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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000113_pilon:604613..610343+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_042898 ID=XLOC_042898|Name=XLOC_042898|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5731bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:604613..610343+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) atgAATCGAAGTATGAATAACAAAAATCCAAAGATATTTGTCTATCTGAT
ATCAGGCTTTCTTTTGGGGCTGGTTATACGTCTCAAATTTTCATCGTCAT
ATCAAGCACTTTCGAAATGTCACGATAAAGTTATTTTGGATCAAAAAGAA
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CGTTAGATGAGATTCTTAAACAACAGTTTTTGGCAACTCAGATGGTAGTA
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ACAAGctatcaatcaaaaatatgGAAATCGTAGATTGGAATTGTTAAATG
GATATCACAGAGTTGATCCGAAAAGAGGTATTTTTACTGccttttgaatc
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AacttgaaaatagaaatttgtcTGTTCAAATTAGATATACCCAGTTTGAA
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TTCTGTTTCTTCTGTTTCAATGAtggttactcttaggtgccaaataaccc
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AATATCTGATTGAAATGAAGGACAAATCGTCAGATAAAGTGTATCGTTAT
CAGTTACTTCGACCTTTCTCCAGAGTTGAATCACTTTCAATGCCAGCTGC
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TAttataactcaaatgtctccttaactcgaacaagttttcacctcccttc
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GAATTACTTGTGTttaggcttttcctgaaaatttgatTCTAAAATTCTAG
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gtACCTGGACCTGGAAAATCTAACCTCCTCAACATCTGGAATAGCCTAAT
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aattaaaatttcagtcaaatctttacttgtctgtacacagacccgatatc
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CCCCCAATGCAAACTTCTTATATTTTCAGATACAAGCAATCATACATGTG
GGCTCAATTACCATGGTTACAAGTTGGTGTTAAACACATTTCTGATGTCT
TGGTGATGGACATTGTGTCAATGAAACTACCTTCCAACGCTCTTATACTC
TTGCTCTCACATCATAATCATTTCACTGtcaattttttaaacagatGTCG
TGTTAATGTAGTGACTGGATTGCAGGTACAGTGGAACTTCTTTAACTgga
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ATTTCTTTAGTTTCATCACCGTAATTAGATTCACCTTCTAAATTCAACTA
GAGTGCAGAAGGAGTGTATTGAAGCATGTAATTAGGCACAGGATATTGTC
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TGTGTCATCGCCATGTATCGAAATCTTCCAAAGATTTTTCTACGATTTTT
CCTCAGAGACCAGTCAGACATATTTTTAACCATTCTGTCAGTATCTATTG
CTTGATAATCACTTAAAATGAGAGCACACCATTGATTCTATTaacaattt
taatgttttttacttttcaggtctttttCCCCATTCCTTTCTTGGAATAC
AATCCAGACATTGTTTACAATGGCAAGCAGAAACCAGCATTTTCAGAAGT
ACACACCACAACCGGGTTCTGGGGTCGAGACTCATATCAAGTTGGCTGTT
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GATGAAAACTTGCCTAACAATAAAACTATTCTTGGTGTTTTTGAAGGATC
CAATCTTAATGTTTTCAGAGCTTTGGATAGTGAACTTCATACTTGGTATG
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TTTAAGAATTCACAAAGACTTGGTAATAGAGCTCAGTTAGCTCaagtttt
ctttgattttaataaTTCGAAAAAACCATAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000113_pilon:604613..610343+ >XLOC_042898 ID=XLOC_042898|Name=XLOC_042898|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4338bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:604613..610343+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) atgAATCGAAGTATGAATAACAAAAATCCAAAGATATTTGTCTATCTGAT ATCAGGCTTTCTTTTGGGGCTGGTTATACGTCTCAAATTTTCATCGTCAT ATCAAGCACTTTCGAAATGTCACGATAAAGTTATTTTGGATCAAAAAGAA CAATCTAAATCTGGTCGAAGCATAAATATAGAAAAGCCAGTAACAGTAAA GGCAAAACCAAATCGATTTAACAATGACTACAGGCCTTATTTTGTATACA GTGAGCTTGGTTTCAAAAATCTAATGTTTGTTGGTGTCAAAATAAGTGAA CAACAACTTATGACCAATGGTGTGACCATTAATAACACGTGGTCTTCAGA TGATCAGACTGTTGTTTTCTTCACACCGTACTCAAGAGACAGTGAATTTC ATAACCGATTTGTGAAGAAATTAAACCTTAACGTCATTCAATTACCAGAT ATTGTGGACACGTCGAGTGATTTGGAATTTTCATTGCGTATTGTACAATA TATGAAAGATCACCATTTGAATAAATATAACTGGTTTATTTTGAGTAATG ATAATGTTTATTTGAATATGGTTAATGCTGGAGATCATTTAAAACGGTTG AATTCGACACAACCAATCATACTGGCAAATAAAATTAAAGGAGAATGCTC TTCAAGCCATGGCGTTATAATGAGTCATACAGCTCTTTCAAACTATTACC AAACTGATGGAGCGGGTTTTCCTTCTGGGTTGTTATCAAAACTGGGAAAT AAGGAAACACTTTTTTGCatgAATCGAAGTATGAATAACAAAAATCCAAA GATATTTGTCTATCTGATATCAGGCTTTCTTTTGGGGCTGGTTATACGTC TCAAATTTTCATCGTCATATCAAGCACTTTCGAAATGTCACGATAAAGTT ATTTTGGATCAAAAAGAACAATCTAAATCTGGTCGAAGCATAAATATAGA AAAGCCAGTAACAGTAAAGGCAAAACCAAATCGATTTAACAATGACTACA GGCCTTATTTTGTATACAGTGAGCTTGGTTTCAAAAATCTAATGTTTGTT GGTGTCAAAATAAGTGAACAACAACTTATGACCAATGGTGTGACCATTAA TAACACGTGGTCTTCAGATGATCAGACTGTTGTTTTCTTCACACCGTACT CAAGAGACAGTGAATTTCATAACCGATTTGTGAAGAAATTAAACCTTAAC GTCATTCAATTACCAGATATTGTGGACACGTCGAGTGATTTGGAATTTTC ATTGCGTATTGTACAATATATGAAAGATCACCATTTGAATAAATATAACT GGTTTATTTTGAGTAATGATAATGTTTATTTGAATATGGTTAATGCTGGA GATCATTTAAAACGGTTGAATTCGACACAACCAATCATACTGGCAAATAA AATTAAAGGAGAATGCTCTTCAAGCCATGGCGTTATAATGAGTCATACAG CTCTTTCAAACTATTACCAAACTGATGGAGCGGGTTTTCCTTCTGGGTTG TTATCAAAACTGGGAAATAAGGAAACACTTTTTTGCAATTCCGAACGATT TCTTAATATCCAAAGCAGCAATATGCAACGAGTTTTAGGAGATGGAAACA CCCTAAATGTTATCTCTATTGCTCCTCTCAAATCAAACACGGATATGTTG AAATTACACAAAACTATCGTTCAAGAACGTTTAAAGGAAACTTTAAAAAC TTCACGTAACTTACAAGCTTCGATCAAAGAATTTCATGATAGAGTGCCAA ACGAATTCCGAACGATTTCTTAATATCCAAAGCAGCAATATGCAACGAGT TTTAGGAGATGGAAACACCCTAAATGTTATCTCTATTGCTCCTCTCAAAT CAAACACGGATATGTTGAAATTACACAAAACTATCGTTCAAGAACGTTTA AAGGAAACTTTAAAAACTTCACGTAACTTACAAGCTTCGATCAAAGAATT TCATGATAGAGTGCCAAACGATGTGTTGGAGAAGAAATTAACATGGCCAC TAGGCTATCCGCGACCATTCCGACCATCATCAAGATTTGAAGTTATTCAA TGGAcattatttgataaaaacaaGATGTATGCTTTCACTGATCAAGAGCC AACCTCATCTTTCCCTGCTTCATATTATGGTGATTTTACAGAGATTCTAC AAACAGTAAAACAAGctatcaatcaaaaatatgGAAATCGTAGATTGGAA TTGTTAAATGGATATCACAGAGTTGATCCGAAAAGAGATGTGTTGGAGAA GAAATTAACATGGCCACTAGGCTATCCGCGACCATTCCGACCATCATCAA GATTTGAAGTTATTCAATGGAcattatttgataaaaacaaGATGTATGCT TTCACTGATCAAGAGCCAACCTCATCTTTCCCTGCTTCATATTATGGTGA TTTTACAGAGATTCTACAAACAGTAAAACAAGctatcaatcaaaaatatg GAAATCGTAGATTGGAATTGTTAAATGGATATCACAGAGTTGATCCGAAA AGAGGGGCAGAATATCTGATTGAAATGAAGGACAAATCGTCAGATAAAGT GTATCGTTATCAGTTACTTCGACCTTTCTCCAGAGTTGAATCACTTTCAA TGCCAGCTGCAACAGAACAGAAAGGAATACACATTGTACTACCGTTACTC AAGGGCAGAATATCTGATTGAAATGAAGGACAAATCGTCAGATAAAGTGT ATCGTTATCAGTTACTTCGACCTTTCTCCAGAGTTGAATCACTTTCAATG CCAGCTGCAACAGAACAGAAAGGAATACACATTGTACTACCGTTACTCAA GGATGacatgaaatattttgaaaagttcatGCAAATGTACAAAAGACTTT GTTTACAATCTGGAGAAAATGTTGTTCTTCTAACTGTCTTTGTCAATATT CGTGATGGGaagtttgaagaagaaaaagaaccgTTTCTAGAATTCAAAAA TCTGATTTCAAGGGATGacatgaaatattttgaaaagttcatGCAAATGT ACAAAAGACTTTGTTTACAATCTGGAGAAAATGTTGTTCTTCTAACTGTC TTTGTCAATATTCGTGATGGGaagtttgaagaagaaaaagaaccgTTTCT AGAATTCAAAAATCTGATTTCAAGATACAAGCAATCATACATGTGGGCTC AATTACCATGGTTACAAGTTGGTGTTAAACACATTTCTGATGTCTTGGTG ATGGACATTGTGTCAATGAAACTACCTTCCAACGCTCTTATACTCTTGCT CTCACATCATAATCATTTCACTGtcaattttttaaacagatGTCGTGTTA ATGTAGTGACTGGATTGCAGATACAAGCAATCATACATGTGGGCTCAATT ACCATGGTTACAAGTTGGTGTTAAACACATTTCTGATGTCTTGGTGATGG ACATTGTGTCAATGAAACTACCTTCCAACGCTCTTATACTCTTGCTCTCA CATCATAATCATTTCACTGtcaattttttaaacagatGTCGTGTTAATGT AGTGACTGGATTGCAGgtctttttCCCCATTCCTTTCTTGGAATACAATC CAGACATTGTTTACAATGGCAAGCAGAAACCAGCATTTTCAGAAGTACAC ACCACAACCGGGTTCTGGGGTCGAGACTCATATCAAGTTGGCTGTTTCAA TAATAATGATTATAAAGCAGCTCGTATGTGGAAAAATGACTTCCTTGATG AAAACTTGCCTAACAATAAAACTATTCTTGGTGTTTTTGAAGGATCCAAT CTTAATGTTTTCAGAGCTTTGGATAGTGAACTTCATACTTGGTATGAGTT TGAGAATTGTGTTTCAGatgtcaaaacaaataaaaccgAATGTCATTTTA AGAATTCACAAAGACTTGGTAATAGAGCTCAGTTAGCTCaagttttcttt gattttaataaTTCGAAAAAACCATAGgtctttttCCCCATTCCTTTCTT GGAATACAATCCAGACATTGTTTACAATGGCAAGCAGAAACCAGCATTTT CAGAAGTACACACCACAACCGGGTTCTGGGGTCGAGACTCATATCAAGTT GGCTGTTTCAATAATAATGATTATAAAGCAGCTCGTATGTGGAAAAATGA CTTCCTTGATGAAAACTTGCCTAACAATAAAACTATTCTTGGTGTTTTTG AAGGATCCAATCTTAATGTTTTCAGAGCTTTGGATAGTGAACTTCATACT TGGTATGAGTTTGAGAATTGTGTTTCAGatgtcaaaacaaataaaaccgA ATGTCATTTTAAGAATTCACAAAGACTTGGTAATAGAGCTCAGTTAGCTC aagttttctttgattttaataaTTCGAAAAAACCATAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000113_pilon | genome | sc0000113_pilon:604613..610343 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1759-2169:5321 |
| Aaloc | 1564-1758:4681 |
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| Aaloc | 1255-1398:3447 |
| Aaloc | 988-1251:2363 |
| Aaloc | 769-984:1090 |
| Aaloc | 1-768:1 |
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