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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000104_pilon:165587..174791- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_042978 ID=XLOC_042978|Name=XLOC_042978|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9205bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000104_pilon:165587..174791- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGACTCGATTACTTTTGAAGTTGACCATCGTCTTACTTGCATTTGAAAC
GGGTAAGCAAGAACATTATTCGAAGTATGCACCCCCTTCTCACAGTCACA
GACCCGGTAGGATTTTTTCAGTCAATGGGGATAAAAATGACGGACTAAAA
CTCGATTGGGATTCATATTCCCATGTTTTTCATGGCTGGGGATTTCAATA
TTTTGGCCAATTTTTCCAGTGGGAAGGGGTTCCAGTGGATCTGTGAAAAG
GGGGTGTAAGTATGTCAGAAATACATTGCTGAAATTTATACTTTTTCCTA
AAAGTATTAAAGGCCGGGGGGAGGGGGTCTTTAGCCAAAGATTTTGTGAA
ATCTGGCCTTTTATCATCGACTGGCTCAAAAGTTCCTTTAGACGGAAGAC
TCTTGCCCGTTAAGACTCTCTTACGCCTGGGCTGTACCCGTTTTTACAAG
ATTATTCTTATTCTCTCTTCGCGTCTAAACTATTCGAGACAGCGTCCTTA
TCTAGAACTGTTGAGGTTGTCTAACACCCCTGCTGTGACCTTGAGAATCG
TCATTCTAGGCCTTCAGGCCTTAAATGTTTTCTTGTAACGATTACTAACA
TCCTATTTCCTAACTAACAAATAATTAAAGGTTTTGTTTTTAAATAAGAG
TGATATCGTTTGCTTACCCATCAATTTTAATTTACAAGCTTTTTCACGCA
CGTATGTGGAGCAAGATTGGTCAGAAAGAGTAAAAAAACATTTTTTCGCT
TATATCAGCATAATATACGGGAGGCAGACACTTTCCTTATATGAAATATG
TGTCTGATATGAAACGGGAACACTTATGTAAAAATAAAACCTTTAAAATA
AAATAATAATTATCCACCTTCCAAGGAGTAGACTTTAGCATTTTCAAAAT
TCAAAACACATGCCACTTTTGATGTCGTTGGTCCTGTATCGCCAAGATTT
TTGAGAATAATAAGTTGTCCTACAGTTCCTCTCTTTTTTATAGGTTTATT
TTATAGTGTTCCCGTTTCATATCAGACACATATTTCATATCACACATATG
TTTTATATCGGGACAGTGTCTGCCTATTGTTATTACACTGAATTAACCAA
AAGAAATGTCTTTCCTTTCCACATCTGTGTCAATCCAATGCGAAAAAGCT
TGTGAATTAAAATAGATGAGTAGGCAAACGATATCACTCTTATTTAAAAT
CAAATCCTTTAAGCTCGACATGGTCTAAAATCGCCTTACATATAAGTGGT
CGAAAATATGGTACATTGTAATAAACTTGAGCACACAATTTCGAAATAGT
TCTCTACCATATGATGACTAAAGCTTAAGGCAGCAATGAAAATAAACGGA
AGTTTGCTTCTGATACCCCCTCACAGTATAATGAAACCCGTGTTTTTATT
TGTATTTTTAGTTTCGCTGTCGTTAAAGAAAGGCATAGTAATACCTGGTA
GTAAGTGACTTAAAAACGAATTTATTGTAAATGTTGTTGCCAATAAAAAT
GACTGTCTACATTCTATGTATGTATAAAACGTCTCGCTAGGCTGAATAAA
TGTATTTAAAGTACTTTGATATTTAAAAAAAAGATATCCTCTAGTTTAAA
ACTTGAGGTAATGCTTCTTTAAATTTGATAGTTTTATAACAATCAGCTTT
TATAGCCGAAATACCCTTTTCGGAAAGTGTAAAAAACACGTACAAAGGAG
TATCAATAATTAGGCAATTCTAGGTGTTTGCTTTATGAAATGTTTTAGTG
ACTTTCAAAAACTGTACTTTAAATTTTGATAACATTCTCTAATTGAAAAA
TGTATACCTTATCGGAAAAACAGAGTTGATGGGAAGTGATCAAAATCTTT
TGACAGAACTTTCCATTACTCGCCCTATAAGACTTTTTAATGGAAATTTC
ACACTCAAACTCATAAAAAATAGAAGTTCCCTTTTGGGTAGAATACCTTC
AAGAGGGACTTCAATGAGAACTGACTAATTTGAAATCTTTTTTTGTGGAA
ATGTAAGGTGACAGGTGATAATTTCCCCCACCGCTATCTGAAAACTACAT
ATATTTTCTTTTCAGTCACAGCATGCGGTTCGGCTGAGCTACATAACAAA
TATAGACGTTTTCACAAATCAACGCCGGACGTTGATGGAAGCAACGAGTT
GGTCAAACTCTCTCAACAATGTGCAAGTCAAATTATTCAAACTGGAAAAA
GCACGTGTGACCATGAGGATTCTTATGGAATCAATATTGCAATACTTCCC
TCTGTTTCTCGGACTTCACACTTAGAAGAACTTATGGCAGCATGGTAAAT
TTTTTAGAATCATGAAATATTTGCCATCACGGGAAACTTATAGCGAATAC
TGCACATGATTAAATACACGGGGTACTGGTAACCACTGAGTTTGAAGCCC
CAGGGGCTAGAGAGGAATCTTCAACCCTTCTCAAGCAAGAAAAAGTGAAG
TTTGCCCCGTATTTAGAATTCTTGTTTGAAAAACACACGGGTCACGTGTT
CTGAATGGGAAATAAGTGACTTTATTTGTGGACTAGCAAACTAGTCTGTT
AATTACTTATGTCAGAGGGCGGGAACATAAAGGCGGTGGGCGATTGCTAG
AATAAGAGCTGCGTAGGAACAAGCAAAAGTTGGTGAGAGGCTGCTGGTTA
ACAGCTTTCAGCCATCCGCCGACAAAATTTCACGCTCACTTTTTCCGCGT
GATACCGTTCCAGTGCGGCTGCTGTGCCAGATCTTTTCATTTCTTTTCAT
TTCTCATCATGTTGATAACAAGGACTTCAAGTATTCGGGCTTTCTTTTTT
AGGTATTCCGAATTGGATTCAATCAAATTTAACAGTAAAGGTTACGAAAA
TTTACATTACAACGCTTCTACCATTGCAAACGCTACTCAGGTAAGAATCT
TCGTTTTAAAAGGCGGAAATAATTAAAGGCGAAATTGACGAATTTTGCCA
GGGTAAGTCAAGTTTTAGCTCTTGCTAAAATTCAAAAAATTACTGCCCCG
CATAATTTAACAGTAATACACCTTTTCGACCGTAGTCGCGCAGTAGGGCG
CGTGCCACTTTATTATTTAATTTACCACCCTAAACTCGATCCAATCCTTT
TTTTACATTTTTTTCTATTGTCTTTATGTGCGAAAAAAAGGCTGGGACGG
TTTTAGGGTGGTAAAACGGACAGAAAGATGCCCGCGCAGCAATTGGTGGC
TACGGTTGAACAGGTGTATAGTGCTTCTTGATATCGAAATAAACTTTTGC
CCCCTTCTAAATAATAGATGATATTGTCATCCGCAGAGGTAGTAAACGGG
GAAAATTAAAGATGTGCAGATTTAACAAACAGCAAGATAGTAGTTAGAGA
AAATTGCCGCGATAGAGTTTCGAAGAATAGCCGTCAATTCTATCGCTGCG
GAAGGGAAGCCCATGTTTGATTTTTTTTTTCGGTTAAATAATGACACTGT
CTTAAACTTTAGCATGGTCTACCATTCTAGAAAAAGACCATACCCCTCCC
CGTACTACGAAACCTTTTCTGTGTTTCACGTTATCGCTAAACCGACCTTT
TATCCAGTTTCAGCCACAGATTTATAAAGCCCGAGGGGCTAAATGTCATG
CTTTAATCTCTTCCAAGCAAAAAATAAAAAAATATTCTTGCTATTGTTTT
CGAAAGCCCGCGAAGCTTCTGATTGGTGGCGCTGAAATTCTATTGTAATG
TCATGTGACCTAGATAGGATTTCCTACCTACGACTTTGCACTTTTCATCT
AGCTCTTCGGGCTTTATACATTTGTGGTTTCAGCGTACTTTGCAATAAAA
AAGTCAGTAGAAAATAAAAAGAATCTTCCATTCAAAGTCTACTCTTTATT
AGAAAAGCTAGAAAAAGCGTCATTATTCGAAACTCTCACAAACCTTGTTT
TCTTGCGTTTGCAAAAAACATAGATATGAAACTTGGGGCAAAAAGGGGGA
GTTCTAACCGCGTTTACAATCTGTTCCTTTTTGTATCCCGTTTCTTGGTT
TTCTGGGTTTTAGTTTAAATAAAAATTATGTTTAAGTTTCTTCATTCCAA
ATATTTGACTTAGCCATAAAAGTGACCAGCGACAGACTTCTCTATTCCCT
AATCAAGTATATCAAGCAAGCATATAAAGTGAAGTAACTTAAGAAGCTTA
AACTTTTCATCATGTCTGGTCACAGACTTGTTAGAGGGATGAAGTTGGCG
CTCTCTTATTCGACGTCCTACTATTCCAATACGCTCCATTATTCGACAAT
ATTGAAAGTCATCGTCAACAAGTAACTCTCATAAAACGACGTTCTACTAT
TAGATACGCTCTTTAAATAAAATGATGACTATTTCGGATGAAAATTTACT
CCTTTAGTTTAGATCAGAATTTCATTTTCTATATAAAACTTTTTCCTTCC
TCCTTTCAATAATAAAACTCAAATGTTTGTCTCGGAAGACTCTTGGCGAA
TCGATATCTTCTTTTACTTAGTAAACTTTGCCGCGCCTTTCTTGAGAAAA
AATATTTTTCTATGTTTATCAAATTTCATAAAATTTAAAATAATTAATCA
TAAAGAATTATCATATTTATTAAAATTGTTTCTCGCGTGTTAGTAAATTA
CCCCCTCGGCGTATTTAACTCTTCTAAATTATTAACTCCCCACTTTTAAT
ATAACGAGTTCCTCCCTGTTATTAGGAAGGAGATATTCCTTTGACAGGGC
CGGCGAAACTAGGGGGGCCGGGGGGGCCATGGCCCCCACACTTTTTTGCT
AAGAAAGGCCCGTCGGCGCCATTGAGTTTCAAGCCGAAGGCTAGAGGTCA
ATCTCCTTGGTAGGATTTGAAGCCAACAAATCCTACCAAAGTTGAGCGGC
CTTGAGCGACCCGCCTGGTTTTTACACAAATGACAGATTGAAACTAAAAT
TTACCGCTTAATTTTGAGAAATATATCAGTCGAAAACAAAGGAATTGCTA
GATTCAATCCGTCATCAAAAATACGGCGCATATTTTAAGGCTTCAATTTT
TCTTGCCTGAGAAAGGTTAGAGATTGACCTCTAGCCCTTCGGGCTTGAAA
CTCAATGGTCGGCGCCAACCATGGTGGCGCCTCCTTAGACACTTACTATT
TGGCCCCTCCACTTTCAAAATTGATTCGCCGGCCCTGTTTGAGACCTTTT
ATAAGAACAGGTGCATTTTGGGTGAGACTCGCCTATTCTAATCTTTTCGT
GATGTTAAGGTTTTAATGTTTTTAAAATGTTCTTGATAATCTTTTCACAC
TATTTGCCAACCTCGTGCCCAGAGTCACTTGCACCACTTTTTGATTTTAT
TGATTTGATGAACGTGTAGAGTCTACTTATGGCTGAACTTTGCTTTGCTT
TTTGATAATTTTTTATGACGCTCAGTCCAGTGAAGTAGACCAGGAGCGTT
TGGCAAGGTAGCCATTTCGAGAAAAAAATGTTAAAAATCCAAATAACACT
AAAACTACTTGGAGTTGAAAGATATAAGAAAACTTAGTAAACTAAGGGAC
TTGGTTTGAGAGTGTGATTGTCTTAAAAGGGGCTTTTAATCAGCATTTCT
CTTTGTGATTTCTGAAATCTGAGGCTCAAGTTGTTCTTCATTTGCTCTTA
CGTTTTGGCCAGATTTAAGCCTTGTTTTCTTATAAAAAACCGTGTTTACC
ATACTGTTCGTATAAAAACGAACTCTCTCAACACTCAGTTCCAAACCTTT
TTATTATCCACCCACTGACTGAATGAGTGCAAATTTGTATAATGCGAATC
GCTACAGGCTTCCTAATAAACACTTCAGAAAATCTGAATTTACAATTTAA
AAATATCATGGTGGATGAATTTTTTTATGAAATCTTTGAATTTTGTAAGA
AATTTCTGTGTGAATTTAACAGTTTTTCAGTGTTTGTGATTATATCTATT
TTAAGTATTAAAAACTCAATAATTTAGGCCCGCATTGGATTTGGAAGCTT
TGCCATGCTGATATTATAAACCTCACGTTTACTTTGTAAGAAATAATCAC
CGAAAGGTATATCACAGAATTTTCGATTTGATTCTTACAAAGTAATGCTT
AAGTTACGCCAGAATTAAACGCCCACGACTTAATTTCCACCGCAAAATGA
GGTTAAGCATACCAGGATAATCACGACGGAAGAAAAATGTAATAGGCTAG
TGAAAATATGAAATTTGATTGGTTGAAACTCACTAACCTGTTAAAATTTC
GTTAGTCGTCGTGATTTTACCGTTTTACTTAACTTCACTATAGAACGTTA
TCGTAATACTTGCGCTAATGCGGGGCTACCCTAGCATTACCTATTAGTTT
TTAATGGCTTTTTCTCGCTGTTTTACCCTATTACGCACTCATGATTTAAC
AATTCTATGATTTTTTTTAATTTTGTTTCTTAGATTATTTGGCGATCCAC
CCAAAAGGTTGGGTGCTCGGGCGTGACACACCCAGGGCGTCATCAATCAT
CAGTTTATGTTTGTTTTTATTCACCACGTGGCAATTATTTTGATAAACCG
ACTGATATCATACTCAACCTCAAACCGAGAATCACACCCATTGAAGCCAA
AACTAAATTCGGTAAGACAACATTTGAATTTTCTAGAGATTATTACGGCT
AGTTTCGTTTGTATCTATAAGATTAGTGTCCATATGGAAACGAAATTTCG
CACATAAAATCGCCTCATAACAAGTCAAAAGTAAAAGAGAAGAAGAAGAG
TTTTTTAATACATCTAACAGGTCATAAGTTCCAGGGCACTTCTACCCCTT
CCTCATCCCGGGTTGGATCCCTCTAAATCGGAATCAAGATCATTCCTGAT
TGGAAAGTGCTAGGAGCTTGTGCTCTTTTATGCACTTTTAAAGAGAGACT
AAAGAGAGACTAAACCTACCCAAAAACAAAGAAAGTATTTTTGGCGTATT
CCCAAAAGTAGCACCTTCATCTTATTGGTCTCTTTAACCCGGGGGTCCCA
AAGAAAACGCTGATCCAGCCTTGAGATTACACTAACTTACCTTACCAGGT
CGAGCTTGCTCGGCTTGCGATGACACGTTCTCTCCACTGTTGCTGATGTC
CCATAGCATTTGGAAGGTCTTTCTTTAAGCAGCTTGCATCATCTCTCAGT
TGGTCGATGTAGGTTTCGTTTGGTCTGCCCTGCGGTATTTTTCCATAAAG
GGGCTCGCAAAGTATTACCTCCGAGGATTGCACGTTTTTGCTAAACCAAC
AGTGGCCAGCAAAACGTAGACGCTGTTCTCGAATCGCTGATGTAACGCGA
GATATCTTACGATAAAGCTCGATATTAGTAAGGTGATCTTTCCAGGATTT
ATTTAACGCTACTTTCACAATCTTGTATAATCCCCATCGGCTCGATATCT
TGGACATTGAATTCTACACTGGGAAGAAATGGGGCCGTAGTAAGACAATA
GGGCCGTAATTTACGCCGAAACCTATAAAAATTCTTTGAACCACCTGATG
ACGTTCAAATTTGACGTCAAAAACATATTGTATTTTATTTTCTAACGTTA
TCTCATTTCACTGAAGATTGGTGCCTGAGCACCATGAAACTCCAAGTTTG
AAACAAAGATATTGTATTATAGAAATTCTTACATATGCTTCAAAACAAGG
TCCTTTAAACCGTCTCATTTAAAGCCGAACTTTGGTCCGTTGCGGCCCCA
ACATCAATTAGGGCGTGCGTAAAATATTCTTTTTGTTGGATGGATAGTGA
GCCTTAATAGAACGACTTTGTAAAGTTACTCCTGAGCCATTTTCAAAAGG
CTTGATTTATTGTTCATAAAATTGAAGATTTTCTTAACCGAAGGTAAGAA
ACAGAAGGTAAGTAAAGGGAAATTAATCTTTTCTACAGATAGGGAAGAAA
AAAAAAGATGGTGACAAAATCGGAAGTCGTATGATAATACACATTGACAA
AACCAATGGATTTTGATAAGAGATATTTTTCCCCGCAACTCTTGTCACGA
AATTTAGTTTCTCGAAATATTTTCAGGTCAAGACAACTTTGGAGGAATAT
TTCGAAGAAGGAAAAAAATCATAGCCTAACCGCCATCTTTCTATAAGTAG
CAAATATTCCCTGCGTCAAAGACACGGTTGGGCCGCCAACCACTGGAAAA
TTTGGTCGAAATTTGGTCGCCGGTGGAAAAAATACCCTACAATTTTAGCC
TCATTGGGAAATTAACTTTCATTTCAACCCCATTTGAAATTTCAATTTAA
ACAATTGCACTCCAAAACCGTCCCCAATGGATTTTTCGAGCTTAGAACAA
TAGAATTTCTGTTAAGTGGTCCGGCGTAATTTGGCAGGCTTCATATTTTG
GCTTTACTTGAGGTGGTAGCAAATAAATGCCACTATAATCCAGACCCTTT
TTGGAGAAAAACAAACAGAAAACCATGTCCAATAGACCAATTTCTTTCAA
ATTTTCGACGTATTTTAATGTTTTTATTATAGTTTCATAAACTTTGATTG
GGTTTTAGAGTAATTTTATTCTTTTGCTGTTTTCATTTAATTTTTTAAAA
CGAAAGTGAAAAAATTCCAATATGGCGACTTTTTTATATTATTTTTATTT
CGTTTTTTATATTATAGTGCTCTGAAATATTTTTCATCATCAAGGTTTTA
TTGGAATTGAAGCGTTGATTGGGAAATTAAAAAGCAAAATATGAATTAGT
GGGGGCCCCTTCGTGTGCATACTCAAAGCAAATTAACTTGATTCTAAGGA
AAAAAGACTTCCTCCCAGTTCTTCTAGAAAACAAAAATCATTCTTTTCTC
GCGAGCTTCCATCGGTGATTTTCGGCTATTCAACTGTCGCATCAAGGAAC
AAATTTCAGGCCCGGTGGAATAACCTTAAAAGTGGGGAGGCTGAAGGCTC
AAAATGAGATCAAGTTTTCTAGGAATTTGAGAAAAAAATCTCATTTGGTC
AAAGTTGGAGAGGCTAAATTCTCCCCAGTCTCCCCGCTTCCGCCGGGGCT
GAATTTTCGATTCTCAAAATCAAATGATAGTTATTGTATGATTGTGAATT
ATATTAATTGATGGCAAAAATAATTTTTACTATTCTTTTCGAAAAATTTG
TTTTTCATCTTCCAGAGGAATGCAAGGACGACTACCCAGAAGAGTGCAAA
GCCATCGAGCGCCGAAAAGCGGAACATGTCTGCCATTTTGATTTGGTTGG
ATTCAAAGGAAAAGTCAACGAGTATTGTCGAAAAACATGTGGACTTTGTT
CTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000104_pilon:165587..174791- >XLOC_042978 ID=XLOC_042978|Name=XLOC_042978|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1452bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000104_pilon:165587..174791- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGACTCGATTACTTTTGAAGTTGACCATCGTCTTACTTGCATTTGAAAC GGATGACTCGATTACTTTTGAAGTTGACCATCGTCTTACTTGCATTTGAA ACGGTTTCGCTGTCGTTAAAGAAAGGCATAGTAATACCTGGTATTTCGCT GTCGTTAAAGAAAGGCATAGTAATACCTGGTATCACAGCATGCGGTTCGG CTGAGCTACATAACAAATATAGACGTTTTCACAAATCAACGCCGGACGTT GATGGAAGCAACGAGTTGGTCAAACTCTCTCAACAATGTGCAAGTCAAAT TATTCAAACTGGAAAAAGCACGTGTGACCATGAGGATTCTTATGGAATCA ATATTGCAATACTTCCCTCTGTTTCTCGGACTTCACACTTAGAAGAACTT ATGGCAGCATGTCACAGCATGCGGTTCGGCTGAGCTACATAACAAATATA GACGTTTTCACAAATCAACGCCGGACGTTGATGGAAGCAACGAGTTGGTC AAACTCTCTCAACAATGTGCAAGTCAAATTATTCAAACTGGAAAAAGCAC GTGTGACCATGAGGATTCTTATGGAATCAATATTGCAATACTTCCCTCTG TTTCTCGGACTTCACACTTAGAAGAACTTATGGCAGCATGGTATTCCGAA TTGGATTCAATCAAATTTAACAGTAAAGGTTACGAAAATTTACATTACAA CGCTTCTACCATTGCAAACGCTACTCAGGTATTCCGAATTGGATTCAATC AAATTTAACAGTAAAGGTTACGAAAATTTACATTACAACGCTTCTACCAT TGCAAACGCTACTCAGATTATTTGGCGATCCACCCAAAAGGTTGGGTGCT CGGGCGTGACACACCCAGGGCGTCATCAATCATCAGTTTATGTTTGTTTT TATTCACCACGTGGCAATTATTTTGATAAACCGACTGATATCATACTCAA CCTCAAACCGAGAATCACACCCATTGAAGCCAAAACTAAATTCGATTATT TGGCGATCCACCCAAAAGGTTGGGTGCTCGGGCGTGACACACCCAGGGCG TCATCAATCATCAGTTTATGTTTGTTTTTATTCACCACGTGGCAATTATT TTGATAAACCGACTGATATCATACTCAACCTCAAACCGAGAATCACACCC ATTGAAGCCAAAACTAAATTCGAGGAATGCAAGGACGACTACCCAGAAGA GTGCAAAGCCATCGAGCGCCGAAAAGCGGAACATGTCTGCCATTTTGATT TGGTTGGATTCAAAGGAAAAGTCAACGAGTATTGTCGAAAAACATGTGGA CTTTGTTCTTGAAGGAATGCAAGGACGACTACCCAGAAGAGTGCAAAGCC ATCGAGCGCCGAAAAGCGGAACATGTCTGCCATTTTGATTTGGTTGGATT CAAAGGAAAAGTCAACGAGTATTGTCGAAAAACATGTGGACTTTGTTCTT GA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000104_pilon | genome | sc0000104_pilon:165587..174791 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 589-726:139 |
| Aaloc | 409-585:2823 |
| Aaloc | 322-408:6403 |
| Aaloc | 94-318:7139 |
| Aaloc | 55-90:7793 |
| Aaloc | 1-51:9206 |
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