|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000269_pilon:135842..142124- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_042847 ID=XLOC_042847|Name=XLOC_042847|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6283bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000269_pilon:135842..142124- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCCACCACCATCAAAGCCAGGAGAACGCCAAAAACTTTTCAAAAACCA
AGACAAAGACACTGAGGTGAGAGATCTTTTCATCAGTATTCGCTTTTAAT
CTAATCTGATGCTGTTTAGTATATGGAGTATATAAATGATAATTTTGATT
TCTTATGGTTTAACATTGAGTGGAAAGGAAGGAAAATGTTGTATGTTACT
CTCGTTTGATCTGAACTTATTTCCAAATGTCACCATAATGACAAATTTAT
TCAATTATTACTGTACATATGATTAGAGTGTAAGCAACAAACTCTGAGTG
ATGTACTTTTTATGATGGAAGATAACTTTTGAAATATTGATACATGGCTC
TGGTTCTTAACTAATTGAGCACTCTTATTATTGATTTACCACTCTTGTTT
ATGTTATTTTACCTTACTTATTCTATCTTTACGTCTGAAAATTCAAGGGA
TTATTATAATAATACCTTTTTATTGTAAAATTTTAGTCTTTAAGACAAAG
AAGAAATGAAGTATCAGTTGTACTGAGGAAAGCAAAACGAGAAGAAGCAC
TTCAAAAAAGACGTCTTGTCCCCAATACACCAGAAGACGATGAAAAATAT
AATAAATTTATGGTAGGTGTCATATAAGAGAATGGTCAACTTGAATTTCA
ATCCTTTTTCCAGTAAAAGCAGAGAAATTTATTCTTTTTAATTGAAATTG
AACAAAAGCATCAAAGCAAATGTGTTAACGGTGTTAATTTTGTTCTATTC
TAAACATGGCTCATTGTACATCTTTTTTTCTTTTTACCAGGATGCATCAC
TACAAATGATTGTTGAGGTAAGCAGGCCTACTTCAATAGTTACAAAATTT
ATGATACTGTATATAAAGATAAATTCCAAAAAAAATGGATGAGGGGTGTT
TTATTTCACAGTTTCATCAAAATCGTTTTCAAAAAAGTACTGTAATTCAT
ATGATCCTGATTTGATTTTGTATCCACCTTGTCCTAATGTACTTGTGTTT
ACTTATCTTTCAGAATGCTGCACACGGTGACCCAGCAACAAGACTCAGTG
CTGTACAAGCAGCAAGAAAATTGCTTTCAAAAGATAGACATCCTCCAATT
GATGAATTAATCAAGTAAATAGTTCTTTGATCAAGGGTTATAAATTGCTA
GGTGCAGGCCTTTCCACAAATAAAATCGAACGTGATCAATGAATTGAACT
TGTAAATGATTTTTCACCAAATCGCTTGCGTCAATCAAATTTTGCGTGCA
ATTTCTAAAAAACGCTACCCAGAAATATTTTTACCAATCATATAGATTAT
TCCTTTATCTATATCTATATCATAAAGTCTATCATTCTCATTTTCAATTG
AGCTTATCAGCTGCGAGATCACCCTTAAACAAAGATAACTTTATGATGGA
AACCTAATCAACGTGAGCAACTTTTTGTCCACTATACGAGATTGGCGAGC
GCTCTACTGAACGTGAGAGTGATTGCTCGCGTCTTATTGAAATGACTGAG
GTGTTTGTTAGTCTTATTTTTTGTTAATGAAATTTCAATGAAATATTTGT
AAATCTTTTTATTTCATACATTTTGCTCTAATTGCTTTTGCTGTTATTTC
TTTTTTAGGTCTGGCATTCTACCTATACTTGTGGAATGTTTACAGTTTGA
TGACAAGTAAGTTTAAGCTCAAAATCTACTTGCCTGAGCCTGTTCATATT
AGTTTATATTAAACTTTCTTTTCATTTAAATCTAATACATTACAAACAAT
ATGTTATTAAGATATGGCCTTGGCCATTATTAAAACAAATTTGTCTCCTA
TCCGAGTTTTGTCCTCCTTGTCACATATCATACTGTTAGTGTCACAGCTC
ATGTGAACATTTCATCGATTGAAATTTGTCCTTTTCAGTGCTTCTTTACA
ATTTGAAGCTGCCTGGGCCTTAACAAACATTGCTTCTGGATCATCTGCAC
AAACACAAGCTGTCGTACATGCCGGTGCTGTCGCTCACTTCATGAGACTT
TTAGAATCTAAACACCAAAATGTTTGTGAGCAAGCTGTTTGGGCTCTTGG
AAATATTATTGGTGATGGTCCTGTTTTAAGAGACTTTGTAATTCGCCATG
GTGTAGTTGCTCCTTTATTGACATTCATCGACCCAAATGTTCCAGTATGT
ATTTCAATCCGTCATTTTCTTTTTGCTTAAATCCGTTTTATACCTCCTGC
AGTTCATTGTGATATTCAGTGCAATGTTAAGCCATGAACTTTGTGTGAAC
CTTTAACCCTATTCATACTAGGCTTTTAGGGGCGGTTCAGAACTAGGGGG
GGGCTTTTCCTGTACCACCCCTTAACTTTTGATCTAGTGGGTCTTTTTGG
ATGAAATTTGGCACACAAGATCCTCGTGACGTAAGGTAACTTTTGACAAA
AAATTTTTTTGATGACGTCACTCATCATGCCCAAAGTGAGCAAAAACCGA
ACATTTCCTTTGTTCTTATAAATAGCTATTGTATTCTAACAAAGGCTTTA
GAAAAAAGTTGCCTGAGTTTAAAATGCTTATTTTATCCTAAATATTCAAT
AAATTACGGTTTAAACGATATATTTGACAATGAAAATAAATTTGTACTGG
AAAAGTGTCAATTTTTGTGACACCTTACTGTCAGAAATCTCATCATGCTC
AAGGTGTGAAAATATTTAGATGTCAAATTTTTTTTTATTTTGAAGCTTAA
TAAAAGTTAGGAATTTACAGAAAATTTCACGGCAAAAGCTCTATTATTTC
AGGAGCTATTAGCAATAGTTTGACCTCCGAACAGAAAGAGCCCCCCCCTA
GTACGAATAGGGTTAATAAAATGCTCGCATCCTCTTCATGATACCAAAAT
TTCATATTTCAGTTAACTTTTCTTCGAAATGTAACATGGGTTATTGTCAA
TTTATGCCGTAACAAAGAACCACCACCACCAATGGAAACCATTCAACAAC
TTTTACCAGCCCTTGGTGTTCTCATCCACCACAATGACCTTGATGTAAGA
AAGAATAATAGCTTTGGTTGAATTATTGCAATGTTTAAAACGGCACTTAA
ATTTGTAACAGTGATGTGATCGTTCTTAGATTTGAAATGGTGCAAATAAC
TGACATGATTCTCATAAAGATGCAAATAATTGCATTCGCACTCTAGTCTA
GTCATAATTGAAATTTTGATTGAAATGTTCGCATTTGCATGCCCCCCCCC
CAATACTTTGTAAAGTATTTTTTTTTTTACTTTGAAAAATCTTATATATA
CCGTTTAGAGGGGTGAAATAAGGGCAAAAAGTCGACATATTTTTTTGGCC
CCCACATGCGCACGCCGGGGGCCATGATTTGTTGATGATTTCTGAAAACT
TGTGGATGTGAGGAATCTTTGTTTGTGTTAGCTTATTATTTTCTAATGAA
TGACCCGTTTTAGATAATGTTAATTTCTATTTGGTTTGTATTTCATTTTA
GATTCTTGTGGACAGTGTTTGGGCTTTGTCCTACCTTACTGATTGTGGTA
ACGACCATATTCAAGCTGTTCTCCAAGTTGGGGTTGTTCCAAAACTTGTG
TCTTTCTTAACGCACACTGAAATAAGACTACAGGTAACAATTTTTTCTGA
TCAACAAGGAAGGAAAAATATTTTGAGAAGAGAGACAAGCCAAGTCACGA
GTTGTGAAGCTAGATGTTACAAAATTAACAAAATCCATCACGCAATATTT
GAGAACTTGATTTTCGAAACATTAAAGTTTAACTGTGTGTCCCTCACAAA
GGCTTAGAAGTACATTAGCTTTAATTGAAGAATAGAGTTTTGAAATTTTT
TTGTAAAATTAAAACATGATATAGACTTTCACACTTATTAAGCCAGTGTA
GTATGTTTTGATGTTTGAAGAAAATTGTTTGATATTTTGATATTTGGCTC
TGCAGACGTATCAACATTTCAAATTACATAAAATGATCCAGTATATATAA
ACAAACTTTCGGTAGCTTTGAGGAACTGCTTTATAATATGATGACTTAAA
AAATTGAATTTATTTTTTTTTTTTTTATTTTATTTTAAGACTGCTGCATT
GAGAGCTGTGGGCAACATTGTCACTGGCACAGATGAACAAACACAATCAG
TATTGAATAATGGAGCTCTTGGACAGTTCCCTTCACTGCTTTCACATCAA
AAAGAAAAGATCAGAAAGGTTTGACTTTTCAATGATTTATAAGACAATTC
ATATATTTATCTGAATACTAGTATCAACCTATATTTACAAAGCTACCAAA
AATGTACAATGTTCAATGCCAATGGCTAGAACGAATTGAAAATTTCGCAT
ATTTTAACTTTGTGTTATCCTTTTGTAGGAGGCAGTTTGGTTTCTGTCTA
ACATCACTGCTGGAACAGAAGAACAGGTTCAGCAAGTTATCGATGCTGGC
CTCATTCCTTTTGTCATCAAAGCTCTTACAGAGGTAATTGGTTTCCCACT
TTGTGATATTATTCTGTAAGAATCTAGAATTTCCCTGGTTTCCTTAAAAT
TTTAGTTTGGTCATCTGACTTGTGGCATAGTGTTAGTTTTTCTATAGCAA
CTCATTCAGTTTGGTTATTTTCTTAGGGAGAATTTCAAACTCAAAAAGAA
GCTGCTTGGGCTATCAGCAATTTGACTGTCAGTGGTGTACCAGGACAGGT
AATTATATCATTAATTTTTATTTGGCAAACAAAAGCTTTGTTATAATCCC
TATCCACTAAAAGAGATTACAATACTCAGGTCTAGCTATTAAGCAAAAGT
TTTGCATGCCATACAACCATTAAGCTCAAATATGGACTTACCGGTTCATC
TTGAAATAGGCATGCTATTTTAGTTTGTGTACCTTAATAGATGTGGATTA
ATTTTTGCAAATATTGGCCATTTTAGCAATGGTAAAGATGAAATCATGTG
AAAATCGAAATTTAATCGATGAAAATGTATTTACCCCATTTTCAACCTTT
ATTTCCCTTCTTTGGAGAAATTTTAATTTTCTGAAGATGTAAAAAAGCAG
ATGGGTCGCCAATATTTCCAATTTGGAACTATATTTAAAATATCGAAAAT
ACCCAATGTAAGATTTTTAGAATATGTCAATAAGCAAAAACAAGTTCAAG
CGAAAAATTTTATTACTCAATTCATAAAAAAAGTCTACATGAAAATTAAT
CCATTTAAGGTAATAATTCCAGGCCCCTACGGCAGCACTTCGTGAACAGT
CAGGCTTGGCCCTGGCACTGAAATGATATAAGAGTTTACAAATTGAATAA
AATTAACTTAGCCATTTTCCTTTTTTGTCTTCTAGGTTGCATATGCAGTA
CAAGAGGGTTGCATTCCACCGTTCTGTAATTTACTCAGTGTACAAGACCC
ACAGGTATGCATATTTCTTCAAGAAATATTTTGCAGGTCTTAATTGTTTT
ATTCATTAATCCAGTGATAGTTGAGATCTTCTTCTCGAAAAAAATACTAA
ATTTATATTGAACTTGAAATTAACATAAAATTTAGCTGAAAGGGTCTAAT
TTACCAGATGCTGCTCATCAAATTTTAGCTGTAAAATGAAAATTTTCATC
ACATTTCTTATCTTATCTTTTTAGATTATTCACATTGTCCTTGATGGTCT
GACCAACATCATGAAGGTAAGCATTCCACTCTATATCGCAATTGTTGCCT
CCTTTTTACGTCAATAAAAGCAATGTTGCATTCCATGGATTTCCTTTGCA
TCTGGACTACTAACCAATCCGTTCCAATCTAATAGAGTTTTAAGATTTTT
CTTGTGTTTCAATTTTCAGATGGCTGGAGATGATGTTGAAAAGATTTGTA
TCATCATCGAAGAATGCGGAGGGCTAGATCGTATTGAAGTCCTTCAAAAT
CATGAAAATCCTGATATTTATAAACTGGCGTACCAAATCATCGAAAAATA
CTTTTCAAATGATGTAAGCATTCTTTTATAAAAGTCACTCGACCCATTCA
GCTGTTTCACGCGTAAACCTAGGCTGTTAATAACCTAAGACAACATATAG
GCCATATGAGATACTATGTAAACTTAATTTCGAGAAACTCAGATGAAGTA
TGGTCAATCATTAACGTTGTTGCCATTATTGTAATTAAGTTCGATTGATT
TTTCAAAATAAGATGATTTGATATGTGTTATATGGTGTTTGAGACAAGCA
AATAAAACTATTGTATTTATTGTATTTATCTTAGGTTGAAAATGAAGACG
AGACGGTGGTGCCCGAGCAAAACCCACAAGGACAGTACCAATTCAATGCC
AAAGCAAGTGAGACGTCCAAATTCTCACTGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000269_pilon:135842..142124- >XLOC_042847 ID=XLOC_042847|Name=XLOC_042847|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3096bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000269_pilon:135842..142124- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCCACCACCATCAAAGCCAGGAGAACGCCAAAAACTTTTCAAAAACCA
AGACAAAGACACTGAGATGCCACCACCATCAAAGCCAGGAGAACGCCAAA
AACTTTTCAAAAACCAAGACAAAGACACTGAGTCTTTAAGACAAAGAAGA
AATGAAGTATCAGTTGTACTGAGGAAAGCAAAACGAGAAGAAGCACTTCA
AAAAAGACGTCTTGTCCCCAATACACCAGAAGACGATGAAAAATATAATA
AATTTATGTCTTTAAGACAAAGAAGAAATGAAGTATCAGTTGTACTGAGG
AAAGCAAAACGAGAAGAAGCACTTCAAAAAAGACGTCTTGTCCCCAATAC
ACCAGAAGACGATGAAAAATATAATAAATTTATGGATGCATCACTACAAA
TGATTGTTGAGGATGCATCACTACAAATGATTGTTGAGAATGCTGCACAC
GGTGACCCAGCAACAAGACTCAGTGCTGTACAAGCAGCAAGAAAATTGCT
TTCAAAAGATAGACATCCTCCAATTGATGAATTAATCAAAATGCTGCACA
CGGTGACCCAGCAACAAGACTCAGTGCTGTACAAGCAGCAAGAAAATTGC
TTTCAAAAGATAGACATCCTCCAATTGATGAATTAATCAAGTCTGGCATT
CTACCTATACTTGTGGAATGTTTACAGTTTGATGACAAGTCTGGCATTCT
ACCTATACTTGTGGAATGTTTACAGTTTGATGACAATGCTTCTTTACAAT
TTGAAGCTGCCTGGGCCTTAACAAACATTGCTTCTGGATCATCTGCACAA
ACACAAGCTGTCGTACATGCCGGTGCTGTCGCTCACTTCATGAGACTTTT
AGAATCTAAACACCAAAATGTTTGTGAGCAAGCTGTTTGGGCTCTTGGAA
ATATTATTGGTGATGGTCCTGTTTTAAGAGACTTTGTAATTCGCCATGGT
GTAGTTGCTCCTTTATTGACATTCATCGACCCAAATGTTCCATGCTTCTT
TACAATTTGAAGCTGCCTGGGCCTTAACAAACATTGCTTCTGGATCATCT
GCACAAACACAAGCTGTCGTACATGCCGGTGCTGTCGCTCACTTCATGAG
ACTTTTAGAATCTAAACACCAAAATGTTTGTGAGCAAGCTGTTTGGGCTC
TTGGAAATATTATTGGTGATGGTCCTGTTTTAAGAGACTTTGTAATTCGC
CATGGTGTAGTTGCTCCTTTATTGACATTCATCGACCCAAATGTTCCATT
AACTTTTCTTCGAAATGTAACATGGGTTATTGTCAATTTATGCCGTAACA
AAGAACCACCACCACCAATGGAAACCATTCAACAACTTTTACCAGCCCTT
GGTGTTCTCATCCACCACAATGACCTTGATTTAACTTTTCTTCGAAATGT
AACATGGGTTATTGTCAATTTATGCCGTAACAAAGAACCACCACCACCAA
TGGAAACCATTCAACAACTTTTACCAGCCCTTGGTGTTCTCATCCACCAC
AATGACCTTGATATTCTTGTGGACAGTGTTTGGGCTTTGTCCTACCTTAC
TGATTGTGGTAACGACCATATTCAAGCTGTTCTCCAAGTTGGGGTTGTTC
CAAAACTTGTGTCTTTCTTAACGCACACTGAAATAAGACTACAGATTCTT
GTGGACAGTGTTTGGGCTTTGTCCTACCTTACTGATTGTGGTAACGACCA
TATTCAAGCTGTTCTCCAAGTTGGGGTTGTTCCAAAACTTGTGTCTTTCT
TAACGCACACTGAAATAAGACTACAGACTGCTGCATTGAGAGCTGTGGGC
AACATTGTCACTGGCACAGATGAACAAACACAATCAGTATTGAATAATGG
AGCTCTTGGACAGTTCCCTTCACTGCTTTCACATCAAAAAGAAAAGATCA
GAAAGACTGCTGCATTGAGAGCTGTGGGCAACATTGTCACTGGCACAGAT
GAACAAACACAATCAGTATTGAATAATGGAGCTCTTGGACAGTTCCCTTC
ACTGCTTTCACATCAAAAAGAAAAGATCAGAAAGGAGGCAGTTTGGTTTC
TGTCTAACATCACTGCTGGAACAGAAGAACAGGTTCAGCAAGTTATCGAT
GCTGGCCTCATTCCTTTTGTCATCAAAGCTCTTACAGAGGAGGCAGTTTG
GTTTCTGTCTAACATCACTGCTGGAACAGAAGAACAGGTTCAGCAAGTTA
TCGATGCTGGCCTCATTCCTTTTGTCATCAAAGCTCTTACAGAGGGAGAA
TTTCAAACTCAAAAAGAAGCTGCTTGGGCTATCAGCAATTTGACTGTCAG
TGGTGTACCAGGACAGGGAGAATTTCAAACTCAAAAAGAAGCTGCTTGGG
CTATCAGCAATTTGACTGTCAGTGGTGTACCAGGACAGGTTGCATATGCA
GTACAAGAGGGTTGCATTCCACCGTTCTGTAATTTACTCAGTGTACAAGA
CCCACAGGTTGCATATGCAGTACAAGAGGGTTGCATTCCACCGTTCTGTA
ATTTACTCAGTGTACAAGACCCACAGATTATTCACATTGTCCTTGATGGT
CTGACCAACATCATGAAGATTATTCACATTGTCCTTGATGGTCTGACCAA
CATCATGAAGATGGCTGGAGATGATGTTGAAAAGATTTGTATCATCATCG
AAGAATGCGGAGGGCTAGATCGTATTGAAGTCCTTCAAAATCATGAAAAT
CCTGATATTTATAAACTGGCGTACCAAATCATCGAAAAATACTTTTCAAA
TGATATGGCTGGAGATGATGTTGAAAAGATTTGTATCATCATCGAAGAAT
GCGGAGGGCTAGATCGTATTGAAGTCCTTCAAAATCATGAAAATCCTGAT
ATTTATAAACTGGCGTACCAAATCATCGAAAAATACTTTTCAAATGATGT
TGAAAATGAAGACGAGACGGTGGTGCCCGAGCAAAACCCACAAGGACAGT
ACCAATTCAATGCCAAAGCAAGTGAGACGTCCAAATTCTCACTGTAAGTT
GAAAATGAAGACGAGACGGTGGTGCCCGAGCAAAACCCACAAGGACAGTA
CCAATTCAATGCCAAAGCAAGTGAGACGTCCAAATTCTCACTGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000269_pilon | genome | sc0000269_pilon:135842..142124 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1450-1548:100 |
| Aaloc | 1306-1449:515 |
| Aaloc | 1264-1305:710 |
| Aaloc | 1195-1263:999 |
| Aaloc | 1123-1194:1708 |
| Aaloc | 1018-1122:1956 |
| Aaloc | 889-1017:2245 |
| Aaloc | 757-888:2833 |
| Aaloc | 625-756:3422 |
| Aaloc | 370-624:4395 |
| Aaloc | 322-366:4675 |
| Aaloc | 220-318:5271 |
| Aaloc | 193-219:5494 |
| Aaloc | 67-192:5798 |
| Aaloc | 1-66:6284 |
|
