCCGTTAAAAAATATTTCTTGAAAATCTTTCTTCATC GTTCAGGTCATTTTATTGATTTTGTCATATGAGATGGCATTGTGATTGAT ATGACTTGATAACACGAAAAGAAAAATAATCTTATGGAATTCTATACCTG AAATATATTTGAATGCTATGATAGGTCATTAGAAGGACATGAAAAAGTTG CCCGAAGGGCTAGAAGTGAATCTTTAACCTTTCTCAGGCAAGAAAAAGTG AAGCCTTAAAATGTCCGCTGATTTTTTTATGAAGGATTGAATCTTTTTGG AAACCAGCAGTAAATTTTGCTTTGAATTCAGCATTTGTGTGAAATCCACG CACAATTAGCCTACCTAGGAGATTCACTTCTAAGCCTTCTGGTTTTTACT TCATTGCTTACATTATCTCATACGCCTTCTTATAAACTTGAAACCACGTT GAAACTAGTTTAGCATGCTAGACGACTTATTTGGACACAGTAGGAAGTAA GCAAACAATAGTGGAAGGGATAAATTGTTGTTTATACAAACTGATACTAT CACGTAAGAATTATCATAATTATCATTCATTTAACAACAATATTACACAC GGAAAATCGAATTTAAATAAGAGCGATATCGTTTGCTTACTCATCACTCA TTCACAAGCTTTTTCTTATTGAATAGACACAGATTTGTCAGAAAGAGGAA AAGAAAAATATTTTTATAAGCATAATATAACAATAGGCACTCACTGTCCT GATGATAAATATGTGTCTGGTATGAAACGGGAACACTTATGTAAAAATAA AACCTTTAATATTATTATTAATTGAAAATAAAACAGCCGTAACGACGGCT GCAAACTCCGATAGTTGTTACGGGTCAGCCTTTCTTGATATAATTAACAT AAAATTTAAAAGAGCATATCCTAGTAAGTTTGAGCGCGAACGCAAACCAA ATCGGGAAATCAAACAGGAAAGATCGGGAAATCGAACCCGACTATCGCGA TTGATCGGATTTACGAACAATTACAAATGAAAAACACTGATTTTAAGAGA CTCCTTAACCGGAGTTTAATTAAACAGGAAAAAGAAGTCACACAAAAAAC CAGCATGAATGTCCGTACAAACACCTAAGAATAAATGAAAATAAAAATAA GGAGTCAAACTGTTGATTCATGTTAACACTTTATATATTTCAAGTCAAAG GTAAAATTATAGAATTCTGTACAAAAAAGTACCACGTTTTTAAACAGTAA AACGCACAAGAAGGCTCCCAAGCTCTTCTAGCGTGATTACGTGATTTGGA AATTTTTATTTCGTGTTTGCGTGACGAGAGGTCAAAAATGGATCGTGATT TGAAATATTTTTGAGCCGTGATGCGTGATTTGGACTTTTCAAAGAGATGT GTGATTATCCAATTTTTATGCTGTTTTACGTGATCATGATTGAAGACAAA AATTTGCGTGCTATCGTGATCAGAATTACCGCTGGGGGGAGGGGGTTCTA TAAGCAAAAAGAAATTTGAAGGTCAAGTTGTGTTAGAAAATAACGCCATT ATCACATTATTTTTGTAGATATAATGACTTCAAGAACGACCCAATAGCCA AATGTAACTGCACTCCTCCCTACAGTGGTGAAAATGCAATCTCTGCAAGA AGTGATTTGAACCCTGCCAATGGCACCTATCCTTTCGGCGCTCTTGGCCA TCGACGACACGGTGGTACCGATTGTAAGGTAAGGGCATATTTTTAGGGCA TATTTCCCTGAATGAGTTTTAGGAAAGACTTTAATGTGCGAAAATTATAG CAAATTTTGTACAGTACAGGTTTTATGACTTTATGACAAAGAGGGTGGTA GACTGTCTTCACTTCTAAGATTAGATATATGGAGCAATTTTTTTATTTGC GCTCCCATACGTATGTGGAATTAAAAGTACATATGTACACGATTAATCGA AAGTTGAATTCTTTTCTTTTTCAGGCAACGAACTCACGAATGGCACAAAC CTTTTCACAATTCATCGTTGCTGGACCAACTTTTGATCAACAACCACCCT TCAAATGGTCTGATACTGAATGGAAGAAGCCCCTGGGTTTACCAGATGAG TTTAAATTCGAACCCGCTCTTCTTGATTGGAATTTAGAGGAATGGGCACA AGAACCATTTTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000072_pilon:234457..245969-

>XLOC_043209 ID=XLOC_043209|Name=XLOC_043209|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3372bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000072_pilon:234457..245969- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTGGACTTTTTGTCTGACTTTTCTGGGCTGCAGTTTTTTTTTGGTTGC
TGGTCTTCCAGCTCAAGGTATCAGAGAAGAAGGAGATGACGATGATGTAG
AAACCATCAAAGTTTCTGTTGTTTTAAACTCAAAGAATGATTTGGAAATC
AAGGATGGAATTGTCAAGCCTTTTGTTGCCTATGCTGCTTTTAAAAACTC
TGTAAATCAGACTGGATGTGGACTTTTTGTCTGACTTTTCTGGGCTGCAG
TTTTTTTTTGGTTGCTGGTCTTCCAGCTCAAGGTATCAGAGAAGAAGGAG
ATGACGATGATGTAGAAACCATCAAAGTTTCTGTTGTTTTAAACTCAAAG
AATGATTTGGAAATCAAGGATGGAATTGTCAAGCCTTTTGTTGCCTATGC
TGCTTTTAAAAACTCTGTAAATCAGACTGGATGGTCTATGTTGACTCTCT
CTACAAATGGAAGCTTCGATGATGAGCTTCAAGCTCAAGCTGCCGGTATG
GCTGAAGGATACATTAGTGCTGATCATATTATGATGTATTTTAATGCTAC
CGCAGCTGGTTATTGTGCCGCTGATTCTGCGTTCTGTACCACCTTACAAA
ATTATATTGATACTAATGACAAGTGGATTCAAGATAATTTGAAAAGTAAC
AAGAATGATCCGTATTGGAAACATATGGTCTATGTTGACTCTCTCTACAA
ATGGAAGCTTCGATGATGAGCTTCAAGCTCAAGCTGCCGGTATGGCTGAA
GGATACATTAGTGCTGATCATATTATGATGTATTTTAATGCTACCGCAGC
TGGTTATTGTGCCGCTGATTCTGCGTTCTGTACCACCTTACAAAATTATA
TTGATACTAATGACAAGTGGATTCAAGATAATTTGAAAAGTAACAAGAAT
GATCCGTATTGGAAACATGTCAATTTGGTTAACAAACAAATTGAAGGAAT
GGTTAGTGGGTATGAAGCCAGCAAGATGATGCCAGCAATGTCACTTTTTG
ATTTCAAGTCAATTTGGTTAACAAACAAATTGAAGGAATGGTTAGTGGGT
ATGAAGCCAGCAAGATGATGCCAGCAATGTCACTTTTTGATTTCAAACTT
CTCAACTTATTTGGTGATTTGGAAGATTTAGAACAAGCTTTGAAAAAGAA
AAACTTGAAGAAAGTTCTTGGATCAGGTTCATGTTCTGCACTTATCAAAT
TATTCCCTAACAATGCTGAGCTTGCAATTTCACACGTTACTTGGAATGAT
TTCAATGCAATGTTGCGGATATATAAAAGATATAACATGTCACTACACAG
TCACCCTGGGCAAGACTTCTCAACTTATTTGGTGATTTGGAAGATTTAGA
ACAAGCTTTGAAAAAGAAAAACTTGAAGAAAGTTCTTGGATCAGGTTCAT
GTTCTGCACTTATCAAATTATTCCCTAACAATGCTGAGCTTGCAATTTCA
CACGTTACTTGGAATGATTTCAATGCAATGTTGCGGATATATAAAAGATA
TAACATGTCACTACACAGTCACCCTGGGCAAGAGAGCGGTGTGATTCCTG
GCCATTTGCAAAGTTTTTCATCCTACCCTGGTGTGGTATACAGTGGTGAT
GATTTCTACATTCTCAGCAGTGGATTGAGAGCGGTGTGATTCCTGGCCAT
TTGCAAAGTTTTTCATCCTACCCTGGTGTGGTATACAGTGGTGATGATTT
CTACATTCTCAGCAGTGGATTGGTCACTCAAGAAACAACAATCGGCAATT
CTAACAACGATTTATGGAAACACGTTGTTCCACAAACTGTTTTCGAGTTC
GTCCGAACAGTTGTTGCAAACCGCCTCGCGCCAACGGGTGGAAGATGGGC
GGAACTTTTCGAACGCCATAACAGTGGGACCTATAATAACCAATGGATGA
TCTTGAATTATAATTTATTCACTCCGGGAAAGCCGTTGCAACCGGACACC
CTCTGGATTTTAGAGCAACTTCCCGGTACCGTACATATGGCAGATATGAC
AATGTTTTTAGTAGATCATGGATACTGGCCAAGTTTTAATGTGCCGTCAC
TCAAGAAACAACAATCGGCAATTCTAACAACGATTTATGGAAACACGTTG
TTCCACAAACTGTTTTCGAGTTCGTCCGAACAGTTGTTGCAAACCGCCTC
GCGCCAACGGGTGGAAGATGGGCGGAACTTTTCGAACGCCATAACAGTGG
GACCTATAATAACCAATGGATGATCTTGAATTATAATTTATTCACTCCGG
GAAAGCCGTTGCAACCGGACACCCTCTGGATTTTAGAGCAACTTCCCGGT
ACCGTACATATGGCAGATATGACAATGTTTTTAGTAGATCATGGATACTG
GCCAAGTTTTAATGTGCCATATTTCCCTTACATCTATAACATCAGTGGTG
TAACTGCAGCTAAAGAAAAATACGGAAGTTGGTTCGATTATGACTTGAAC
CCGAGATCACAAATCTTCAAGAGAGATCACGAGAAAGTGGTTGATATGCA
AACGCTAGTCAAACTTATGAGATATTTCCCTTACATCTATAACATCAGTG
GTGTAACTGCAGCTAAAGAAAAATACGGAAGTTGGTTCGATTATGACTTG
AACCCGAGATCACAAATCTTCAAGAGAGATCACGAGAAAGTGGTTGATAT
GCAAACGCTAGTCAAACTTATGAGATATAATGACTTCAAGAACGACCCAA
TAGCCAAATGTAACTGCACTCCTCCCTACAGTGGTGAAAATGCAATCTCT
GCAAGAAGTGATTTGAACCCTGCCAATGGCACCTATCCTTTCGGCGCTCT
TGGCCATCGACGACACGGTGGTACCGATTGTAAGATATAATGACTTCAAG
AACGACCCAATAGCCAAATGTAACTGCACTCCTCCCTACAGTGGTGAAAA
TGCAATCTCTGCAAGAAGTGATTTGAACCCTGCCAATGGCACCTATCCTT
TCGGCGCTCTTGGCCATCGACGACACGGTGGTACCGATTGTAAGGCAACG
AACTCACGAATGGCACAAACCTTTTCACAATTCATCGTTGCTGGACCAAC
TTTTGATCAACAACCACCCTTCAAATGGTCTGATACTGAATGGAAGAAGC
CCCTGGGTTTACCAGATGAGTTTAAATTCGAACCCGCTCTTCTTGATTGG
AATTTAGAGGAATGGGCACAAGAACCATTTTAAGCAACGAACTCACGAAT
GGCACAAACCTTTTCACAATTCATCGTTGCTGGACCAACTTTTGATCAAC
AACCACCCTTCAAATGGTCTGATACTGAATGGAAGAAGCCCCTGGGTTTA
CCAGATGAGTTTAAATTCGAACCCGCTCTTCTTGATTGGAATTTAGAGGA
ATGGGCACAAGAACCATTTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_043209XLOC_043209-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000072_pilongenomesc0000072_pilon:234457..245969 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1498-1686:190
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