|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000113_pilon:545421..549664+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_042897 ID=XLOC_042897|Name=XLOC_042897|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4244bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:545421..549664+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTGGCGACTAACCATTTTATTGGTGGCTCTATGCATCTTCACTGCAAG
CATCGAAAGCAGAGCTTTGAAAGGTATGTTACATTTTGAGCTTCATTATC
ATTACAaaattacacccccttctctcTGGCCCACTGAGACCCCTTTCCAc
cggaaaaattggccaaaatatcgtccccggtggaaaatgaTCCTCCAATC
TTTGTCCccaatgaaaataatcaaataaactaaccctcactgcaaaatat
tatgttatttcaccaccactgaattttctgacttaaaaacaaaagaattg
aaactcCCAGCCATAGAAACATGGGAacatcaatccccattgagtttgaG
TTCGTTTCTATCCTACCGGGTCTATGATAAGGGGGTGTGAAATTGTTCAA
CAATCCATGAAAAGATTAATAGATACCCTGTCCGAAACGAAATAAATGGA
TCCGGTTCGTTTGGACCAAATGTCCGAAATGAAATAAGTGGGAGGACTGT
ATGTTTCTTTTAGatgtttcttcttctctatcTAGTTTCGTACTAATCAT
AATTTACAAATGCCGCGCTATTTATATATCCACGTGACCCTACTGGTCAC
GTGGTCAAACTGTCAATCATAATTTCTATTCCACGACATACCCTGTCTCG
ACAAAAAGCGTTGCaagttttgtattttattttgagTTTCAAATATTGCT
TTCCTGTCTGGTCTTACCGATACTCAATCAATCATGGTTATTATGAAATC
TAGGAATTGAAATCTCAAGAAGTATTGCTCTTGAACGAAAAAATATAACT
ATAAAAGTATTATCTCGGTGGATAAATAATTCTGAGTGGATGAATTCAAG
ACATACAGTAGGAATTTAAAagcaatgtatcaaaatgtACAGACTGTCCG
ATTTTCGGAGCTAAACTTTACTTTGTCTATTCCATGAGAAAACTGAACAA
TAGTGGTAACTTTTTCCGTCGAGTTTTATTTCTATACTACCAtttttttC
GTAAAGGggattgagtttgaagcccgaagggctagaaaaGAATCTCTAcc
ctaacctttcccaggcaagaaaaggtgaagccacttattacttcccatcc
agaacgcacATAGAACGCGCCGAAATGATGGTGACGAATTGTATCTGTCG
ACgaattgtattttttgaaatctagcgatagattttactttcaatctggt
gtttgtgtaaaaaccacgcgcaggcgttctggaagggaaataagtggctt
catttcccatctaggagtctcgagtctagcccttcgaggcttggaagtca
atggggAATACCTTTAAAATGCTCAAGGATAAACGTGACCCCTCTAATTC
TTTACTtatcatttgatttgatttactCTTTCAACGAATTGTATCTTCTT
TCAGCCTCACATTCGAAATCACACCAACACGCTTCACATGTCACCAAATC
TGAGAAAGCAGACAAAGGGCCTGGAAAGAAAGgtataaatttgtttttta
ttgcaataaatcaagttttgtttgtAATGGAAATCGCCTGGATTTTCGTC
TTACGTCTTACCTTTTGATGTCTTCAATTTAAATTACATGCTTAAGTGAA
GGGCAACTTTAATCACTTCCAGTTCAAATCTCAACATGATTTGTTTACCT
TTTAATCCAACTTAATTTACAAACTCCGGACCAGAAAGCCTACTGTGTTT
TATTTACCCGGGAGAAGGTTCGGgtacttgccaagtgaaccgtaccgagt
gggaattgaaccAGGGTTGCCCGTGCAGCAACTAAAGGTAATAACCACTA
TACCAAAACGTCATTAATAAACTTCCTAATGCTTCATAAAAATAGAATAC
ccttttttgaccattttagcGGAAGTGCACGCAGCCAAAGTGAGCGAAGA
AGATGATGATGAGGATGGACCAGCTGAAGAAGCTGATGAAGATGCCAGTA
TCAATGAAGATAATGGATCTGCTGCTTCTGCCAGATCTCCAGTTATCCTC
CCTCCTCCAATGCCTTCAAACAACCAAGGTAGATATTATATAAAGAGTAT
AGATAAGAGTTAAAGAGCTCGATTTAACCTCTTGATGAAGGATAAATGAA
GTGTAGTAAAGTAAACTTCAATCGATATTGTTCAATAGAATCGAAGAGTA
ATCCATTCCTGTATTTCAGTCTTTGCGAATCTCCTACAACCACTTAATTT
TAGAGCTTCAACATGATAAGACTTTCTTAGATTTTTCTAACTATGTAAGC
CAAAAAGATTACAAGGTTGAAAATTAGTTGAAAATGATAGTATGAAAGGA
AGTTTATgagaacacccctgtgtcacagtcccggtgggatttttttccCA
CAATGGGGGTAAAGATTTATCGACGTCCCAATggggattgaaattctatt
gttgcaagcttaaaatatccagtggggatggttttggagtgcaatttatg
acattgaatttcgaatgggaatgaaattaaagtcaatttcccagtggggc
tgaaattatagAGTATATTTCTTAAACAGTGAGTTGGGgccccaccgggt
ctgtgacacaggggtgtatgagAACTTCTTAGCTTACCATATTAATACAA
GACAAAATTTGCTCATAAAGATGGAGCCATTAATCGAGCTAAAGTTACGA
GGAATCAGAAAAACAACTTTAGCTTCAGAAGTATAGATTATTAAGAGTTT
CCTTTCTACTTTTTATCCACTTAGGTCTTGATATAAGTAAAAACCCCGAA
GCCATTGCAGCAGCAAGTAATTTACGCCAAGCCATTCATGATAGTCTGGG
TGAGCAACACATACACATCACATACACATTTCTTAAAATGATTTAACTAA
AACAAACGGCCATTCAATGTACATAACGTTTATAAATGTACGTAAAAATG
AATGTTCATACATATACTACACTTTGGAACAAAAACTGGCCATCGGACTT
TaaattctttcaaaactttCCATTTTTGAACTCgattattgaaaaacaaa
acagacgAAAAATGACATtccatttttctttgattttgtagGCAAATTAG
CCAGAGCTGAAATAGACATGCACAAAGCAATCGTTAACCCAAACAAAAAA
CAAGATGGTATGTGTTGCTCACTGTATACATTGGTACCTTATTAACATTA
CTAAGATCCACTGGGATTAATATTGATCTAAAACTAGGTGACAGATGTTT
ggtcaatttctttttctcttgGTAGATGTCTTATCCCTGTTTTTCAAGAT
AATAGAATTGTTTTATAAAGCTTTACTATACCAATTTATTTGTCTCGTTT
AATTTTTAGTCCGACCACCACCACAACGTGCTTTGAAATGTCCACAACCA
TGTCCACAAGATTGTGCCCAATCTGGATGTTCACCAAGCTGTTGTATGTC
TGGTatgccaatgccacaacaacccatgatgatgcctatgccaatgatga
tgcctggaatgatgccTTCGTGCCAACCAGGATGTATGCCACAAGGATGT
GCCCCACCAGGATGTATGCCACCTCCACCATGCTCACCACCAGGTTGTCA
ACCACCAGCCAGCTGTAATCCTGGATGCGTCCCACAACAGCAAGCTATGA
TGCCTATGCAAATGGCTCAACAAGCTTCTTGTCAACCAGGATGTATGCCA
CAAGGATGTGCTCCACCAAGCTGTATGCCACAAGCCTGTATGCCACCAAG
TTGCATGCCACCACCAAGCTGTAACCCTGGATGTGTCCAACAACCAGCAA
TGCAATTCAAAGTCCAAGTTTTACCTCCACAAATCTTCCAATTGCCAGCT
GCACAAGCTTGTCCACAACAATGCCAACCTGGATCTTGCCAAGTTGGCTG
TCCAACATCTTGCTGTCCACAACCAGGAATGATGCAACCTCCACAAATGA
TGATGATGCCTCCACAAATGCCGGCTGGATGTAACCCAGCTTGCCAACAA
AGCTGTGCACCATCATGCCCACGTCAATGCTGTCCACAAACTCCACCAAT
GATGGCTCCACCACCAATGCCAGCAGGTTGCGCACCATCCTGTGCACAAC
AATGCAGTGCACAATGTCAACAGCAATCATGCTGTGGTGCTGGTatgcaa
caaccaatgatgatgcctgctccaatgatgatgccagctccaatgccaat
gcaaatgcaatCTGGATGTCCATCTCTTTGCCAACAACAATGTGCTGCAC
AATGTCCAAGAATGTGCTGTGGGCCAGGACCAGCTGGAAAATAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000113_pilon:545421..549664+ >XLOC_042897 ID=XLOC_042897|Name=XLOC_042897|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2622bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:545421..549664+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTGGCGACTAACCATTTTATTGGTGGCTCTATGCATCTTCACTGCAAG
CATCGAAAGCAGAGCTTTGAAAGATGTGGCGACTAACCATTTTATTGGTG
GCTCTATGCATCTTCACTGCAAGCATCGAAAGCAGAGCTTTGAAAGCCTC
ACATTCGAAATCACACCAACACGCTTCACATGTCACCAAATCTGAGAAAG
CAGACAAAGGGCCTGGAAAGAAAGCCTCACATTCGAAATCACACCAACAC
GCTTCACATGTCACCAAATCTGAGAAAGCAGACAAAGGGCCTGGAAAGAA
AGcGGAAGTGCACGCAGCCAAAGTGAGCGAAGAAGATGATGATGAGGATG
GACCAGCTGAAGAAGCTGATGAAGATGCCAGTATCAATGAAGATAATGGA
TCTGCTGCTTCTGCCAGATCTCCAGTTATCCTCCCTCCTCCAATGCCTTC
AAACAACCAAGcGGAAGTGCACGCAGCCAAAGTGAGCGAAGAAGATGATG
ATGAGGATGGACCAGCTGAAGAAGCTGATGAAGATGCCAGTATCAATGAA
GATAATGGATCTGCTGCTTCTGCCAGATCTCCAGTTATCCTCCCTCCTCC
AATGCCTTCAAACAACCAAGGCAAATTAGCCAGAGCTGAAATAGACATGC
ACAAAGCAATCGTTAACCCAAACAAAAAACAAGATGGCAAATTAGCCAGA
GCTGAAATAGACATGCACAAAGCAATCGTTAACCCAAACAAAAAACAAGA
TGTCCGACCACCACCACAACGTGCTTTGAAATGTCCACAACCATGTCCAC
AAGATTGTGCCCAATCTGGATGTTCACCAAGCTGTTGTATGTCTGGTatg
ccaatgccacaacaacccatgatgatgcctatgccaatgatgatgcctgg
aatgatgccTTCGTGCCAACCAGGATGTATGCCACAAGGATGTGCCCCAC
CAGGATGTATGCCACCTCCACCATGCTCACCACCAGGTTGTCAACCACCA
GCCAGCTGTAATCCTGGATGCGTCCCACAACAGCAAGCTATGATGCCTAT
GCAAATGGCTCAACAAGCTTCTTGTCAACCAGGATGTATGCCACAAGGAT
GTGCTCCACCAAGCTGTATGCCACAAGCCTGTATGCCACCAAGTTGCATG
CCACCACCAAGCTGTAACCCTGGATGTGTCCAACAACCAGCAATGCAATT
CAAAGTCCAAGTTTTACCTCCACAAATCTTCCAATTGCCAGCTGCACAAG
CTTGTCCACAACAATGCCAACCTGGATCTTGCCAAGTTGGCTGTCCAACA
TCTTGCTGTCCACAACCAGGAATGATGCAACCTCCACAAATGATGATGAT
GCCTCCACAAATGCCGGCTGGATGTAACCCAGCTTGCCAACAAAGCTGTG
CACCATCATGCCCACGTCAATGCTGTCCACAAACTCCACCAATGATGGCT
CCACCACCAATGCCAGCAGGTTGCGCACCATCCTGTGCACAACAATGCAG
TGCACAATGTCAACAGCAATCATGCTGTGGTGCTGGTatgcaacaaccaa
tgatgatgcctgctccaatgatgatgccagctccaatgccaatgcaaatg
caatCTGGATGTCCATCTCTTTGCCAACAACAATGTGCTGCACAATGTCC
AAGAATGTGCTGTGGGCCAGGACCAGCTGGAAAATAGTCCGACCACCACC
ACAACGTGCTTTGAAATGTCCACAACCATGTCCACAAGATTGTGCCCAAT
CTGGATGTTCACCAAGCTGTTGTATGTCTGGTatgccaatgccacaacaa
cccatgatgatgcctatgccaatgatgatgcctggaatgatgccTTCGTG
CCAACCAGGATGTATGCCACAAGGATGTGCCCCACCAGGATGTATGCCAC
CTCCACCATGCTCACCACCAGGTTGTCAACCACCAGCCAGCTGTAATCCT
GGATGCGTCCCACAACAGCAAGCTATGATGCCTATGCAAATGGCTCAACA
AGCTTCTTGTCAACCAGGATGTATGCCACAAGGATGTGCTCCACCAAGCT
GTATGCCACAAGCCTGTATGCCACCAAGTTGCATGCCACCACCAAGCTGT
AACCCTGGATGTGTCCAACAACCAGCAATGCAATTCAAAGTCCAAGTTTT
ACCTCCACAAATCTTCCAATTGCCAGCTGCACAAGCTTGTCCACAACAAT
GCCAACCTGGATCTTGCCAAGTTGGCTGTCCAACATCTTGCTGTCCACAA
CCAGGAATGATGCAACCTCCACAAATGATGATGATGCCTCCACAAATGCC
GGCTGGATGTAACCCAGCTTGCCAACAAAGCTGTGCACCATCATGCCCAC
GTCAATGCTGTCCACAAACTCCACCAATGATGGCTCCACCACCAATGCCA
GCAGGTTGCGCACCATCCTGTGCACAACAATGCAGTGCACAATGTCAACA
GCAATCATGCTGTGGTGCTGGTatgcaacaaccaatgatgatgcctgctc
caatgatgatgccagctccaatgccaatgcaaatgcaatCTGGATGTCCA
TCTCTTTGCCAACAACAATGTGCTGCACAATGTCCAAGAATGTGCTGTGG
GCCAGGACCAGCTGGAAAATAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000113_pilon | genome | sc0000113_pilon:545421..549664 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 379-1311:3312 |
| Aaloc | 313-375:3044 |
| Aaloc | 154-309:1872 |
| Aaloc | 76-150:1407 |
| Aaloc | 1-72:1 |
|
