XLOC_043141 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_043141
Unique NameXLOC_043141
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000303_pilon:146980..160655-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_043141 ID=XLOC_043141|Name=XLOC_043141|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13676bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000303_pilon:146980..160655- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AGTGAAGACTCTAGCCTATTTACTAGACTAACTTTTTCAAGAATTTGCAT TGTTACTGTCACAGCGCAAGCCTGTGCGAGACGCGTGTTAAAAATTACCT TGTGTTCAAGTATAATGCCAAAGTCAAAATGCGAAGGCAAAGATTTTACA TCATAAAAATAAAAGACAAAGTAAAATCAACGTCACCAAAGTCGTTCTTT TAAAGACGCGTTATCGTTTACCTAAGTAAATGAAAAAAGACAAAGACATG TTTTATTTATTTATCACCCCCTGATGCTCATCACATTATTATGATTATTT TTGCATTTATGGTTTATGATATAGCAGAAGCAATAAATACATCAATGGTA AAACCAAATGTCTCTTATCGAAGAGAAGGCCCGCTTTATTTCTTGGGATA TGCTTTCAATATACTCTCGAGGATGGCTGCGAAACCTAAAAGTATCTATC CAAGTATATCGAAGATAGGTAAGTACGACTTTATGATGTGGAATTTGGAA AATATAATACATTATTGATTAGAAAAAATGTATTCTAATACTGACTTCTC TTGTTTGCCTCTTCTCGCTGAATCTATTTTACCAATGAAATGCCAAAAAT TAGACTAAAATCTTATATCGTCCATATTGTCTTATATAAAACTTAGGTAT TAAAATCTATTCGTTTATTTTAATTTTTCAGGGAAAGATATCTTCAACAT AGATGACGTCAATGACAAATTGTCACCCTATATCGTTTTGGTTGGAAATT GTGGAGCTGGTAAATCGACGATTGCTGAAAAGCTGACAGATGCCAAAGGT CGTGCATCGTCGACAAGAGCGAGTTTCACAATAACCGCAGAATATCTTTG GACACCGGATAAGAGTCTTCTTATCGCCGACACTCCTGGATTAAATTCTC ATGAAAATGCTTACGAGTATAGTCTAGAGGTTGCTTCTGCCTTTATTCAT 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GCCTTCTGAATTAGCGGCACATACGAAAACTCATATCAAGCCCAGTGATA TCAACATTCTACCAGAAGGAGAAGCAAGTGAACGTGTATTGGCAAAGATT ACCAGACAAATTGAAGCAAAACGTGTCTCTAAATAATCAAAAATGAAAAA AAATAATTAAGCAATATGAATTTTTTTAGCGAGTCAGATGACAAAAAAAT GAATTACACTTAAAGTCTATTCACGATAAGTGTGCACTCTTTTTTATTTT ACCTATAACTTTTGAAGAAATTCTTCAATCTTTAAAAATTTGGTATCATT GGAAAGATATTAGTGAGTGTAACAATTTGAAATAAAAAAATGTTTAAAAA AATTTTAAAAATGAAGATGAAAATGAAGAAGAAAAAAATGAAGATCTTAT AGAAAAGTGCTATAACTATCATTTTCACTGAGGTGAATCCTTGAGCATCG AACGTCATCACTGTGAAATAAATTCTCAAAAATAATCATTCAGTCAAAAG ATATTAAACAAAGTTATAAGCTGATTGACGTCTAAAAACGCTGTTTTCTG CAGTTTTTTGCTGTTTTTTGAGGTCAATCACTTATTAACTTTGTATCATG ACTTTATATTTAATAAATATTTTAATGAAATTTCTTCACAGTGATGATCT CCTAAGATCAAAGAATCTCTCCAGTGAAAATGAAAGTTATAGCACTTTTC TACAAGATCTTCCTATTTTTCTTCTTCATTTTCATCTTCACTTTTAGAAT TTTTTAAAGATTTTTTTATTTCAAATTGTTCCACTCGCTAATATCTTTCC AATGATACCAAGTTTATAAAGATTGAAAAATTCCTTTAAAAGTTATAGTT AAATGAAAAAAGAGTGCACACTTATCGTGAATAGACTTTAGTTTATGTAT TCAAACAAAAACAGTTTGTTAATGTTATTCCCGGATGTTATTTATAATAA AGACGTTTATGGGACAACATTTGACTATTTGGATTTTAATTCCAGCTAGT GTAATTTCTGGAATAAAATATTCACGAACCGTATTAATATATTACCCCAT TTTGTGCTTTGTACAGTCGCTGCTTTATTTTCATTTTTCATAAACTTGAC ATTTATTTATAACTATTATTTTTAATTTTAATTTTAAATTTAGCTAACCC ATGGCTGTTCTTATTTTTTTGGCACTTCCAGCCTCAAATTTTCTTATCCT GTTCTCATTTATATAGTGTAATTGAGGTACTTTAGACGTTGTACCCAATT TTTACTTTGACCCCGAAATTGTTTGAAATTCCCGAAATTGCTTGAAATTG AGTAATTGTAGGATTCGCATTGTTCTTATAAAAGAGAAGTGTAGATTTAT TTTAAGTGTTTGTCTAGATTGTATCTGTATATCAAAGTTTATAATTTTAA TGACTTTTTTTTTCACACAAGGTGTTGTGCGCAGTTATGTAATTTTTGCG CAAATATGTAATTTCTGCGCAGGTATATAATTAGTTTGCGCAGTTGCAGT TATGTAATTTCTGCGCAGATATGTAATTTTTGAGCTGCGCAGTTATGTAA TTATTTTCTGTGCAGTTATGTAATTGGTGACCGGTTTAATAATAACATTT TTGTAAATTTTGATCATAATATGTGAAAAAAATATTTCATCTCGTTAGGA GACACGTTATATACCACTTAATATTCAATGTCCACTTAACATTCATTTAA CGTCTTTTTCATGAATTAATAATTGGGATTGAATTTTTAAATGAAACTTA GCTTAGTACGGCTTTGGTACATACCAACCTTTACAAATAGTAACGTCCAT TTAATATCTATTTAACGTCTTTTTCATAATAATCAATGATTGGGATTGAA TTTTTAAATGAAACTTAGTATAGTAGGGCTTTGTAATATACCACACCCTT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000303_pilon:146980..160655-

>XLOC_043141 ID=XLOC_043141|Name=XLOC_043141|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1806bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000303_pilon:146980..160655- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GAAAATGACCAATCGAATATTGAACAGATTGATAGCGACAAAGCACCATA
CGTCGTTTTAGTCGGAAATGTCGGAAGTGGAAAATCAACCATCGTCGAAA
AATTGACAGGAGAAAAAGGTCGGAGTTCTTCGTCAGCAGAAAGTGCAACA
AGAGCTGCCGAATATTTCTGGACACCTGATCAAAGGCTTCTCATCGCTGA
CACTCCAGGAACCAACCCTCGAAAGGATAAACTGGGGCATAACAAAGAAA
TTGCTGCAGCATTGAGTTATCAAGAAGTATCTAAATTTCTGATCGTTGCT
AAAGCGCATGTGCGAATGGATCAAACGATCAGTGAAATTAAGCAATACAG
TGATCGATTTGTTGAACTTCCAGGAAAATGACCAATCGAATATTGAACAG
ATTGATAGCGACAAAGCACCATACGTCGTTTTAGTCGGAAATGTCGGAAG
TGGAAAATCAACCATCGTCGAAAAATTGACAGGAGAAAAAGGTCGGAGTT
CTTCGTCAGCAGAAAGTGCAACAAGAGCTGCCGAATATTTCTGGACACCT
GATCAAAGGCTTCTCATCGCTGACACTCCAGGAACCAACCCTCGAAAGGA
TAAACTGGGGCATAACAAAGAAATTGCTGCAGCATTGAGTTATCAAGAAG
TATCTAAATTTCTGATCGTTGCTAAAGCGCATGTGCGAATGGATCAAACG
ATCAGTGAAATTAAGCAATACAGTGATCGATTTGTTGAACTTCCAGATGA
TTTGGTAGGTGTCATGGTAACCCATATGGACATCCATAAAGAATGGGATG
AAAGCGAAATGAAAAATGTTTTAAATGAGCGATTTGAGATTCCTGTCGTC
ATCTTCAGTGGCAGCCATAATATAGCAGATGAAGTAAACAGGAGAATCAT
CGATACGTGTCAGACCTCATATAGGATAGATGTTGGATGTAGACTTTACA
ACGAGTATTTTAGGATTGAAGAGAGTAATATAAAGATCTTGAAAATTACA
AATGAATTTGTAAGAAGATTCAAGCAGATAAGAAAGGGTTTTGTAAAGAA
ACTAGCTCTATGCTCTCAATTGGATCGTGCCAATGCTATATTTGAATTTT
TAACGTTCTTTAAAGAGAAGCAGCTAGAAACAGGGAAGGCAGAGATGATA
TGCAATCTGAAATTGAATTTCAAAGGTGAAAATGGTGATTTACAAAAAGG
TTTCTTGATTAACATGGAAAACCAAGCAAATGCTGTGATGAGTGATTTGA
GGAAAGAAGCTGCGTTTTATGTTTTAATGATTTGGTAGGTGTCATGGTAA
CCCATATGGACATCCATAAAGAATGGGATGAAAGCGAAATGAAAAATGTT
TTAAATGAGCGATTTGAGATTCCTGTCGTCATCTTCAGTGGCAGCCATAA
TATAGCAGATGAAGTAAACAGGAGAATCATCGATACGTGTCAGACCTCAT
ATAGGATAGATGTTGGATGTAGACTTTACAACGAGTATTTTAGGATTGAA
GAGAGTAATATAAAGATCTTGAAAATTACAAATGAATTTGTAAGAAGATT
CAAGCAGATAAGAAAGGGTTTTGTAAAGAAACTAGCTCTATGCTCTCAAT
TGGATCGTGCCAATGCTATATTTGAATTTTTAACGTTCTTTAAAGAGAAG
CAGCTAGAAACAGGGAAGGCAGAGATGATATGCAATCTGAAATTGAATTT
CAAAGGTGAAAATGGTGATTTACAAAAAGGTTTCTTGATTAACATGGAAA
ACCAAGCAAATGCTGTGATGAGTGATTTGAGGAAAGAAGCTGCGTTTTAT
GTTTTA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_043141XLOC_043141-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000303_pilongenomesc0000303_pilon:146980..160655 -
Properties
Property NameValue
Aaloc421-948:529
Aaloc46-417:13677