XLOC_043052 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_043052
Unique NameXLOC_043052
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000172_pilon:12202..26344-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_043052 ID=XLOC_043052|Name=XLOC_043052|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14143bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000172_pilon:12202..26344- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AACTGAACTGTTCACACACTCTCAGTTTTAAAGGTCTTTATTAAGACCTT TTGGGTGTATCAGGTAACGATCCGTTATCGCAGAACGTTTTGGGTCTTGT TCTAAATCAGACCTTAAGGTCTTGATTTTAATAAGACCTTTATCGCGCCC AATAGAGACTATTCTAGATCCCGAAAGAGACTTCAAGGGTTCTAATTCTA TCATACCTAAAAGGTCTTATTTTAAACGAGACCTTTCGAAAAAAGTCCGT TATCGCAGAACGTTTAGGGTCTTGTTCTAAATCAGACCTTTAGCGCGCCC ATTAGAGACTATTCTAGATCCCGAAAGAGACTTCAAGGGCTCTGATTCTA TCATACCTAAAAGGTCTTATTTTAAACGAGACCTTTCGAAAAAAGTCCGT TATCGCAGAACGTTTAGGGTCTTGTTCAAAATTAGACCATATTAGTGCCT AAAAGAAACTATGTTTAGTACTCGTTTTTGAAGGTCTGTAATTTTCAAAA GGCCTAAATTACCGAAACAAAACCTAACAATAATTAAGAGAAGAAGAGAA TAAAAATACATTCAAAAATTTCAATCTAAAAGATATATTATACCCAATAG GATTTCTAGATATTTTTCTAACAAATATCCATTATATTATGTATATAATA GTTCTTTGATATCGAAACGTACAAGAGATGTATTGTACGTGTCCAGTTTG TTCATGACAATGATGATGATTCACGACAAATTCTAGCTGTTTATGTAAGT ACGACTGTAAACCAGATTGTCAAACAAACGTCCAAGAGTTGAAAATTGAA TAGACGTTTGTTGGTGACGGTGACACGAAACTTTAACGAACTGGATAGTT GCGTGCTAACATGAAAGCTGGATAGTTGCGTGCTAAAAAATTCAAGAGAA GTGAGATAAAGATCACAAAACTGGCTTTTAGGCCTATTACTTCATCGGAA 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AATTACTGTAATCTTGGCTGAGTTTAAGCCACAAAAACTCGCTTATTCTA AGATCTAACATCTTAATTTTATCTCTTTTACAGTGTTATGAAATCAGGGA GTGGCATTTCGAACACTACAACATTGAGTCGTCTCAAAAATGTCAAAAAC CATTCGTACAAACACACTACCGCAATCACGAGACAAAATTCTCTTCCAGT CGGTGCTTCTTCTCCTATAAACCCTTCAATGTTGGGTTCATCACCTAATT CTCAGCAACAGAATCAAGATAGTACAGACTTTCTATCACCTGTGGAAGAG GATAGGCCTTTTAGACCACGGAGTATGGTCCTGTCGTCGACCACCTCCTC CTCAGGGCTTCCTGCCGTCCCGATGAAAAGCAACCAACATCCCTACATCG CTCGCAAATCGTTCCAACGTAAAAATCAACAGTTGCGCAAAACGAAATCC GTTTCACAATCTATATCCCCTGACCTGATAACAACAACATGTGAAGATAT CTTACGCATGGCACAAGACGCGGGCCGCGAGAATTCACAAGCGGCCGCCA CAAATTTTCAGGACCCAACGAACATTTCGCATCTTTTAATAGACAGTAAT ACAAGGATAATAGATTGCGCCGAAGACTGTTTATCAAACGAAAGTGGAGA ACACGAGTCGCATGAAAACGAGGCTAGTGGTAGCTATGGGAACCAAATAA GTAATGAAGAAGATGAAGACTTGAGGCCTTTAGAAAGGACCTTTAGTGAC GCACTAATCATACCGGATCCGTTTGAGCGCGAACCGGATGATTTACTATC TCCGGACACCAATATTACAGATGTCAATAATTTGATTGTGTAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000172_pilon:12202..26344-

>XLOC_043052 ID=XLOC_043052|Name=XLOC_043052|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4308bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000172_pilon:12202..26344- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAATCAATGTTTAGACCAAGGGATTATGCATCAAAGCACTCAAACTT
ATTTTCTCAACAGATGAAATCAATGTTTAGACCAAGGGATTATGCATCAA
AGCACTCAAACTTATTTTCTCAACAGCGAAGGCTGCGGCATTTAACATGC
ATCATTGGAAGGAATATTGATCCAAATTTAGTACCTATTTCCAAATCTAT
GAAAAGCTCATTGTTGATGCTTTATTTTACAATCCATGATGCTAGTGACT
TGTCCACAGCGAAGGCTGCGGCATTTAACATGCATCATTGGAAGGAATAT
TGATCCAAATTTAGTACCTATTTCCAAATCTATGAAAAGCTCATTGTTGA
TGCTTTATTTTACAATCCATGATGCTAGTGACTTGTCCACAGTGTTTTAC
AAAAGTGAGATTATTGAGAATACATTGTGTTTTACAAAAGTGAGATTATT
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AATGAGGTTGCATGGTGTTATAAAAGCCATCCAACAGACCAGACAGCAAG
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AATACTGAAAAAGTTGCATGGTGTTATAAAAGCCATCCAACAGACCAGAC
AGCAAGTGAACACAGTACAAGGACAAATGGATGCACTGCTTGGTGCACAT
CAATCTAATACTGAAAAAACATCAAAGAAAGAGTTACTGACATTTACAAA
TAAACTCCTTTCAGAGGAACTGAATCAATTGAAACAAAAACATGATGAAG
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ACTGAATCAATTGAAACAAAAACATGATGAAGAAAAACGTGCAAGAGATC
GAGAGAAAGAAGAATTACGGAAAAGAGAAAAACGTGCAAGAGATCGAGAG
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TTTAGAGCAATACATTTCACGAATGAAAATAAGCCATTCAGCGCACATGA
TCAATAAAGAGGATTTTGGAAGAAAAGACTGATGATTTAGAGCAATACAT
TTCACGAATGAAAATAAGCCATTCAGCGCACATGATCAATAAAGAATCGC
TCAGTCAATTTACAAGCCGTTTAGCACATCGGAGAAGGCAATTAGCTGCT
GAATTGAGCTACATATTCCCAATTATAGAGAGAATCGCTCAGTCAATTTA
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TCGGCTACGTTGCACAACTGGTTTACATGATGGCGAAGTTTCTGGAGCTT
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ATGCTGTCTGTTTCCCTCGGCTACGTTGCACAACTGGTTTACATGATGGC
GAAGTTTCTGGAGCTTCCGTTGCGATACCCGATCAAAGCGATGGGATCCC
GATCGTCGGTGTTTGATCCCGTCACCGACAAACTGACAGATCGTCAACGA
GAGTTTCCGTTATATCTGAAAGGAAAAGAGTTTCAATTTCACTATGGCGT
ATTTTTATTGAATAAGAATATAGCCCAGGTTTCCGTTATATCTGAAAGGA
AAAGAGTTTCAATTTCACTATGGCGTATTTTTATTGAATAAGAATATAGC
CCAGTTACGTTACCACAATGAAATAGGAACATCTGATTTAAGAAACACTT
TGGAAAATTTAAAGCGTTTATTAGAAGACAAATTTGGAGTACGAATTTAC
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AGGGAGTGGCATTTCGAACACTACAACATTGAGTCGTCTCAAAAATGTCA
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CCAGTCGGTGCTTCTTCTCCTATAAACCCTTCAATGTTGGGTTCATCACC
TAATTCTCAGCAACAGAATCAAGATAGTACAGACTTTCTATCACCTGTGG
AAGAGGATAGGCCTTTTAGACCACGGAGTATGGTCCTGTCGTCGACCACC
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GGAGAACACGAGTCGCATGAAAACGAGGCTAGTGGTAGCTATGGGAACCA
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AAATTCTCTTCCAGTCGGTGCTTCTTCTCCTATAAACCCTTCAATGTTGG
GTTCATCACCTAATTCTCAGCAACAGAATCAAGATAGTACAGACTTTCTA
TCACCTGTGGAAGAGGATAGGCCTTTTAGACCACGGAGTATGGTCCTGTC
GTCGACCACCTCCTCCTCAGGGCTTCCTGCCGTCCCGATGAAAAGCAACC
AACATCCCTACATCGCTCGCAAATCGTTCCAACGTAAAAATCAACAGTTG
CGCAAAACGAAATCCGTTTCACAATCTATATCCCCTGACCTGATAACAAC
AACATGTGAAGATATCTTACGCATGGCACAAGACGCGGGCCGCGAGAATT
CACAAGCGGCCGCCACAAATTTTCAGGACCCAACGAACATTTCGCATCTT
TTAATAGACAGTAATACAAGGATAATAGATTGCGCCGAAGACTGTTTATC
AAACGAAAGTGGAGAACACGAGTCGCATGAAAACGAGGCTAGTGGTAGCT
ATGGGAACCAAATAAGTAATGAAGAAGATGAAGACTTGAGGCCTTTAGAA
AGGACCTTTAGTGACGCACTAATCATACCGGATCCGTTTGAGCGCGAACC
GGATGATTTACTATCTCCGGACACCAATATTACAGATGTCAATAATTTGA
TTGTGTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_043052XLOC_043052-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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Properties
Property NameValue
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