XLOC_042900 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_042900
Unique NameXLOC_042900
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000113_pilon:619966..634402+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_042900 ID=XLOC_042900|Name=XLOC_042900|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14437bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:619966..634402+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGATCCTAATGCATTGATCATAAGTGGCACTTCTTTTGCAGAACAGGC CATCCGCTATGATCAGGAAAATAATCATGAAGAAGCACATTCTAATTACA TGAAAGCAGCGGAAGCAATTTTGAAAGCTATTGCTTTGGATCGTTCGCTC GACCCTTTGAAAGTCAAAGCTCTTCAATACATTGAAAGAGCTGAACTTTT GCAGAAGATTCTTGATGATAAAGGTAAATATGATCGAACATCTGAAATCA CAgtttattttataaatgaaataaactTGTTACAGACCATTTTTCATACC TTTTTATAGCGTCTGATCATTGGCTTTTGATGTGGCACTCTTAAGAGGAC CTCCTTTGTCTACCTCAAGTGATTTTGGGAATACTCCctctaaaaagggt tgaaaaaaaaactatgaaAACATCAATGTAAACGTAGATTTATAGTTTTA ATCCATCACTCCTTATTATACccatttgatttttaaattttagggAATAC TAAAGATAACAGTCAAGCTATGTCTACCACACAAAATGAAGTAAGTCTTA AAAAATTAACTGAACAATCATCTGGACTCAAGTGATTTGCAGTAATAAAA ATCAATCTAGTCTTGAGACTGTATTTTAAGGACTGATAAATGACCAGTCt agttaaccctttaagtgccaatgtcgtatatatcagacatgggttatgta ggagggcgaagccctcctgtaatgtctagtttgagttagaaatcgttgtt tttggtctaactcgtaggaatcaGATCGGACTTCatggccaagcaaaaaa aatcaaaagtgagtcttttcagcgagattttaagctaaaaatgcaaaaaa atgcaaatatttgacaaaaatccacttttttaagattttgacagtatttt gatcatttttggtcaactcgagtgatccaagaacctccaaatttggccct gattaacttgattctatcctccagcgaattagtttgaagtttcaCCACTC gccacctttctatcattcagtcaggtccgtGCAACTGCTTTAATTATTTC CCttacctaccccccccctttagACGCCGCCCACCCCACCCTTCCTTAAT CGAGCGGTGCCAaaggcgcctaaaagaaagaggagactctaagctatcca accgACTATGAATgcgcttctaactccttctagatctggagatataagcc tttaaagtttgaactagtgattttcttttaaaaacttagaaaaaaactac cgtggcacttaaagggttaaataaaCAGCCATTTTGAAGCATCTATTTCA ACTATAAGACCGTCCAGGACTGGTAAAGCGAGTGGTAAAGAGGGTCTAGG ACTGGTTGTTAGATTTTGTTTATGGTTTGGAGGCTTCTTTAAAACAAGAC CTTGTTCTAAATTTGAATTCTACTAAACTCCTAATACCATACAAAAAAGG CACAATTTTTAGGTACTTAGAAACGCTTGAAGAGTCAATATCTATTGAAT GTTTACTTGTTGTGAGTTATAATACTGCATGTATGTATGATATATTATGA ATGTACCcttaaaaaatttgtttatatattctgttttcttctttagaAAG GTTTAGAGCAAGTGGAATTTCTTCTCATCCAAGCAGTTTCTGAAGATGAA AACGGACATGTGGAAGAAGCTCTCTCCGCTTATGCAGACACCATCGAGCT TTGCTTGGAAAAAGTATGCTGTTTAAATGAAGTCATCTGTTCTctgtgtt tttgtttgtttactcTTATCTTTCCCAAGTGGAAGAGttggaagaatttt tcaaattgaataaacgggggggcctaattaccacggggttggaaaatgga cctttaaaaaccctaaaaagggtcaaaatagactaaatttaggcttttta gagtataacaaggaactttccttttggtagcttggaattttttcaaaaat taataaatgggAGGGTCCTACTAAGGTCCGAGcacattggaaaaaaatcg aaaaattaacaagcgaggGGGCCCCATTTATTTGGCACTTAAGAGTACAa gattcaacaatgacttaaaGCCAAGCATTTCTGTATTCAAACATATATAG AAATTAATgtagaattttcattttatgataACCTATACTGAATAGCATTA TCACCTTTTTATACTGTAGGCTAAACAACCAGATATGCAGCACcacaaag aaaaattgaataagtgGGCAATGGCTGCTTTGGAAAGGTgaatttacttt ttgttttcttttgtgcCTAATTGACAGAAGTCTGGAGTAATAAGCACGTG GGAAACATCTCAAAATGCTGACATGGCCTGCAACGCTTTTAGGTCCAGAC TTCTGGCCAATCTCATATGatgtaataagttggagatttgatatttcaca gaaaagtgctaccaaggggtatttcgggtcccatatcttccgaaggactt ttctgtttgccttgaaatttaacaaacttcttaacctaaggtcgaactac cactggtgtaaaaatgaacattatagcataagtagaaaaaaagctcaatt tttgcaatcgcaaatttaaccgctaaaaattgcgaaatatttcaaccaaa aatacattcaaatatagcgcttatgattctctaaaacaagcaaaacaaat tttcataattatatttgactatcaaaagttacaggcattcttgtttccac tgccaattatgtctggacagactttaatgtATAAACCTGAAAAAAGATTG AACTCagaattcaaatattttgttttttttagagcGGAAGAAATCAAGAA AAGGAAAGCAAACAAGACTTCTCAAGGACAAGCACAACCTCATGTACCTT CGCCTGACAAACTAGACATCAAGAAACTGAGGATCGGTtcggttaaaaat caaaaccagAGTGGGCCTAAAAAAGGTGGTCTGACAAAGCCAGAAATTGA AGTTTTAAGGTAGGTTATAAGATCTGTAATCAATGATTTGCATTTGGGAC ATCAAAATAAATGTGTTTCGTTGCTTGTTCGAGACTTGTTGTTTTTGAGT TAGCCCTTATTCGAGACCCCCTAATAATGttcctttttttaaagtgttat tatttattagttatatattatcagtttttgaaaacaaaagtgaaaaaagt tgattttaaagACACTCTTTTACTTCATTTACATTCTATTTTAGTTTTTG TGAGAATGAATGTGATAATGTCAATGGTTGCcaacatttttttgaagttg aacaATTAAGATTAAGCAAACCTTCCACGTCTCGTTTCAGGACCACATCA TTTGTAAACACGAATAAGTATTTACCTTGGATGGAAATGGATTTGAACGA AAGATTTGCTTATAAAATACCATTCAGGTTAGACATTTATGTTTATATTT TGAAACCCTTTGCTTTATCTATCCGTTTTATGATAATGACTCTCTCACTT TGTTACTATACAGCGAGTGTCCCCTTAATTCTTGAATTTTATGTTATGAA GCAGCCTGGAAAGCTGTTCAAGCTGAATTATGGAATTCTCTCTGTGCTAT CAAATAAGTTAAACCTTTATACCTTGGATAGTCATAATGATTGAGTATCA ATATCTAAAGGTAATAAAAAGGCTtccttattacacgaaaataagtAGAC ATTGAAATTTACACGCAAAAAAGTTAAGAGAAATTTTATTTGCATTTTCA AGGACaccggctggttttaattaaagggGGTTTtaattaacacgaaattt ttgttAATTACCTATCTACTGATTTTCGTGTAATGAATGAATTACTCGAT GCGAAATTTCTTGAAAGTACTTATAGGTCTGCTTTTCTCTACCTCCTAGC GATCCTGATGGTCTCCTCCCACTAgcaccaaaacaaaaatcaaggcTTAC AGATTGGGTTAGACCGTCCGATATTTGCCAAAATCCACAAATGATTTACG CAGTCAACAGTTTCAGTATTAAACAGGTAGGATATTGTAAATAAAATCTC CCTCCTATTTAAAAGAAGATTATCAGCAGTGTTTTAGATTTCGCTAATGA ATTATGTTTTTCATAAATATTATATGTGATGTACTTGGATCTCTACCTTT AGGTTGTAAAACCTGGAAGAGATTCAGCTCCCAAATAATATTGTAGGAAA AGttgtttctaaaaatttttctctTCATTAGACCATAGTTTCAGATTGTT CGTTTGTGGCTTCACTGGCCATCAGTGCTGCGTATGaacgaaaattcaaa aataaaatcctaacAAAGTAAGTTGCTGACCCTCTCATTTAATCAAATTC TTGCCAATTacttcaaatcattctttttcttttgattctttttcttcatc agtgtTAAACGTTCTTCCGTCCTAGTGATGATTTACacctaacagctgat tggttgtaagtgacgtaaaaccagtcaatacgtcacttgcaaatAACCAG CTGTTAGGTTCGTGATAAGATACTTTCCAATCACAAAATTCAGTGAAATT CCACAAAATTTGGAGAAGAATGTTTATTTCAAGTTCCGTCGAACATAAAG ATCTTTGCTTTGTCCACTGTTTGATgacttttatgaaaaaaaaaacacct ccTTCGTATTTTGTCAAAGTTACCAAAAATCACTTTCAGTTTCATAAGCT CTTAAAAATTAACTTGATATTTTGTATAAACTTAAGAGAGATTTTTGCTG TTTCTTTTAGTATAATTTACCCACAAGATCGTGATGGGAATCCAATGACA AACCCATGTGGGAAATACATGGTCAAACTATGGTTCAATGGAGTGGCCAG AAAGGTGAGATCAAGGAGTTTTTTAGGATTCAGGTCCATACTTTCACTAG TAAGGCAACAGTTTCTTTGGGTTTTCCTGTCAAATTTTCTGTATTTATCA AATGTGTTTGTATAAAAGAACGATAAACATATATAGACTGTTTATGTGAA GTGAAAACTATGTAGAATTTAAAAGACTtggattttgttaaatttaggga aaaatgTTCATTAATACCAGATAatataataatacaataatgtGAAAATA ATTGACTTCTGATTCACCTCCAAAATGAATCTtttaatgggctattccag agaAAATCTGAGGAGGTTTTTTGGGAAAGctgaccccctggatttttttt tcaatttttcatttttttggaccaccctagattttcgacctcgttttaCT TATCACCCTGGATTATCAACCTCATATTACTGACCACCCTTGATTTTCCA CctaattttactgaccaccatAGATTTTTATCATCGAAAAACCAgaccct ggattttttaattTCCAGACCAGCCTGAACtccacacctcctcaacatag ggagTACAGAGtgtttctggaatagcccaatataaTAATTAGTGAAAAAG AATAGCAGGTGACCCaaaaaaaGTAAGGGTTTGGAGAGTGAgtaactgtg tccgaaataatttgaatttttattaaattctttttttccgttgtaaagag gaaaggcaaacttaaaatttggtgcataactttttaaaacaaGCTGATGA ATTTTACTGGTTTCATGAGATGATTTATATTGAACCAGATTTTTATTGGC AAAGTTGTATCTATACACTATATATCtgtgaagaaattcatagaatttct gtccaactatcttctttcaggagatttgggtggcagagcagcacatgcat ttcgtccttattaggactcatcagcactgcatactgcactcTGGTTAGGC AGATCGAATTGCCTACCATCTCAcgccataaaactaattgtggTGCAGAC TATATACAACTTTAACATTTTCCCCCTTTGAACGTTATAGGTTGTTATTG ACGACCGACTACCAATGGGGAACAGAGGCGAATTACTAtgctctttttca caaaataaagATGAATTTTGGGTCAGCCTCTTAGAGAAAGCTTATATGAA GGTAAAATTCTCTGTTTtgaacacattttttataagaacaaactgtatca gaacataaagcttcgatatccaaaatatcaagaacaagttaagaacttta agaattttatggcttcgcggactcgaatacacccaatttcttaggaaaaa gaaacaaaaagactcacaaaaatggtggaaaaaagaacatgttcaaaata tttttaggcttggCACTTAAATGATTAAGAAtatttgaaggcttcaaaaa ttctgattattcttataaaaaaagcatataTAATTGTGAATATTGCCCTT ACGTATTACGTATCAATGTGGAGAtggatttctcccaattcaccgtctct gaccagtcagtagacaagaattcacttccagctctaccGAGTGGCAATTG AGTCCTCGGGTTCCAtatggacccgtagctcaatgaTAGAGCAAATGCCT GCGAATGtcatggttgtgagttcgagtctcgccggatccgttggtttccC AActgttctggtggctggtcagaagacaacatgagagcgactgtattcac tacATATATAATTGAATTCACACTGTTTCAACTTACAAATATACAGCTTC ATTATAGAATGTCTTCCTCCTGAAATAGTTAGCTTgttatcatatttttt tttgtccTCTGGAAGGCTTTTCATTTAATTGGATTTATTTTCCTTCTAGG TTATGGGAGGATATGACTTTCCTGGTTCAAACTCAGTAAGAATTTGTTTG TAACCTTTTAAATAGTTTGCACTCTTCTCCCTccttaatttttaaaaaca acttttagAAGTTCCTTATGAATGTGAAAAGTGACTCCACTATTTCCTTT CGCGTTCTTTTTGCCAGCGATTAagcatattttataaaaaatgaatttta cagGTAGGAAACTCTGGAAAGGgtcatgaaaatattgtctATGGAGAAAG TATGATGAATGATATGGAATattgtcaaattttttgaaaaatctcgtAAT TCAATAAGTaatcgaaaaaccttttttgataCATTTACCAATTACAAGGG AAAGGGATGTATCACGCATAGACATATCACAATTTGtggaaatttaagaa aaatatttgcaaaCAATCGCAAAAGGAGTTggaaaatgtatttttcattt tttttgtagagGGGGGATCCATAGTGGGGGAGAAGGTTTTCAGGGGAAAA AGAAACATTGAAGGCAAATTATGGGTTCTATTTCTGGTAATAtaactcat tttcattttcagaacaTAGATTTACATGCGCTGACTGGCTGGATTCCAGA AAGAGCATCattaaaatcaaatgaaattgaCCACACTATTTTGTTTGAGC GACTGACTAAAGGTCTAGCTCAAGGTaattaatttattggaaaattattt caatttatttgaaaattatttcaatttatctCATAACGAGGCTTACTGTG GATTTGATAGCTTTAAAAAGGTTTAATCTGTGTGTCATACACACAGATTT ATTggataaaacactagatagagctactctgtacaTACCTAGCAACGACA GAAACTTTTGCAACTAATACTGAAGGCCACACTAGAAACCTTGGTTTTCa ctgttgaaacttttttaacACTGCGAggacttcaaaatttcaagggtCTC GCAAGCTAAATTGTGAGATCACTTCATCCAAGATAgcaaattattttgct tcaaataggGTAGGAAAAGTTCTATCTAGATATCTAGATATCTGTGTTCA TACAGCTTCTTGTAATTTCGATCCGATCTGTAGGTGATGTTTTGATCACA GCAGCAACTGGCCCTATCTCTGAATTAGAAGCGTCGAGAGCAGGTTTGGT ACCAACTCATGCTTATGCTGTCCTCGATATGAAACTTGTTGCTGTAAGTC TCAAATACAATGACATTCAAATCTTCAGATCCATATTTAACCGAACCAAA TGTGACATCTTTCAGAATGAAGTTGGTATTGGAGTTGGCcttccaaataa aaaagaaactgtcattcaatataatgaatttttactttattttaatCAAA TCAGCTGAATTATTCTTATCTTGTCAGATTTGCGTTACACCTCATGGAAA GTGGACCTCAATGAGACAATGATATCTGGAAAGTTCtttttttAGTCATT GTTTACTAAAAAacatgttttctcttttttagggTAAACGCCTTTGCCAA TTGAAAAATCCATGGAGTCATTTAAGGTGGAAGGTATGATAATTTtccat ttctatttttcataatttcttaTCATTTGACCATTAGAAATTTAGTGGTA AACTGCTTTGAAAGGATGATTTCCCTCAACTCCTATGTATACAGAATGGT GTAGTAGAGGAAATCAATAGAAATACCTTATTCACCTTATACAACTACTC AAATTATAAACGCGAACTGATTATCCTCGCGTAGATCGCGTAGACAACCG TTTAACAAATTTGAGCGGAAGTAATTTTCGAAAGGCCTGACTTTCGCATT TTGCCAGGATACTTGATTAGTGGAATAAAGCGTAACGAGATACATTGTTA ACCTTTAAAGCATCAATGATGTAGTTTACGAAATCATGAAACGTTGTACG GCGTAGATTATACTTTCGGCGTAAAAACTGTCTTTAATTCTAACTTTGAA AGTGTCAATCCAAcaagtatttttccttctaaGCTGttttttcatgtgga aattttcatttttatggcagacagacagacagacggacggacggacggac ggacggacggacggacggacggacggacggacggacggacggattaaaaa tgataaaatcaatgaaaaatttaacttgtttttttatttcttaatcAGGG GAATTATTCGGAAACAGATGACGAACATTGGACACCAGAATTAGAACGTT TGTTGAATTATGATCGCAAGAAAGCAGCTCTTAATGATAACGGTATTCAC AAATGCTTTTACTTTCATTTAGTCTTTCGAAATAACCCAAATTCTCTTGG TGGAATCTAGACtttatttcaattcttttggctGACAATCCCTATTTGTT TCAGTAATGCTTGTACCAGATTAAATCTCTATTTTTTAGGATATCATAGA ATAGAATCTAAAATGaggaaatttctagcatctaatggtatttttgtctc gattcTCCGTCCAATATAGAATAGAATCTTTATAACTTATAGAAAATAGA TAGCATGTTAGGTTTAACCAGCTAAATTAATTATCTTGCCAGGAGTGTTT TGGATCAATTGGGAATCATTACGTCATTTCTATGACGTCATGTACATGAG CTGGAATCCAAAATTGTTCCCTTACAGATTCACATATCATTCGTAAGTCA TCTCAATTGACATGTTTGTAAGAGAAAGGTGCGTCAAGCATATTGTTTGA TCTTTGTTTGACTCAGCTGGGGATTTCACCCACTGCACGTCTTTTTgtat aagaacgtccaaaattttgatcttcttaactttttgagttttaagcctaa aaatgtttttaacatgttctttattttactattttgcgagtatttcttgt ttattttcttaaaaaaatggacagagcgtcgcatcaaaataaaaaagttt taagtttattttttggtaaattgAGTTATGATCATACCGATGCTTTAAAC CCCATATTTTATCGATTTTATTTTGCTAAAATCCATCAAAAGCTAACCTA AAGTGGCCTAATTTTAGGCTTTTTTCACTTTACTTTTAGGTTAAAAAATA GGGCTCAGTCCAGCATGGAAACAATTTTAGACTTAAgcttttttaacaca aaaatatttcaaaagttaatgGCTTTTCAGGATTTcaggaaaaataattt aaagtcgattttctcaaaacgACAAAAATGAACtcaaagcttttttattt tgatgcgacgctctgtccatttttttaagaaaataggtTTTATAagggtc tgcaaagccttaaaatttcttaacttgttctgaaTATTTATCCATCGaag gcttatgttcttatatagtttgttcttatcttTGTGCTACAGCTGCTTTC AATGACATTATTCTATCGTTTATGGTTTCGCTTTCAATTTAAGTTGATTT ATTACCAAATTGTGATAGTGGGGATTATTTTAGAAGTTGCGAACACTGGT GTTCTCGACTATAGTCTAGACTTCAATATCAAAACTGATGATGGATCAaa agacaaaaatattattttctttgtacAGGAAATGGAAATCGGCAGACGGA CCGATCAAAGACGCTTACAACATTGGCGAGAATCCTCAATATAGCTTAGA GATCCAGTCACCAGACAAGGAGCCTACTGTTTGGTTGCTTTTGACACGAC ACATCACTGATAGAGTAAgtttttttgtcatcttttcCCTACCGGAAGTG ATTGAGAAATAATATAGTGGTGTCTCTTTAACTTGAACTCCTAGAAGTCC AATTTTTCCTTTACTCGAACAAGTTTCTCCGTGCCcgctcgagttataga gactccactgtatgcAGTCGAATCATAACTCTAACCATCGATTATTCCAT TCTTCTTTAATTCCACTTTGAAGACTTGACTGAAAGATAGAATTGGCCGA AACATCAGGTCAAAAcaggatgaaaaagatcaaagcagTGTGCCAAactg ggcagattctcttacgaaGCCATGACCTTTAGAGTGCGTACGTGGCATGC GTGGAAtgtcagaatctgctcggagataaCATTGATCCCTTTTCAAAGGC AAAGATATATCACTATATCTGTGCCTATGAAATGTTCGATCAAAATCAAT GTTCTCGTTTTAGGACGATTTTGcagaaaataaggaatttatCACGATGC ATGTTTTCAAATCAGATGGATCTCGTATATACTATCCAGGTATATAATAC ATGATGtttgcttttttaacacatgttttgatttttaaccgactttttat tggtttaACGAATGTAACTTTCTGAGTTAATAGCTGATTGATTTGTGGAA TATTTTTAATGCCAAGTACAATAGTTGTGTCAATCACGGaaaaaaaCTCC ATTTGAAAGCTTTGTAGTGTTAtctagtttttttaataaaaaaactcaaa cacCCTTTTCCTGCGCGTCATATGACGTCACACGGGACAAATTCCTGTTT TTGGATGACTCTGTGAGGaaaaaaaTTGCATAAACAATGTTGATATGAAT CCACTTCTGTGTGACCTACCTTAATtttgtctaatgtcgacatccctcat ctaattccgacaccctttttatcagctgaaaatctttttttctttgctta gttgTCAGGGAGGACAAGGAACTTGAgaaggaataatccttttttcaatc agtgattcaaactttcatattattcctgtctctaaagaagggtgtcgaaa tcagacgagggatgtcaatattagaccatattactcttaggtgccaaata aacgggggggttgaaaaaaattttcaaatcaaataaacggggggggacct aattaccggggggttggaaaatggacttttaaaaaccctaaaaagggtca aaatggactaaatttaggctttttagagtaaaacaagaaactttcctttt gggagctgggaattttttcaaaaattaataaacgggggggggggggggtc ctaataacgtccgggggggttggaaaaaaattgaaaaattaacaagcggg gggggggcgtttatttggcacctaagagtacggTAATTGACCATAGCCTT CTACTAAACTGAAAACCTGTGACTAAGCTATATCCACCGTTATTTATCGA GTTTATTCGAAAGTTGTACCCCCAATAAGAAGCTGTTGCAGTTTTAAAAA CGGCGTTAAACGGCGttaaacggcgctacatcacaaGTGTGCAAGAAAAG TAGATCTATTGCTATGCATTACActgctattcatgatatgcaccactgga aagtcttctgagaacttttaaaattttccacccataacgtcacttaaaca atagaaaaagtgacgtattgggtggaaaaagaaacagaaaagttgcataa tttcctgaagtcattgcagtggtgcatatcatgaattgattaTTTCTAAC ATTAGGGTCACAGGCTTTTTTATGAGCATATTCTTGTTACCCTTTTCTTA TAGACGAGAAATATTTGGAAGGGACGAAGATCAATTCACCTCACTACTTG AGCAAAATGAAACCGCCACGTGGTACCAGCAAATTCACTGTCGCTGTCTC GCAATACGAAAAAATGCACACTATCTACTATTCcattaaagtaaaaataa atttttttaaacttttcagcTTGAGGAGAACGGCGGGAAACGGTGTCtta aatttcaattcattttgtttaaatttttaattaaagcTGACAAATACAAA GTTCAAAGTTCAAAGTTCAAATCTTAGTCAGATTTCTGTCTCAGTGAGGT ACAAACTCAATAAAATTCtgtaaaagttttttgtttaaagTCCACTTCTG TCTGAGACAAGAAAGCCGAAATCTACATTAtatcaagtttttcactttta ttatattttgtcTGAATAAACCTTTAAACCTTTTCTTTCAGGTATTTTCG ACTGCGAAATTTCACATGGCTCCCGTTCCTGATATCTACAGTTCCAAAAA GAGGGTATGGATTGACTTGACACTTGAgtcgaacaatttttgatagaTTC AGGggtttttctaagcactttttttatgtccgtataccggccaaaatact caatccaaagaaatattttcaactaaaaaaaaaataacaaatacaatcta cataaaattttttttttgagagcttaGCCCTCTGAACCCACTAGGGCTTC GCCCCGAACACACTAGGGGGCTTCAAAGCGCCCTCAGACCCCCAGATTCA TCAATGATGCCCTTTCAGGCATTAGAAACTCAATCTAAATATACAAAACG GTCCTTGCTCAGAGTGCTTaaaaaaaTCCCTGTAGATATTCTTGGATCAT CCGAATTCAGTTATCCgaattaattcttttttttcttgaataaaagGTTT TTACACTGATTACCAAAATCCTATCCCTAAAAAGATATTTCTAGCAAAAG AGAAATCTTATTTTATTGCATATATTTTTAACACCAGCTAACTGGTGTTA CCCTGACATACTGACATACTAAACTTACCATTCGAGATAGGTATGAATGG AATATGGATAATTGGTAGCTTATATgatcgatgttttttttttgctttag atTACATGTCAATGGACAAGTCAAACGGCAGGTGGAAGTCGTGCTTCACC AACTTATGAAAACAACCCTAAAATACCACTAGAATTGATTGCTGACCTGC CTGCCCATCTGCTGATCAAAATCGAAGCTAATAGGTACAACAGTACAATC TTTATAAttgataaattcaaaattaacaaCGCTTAATTGAATTTTGGTCG CTGTTTTTACTCTCGAATCGTTTATtctatctttaataattttgacGAGG AccaattttggtgaatttagcGAGTTTTGTTGAATAAATAATTGCTGCCC CGACAAAATTgttcttgccaaaattaaaataattacgTTACtagccaaaa taagttctttcCAAATTTAATTCTTACCTAATCTAATTATTTTTACCTAA TCTAATTATTTTTGCGACTTTCAcctctcgccaaaattaattcccgtAAG GTATTTACTATGAGTTACTTGTAAAAGTGTTATGATTTGTATAATGAACA ATAGCCTTATTTTTGGTCGCTTTTTCAGGAAATTCGCAGCGGCTGTGGAA CTGCGCTCAGCAGATGGTAGTTTCTCCAAAACTTCTGGTGACTACAGGTA ACGTTCATTtggaaatgatcaattttcgAATGTTCCTTCCTTAAATAAct attgaaacttttttgtttgaaattcgCTTTTTGTCCTTTTGGTGCATAAA TGACCTCTTTTAAATATTAGGTTTTGAGACCTTCCACATTGATAGCCAGG GACAATTTCATACGCATCGGAAGATGCAGGTTACAGAACAGTGTGTGCTT TTCCTCGTTATCTTGACCATTTCCAGTACTGTGTACTGTATGTAACGTGC AATGACCAAGCATCTGTTCACATCCCTGTATCACAAACTTGGTGGATCTC TCTACCGAAAATCGTCTCCGTTGAAAAATGCCAGGAAACTTCATCCCCTT TGCAAAATTCTCTGAACTCTGAAAATTATCACGGCGTGCTGGAGATCACA AAATCCCTTTGTGGTtcaaaactgagaaaaataGTGTCCGAGAGTAAAAT CCCCTACATAATGTTTTATTGAATCCATACACTAACTTTTCTTTCTCTCT TTAGATGGGGCTTCGTTGCGTTTACTTTGCGTGACGTAAAGCCAGGCCAA TACGTCATCATTCCGTCCACATTTTCTCCTGGTCAAGAAGGGCCTTTCTT TTTGGAAGTGCAAGCTTCTTGTGCTTTTAAAATGTAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000113_pilon:619966..634402+

>XLOC_042900 ID=XLOC_042900|Name=XLOC_042900|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4776bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:619966..634402+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGATCCTAATGCATTGATCATAAGTGGCACTTCTTTTGCAGAACAGGC
CATCCGCTATGATCAGGAAAATAATCATGAAGAAGCACATTCTAATTACA
TGAAAGCAGCGGAAGCAATTTTGAAAGCTATTGCTTTGGATCGTTCGCTC
GACCCTTTGAAAGTCAAAGCTCTTCAATACATTGAAAGAGCTGAACTTTT
GCAGAAGATTCTTGATGATAAAGATGGATCCTAATGCATTGATCATAAGT
GGCACTTCTTTTGCAGAACAGGCCATCCGCTATGATCAGGAAAATAATCA
TGAAGAAGCACATTCTAATTACATGAAAGCAGCGGAAGCAATTTTGAAAG
CTATTGCTTTGGATCGTTCGCTCGACCCTTTGAAAGTCAAAGCTCTTCAA
TACATTGAAAGAGCTGAACTTTTGCAGAAGATTCTTGATGATAAAGggAA
TACTAAAGATAACAGTCAAGCTATGTCTACCACACAAAATGAAggAATAC
TAAAGATAACAGTCAAGCTATGTCTACCACACAAAATGAAaAAGGTTTAG
AGCAAGTGGAATTTCTTCTCATCCAAGCAGTTTCTGAAGATGAAAACGGA
CATGTGGAAGAAGCTCTCTCCGCTTATGCAGACACCATCGAGCTTTGCTT
GGAAAAAaAAGGTTTAGAGCAAGTGGAATTTCTTCTCATCCAAGCAGTTT
CTGAAGATGAAAACGGACATGTGGAAGAAGCTCTCTCCGCTTATGCAGAC
ACCATCGAGCTTTGCTTGGAAAAAGCTAAACAACCAGATATGCAGCACca
caaagaaaaattgaataagtgGGCAATGGCTGCTTTGGAAAGGCTAAACA
ACCAGATATGCAGCACcacaaagaaaaattgaataagtgGGCAATGGCTG
CTTTGGAAAGagcGGAAGAAATCAAGAAAAGGAAAGCAAACAAGACTTCT
CAAGGACAAGCACAACCTCATGTACCTTCGCCTGACAAACTAGACATCAA
GAAACTGAGGATCGGTtcggttaaaaatcaaaaccagAGTGGGCCTAAAA
AAGGTGGTCTGACAAAGCCAGAAATTGAAGTTTTAAGagcGGAAGAAATC
AAGAAAAGGAAAGCAAACAAGACTTCTCAAGGACAAGCACAACCTCATGT
ACCTTCGCCTGACAAACTAGACATCAAGAAACTGAGGATCGGTtcggtta
aaaatcaaaaccagAGTGGGCCTAAAAAAGGTGGTCTGACAAAGCCAGAA
ATTGAAGTTTTAAGGACCACATCATTTGTAAACACGAATAAGTATTTACC
TTGGATGGAAATGGATTTGAACGAAAGATTTGCTTATAAAATACCATTCA
GGACCACATCATTTGTAAACACGAATAAGTATTTACCTTGGATGGAAATG
GATTTGAACGAAAGATTTGCTTATAAAATACCATTCAGCGATCCTGATGG
TCTCCTCCCACTAgcaccaaaacaaaaatcaaggcTTACAGATTGGGTTA
GACCGTCCGATATTTGCCAAAATCCACAAATGATTTACGCAGTCAACAGT
TTCAGTATTAAACAGCGATCCTGATGGTCTCCTCCCACTAgcaccaaaac
aaaaatcaaggcTTACAGATTGGGTTAGACCGTCCGATATTTGCCAAAAT
CCACAAATGATTTACGCAGTCAACAGTTTCAGTATTAAACAGACCATAGT
TTCAGATTGTTCGTTTGTGGCTTCACTGGCCATCAGTGCTGCGTATGaac
gaaaattcaaaaataaaatcctaacAAAACCATAGTTTCAGATTGTTCGT
TTGTGGCTTCACTGGCCATCAGTGCTGCGTATGaacgaaaattcaaaaat
aaaatcctaacAAATATAATTTACCCACAAGATCGTGATGGGAATCCAAT
GACAAACCCATGTGGGAAATACATGGTCAAACTATGGTTCAATGGAGTGG
CCAGAAAGTATAATTTACCCACAAGATCGTGATGGGAATCCAATGACAAA
CCCATGTGGGAAATACATGGTCAAACTATGGTTCAATGGAGTGGCCAGAA
AGGTTGTTATTGACGACCGACTACCAATGGGGAACAGAGGCGAATTACTA
tgctctttttcacaaaataaagATGAATTTTGGGTCAGCCTCTTAGAGAA
AGCTTATATGAAGGTTGTTATTGACGACCGACTACCAATGGGGAACAGAG
GCGAATTACTAtgctctttttcacaaaataaagATGAATTTTGGGTCAGC
CTCTTAGAGAAAGCTTATATGAAGGTTATGGGAGGATATGACTTTCCTGG
TTCAAACTCAGTTATGGGAGGATATGACTTTCCTGGTTCAAACTCAaaca
TAGATTTACATGCGCTGACTGGCTGGATTCCAGAAAGAGCATCattaaaa
tcaaatgaaattgaCCACACTATTTTGTTTGAGCGACTGACTAAAGGTCT
AGCTCAAGaacaTAGATTTACATGCGCTGACTGGCTGGATTCCAGAAAGA
GCATCattaaaatcaaatgaaattgaCCACACTATTTTGTTTGAGCGACT
GACTAAAGGTCTAGCTCAAGGTGATGTTTTGATCACAGCAGCAACTGGCC
CTATCTCTGAATTAGAAGCGTCGAGAGCAGGTTTGGTACCAACTCATGCT
TATGCTGTCCTCGATATGAAACTTGTTGCTGTGATGTTTTGATCACAGCA
GCAACTGGCCCTATCTCTGAATTAGAAGCGTCGAGAGCAGGTTTGGTACC
AACTCATGCTTATGCTGTCCTCGATATGAAACTTGTTGCTggTAAACGCC
TTTGCCAATTGAAAAATCCATGGAGTCATTTAAGGTGGAAGggTAAACGC
CTTTGCCAATTGAAAAATCCATGGAGTCATTTAAGGTGGAAGGGGAATTA
TTCGGAAACAGATGACGAACATTGGACACCAGAATTAGAACGTTTGTTGA
ATTATGATCGCAAGAAAGCAGCTCTTAATGATAACGGGGAATTATTCGGA
AACAGATGACGAACATTGGACACCAGAATTAGAACGTTTGTTGAATTATG
ATCGCAAGAAAGCAGCTCTTAATGATAACGGAGTGTTTTGGATCAATTGG
GAATCATTACGTCATTTCTATGACGTCATGTACATGAGCTGGAATCCAAA
ATTGTTCCCTTACAGATTCACATATCATTCGAGTGTTTTGGATCAATTGG
GAATCATTACGTCATTTCTATGACGTCATGTACATGAGCTGGAATCCAAA
ATTGTTCCCTTACAGATTCACATATCATTCGAAATGGAAATCGGCAGACG
GACCGATCAAAGACGCTTACAACATTGGCGAGAATCCTCAATATAGCTTA
GAGATCCAGTCACCAGACAAGGAGCCTACTGTTTGGTTGCTTTTGACACG
ACACATCACTGATAGAGAAATGGAAATCGGCAGACGGACCGATCAAAGAC
GCTTACAACATTGGCGAGAATCCTCAATATAGCTTAGAGATCCAGTCACC
AGACAAGGAGCCTACTGTTTGGTTGCTTTTGACACGACACATCACTGATA
GAGACGATTTTGcagaaaataaggaatttatCACGATGCATGTTTTCAAA
TCAGATGGATCTCGTATATACTATCCAGGACGATTTTGcagaaaataagg
aatttatCACGATGCATGTTTTCAAATCAGATGGATCTCGTATATACTAT
CCAGACGAGAAATATTTGGAAGGGACGAAGATCAATTCACCTCACTACTT
GAGCAAAATGAAACCGCCACGTGGTACCAGCAAATTCACTGTCGCTGTCT
CGCAATACGAAAAAATGCACACTATCTACTATTCcattaaaACGAGAAAT
ATTTGGAAGGGACGAAGATCAATTCACCTCACTACTTGAGCAAAATGAAA
CCGCCACGTGGTACCAGCAAATTCACTGTCGCTGTCTCGCAATACGAAAA
AATGCACACTATCTACTATTCcattaaaGTATTTTCGACTGCGAAATTTC
ACATGGCTCCCGTTCCTGATATCTACAGTTCCAAAAAGAGGGTATTTTCG
ACTGCGAAATTTCACATGGCTCCCGTTCCTGATATCTACAGTTCCAAAAA
GAGGatTACATGTCAATGGACAAGTCAAACGGCAGGTGGAAGTCGTGCTT
CACCAACTTATGAAAACAACCCTAAAATACCACTAGAATTGATTGCTGAC
CTGCCTGCCCATCTGCTGATCAAAATCGAAGCTAATAGatTACATGTCAA
TGGACAAGTCAAACGGCAGGTGGAAGTCGTGCTTCACCAACTTATGAAAA
CAACCCTAAAATACCACTAGAATTGATTGCTGACCTGCCTGCCCATCTGC
TGATCAAAATCGAAGCTAATAGGAAATTCGCAGCGGCTGTGGAACTGCGC
TCAGCAGATGGTAGTTTCTCCAAAACTTCTGGTGACTACAGGAAATTCGC
AGCGGCTGTGGAACTGCGCTCAGCAGATGGTAGTTTCTCCAAAACTTCTG
GTGACTACAGATGGGGCTTCGTTGCGTTTACTTTGCGTGACGTAAAGCCA
GGCCAATACGTCATCATTCCGTCCACATTTTCTCCTGGTCAAGAAGGGCC
TTTCTTTTTGGAAGTGCAAGCTTCTTGTGCTTTTAAAATGTAGATGGGGC
TTCGTTGCGTTTACTTTGCGTGACGTAAAGCCAGGCCAATACGTCATCAT
TCCGTCCACATTTTCTCCTGGTCAAGAAGGGCCTTTCTTTTTGGAAGTGC
AAGCTTCTTGTGCTTTTAAAATGTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_042900XLOC_042900-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000113_pilongenomesc0000113_pilon:619966..634402 +
Properties
Property NameValue
Aaloc2257-2388:14306
Aaloc2188-2253:13730
Aaloc2053-2184:13201
Aaloc1990-2052:12542
Aaloc1855-1989:12106
Aaloc1777-1851:10764
Aaloc1642-1776:10180
Aaloc1543-1638:9195
Aaloc1447-1539:8799
Aaloc1396-1446:8133
Aaloc1288-1395:7736
Aaloc1174-1284:7213
Aaloc1138-1173:6650
Aaloc1027-1137:5841
Aaloc934-1026:4712
Aaloc847-930:4182
Aaloc721-846:3851
Aaloc634-717:3292
Aaloc457-630:2784
Aaloc388-453:2170
Aaloc271-387:1597
Aaloc226-270:496
Aaloc1-222:1