XLOC_042898 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_042898
Unique NameXLOC_042898
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000113_pilon:604613..610343+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_042898 ID=XLOC_042898|Name=XLOC_042898|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5731bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:604613..610343+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgAATCGAAGTATGAATAACAAAAATCCAAAGATATTTGTCTATCTGAT ATCAGGCTTTCTTTTGGGGCTGGTTATACGTCTCAAATTTTCATCGTCAT ATCAAGCACTTTCGAAATGTCACGATAAAGTTATTTTGGATCAAAAAGAA CAATCTAAATCTGGTCGAAGCATAAATATAGAAAAGCCAGTAACAGTAAA GGCAAAACCAAATCGATTTAACAATGACTACAGGCCTTATTTTGTATACA GTGAGCTTGGTTTCAAAAATCTAATGTTTGTTGGTGTCAAAATAAGTGAA CAACAACTTATGACCAATGGTGTGACCATTAATAACACGTGGTCTTCAGA TGATCAGACTGTTGTTTTCTTCACACCGTACTCAAGAGACAGTGAATTTC ATAACCGATTTGTGAAGAAATTAAACCTTAACGTCATTCAATTACCAGAT ATTGTGGACACGTCGAGTGATTTGGAATTTTCATTGCGTATTGTACAATA TATGAAAGATCACCATTTGAATAAATATAACTGGTTTATTTTGAGTAATG ATAATGTTTATTTGAATATGGTTAATGCTGGAGATCATTTAAAACGGTTG AATTCGACACAACCAATCATACTGGCAAATAAAATTAAAGGAGAATGCTC TTCAAGCCATGGCGTTATAATGAGTCATACAGCTCTTTCAAACTATTACC AAACTGATGGAGCGGGTTTTCCTTCTGGGTTGTTATCAAAACTGGGAAAT AAGGAAACACTTTTTTGCGTGAGTTTCTATTTCTTCTAATAATAAAGATA TTTTCTTGCCAAGGTATTTACAATCTCAAACTACGTTGCATGCTTTAATC GATTGTGATTATTtggaaacttttctttttttgtgagAAACAAATTGCGT TTTTGCCTTTACCTTTCAAGGacttttttactattaaattttagaactcg 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ctttgattttaataaTTCGAAAAAACCATAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000113_pilon:604613..610343+

>XLOC_042898 ID=XLOC_042898|Name=XLOC_042898|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4338bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:604613..610343+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgAATCGAAGTATGAATAACAAAAATCCAAAGATATTTGTCTATCTGAT
ATCAGGCTTTCTTTTGGGGCTGGTTATACGTCTCAAATTTTCATCGTCAT
ATCAAGCACTTTCGAAATGTCACGATAAAGTTATTTTGGATCAAAAAGAA
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ATGTCATTTTAAGAATTCACAAAGACTTGGTAATAGAGCTCAGTTAGCTC
aagttttctttgattttaataaTTCGAAAAAACCATAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_042898XLOC_042898-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000113_pilongenomesc0000113_pilon:604613..610343 +
Properties
Property NameValue
Aaloc1759-2169:5321
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