|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000248_pilon:393605..394798- Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_042879 ID=XLOC_042879|Name=XLOC_042879|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=1194bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000248_pilon:393605..394798- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCATAAGATTTGCTTGTTAGCCGTACTTTTTGCGGCGGTCTATGCTAG
ACCATATTTTGACCAAAACAGTGAGTCACACTTCACTGTCCACGAGAAAC
CACCAGAACTTGTTGTCAATGCTGGACCAGAAGGAGTCAAAGTCCAAGCT
AAACCATCCAAACTTCAAGTTGTTGAATATCCAGGACATCAAGTTGCTGC
CCAAAAACGCGATGATATCACCAACTGTTACTTCGGTGGTGAAGGTTGTG
GTGGACACGGTGGCCTCGGTTTAGGAGGCTATGGAGGCCACGGATTCGGT
GGCGGATATGGCGGTCACGGCTTAGGCGGTGGCTATGGCGGTTATGGCCA
CGGTGGTGGTTATGGCGGAAATGGAGGCAGTTATGGCGGTGGTTATGGCG
GAAATGGAGGCGGTTATGGCGGTGGTTATGGTGGACACGGCTTCGGTGGT
GGATACGGAGGATACGGTGGTCATGGATGCGTTGGACATGATTGTGCATT
CAGTGGATGTCTTTACAATGGAGGTGGTTACGGATGTGGCGCCCACCACG
ATCACACCACATATGTGCCATCACACACTCCACCCGTCCACGTTGGTCCA
AACGCTCCACCAATTCACGTTGGCCCACACGTTCCAGCTGTTCATGTCGG
ACCACATGTACCAAGCATCCATTACGGTACTCATGCTCCATTATACCATG
TTGGACCACACGTTCCATTCGTTCACATGCCACCACCTGTTCACACTGTC
CATGCAGGACCCATGGGACCACCAGTGCACGTCACCTCACCACCAACCGT
TTACCATCAACCACCAGTTGTCTACCATCAACCTCATGTTGTTGGACATG
CTGCAGACCACGACTTCGGACATCATGTTGGAGTTGGAGGAGATTATGGA
GGTCATTACGGATCTGGATACGGATGGGGAGGTCACGGTGGATACGGAGG
ATATGGCGGCCACGGATTCGGTGGTGGTTCCGGTGGTGGTTTCGGTGGTG
GCTATGGAGGTGGCTATGGAGGCCACGGACTCGGTGGCGGATATGGCGGC
CACGGCTTGGGCGGTGGTTATGGAGGTTATGGCCATGGTGGTGCCGGTTA
TGGTGGTTTGGGTGGTCATGATGGAGAATGCTGTGAAGCTGGAGGTTATG
GTCATGGATACAAGAGAGCTATCAAACAAAAACGATCGATTGAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000248_pilon:393605..394798- >XLOC_042879 ID=XLOC_042879|Name=XLOC_042879|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2388bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000248_pilon:393605..394798- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCATAAGATTTGCTTGTTAGCCGTACTTTTTGCGGCGGTCTATGCTAG
ACCATATTTTGACCAAAACAGTGAGTCACACTTCACTGTCCACGAGAAAC
CACCAGAACTTGTTGTCAATGCTGGACCAGAAGGAGTCAAAGTCCAAGCT
AAACCATCCAAACTTCAAGTTGTTGAATATCCAGGACATCAAGTTGCTGC
CCAAAAACGCGATGATATCACCAACTGTTACTTCGGTGGTGAAGGTTGTG
GTGGACACGGTGGCCTCGGTTTAGGAGGCTATGGAGGCCACGGATTCGGT
GGCGGATATGGCGGTCACGGCTTAGGCGGTGGCTATGGCGGTTATGGCCA
CGGTGGTGGTTATGGCGGAAATGGAGGCAGTTATGGCGGTGGTTATGGCG
GAAATGGAGGCGGTTATGGCGGTGGTTATGGTGGACACGGCTTCGGTGGT
GGATACGGAGGATACGGTGGTCATGGATGCGTTGGACATGATTGTGCATT
CAGTGGATGTCTTTACAATGGAGGTGGTTACGGATGTGGCGCCCACCACG
ATCACACCACATATGTGCCATCACACACTCCACCCGTCCACGTTGGTCCA
AACGCTCCACCAATTCACGTTGGCCCACACGTTCCAGCTGTTCATGTCGG
ACCACATGTACCAAGCATCCATTACGGTACTCATGCTCCATTATACCATG
TTGGACCACACGTTCCATTCGTTCACATGCCACCACCTGTTCACACTGTC
CATGCAGGACCCATGGGACCACCAGTGCACGTCACCTCACCACCAACCGT
TTACCATCAACCACCAGTTGTCTACCATCAACCTCATGTTGTTGGACATG
CTGCAGACCACGACTTCGGACATCATGTTGGAGTTGGAGGAGATTATGGA
GGTCATTACGGATCTGGATACGGATGGGGAGGTCACGGTGGATACGGAGG
ATATGGCGGCCACGGATTCGGTGGTGGTTCCGGTGGTGGTTTCGGTGGTG
GCTATGGAGGTGGCTATGGAGGCCACGGACTCGGTGGCGGATATGGCGGC
CACGGCTTGGGCGGTGGTTATGGAGGTTATGGCCATGGTGGTGCCGGTTA
TGGTGGTTTGGGTGGTCATGATGGAGAATGCTGTGAAGCTGGAGGTTATG
GTCATGGATACAAGAGAGCTATCAAACAAAAACGATCGATTGAAATGCAT
AAGATTTGCTTGTTAGCCGTACTTTTTGCGGCGGTCTATGCTAGACCATA
TTTTGACCAAAACAGTGAGTCACACTTCACTGTCCACGAGAAACCACCAG
AACTTGTTGTCAATGCTGGACCAGAAGGAGTCAAAGTCCAAGCTAAACCA
TCCAAACTTCAAGTTGTTGAATATCCAGGACATCAAGTTGCTGCCCAAAA
ACGCGATGATATCACCAACTGTTACTTCGGTGGTGAAGGTTGTGGTGGAC
ACGGTGGCCTCGGTTTAGGAGGCTATGGAGGCCACGGATTCGGTGGCGGA
TATGGCGGTCACGGCTTAGGCGGTGGCTATGGCGGTTATGGCCACGGTGG
TGGTTATGGCGGAAATGGAGGCAGTTATGGCGGTGGTTATGGCGGAAATG
GAGGCGGTTATGGCGGTGGTTATGGTGGACACGGCTTCGGTGGTGGATAC
GGAGGATACGGTGGTCATGGATGCGTTGGACATGATTGTGCATTCAGTGG
ATGTCTTTACAATGGAGGTGGTTACGGATGTGGCGCCCACCACGATCACA
CCACATATGTGCCATCACACACTCCACCCGTCCACGTTGGTCCAAACGCT
CCACCAATTCACGTTGGCCCACACGTTCCAGCTGTTCATGTCGGACCACA
TGTACCAAGCATCCATTACGGTACTCATGCTCCATTATACCATGTTGGAC
CACACGTTCCATTCGTTCACATGCCACCACCTGTTCACACTGTCCATGCA
GGACCCATGGGACCACCAGTGCACGTCACCTCACCACCAACCGTTTACCA
TCAACCACCAGTTGTCTACCATCAACCTCATGTTGTTGGACATGCTGCAG
ACCACGACTTCGGACATCATGTTGGAGTTGGAGGAGATTATGGAGGTCAT
TACGGATCTGGATACGGATGGGGAGGTCACGGTGGATACGGAGGATATGG
CGGCCACGGATTCGGTGGTGGTTCCGGTGGTGGTTTCGGTGGTGGCTATG
GAGGTGGCTATGGAGGCCACGGACTCGGTGGCGGATATGGCGGCCACGGC
TTGGGCGGTGGTTATGGAGGTTATGGCCATGGTGGTGCCGGTTATGGTGG
TTTGGGTGGTCATGATGGAGAATGCTGTGAAGCTGGAGGTTATGGTCATG
GATACAAGAGAGCTATCAAACAAAAACGATCGATTGAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000248_pilon | genome | sc0000248_pilon:393605..394798 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1-1194:1195 |
|
