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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000174_pilon:147212..153758+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_042998 ID=XLOC_042998|Name=XLOC_042998|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6547bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000174_pilon:147212..153758+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTACAAGAATTTCAATCACCAGACTCGGATGACTGTCACGGTTTGGG
CTTCATCAAACCTCCAAAGAAAATGCCTTGTTGTGgaccaaaattatcaa
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GACCTACgccaatatcttactttatatcCGCTCCTTACACCAATATGcca
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TCTAGCCTGGACCACAACACGTAGAGTGTAAATAGAATATAAAGCTTATT
TGAGCAACTTTTACGGGCGGGAAAATCAAATATCCTAGGGCCAATCTCTG
GACCTAGAACTTTTTTCGGCGTAGACCTCAgttttaaggtatgtgtacac
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ACTGGGTTGTGGTGCTTTTCTCTTCTGCTCTGCGGGTGAAAAAGCACAGA
CTTTAACTGGCTAGTACGAAATGCAGGTCCcaggttacaggtttcagggc
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tggtTGTCTTCGAGCTTCATGCTCTGGCAAGAAACTTTCTGCTTCACACC
ACAATGCTGCATCCATCAAACCTGAATAAAGGAAGGATGTCGGCAACTAA
ACAGTTTTCATGTCAAGAATGGAGTTAGAGTcggctctcctgcaccctgt
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TTGGGCATTGAATTGAATAACTTAGCACCTTGCACAACAAGCGTGCTATC
ATGTAGTTTTGAACTATGGGTGCGAACACACATCCTTCCCAATCTTGGGA
Gttccttgaattgaaatttattgttgatgtttggaaccagattttcagct
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gtaaagttttagctttttcagacaatcccaatagttttttggagtgccag
ttattcttttgagaaatgatttttggatttcttctaaTCTTTGGGTAGAA
CTGACAGCACTTGGACTCCATAGGACTGAGCAATATTCAATGACTGGAAT
AACCAATGATTTGTAAAGAGTAATCATTAGTTGGGGTAAACGCGAAGAGA
AAGTCCGCAGAATCcaggaaatcaagttttttgctttctcaatgactgaa
tttatttgatgtgtaaaGACAGCATCATCTGACATTAGTACTCCCAGGTC
CTtcacaaatttcttcctttcaATATTTTCTCCTGAAGGGGATTTGTAGT
gagtttggttttttatttcttcatctggACCATAGCGTAGAAGTTCAAAC
TTTGTGTCATTTAGTTTCATGTTGTTTTCTTCAGTCCAGTCATAGACTTT
TTCtagttctttttgaagaatttcaacatcctttgtgtttttgattgatt
tggtggcacgtgtatcatcagcaaatgatttcaatatacagtacagtact
ttttcatcaatgtcaCCAATCAATATTAGAAATATAAGAGGTCCCAATAC
ACTgccttgagggactcctgaaattACTTTCTGGGCTTTGGACTTGACAC
CATTTACTAttactgtttgatatctttcagTAAGGAATGATTCAATCCAT
CTGTGGATTGGTCCGGATATACCCAATTGCTTTAATTTCCCAAGTACAAC
TGCATGATCGACTTTGTCGAAAGCTTTTGAGAAATCAAGGTAAACAACAT
CTGCATTCAAACCCTCATCTAATATGTCAAGAATGAGGTCGTGTTGCTCG
AGAAGCTGACTAAGGCAGGATCTCCCACTTCTGAAACCAtgttggtttgg
attgaaaaggTCATTGTTGTTCATGTGATTTACAATatgatttctcaata
ttttctcgaaaatttttatcacatgCGAGGTGAGTGCAACAGGTCTGTAG
TTGGCAGCCAGAGATCTGCTTCCTCCTTTGTGAATCGGTGTTATGgtgca
ttttttcagttcagttGGAACAAGACCTATTTCTAGGCTTTTCTTCCAGA
GTAAACACAGTGGAACGGATAACTcatctttgcattttttgagaaacata
gctggaaatCCATCAGGTCCTGCAGAAGATGATGGAGACAGCTCATTTAT
TGCTTTAACGATGGAGTCTTCTGTTATGTTAATCTCATCTATCTTGACGT
TTGTTTTGTCTTGGTTaggttgtggttgtggttgcTTTGGTTTACTGAAC
ACTTTAGCATATTGGTCGGCTATTGGGTTCAGGTTTCAGAGCAAGGGTTC
AGTTTAAAATTGTCTACATTTTCAGACCAGAATATTCCGTGGTATATATC
AGTCAaggacaccttcaaattagcctatcataggctgattagcctatcat
aggctatttagactattttatataggctatttagccgaaaatcgataaaa
acctcgatttctgacgaaatataaatagtcgcgtcttctCTAAGGAATAC
ATGGTTTCTCAGTATTAAGCAGTATAGTCCCAACTCTTTATACAAAGTTT
TACAGTTTTACTTTGTACCAATGCTGCacacaagcacttaagccaaaaaG
TCCCAGACGAAATCAGTTTGTTgaagtttgtaaaaaaaaaaacattgaaa
gctTTCAAATTCAgaatgtgaatagagcagtaaaaaatggAATGTAGTTT
TGAATCGGTTGAAGGGGTAGCATCTCTAGGATATTTGGTGGAAGGTTTGA
AACGTAATCCACAAATCCCATTTTATTGAGCTTTGCTTCAGACAGGATGA
TGTCTTGTTTGTCATTAGTAACGACCCTGGACACCACCGTACATTGCGCG
GTTGTGTACGGTGGGGCTGGGTGTAAATGTCCGGTGAAAATTTTTGGTTA
GGTTCGAAAACACCGTAAATTTTTCCACAGTACAATTTTACGGTGGAATT
AGATTCATTTCCTGCTTCAAAATTCTTTACGTGTCCAttatctaaacctt
ccagatattgaaaatttccccaacctttagagctttagcgtgtctgATAA
AAATCtctgcatctgggtgccagataaagtACAATTGTAAGTACTGTAca
gttattttcaaattatttttaggcGATTATGGGAATTCTGTTTCGAGTTC
AATCGGTAGCTTTGATTGAAGACATCCCAAAAGGCGGAACTGAAGAAGAA
GGCTTTCAAACAGCTTCCACGTAAgacctgaatttttttctactttaaaa
aacaACGTAaaatagcgtcagcctgggtttaggtcccagccAAAAATTAc
gtcccccctgagttttaagtccccccccaaagatttatgaattttttgtt
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CGATTCgtgagcttcaatttgagtaattgaagccaactattaagctgaat
tattttagccccactttaagtgatgagattttagctacCCTCAAGTACAa
aggtccccccaaaaaagtggtgtacttccagcccctCCTTTTTTGGAGGG
ATGCTATGTTTAACATGCAACGTTTTCAacggtttgaaaaaaaattaaca
aggaaAAACTCTTAATGTTTATCATTGAAGATgactatgttttcatttta
caGTAATTGTTTCATCGCTGCTGGGTTATATGTTGGTGTTTTCATTTTTA
CGAGTTATCAAAAGTATGCGATCAGCAGAGGATATTCTCGCTTATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000174_pilon:147212..153758+ >XLOC_042998 ID=XLOC_042998|Name=XLOC_042998|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=666bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000174_pilon:147212..153758+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTACAAGAATTTCAATCACCAGACTCGGATGACTGTCACGGTTTGGG
CTTCATCAAACCTCCAAAGAAAATGCCTTGTTGTGgaccaaaattatcaa
attgtTGCTTTGTATTAAGCATATGGGGAATGATTATGCTGATGGTACAA
GAATTTCAATCACCAGACTCGGATGACTGTCACGGTTTGGGCTTCATCAA
ACCTCCAAAGAAAATGCCTTGTTGTGgaccaaaattatcaaattgtTGCT
TTGTATTAAGCATATGGGGAATGATTATGCTGgcGATTATGGGAATTCTG
TTTCGAGTTCAATCGGTAGCTTTGATTGAAGACATCCCAAAAGGCGGAAC
TGAAGAAGAAGGCTTTCAAACAGCTTCCACgcGATTATGGGAATTCTGTT
TCGAGTTCAATCGGTAGCTTTGATTGAAGACATCCCAAAAGGCGGAACTG
AAGAAGAAGGCTTTCAAACAGCTTCCACTAATTGTTTCATCGCTGCTGGG
TTATATGTTGGTGTTTTCATTTTTACGAGTTATCAAAAGTATGCGATCAG
CAGAGGATATTCTCGCTTATAATAATTGTTTCATCGCTGCTGGGTTATAT
GTTGGTGTTTTCATTTTTACGAGTTATCAAAAGTATGCGATCAGCAGAGG
ATATTCTCGCTTATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000174_pilon | genome | sc0000174_pilon:147212..153758 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 241-333:6455 |
| Aaloc | 142-237:5823 |
| Aaloc | 1-141:1 |
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