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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000032_pilon:470310..475525- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_042805 ID=XLOC_042805|Name=XLOC_042805|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5216bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000032_pilon:470310..475525- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AACAAATTAAAGTCATCACAACGTGACAAGGTCCGGCAATTCATTTCTTT
CACCAACACTGGCGAGAAGACGGCAATCTTCTGTTTGAGTTCTCATGATT
GGCGAATGGACATTGCTACGGACAATTATTTTCAACACCCAGAACGTTAC
TTCAAGGAGAATAGCAAAAGTTCCTCCTCTGATAAAAATCGAATCGACAA
GAAAAAAATTTTACACTTGTTTGAAAAATATAAAGGTATACATCATTCAG
TCCGTTACAAAGCGATTGCAACTTTTTTATCTTCTTTTTATTAAATAAAC
CATCTGTTTGGATATTAATTGAATTCAAATAGGAATGGTTTTGACCTTCT
TTCAAAGGTTGACCTCAACGGGTAGAACCCCCCCTTGATCAAGTGGGATG
GGCTTGGAGCAAAGATCTAGTATAGGGGGAAACTTTTATTTAGCTAGCGA
GAGAGTAATTTAGGTTAATAGAGAGCAGGCGCAGAGGGACCTTATGCTAA
GGAATAATACCCAAATCTAATTGAAACTCTTTTAGGCACCTACTCTAATA
AGTGCTCCCTAAAAGTTCTTTGCCATTATATTTTTCTCCCAAATCCCAAA
AAATGCTTATTTGAATTTTAAATTTTTGCCCGAAAATATTTAATTCTTTA
CCCTGGTTTTAAGTTTTTACAACCCTTTCCAAAGCCTTTGGATTTCAGAT
GGAGAGGATTTTGGAGATAGTCATTCTAGCTGCCAGAAAAATGTCTAGTT
AGATTATTCTAACATATACTTTTGATGTTTCAACAAAAGTTTCATATGTC
ACTATAAAAATCAATTTTCGTAGTTTTAGAAGGAACTTTTTAAGCTTTAT
TGTCAGGAAGAGCTGCAATCACTTTGATTATATTTTGACTGAATTCTGGC
ATCAAGATACTATGGTTTGAGATTATAATAGTCTCATTATCAAACAAAGC
ACCTTATCTCTAAAAAGTGTGTCCCATATTTACCCCGTAGTGAAATCTTA
ATTTTGGGGTAATTATGGGACACTAAAGTTTGAGTTTCAAGTGTTTATTT
TTTATAAGAAAATTACAAACTTGATTTTCTAGTTTAATGGAATCATAACT
ACACTCTAAGTCTTTCAAAACCTGCAAAGGTTTGCATCTAAATTTACTTC
AGTTGGTCTAGATTGCTCTATACAAATATTACTGTTTAAGTGTCCCGTTA
TTACCCCCAAATGGGAAAAAATCTGGGGTAAAAACGGGACACTGTCACTA
TTTTTGTTGAAAATCCTTTAAATGATATGTATGTAGCACTTGGATTTGAA
GTCATCAAGTGAATGCAAAACCTCAAATATCATGACCCTTTGGAAAGATA
TCTGGATTTTTCAATAACATTTTATACCTGTCCCATATTTACCCAAAGGA
TGTCCCGTAATTACCCCCAAAATGCGGAGTAATTACGGGACACCTTTAAA
GTAAATTTTAGGAACATCTACTAAATTTCAAGGAAAAGTAATACATCTTA
TGTAAAGGTCATACTTTGAAAAATAAAATATCAAAAGATCGGATCTCTAG
GATTAATACTTTCAGAGTAATGCCCAAATAAGTCAAAATCGTCCCGTAAT
TACCCCAGATGACTATACACTTGTTCCTTGGGTAAATCTCATCTGGTGGA
CAATTTTTAAAAATTTAGATTTTCGGGGTCTGGGGACGAGTTTATGCACC
TTAAATGAAGTTAGAACATATTCTTAGTTGATTATACTTCTAGAACGCTC
AGATTTTTTTCATCAAACTTACCTATTAATCTTATAATTTGAGCCTACGA
ATGATGCAAAATAATTTGAGCCCACATTCGACAGTACCAATATTTTCTTC
TCGTTTTTAACGAGTTTATAAATACTTGATTCTCATGTTATTTAGACCCA
CATGAAGACAAAATGCTAGCCAACGGTTTATCCAAATTCTGCGAAGACAT
TGATCTGGATCCAGCAAGTTTTGAAATCTTGTTAATCTGCTGGAAATTCA
AAGCAGCTGTTCAGTGTGAATTCACAAGGAAAGAATTTACCGATGGCATG
TTAGAATTAAGGTACATGATTTTTTATAAACATTGCATTCATGATATGGC
AAAAAAAAAATAGCATTTGCTCAGCATTACGTGACCCTACATTTTCTGAT
TTTTGCTGTTTTTGGCTAGATTTTACGGATATTTGGGATTTCCCTAAAAT
TTTGCTTAGTAGGATGTAAGCATCCTTCAAGTATTTTTCAGCCTTGTCAA
TCTCTAGGTCCAAGCCACCTCCGAGCCATTTATTGGAACTTTATGTGCTT
AATAAAAAGAAACATGCTACAAAAATGAAGAAAAAAAAATTTTTGTAAAC
ATTTTCTAGTTGTATGTAAGGAGTTTGTGTATTTTTATGTTGTTCTAAAA
ATGCGTTTTTAGATAAGTGCTGAATCTGGCTGAATGTATTACTTTGCTTA
AAATTAATATAAGGCGAGGCCACTTTGATTAGTTGTTTTACGGGCTCGAC
CGACCCTGAAATTCCTAAAATTGAAATAAAAACTTTGGTAGTTTTTCCAT
GGTTTCGAGAATTCTATGTTCAATTTTTGATTTTATACATGAATTCGAGC
TTTTTGTGCCTTTTTATTTTCTATTTCGCATTTTTGTTAAGATGTAGCAG
TTTTTGCTGCCTTTTTAGGAGATTTTAAAGGTGAAATTCTACTTTTATTT
TTATTTTTTTGCCGACCGACCGACCCTCTTTTTTGGGTAGCTTAACCCAT
AAAACAACAAATTAAATTGACCTCGCCTAATCAATTCTTTTCATGTCTTT
TTATCTGTCCAGTGTCGATAGCTTGGATGGGTTGAAAAGAAAAATGCCCA
GTGTAGAACAAGAGTTAACAGACGCTGCAAAGTTTCGTGATTTATATCAA
TTCACTTTCAATTTCGCTAAAAATCCTGAACAAAAAGGATTGGGTGAGAA
AATTATCTTTTCCCAGTATTTCAATGCTTTATTATACCTTTTTTATATCG
ATGATTGTATTGCTCTATAGTACTGAGAATCGCTACCAGTAGCAAACATC
AAACTGGATAATCAGATGGTCAGATGGTTTGAGATCTTTTGACTTAGATT
TCATCCATGATCCTGAGAAAAACCTTTATATCTTTCTACCTGACTCCTTT
CCTCCAAAGTCATGAAAAGTTAATTTGACATTTCTAAAAATGGGTTCTTA
CACGGTTCTTACGTTAGAATATTTTCATCCTAAAAGCCAAAAACTTTTCA
CTGGAATATCTTGGCTTTGGAAAAGAGGTTTGGAGGTTTTGCTGGGAATT
GTAAGAATCTACAGGCAAAACATCTAAAAAAATCTAATTAGTCCCTTAAT
TGTAATTTCATTAACAATCATATACTTTGTTTCAGATCTAGAGATGGCGA
TTGCTTATTGGAATATTGTGTTCAAGGGTCGCTTCAAGTTTCTCGAATTA
TGGGTGCAATTTCTTACTGTAAGGATTTTTTTGGTTTTCCGACTAGATCT
ACTTGTTATGTTATAGTCAAACATTTATTAAAATCAGATACTCCTCAGAA
ACGTTTTAGAATACATCAGGCCTACAAACTTTTGCGAGCAGAAACTTTCG
CCCTTTTCGCGAAAGTAAACGTCTTTGAAAATTCTTGATAGAACCATTCG
CGAGTATCAAGTAAATTTTTTACGTGACAAAAGTTTATGCTAGCGAAAAG
TTCTTACCATAATAGAATAACTGTAAAACTTCTAATTTTAAATAAATCGT
AGGGATTATACAGTAGACTTTCGGTTATTCGAGACTGCCTATTCGAATAG
GCAGTCTCGAATCCCCTTGGATTTGCTTACCAAACTCACGCAAAAACACT
CTTAGCTATCCGAACTTATTCAAACTCTCAGTTACTCGAAGCATTTCTAT
ATATATTCTGTCAAATTTGCGAAAGTCAATCTCGTAAATGTAGCGATTTT
TCGACCTCGTGAAAGTTTGTAGCATCTTCTAACTGTTCCGGAATATTAAA
TAGATTCTATACAAGCCAACCCTAGGCGAGGATAACATCTTTTAGCGTCT
TCTACACTGTCTGCACCACAAAATGTAGGTTCACCACAAAAATTAGGGTT
TTTGGTTTGACGTCCGTTGAAATTTATTCAGTGTGTGTTTGAAACCAGAA
AACTTTGGAAATGGAGGACCTATGATGAATATATCAACATATCTAAATTG
TAATCATTGCTTTTTTTGATAGTTTTCTTGCAAAACCAGGGATTTTTTTC
CAAAATTAAAAAATAAGTTTGTCCTACAAACTGGAGCCAATTTTTAAAAG
CTTTGTCCGTCCTGAACATTGTGTCAACATTTTATGTTGGAAAAACAAAG
AAAAACATATTTTTTGAATTTCTATTGATTCTGTATTGTATTAGGTTTTA
CCACACAAAATTAACAAGAAGATTTGTTGATTCCGACAGAAGTTAGACGG
AATAAGGCTCGCCTATATCTGTGGGTGGAGCAACTTTAAAACTGAAAGTT
CGAACTTGACTGATTTTTATCCATAATGGTTTTTAGAATTGATCACTATG
AAAAAAATTTTTGTGACAAGTAAGTGCCATAAGACTCAATTTTGTATTTC
CAATGATTTCTTAAGGCATCAGAAAAATGCAGAATTTATCGACATATTGG
GGCGCCGGCAGTGTACCCGAAAATAGTTCCCATTTTGTCATAATTGTGGT
CTAACTCGACCAATTGTAGCCATGTTGTTATTTTCTCCCCATGCAGGAAA
ATCAAAAACATTCTATACCAAAAGACACGTGGAATTTATTGTTGGATTTT
TCTAATTCTGCCAACGATGATATGTCGAATTACGATGAAGAAGGTACTTA
TAGCTCTTTTTTTCTTTCAATTCCCACTTTCTTTGTCTTAATTTCATTGG
GTAAACTTTTATGGGGATTAAATTTGTCCCTCTTTTGATTTCGGTTTTTT
TGTGGGTCATCCCTAAGCTAAAAATTTGAAATTTGACTTAATCTTATTTC
TAAAAGGTCTAATGAGTAGATTTTCAAAGAGATGGACACTCTATTTTCGC
ATTTTTTTTCAAGATCGTTTCATTTCGAGATTTGAATTCTGCAAAGTTAT
ACATTCCAGTATGTTTAGATTTTTCTCATTTTTTAGACGCATGGCCTGTT
TTGATCGATGATTTTGTAACATGGTCCAAACCCAGGATACAGAACAAAAA
AACAACGCTGGTTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000032_pilon:470310..475525- >XLOC_042805 ID=XLOC_042805|Name=XLOC_042805|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1584bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000032_pilon:470310..475525- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AACAAATTAAAGTCATCACAACGTGACAAGGTCCGGCAATTCATTTCTTT
CACCAACACTGGCGAGAAGACGGCAATCTTCTGTTTGAGTTCTCATGATT
GGCGAATGGACATTGCTACGGACAATTATTTTCAACACCCAGAACGTTAC
TTCAAGGAGAATAGCAAAAGTTCCTCCTCTGATAAAAATCGAATCGACAA
GAAAAAAATTTTACACTTGTTTGAAAAATATAAAGAACAAATTAAAGTCA
TCACAACGTGACAAGGTCCGGCAATTCATTTCTTTCACCAACACTGGCGA
GAAGACGGCAATCTTCTGTTTGAGTTCTCATGATTGGCGAATGGACATTG
CTACGGACAATTATTTTCAACACCCAGAACGTTACTTCAAGGAGAATAGC
AAAAGTTCCTCCTCTGATAAAAATCGAATCGACAAGAAAAAAATTTTACA
CTTGTTTGAAAAATATAAAGACCCACATGAAGACAAAATGCTAGCCAACG
GTTTATCCAAATTCTGCGAAGACATTGATCTGGATCCAGCAAGTTTTGAA
ATCTTGTTAATCTGCTGGAAATTCAAAGCAGCTGTTCAGTGTGAATTCAC
AAGGAAAGAATTTACCGATGGCATGTTAGAATTAAGACCCACATGAAGAC
AAAATGCTAGCCAACGGTTTATCCAAATTCTGCGAAGACATTGATCTGGA
TCCAGCAAGTTTTGAAATCTTGTTAATCTGCTGGAAATTCAAAGCAGCTG
TTCAGTGTGAATTCACAAGGAAAGAATTTACCGATGGCATGTTAGAATTA
AGTGTCGATAGCTTGGATGGGTTGAAAAGAAAAATGCCCAGTGTAGAACA
AGAGTTAACAGACGCTGCAAAGTTTCGTGATTTATATCAATTCACTTTCA
ATTTCGCTAAAAATCCTGAACAAAAAGGATTGGTGTCGATAGCTTGGATG
GGTTGAAAAGAAAAATGCCCAGTGTAGAACAAGAGTTAACAGACGCTGCA
AAGTTTCGTGATTTATATCAATTCACTTTCAATTTCGCTAAAAATCCTGA
ACAAAAAGGATTGGATCTAGAGATGGCGATTGCTTATTGGAATATTGTGT
TCAAGGGTCGCTTCAAGTTTCTCGAATTATGGGTGCAATTTCTTACTATC
TAGAGATGGCGATTGCTTATTGGAATATTGTGTTCAAGGGTCGCTTCAAG
TTTCTCGAATTATGGGTGCAATTTCTTACTGAAAATCAAAAACATTCTAT
ACCAAAAGACACGTGGAATTTATTGTTGGATTTTTCTAATTCTGCCAACG
ATGATATGTCGAATTACGATGAAGAAGGAAAATCAAAAACATTCTATACC
AAAAGACACGTGGAATTTATTGTTGGATTTTTCTAATTCTGCCAACGATG
ATATGTCGAATTACGATGAAGAAGACGCATGGCCTGTTTTGATCGATGAT
TTTGTAACATGGTCCAAACCCAGGATACAGAACAAAAAAACAACGCTGGT
TTGAACGCATGGCCTGTTTTGATCGATGATTTTGTAACATGGTCCAAACC
CAGGATACAGAACAAAAAAACAACGCTGGTTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000032_pilon | genome | sc0000032_pilon:470310..475525 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 718-795:79 |
| Aaloc | 619-714:471 |
| Aaloc | 538-618:1830 |
| Aaloc | 406-534:2404 |
| Aaloc | 241-402:3320 |
| Aaloc | 4-237:5217 |
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