XLOC_042979 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_042979
Unique NameXLOC_042979
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000384_pilon:153926..162134+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_042979 ID=XLOC_042979|Name=XLOC_042979|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8209bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000384_pilon:153926..162134+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CTATATAcattcactttatggtgtttctgtatgactgtctgtgtacctag tctaaccaccgttaaaagccttcgggaaggtccctcctaacttggaaaga cagaatttgagcaatttcaccaaaccactggagcgtaagttatttaggct atcacaactgcatgaaaaagttgaacgtgcgcatgtaaagttagtTTTTA Ggcttttaaaatagatttaccacacttaacaaacagtgaaaacattctaa gtgaggtaaatctatttttaagactaaaagaaaaagtttgttttcattga ttgacattcattcgaccacttttggattcaactttacatatgcgtacatt caacttttttgtactttgccggtatcttgttttaccaagttaagaaggac tttctcgagttacgaccatatgatggtctttaaagctcaagaagctctat aaacaatataggtagttattaaaaaaataacagacaaaCATAAATTACAG tctgaataaaaatatcaaatgtacatttgaaaaattaagcaaatttcttt aaagattctggaaaaagaattaaaatcattgctggaaatgaacttctgac taaattacagtagttagtattcagtttcaaaaacaagaaacaaaatttga caaacaaaacacttttttcagtcaatgaatcagctcatcatcataaccag tctgccattttttttattttgatttgcacaagtaatattgtaattcgtgt tatatatcatacactgttataatttgcatttataacactcgcatCTGCTT TTCAAAGCtgaatcaaaactaataaattgtaatatgtaataatggtaata gcatataacgaaATATGACCCGTGGGGGaaggggtactagggcaagatgg gttacggggatgctccgctggccagggtaccttttttaacctccacgagt 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000384_pilon:153926..162134+

>XLOC_042979 ID=XLOC_042979|Name=XLOC_042979|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1530bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000384_pilon:153926..162134+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GAAGAAATTGTCTTGAATACCAAAATCACAATGCAAGGagttaattttga
atttcacaAGGATTATGATGTGCCAGCTAGGAAGAAATTGTCTTGAATAC
CAAAATCACAATGCAAGGagttaattttgaatttcacaAGGATTATGATG
TGCCAGCTAGGGCACAAATACGATGTTTTGGTGCTTCAGAATTGTCAGCT
ATTCCGTTTGATATGTTTAATGTTCCTGGCGAAAAACCTATCTTCCAAAT
TCAAGAGTTTTCTTATACGCCTTCCTATATGGATATGGAAGAATTAGTga
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ACAAATATAGTACAATACCCCATACATCTATAGGGCACAAATACGATGTT
TTGGTGCTTCAGAATTGTCAGCTATTCCGTTTGATATGTTTAATGTTCCT
GGCGAAAAACCTATCTTCCAAATTCAAGAGTTTTCTTATACGCCTTCCTA
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GTTTGGAATTCAAGATTTGAGATTCGAGTATAATATCAATCGGGTAGTAT
CAAACGATGATAAAGGGGAAGAAATCAAAGATAGCAAaggaaaatcgaaa
aagaaaacCGATTTTGGTGATGTCAAGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_042979XLOC_042979-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000384_pilongenomesc0000384_pilon:153926..162134 +
Properties
Property NameValue
Aaloc487-765:7931
Aaloc406-483:2440
Aaloc82-402:246
Aaloc1-78:1