XLOC_042811 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_042811
Unique NameXLOC_042811
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000001_pilon:3950485..3963726-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_042811 ID=XLOC_042811|Name=XLOC_042811|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13242bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001_pilon:3950485..3963726- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AATATTGAAAGTCAACGTCAACGAGAAACTCTCTTACACGACGCTCTACT TTCGATACGCTCCCTTTTTTTATGAAAATACAATTCCCCTTGAAATCGTA GAGAGCCTCAATTGATGCAAATTCAGCATTTTTGCAAAAACTCCTAAAAA ATGAAAGAAATTATGTAAAAATAGGCTGATTCGTGAAATTTTTCCACGTC AAAATTTTAGATCTCCGATTCGTAAAAAAAGTCTGCTCGAAAATTTATCT TCTTTACTTTTTTCCATCAGGTGTCGGAGGCAACTTAGTAGCAGTTCAGG CAAGTCGCTTATCAACTTCTTTACATTTGAAAGTTCCACTGGGTACATTA CCGGACGCTACAAACTACGGATGCATACGGACATTTTGCACGGGTGGTAA GTTCTTCTTTTTTTCTTCTAAACAATACTAAAATATTTTGTCCGAGGCAA TCATTTCTCCAAAGTTATAAGTTTGAGTGGGGAACGACTTAAGACGTTTA TGTGAACACAGCCAACTCTCTCTCTTATTCAAACTTGCTCTCTATTTCGA AAATCTTTCTAGCATTTTATGAGGTCGAGTCAGATGGAGTCGATTGTAAC TCTGGTCTTTAAAATCTAGAAATATGAGTTCAAAATCAAGCCTATTTAAT AGTCGACCAGACAGATATTTATAAATGGATCAATGGAGAAAGATAAAAAG ATTTACGATGGTATTTCATCATTATACTATACAATGATATATAATATACC ATAATCGGATCTTAAATGTGGCAATGGATGATCTAATTCATCTTGATGAT TTCCAGAGAACTTGCCATTGAAAGTTGAAGTTTTTAAAACAAAATTACTT TCTCGATATGCGAAGAAATGTGAGTCTTTTGGGAGGGCATGGAAATGGAA TGGTTGAGATCGATTGAGTATAAAGTGTTTTGATACAGAAAATCAATGTT CTCACTCGACGAACAAAATTTTGTGAACTCACACAAAACATTTTACATTT ATTTTATACTTTTTTCCGGATAACAAACGGAAACTTATGGGTAATTTCAG TTTCGGAAAACAATTGACACGGGGTATACGAGAACATAAGCAAAGATTGG AGACAATAGAATTTGATGTTTTTCAATATATTACATACAACGTTTTGGTC TCATATATTATACGCTAATTACAAGAAAACTGGACTTCTTCCAGAAAACT GAAGAAGTTAAAGAATTGAAAGATGTCGACAAGCTTAATTGACAAAATTA TTGAAAGGGCACTAGAATAGAAGGGTTGAGATTTAGAGATCGATCGAGTG TAAAGTTGAGCGAGTATAATGATTATAAAAGCAAGAGGCCTAGATTTGAA AGAGGTGGGGAAAAGTGAAATGATGGAAGGGTTTAAATTGGAGGGAGGAG GGAGTGTTGGGAATGGGGAGGAGAGCTAAAGTTAGGATGATGTCGTTGAA AGACGATTTTGAGATAAGAGAAGGTTGTTAAAAAGGAGAGAAAGATCTAA AAAAGGGTAAAAGGTCATTCGTTGTGTCCCTGAGTACATAATTTCCACAG TGGAATCTTCGGTTTTCATTTCAAAGGACAGAGAATTTCAAGACTTTACC GAGAGAAGAAGTCTAGTACCCGAGAAAGCTTTTTGAATCTTTTATGGATC AGAAAATTAACCATGAGGTCAAAGAAAGATATTTTTTTGAGCCCAATCAG TTTTTTATTGGTATAAAATTTGAGATTACTGAATTCCTTAAAAACTTTTA AAACTTGATCATTTGCTATTTTCTGTAATCGTATGTTTTGTCTGCAAGAT CAATTTTCTGTCCACATAAAGATTCAGTCGAACTTAACTTGCGTACTATA CTCCTTCTCCTGGGAGGCTTGAAAAACTTTGCACTTTCAAATGGAAACAA AAGATTCAACAATAGAAATATTTCCACGAATCTAAAGGAAGGAACCTTAA ACTAGAAAACAAAAATTGGAAAGAAAATAGAAGGTTTACAAAATATTTAT TGCGAAGAGTTGTTGTCGTTGTTGTTGAAAGAACTTTTTAGTTGATTCAA TCCTTGTTCCAAGTCCATGAAAAATTGGTCGAAATGTTGTTCAATGACAT CGATAGCTTCCTTGGATTTGATTTCAAAGAATTTGGATGGCAAGGTGTTG TTTACACTTTGAGGCGCGTGGGTTTGTGAGTAGCTTTGGTGTGAGTAGCT TTGCTGGTGCAAGTCTCTTTGTCTTTCATGGCTGATTAAGTCGGCCGAAT TATCGTCGACTTGTTTAGTAGTCAAGAGATCTTCGTATTCCATTGGAGTG CTATCGACTTGTTCAGCAAGCTCGTTGTATTCCATTTGTAGAGCGTACAT TTCTTGTCGCTCGGTGTTGATTACCGCTTCCATTTGGTCGTTTGCTTGCT CGTAAAAAGTCAATCTATCTTTCAACGATCGGATACGACGAGAAAACCTC TTGATGCGTTGGTCTTGTTCTTTTGTTGTGAGCAACAAATCTTCGATGCG AAGTTCTAAATCTTCTTTTTCTTCTTCAACTTGTCGGTGCATTTTGATGA AATATTTTGTGCTCCGTTCACATTTGTCGAATTCTATTTGAAGGTTTGCG ATTTGCTTTTCTTTTTCAGCACGAAATTCTTTCATCCCTTTCTTCAACAA ATCGATCGCAATTCCCTTGGAAATGTTTTCTTGTTCCAAAGATTCGATTT TATCTTTGAATGTCCGGTCTTCTTGTAAACGAAGTTGGTTCTCTCTTTGG AGAGAATCGATAGCAGCATCTTTTGAATGAAGTTTATTTTGCAACAATGC AATTTCTTCTCGCATTATGTGTCCTTCTCCGATGCGAGCGCTATTTGTTT CCTTTTGAAGAATATTCAAAGCTGCATCTTTTGAAATGACTTTATTGTTC AGGGAGGCGTTTTCGGCTTCCAACCGAAGAAGCCTTTCCCGGAGTTGTTG GTTCTCTTGAACCTGAAAGAAATAATCATAAACTTATCATAAGACTAATT CCATTTAAAATTAACATCTAATCATTTCCAGTTCGTCAGTTGAGGACGTT TGCTGCAATAAATTATGAAAATAATGCCAATCAAATCTTTTTGCAAGACT GGTTACAAGATTGATTTAAAGATTTAGAGATAAACTTGTGAAGAAAATTC GATTTCATCTGAAATGAAAGAAACTTGGAAGAGAAAATTTCTAGCAAAAC TTACCAAAAATGATTCATTTGTGCCCTGGCACGTTTTGTCTTCCTTAATC GAAGACATATTTCACAAATTAACAAAATTATTTTCACTGAAAATCAGCAA AAATATCAAATATTTTTCACAGCGACGTTGCTAACGACTGGCGTCAATTG TTGTCTAACGAAAAATCTCGAGAGCTAATTATAATTTCGACTATCATACT GATGAAAAATATTTGACGTCAGTTTTTTGTTCGCACGTCACTTTGAAAAG TAAAATGGTAGCATTTCATCACTCAGGGCGCTTTGCACTCCTCAAGAAGA ATTTCTGCAAAAGCAATGGATGCCTCGTGAAAATGTCATCCTATGTTTTG AGCTTTGAATTCGAATTCTAAACCCAAAGCATTAAACAATAAACAAAACG ACAAATCACAATTCTTGTACTACAAAAATGCAGAAGAAGAAAATTTAACA TGTTTCCAAATGAAACACCCCTGGTTACAGACCCGCTGAGCCCCACTGGA AAATTTGGCGAAAATTTCGTCCCCAGAGGGAAAATACCCTGAAATTTCAG CACCGATGGGAAATTGACTATGATTTCATCCCCATTCGAGATTCAATGTT TAAAAATTGTACTCTAAAACCATCCCTACTGATTTTTTAACCTTGGAACA ATAAAATTTCTATCCCCATTGAGATTTCAATAGGAATTTTCATCCCCACT TAGGAAAAAGTTCCACCGGAGCTGTGAGACAGGGGTGTTAAGATTAACAA CAGTGTGTATTAGTATAAGTTTGGTAAAAGAGGACTTAGAAATTGAATTT CAAACACGTGTTGCTTATTTTATTTTCATTTTAGGTGGTCACTCTCGGAC GTCACGTGTTTTGTTAGCGATGAGCATCCCTGGTCATATCATCTTTCTTG CCATCATTTCAAGTTTGAAGGCTGGTCACACGAGCACTACTGCTCGATTT TTTTGTATGTACATTTTGGCTGGCTTTATTCAGGTATACTGGTCGGTTTT TTTGTTTTTCTGATTTAGTGGAATAGGATATTTTGTCTTAGCAACCGTAG TGCAATTTTTCTATGTGATTTAATTTCGCTCCTTTTAAATATTCTTAAAC ACCTTATTTTAGCTCTTTTTATGCTGACGTAAGGGATCGGAATTAAGTTA GGGCCGGGTTAAAAATGGAAAAGTTGAGCTTTGGCGTAAAAAAGGCTGAC GTGCTGACGTTAAAGAGGCCGGCGCTAAAACTATGGACGGTGTAAAAAGG GCCGATGAGGTAAGATTTTGAAATGCTCAATTATTTTTTTGTCTATTTTT CTCCAGGTGGCAGCTCTCTTATTCATTTGCAATTGGCTGGTTCACATTCT GTGGAAGTATAGAAAAGACCCCGACAACTATTCCATCCCTTATCTGACGG CGTTGGGTGATTTGCTGGGTACAGCTCTACTCGCTATTGACTTTTATCTA CTGTTTCTTATGGGTGATCGAGATGATGATTTGGGTGAATGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000001_pilon:3950485..3963726-

>XLOC_042811 ID=XLOC_042811|Name=XLOC_042811|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3192bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001_pilon:3950485..3963726- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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ATAATGATTCTGGGGCTGAGAATGGGATAATGAATCCCAGTAAAAGAAGT
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TGGGAGTGATTTTGAGATTGTTGACCATAATGATTTTGATGACCTTCAAG
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ACAGCTGATGTGGATAATAACAAAGAGAGTAGTTTTTTCATTGCTTTGCA
AGTATTTTTCCCCTTTTTTGCTGCTGGTTTGGGAACAGTTGCTGCAGGTT
TGCTACTGGATCATGTTCAGCATTGGAAAGTTTACATGGAAATTCCAGAA
GTTTACATTCTTGTACCGGCACTTCTTGGTCTGAAAGGCAACTTGGAAAT
GACTTTAGCATCAAGATTATCCACTGCACATTGGAAAGTTTACATGGAAA
TTCCAGAAGTTTACATTCTTGTACCGGCACTTCTTGGTCTGAAAGGCAAC
TTGGAAATGACTTTAGCATCAAGATTATCCACTGCAGCAAACATAGGCCA
CATGGACAGTCCAAAAGAGAAAAGGTCTATTGTGATTGGCAACCTTATAT
TAACGCAGGCAAACATAGGCCACATGGACAGTCCAAAAGAGAAAAGGTCT
ATTGTGATTGGCAACCTTATATTAACGCAGGCACAAGCTTTAGTGGTGGC
TGCTCTTGCTTCAATGGCAGCTGTTATATTTCGATGGGTACCAAGTGACC
AGTTCAACATTCACCATGCTTTCCTCATGTGTGCAAGTTCCCTTATCACT
GCATCCTTGGCAAGTCTCCTACTCGGTGGTGTCATGTGTACTGTAATCAT
ACTCTCCAAGAAGTATGGTATCAATCCTGATAATGTTGCTACACCCATTG
CTGCAAGTCTCGGTGACCTGGTTACATTGGCTTTGCTATCATTTTTCAGT
GACTTTTTACATAGGAAGATAGGCACAAGCTTTAGTGGTGGCTGCTCTTG
CTTCAATGGCAGCTGTTATATTTCGATGGGTACCAAGTGACCAGTTCAAC
ATTCACCATGCTTTCCTCATGTGTGCAAGTTCCCTTATCACTGCATCCTT
GGCAAGTCTCCTACTCGGTGGTGTCATGTGTACTGTAATCATACTCTCCA
AGAAGTATGGTATCAATCCTGATAATGTTGCTACACCCATTGCTGCAAGT
CTCGGTGACCTGGTTACATTGGCTTTGCTATCATTTTTCAGTGACTTTTT
ACATAGGAAGATAGATGATAATGTGCATTTATGGATTGCACCATTTATTT
GTTGCTTGTTTACGCTGATGCTACCATTATGGTTTTACATGGCGCATCAC
AACAAATATACTCATACCACGCTTTACAATGGATGGTCACCTGTGATTAT
AGCTATGTGTATAAGCAGATGATAATGTGCATTTATGGATTGCACCATTT
ATTTGTTGCTTGTTTACGCTGATGCTACCATTATGGTTTTACATGGCGCA
TCACAACAAATATACTCATACCACGCTTTACAATGGATGGTCACCTGTGA
TTATAGCTATGTGTATAAGCAGTGGTGGTGGCTTGATACTGAGTTATTTC
GTACAAAGATTCAAAGGGATCGCTGTCTTCAGTCCAGTCATCAATGTGGT
GGTGGCTTGATACTGAGTTATTTCGTACAAAGATTCAAAGGGATCGCTGT
CTTCAGTCCAGTCATCAATGGTGTCGGAGGCAACTTAGTAGCAGTTCAGG
CAAGTCGCTTATCAACTTCTTTACATTTGAAAGTTCCACTGGGTACATTA
CCGGACGCTACAAACTACGGATGCATACGGACATTTTGCACGGGTGGTGT
CGGAGGCAACTTAGTAGCAGTTCAGGCAAGTCGCTTATCAACTTCTTTAC
ATTTGAAAGTTCCACTGGGTACATTACCGGACGCTACAAACTACGGATGC
ATACGGACATTTTGCACGGGTGGTGGTCACTCTCGGACGTCACGTGTTTT
GTTAGCGATGAGCATCCCTGGTCATATCATCTTTCTTGCCATCATTTCAA
GTTTGAAGGCTGGTCACACGAGCACTACTGCTCGATTTTTTTGTATGTAC
ATTTTGGCTGGCTTTATTCAGGTGGTCACTCTCGGACGTCACGTGTTTTG
TTAGCGATGAGCATCCCTGGTCATATCATCTTTCTTGCCATCATTTCAAG
TTTGAAGGCTGGTCACACGAGCACTACTGCTCGATTTTTTTGTATGTACA
TTTTGGCTGGCTTTATTCAGGTGGCAGCTCTCTTATTCATTTGCAATTGG
CTGGTTCACATTCTGTGGAAGTATAGAAAAGACCCCGACAACTATTCCAT
CCCTTATCTGACGGCGTTGGGTGATTTGCTGGGTACAGCTCTACTCGCTA
TTGACTTTTATCTACTGTTTCTTATGGGTGATCGAGATGATGATTTGGGT
GAATGAGTGGCAGCTCTCTTATTCATTTGCAATTGGCTGGTTCACATTCT
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CGTTGGGTGATTTGCTGGGTACAGCTCTACTCGCTATTGACTTTTATCTA
CTGTTTCTTATGGGTGATCGAGATGATGATTTGGGTGAATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_042811XLOC_042811-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000001_pilongenomesc0000001_pilon:3950485..3963726 -
Properties
Property NameValue
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