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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000260_pilon:375656..381480+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_043106 ID=XLOC_043106|Name=XLOC_043106|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5825bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000260_pilon:375656..381480+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATTGATCCTCTCGCTCGACGGCTCCGCTCCTTAGGACACAATGACCAAGT
AAGTTTATGTTGAACTCTGAAGGTTTATGCGAAACTATTCGTGTTTTAAG
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ttcaaaactttcaaacacatattggggaaaaaaatttgaacattattcct
tctttttttcattgaagGTTGCTATCAAAGTCATGCCGACTTCACGTGGT
ATGGCACCCATAATAATGGAGCTTAACGCAATGAACTTGTTGAAAGGTTG
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TCTCTAACTcgacgctctattattcgatacgctcttttattcccttgaaa
attgaattaaagaGTTTCAACCTTTCGTGACGGAATCACCCGGACAACTA
CCGCCGCCCTCTGCCGATCTCCCTGGAGAGCTACCCCAGAATAGAAATAT
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AAAAACTGAAGaaacatatttttcatattttttattaaaagtcgcgctct
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GAAATCagtccaaaattttgtctccgTTGGgagaaaataccctaaaattt
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AATGTTGACCTTAGGAATAgataaattttacaaattttacaaaaattcat
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ATGGAGCTGTAAAAATTACAGGTACGTTTTGTTCTCCATGGTTTTATTAT
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GGCACACGACGTCGTTTAAACGCTaacctaacgttatatggacgttgtga
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TTAGATAATAAACAAATCGAATAATACACCATACATTTACGAGATATTTC
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CTTTGATTTTAAACTCATCTTTTAACAGCTCTTCTATATCAACCTCTATT
TTGTGATGTAGATCTGACCTGTTTGATGAGCCGATTTATTCCAAGTGGCG
TTACTTTTCTCGGAAAACGAAATttgaaagggttaaaaaaagattgaatt
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TCCGTGGCCACTATTCTATTGCAACTTGCTATTACATTtgctttttgatt
ttcattttcaggggcGCCATTTTGTATGCAATGTTGACGGGAAAGTTTCT
TCCCATTAATTGGTCGAAAGATTTATTCGTGTCTGACGGTATGTTTACAT
GACTAGTTCTTTTAAATGGATGTTATCTTTCAGTTTCTGAATCCTTGGCC
CTCTCTGTACATGTTTTGAGTGAATTAACTTTCTGTTTGGTAAATATTTG
AGGCTAACGTAAGAATTTTCTGTTCTCGATTTTCTCAAATGATGATAAGT
ACtttaaattgcttaaaaaaaacagattaTGCCAGGAGACTTACTGGACG
CATAAGTCCATTCTTTTTAAGGAGACGAGAAATGGATAACCTCGGATTTA
AGACTTTTAACACTTTTTCAGCCTGTAATCCATAACCTGTAATATTAGGT
ACATAATATgtaaaaaacctgaaaaagtgTGTTTTTAGCCATTCTTCCTT
GGATTTTCATCTTGGTTGCAGGTCTAAGATCTCCTATTCGTCATGGAGAT
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ttattctttaGAATTGCATGATCTGTTAACCAAATTGTTGAACCACGACC
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CCTTCTCCTTCAGCTATTGAAGCGGTATGACAATTAACTTCTTAACAATA
GCCTTTTCAACTTATGACTTTGTATTCCCAGCTGGCAATCAACGTTGtgt
caacgtttatctaacgttcacaacgtccatataacgttagattaacgtta
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AAGGGACCAGGTTTGACTTTAAAGCAAAAGgtttagaaattgaaaatttt
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ATGGATGGATTGAAATAGTCGGACTTCTGAAACCGTCAAAATTGAATTCG
ACGTACTTTTAATTGCATATCTAGTCGATGTATGATGTTCAAAAGTTATA
TCACATTATATTCACATCATATTATACATTATATCACACAGTGCGAGCTT
GCCATCGAAGCACTGCCTTTCCCAGGTCAAATTAGTCAAATTTTGTCCAA
ATGTCGTCTGTACTGTAAAACATAAGGgcaaagtgaaaaatttttaacaa
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GCCATAAAGAAATCCCCAAATATCGTTTATCTATTGTCTACCACGGATTT
CTGAAagtttcacaaaattttttttatatgttttcacggtttttcgtcat
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GATGAAAAGGTAAGAAACATAATGTtcttttaacgttcatctaacgtttc
atAAATGATTGTACGTTAGTTGGATGTTAAGtgaacgttgtttcgacgtt
cctttgaacgttgtttcgacgttcctTTGTCAACGTTCCCTTGTTACACT
ACCCGCTATTTTATGAAAACCAGTAAATATTGTTTGAAGCTTGGCTTTCT
TATTCATTTACTTTAATCATTTGTTGActtaaaaagttctcaaaacTAGC
ATTTTCTTGACCATTTTCAAATGTCTTTCCAAATTTGAGCCTTgtataaa
tgttcttataaaattattctcgAAAAAGTGTGTATAAGTTAATTCTAAAG
AATTAATCTTTGGAAGCCTTGCTTCCTTGAAGGAAACTTAGAAATGAAGC
TGTAAATGTAAATCTGTTAACTTTAGGCACAAAAAATGAAGAGCCAAAAA
TCAGAAGAGCTCGCCTCGCAAGATGTGAGAGTACAAATAAACGAATACCG
ACTTCATACACTgttcatcattgacaataagaCATTCAAACAGTAAGTTt
agagtttttatttttgatgataTGCAAAGTATTTCTAATAACGCagaatt
taaacaaaatatttcttgaaatttgtgCAAACGACAAAATTCACTCTTTC
TTTTGTCTTAAATGCTATTCAAGCAAATTATAATTCATCCACGATTTCAC
TGTTTAGCCCCTCAAATCTGAGTCACGTGTATTTACACTCAAAATTAGCC
AATACATACCGAATCCCAGAATTAAGGCTATTACTCCTGAacatttgatt
taaaaaggcaTAAGCAGAATGCTTTAAAGAGTATAATATAACCGACCAGA
AATGATGTCCAAACGCAACTTTTACGTCAtttttttAGAGTTACGTTGGG
TAATCGATAtcgtttttcgagagctttcgactGATATAAGCGGTTtcgac
tttgaaattttgtctaaatttagGGTTTTGTCAGTGACGTCTATTTTTGG
GTCCTGAAACATTTCCCTAGACCTTAGCGAAAAACCACCCAGGCGACAAA
CTATATAAATGCTTCATTCTTTGAAATATACCAAGTTTGGTTTCGTCTCA
TAAAAGATATCACGGGCTCCTAAGGGTTTGCCCCCTACTAATacgccttt
tcgaccgtagtcgtaAGGTCAGGCGCGTACCACTTTTTATCCCACTAATC
TCGATCCAATccatttttgacacatttttctattgtctataggtgggaaa
aaggactgggacggtatAGTGGGATAAAGTGGACAAAGAATATGCCTGTG
CGATAATTggcggctacagtcgaaaaggtgtaatAGGCAATGCGCTGTCA
AAGTTTTTGCATACCTTTTAAAAAcctcttttctttgttttgtttcagaG
ATCACGTGAATGTCATCAATGTCGCTTCCAATCCTAAATTCCCTAATGGA
CATCATTTTCAGCCTGCTGAATTATGGGACTATCCTAACGGTCACCATTT
TCCTTGCATGGAATTCTGGGAATGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000260_pilon:375656..381480+ >XLOC_043106 ID=XLOC_043106|Name=XLOC_043106|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2112bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000260_pilon:375656..381480+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATTGATCCTCTCGCTCGACGGCTCCGCTCCTTAGGACACAATGACCAAAT
TGATCCTCTCGCTCGACGGCTCCGCTCCTTAGGACACAATGACCAAGTTG
CTATCAAAGTCATGCCGACTTCACGTGGTATGGCACCCATAATAATGGAG
CTTAACGCAATGAACTTGTTGAAAGGTTGTCAGAATGTTGTTGCTATCAA
AGTCATGCCGACTTCACGTGGTATGGCACCCATAATAATGGAGCTTAACG
CAATGAACTTGTTGAAAGGTTGTCAGAATGTTGTCCAGATGCTGGATTTC
TTTCAAGGAGAAAATCATTGCTACCTAGTAATGGAGCTCTGCAAAGAAGA
CCTGATGACAACCTTAAACGAACGGATGCACACAAAGCCAAACATAAGAG
AAATCTTCACACAAACTTTGAATGGCGTTCATCAATGCCATTTGAAGAGC
ATTGCTCACTGGTCCAGATGCTGGATTTCTTTCAAGGAGAAAATCATTGC
TACCTAGTAATGGAGCTCTGCAAAGAAGACCTGATGACAACCTTAAACGA
ACGGATGCACACAAAGCCAAACATAAGAGAAATCTTCACACAAACTTTGA
ATGGCGTTCATCAATGCCATTTGAAGAGCATTGCTCACTGtgATTTGAAA
TTAGAGAATGTTCTTATTAATCAGGATGGAGCTGTAAAAATTACAGtgAT
TTGAAATTAGAGAATGTTCTTATTAATCAGGATGGAGCTGTAAAAATTAC
AGaCTTTGGTCTTGGAATGATTCCATCCTCACCCGGTAACGGTTGCCAAA
AATTTTGTGGTACACCAGAATACATGGCTCCTGAGGTCCACCGTGGATAC
GTTGGCTTCGATAACACGCCATACGACCCCTTCAAAGCAGACATGTGGAG
CTTaCTTTGGTCTTGGAATGATTCCATCCTCACCCGGTAACGGTTGCCAA
AAATTTTGTGGTACACCAGAATACATGGCTCCTGAGGTCCACCGTGGATA
CGTTGGCTTCGATAACACGCCATACGACCCCTTCAAAGCAGACATGTGGA
GCTTgggcGCCATTTTGTATGCAATGTTGACGGGAAAGTTTCTTCCCATT
AATTGGTCGAAAGATTTATTCGTGTCTGACGgggcGCCATTTTGTATGCA
ATGTTGACGGGAAAGTTTCTTCCCATTAATTGGTCGAAAGATTTATTCGT
GTCTGACGAATTGCATGATCTGTTAACCAAATTGTTGAACCACGACCCAG
CGTCGAGACCATCTACGTCAGAAATTATCAACCATCCTTGGTTAACACCT
TCTCCTTCAGCTATTGAAGCGAATTGCATGATCTGTTAACCAAATTGTTG
AACCACGACCCAGCGTCGAGACCATCTACGTCAGAAATTATCAACCATCC
TTGGTTAACACCTTCTCCTTCAGCTATTGAAGCGaaatcCGCAAACAGTG
TTAAGAAAGAACAGAAAGAAGTTGCTAAGaaatcCGCAAACAGTGTTAAG
AAAGAACAGAAAGAAGTTGCTAAGACTGTATCACAATATCATCAAGTGAG
CGTTAACAAAGCTTTGGATGAAAAGACTGTATCACAATATCATCAAGTGA
GCGTTAACAAAGCTTTGGATGAAAAGGCACAAAAAATGAAGAGCCAAAAA
TCAGAAGAGCTCGCCTCGCAAGATGTGAGAGTACAAATAAACGAATACCG
ACTTCATACACTgttcatcattgacaataagaCATTCAAACAGCACAAAA
AATGAAGAGCCAAAAATCAGAAGAGCTCGCCTCGCAAGATGTGAGAGTAC
AAATAAACGAATACCGACTTCATACACTgttcatcattgacaataagaCA
TTCAAACAaGATCACGTGAATGTCATCAATGTCGCTTCCAATCCTAAATT
CCCTAATGGACATCATTTTCAGCCTGCTGAATTATGGGACTATCCTAACG
GTCACCATTTTCCTTGCATGGAATTCTGGGAATGAaGATCACGTGAATGT
CATCAATGTCGCTTCCAATCCTAAATTCCCTAATGGACATCATTTTCAGC
CTGCTGAATTATGGGACTATCCTAACGGTCACCATTTTCCTTGCATGGAA
TTCTGGGAATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000260_pilon | genome | sc0000260_pilon:375656..381480 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1009-1134:5700 |
| Aaloc | 892-1005:4727 |
| Aaloc | 841-891:4259 |
| Aaloc | 796-840:4021 |
| Aaloc | 685-795:3364 |
| Aaloc | 607-681:2813 |
| Aaloc | 457-603:2333 |
| Aaloc | 400-453:1817 |
| Aaloc | 220-396:938 |
| Aaloc | 127-219:218 |
| Aaloc | 79-126:1 |
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