XLOC_042803 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_042803
Unique NameXLOC_042803
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000032_pilon:401815..416999-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_042803 ID=XLOC_042803|Name=XLOC_042803|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=15185bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000032_pilon:401815..416999- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TGATCTTTTCAAGACGTATATATATACGCCTTTCGCCTTCTAAGGGTTAA ATCATGATATGCACCATTGCAATGTCTTCCACCTAACAGCTGATTTGTTG AAAGTGACTTATTGACAGATTTTACGTCACTTACAACCAATCAACTATTC ATGATATACACCACTGGAGAGTCTTCTGAGAATTTTTGAAACTTTTCATC CAATACGTCACTTTTTCTATTGTTTAAGTGACGTAATGGGTGGAAAATTT CAAAAATTCTCGGAAGACTCTCCGGTGGTGCATATCATGAATAGATAACT GTTGGATTCTCTTCATTTCAACTATTGGAATCTTCTATAAATTCTCAGTA GCCACCAAGATGATATCCTCATGTTGAATATCTCTCTATATTTCGGATAG GTTTTCTGTCTCTGTAGTGATTCTATCAAAGCAGATTCCCCTTTCGACAT TCAACGTATCTCCTACCATTTGTTGCTTACACAGCATTTTTAAATAAAAA CAGAAACAAGTTTCTCACCCTCACGCGTTTCGTGAGCACCAAATTTGAGA AATTCTATAAAGGCGCGCCTCCTCTTTATATCATAATGTAAAATATTTTT TTAAGACTCATCTCATTTCGTTTCATTTCAGCTCCCTTACATGTATTCAT ATTCAACGGTGAAAGGTGAATTCGTTGATGACACGTACACGTGCGTCAAA TCAGTCTCCTTCACCACGCCTGCTGTATCGCCTTCCTTTGAACTGAAAGA TTACGCTTCCACCGAATACTCCACGTGGACTGAAAGCATGTAAGTCGTTG TCATCTGATATTCTGTTGGAGGAATGGCGGAATAGCGTCTGCCCACGCAG GCCAATATTTTATTGGAGCGAATTGTAGTCTAGATCATTCGATTTGTAGT CACCCCCTTCAAACGCTCCCAGAAATAAGTCATTACTTATTAAGTAGACT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000032_pilon:401815..416999-

>XLOC_042803 ID=XLOC_042803|Name=XLOC_042803|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4212bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000032_pilon:401815..416999- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GACAGATAGAAAACAAAATCTATGACAACTTGAAATATTTCCAACAGTGT
ATTTTGTTGACAAACGCAACACATCAAGTTGGATGTACATCTGATATGAA
TGGGAATCGTGGAACGTTACATTTCATTGATTCAGATGAAGATTTGCAAT
GGCTTATCAAGAAAGGCAGTCACACACCCTACATCCCTCTTTTAAATGCT
TCCATGTTCACTAGCTGATATGAATGGGAATCGTGGAACGTTACATTTCA
TTGATTCAGATGAAGATTTGCAATGGCTTATCAAGAAAGGCAGTCACACA
CCCTACATCCCTCTTTTAAATGCTTCCATGTTCACTAGGCCTGTCATGGA
TAAACTCATGGAGTCAAAGAAGATCAGTGGGGTTTTAATGATTCACGAAC
CTAAAACTCAAAACCCAACAGGCCTGTCATGGATAAACTCATGGAGTCAA
AGAAGATCAGTGGGGTTTTAATGATTCACGAACCTAAAACTCAAAACCCA
ACAGAGTTTTCTCCTGAGGACACTTGCCCATTGGATAATTTTGAGTTTTC
TCCTGAGGACACTTGCCCATTGGATAATTTTGGTATTTACAGTGGACATA
AAGAATATGGAGATTGTCAAAAAGTCAAATGGAATCCAGTTGTATTTACA
GTGGACATAAAGAATATGGAGATTGTCAAAAAGTCAAATGGAATCCAGTT
GGAAATGGAATGTCATTTGTGTATTACGGTATCCCAATATTTTCACTCAC
TAGCAGACACGAAATCGATGCACTTATTAAGGGAAATGGAATGTCATTTG
TGTATTACGGTATCCCAATATTTTCACTCACTAGCAGACACGAAATCGAT
GCACTTATTAAGTGCTTCAGAAAACACAATGACCCAAAATCGAACAAAAC
AATTGATTATCCGTTGTGTGCGGTTGAGATGAAGGATTTCATGTTTGCTG
CAAAAGACACACCAACTTGTATGAGAAAAACTGAAGCTCCTAATCTCATC
GGAATGCTTCAGAAAACACAATGACCCAAAATCGAACAAAACAATTGATT
ATCCGTTGTGTGCGGTTGAGATGAAGGATTTCATGTTTGCTGCAAAAGAC
ACACCAACTTGTATGAGAAAAACTGAAGCTCCTAATCTCATCGGAAGTAC
ATATTGCGACCCGCTTGAGGATAAGAATGTATATGGCTTCTTGGAACCTC
TTTCTCCTGAAGTCGATGATGGTGAAGTCATAATGGCTACCACTAAAGTA
CATATTGCGACCCGCTTGAGGATAAGAATGTATATGGCTTCTTGGAACCT
CTTTCTCCTGAAGTCGATGATGGTGAAGTCATAATGGCTACCACTAAAAT
GGACAGCACAGCATTTTTTCATGACATTGCACTGGGTGCTGATAACGGGG
TCACTGGCATTGTCACCCTCCTTGGTGCTGCTTTTGCTCTAGGCAACTAC
AAAAGAGAGCTTAGTATGGACAGCACAGCATTTTTTCATGACATTGCACT
GGGTGCTGATAACGGGGTCACTGGCATTGTCACCCTCCTTGGTGCTGCTT
TTGCTCTAGGCAACTACAAAAGAGAGCTTAGTGAGAAGAGCATGGCTGAA
AAATTGCGTCCTGTTTTATTTTCATTCTTCAATGGGGAGAAGAGCATGGC
TGAAAAATTGCGTCCTGTTTTATTTTCATTCTTCAATGGGGAAGCTTTTG
ATTACATTGGATCATCAAAGATGGTATTTGATATGCAGCGAAATAGCTTC
CCATACAAAACTGACTACAAAGACCCTATTGAAGCTTTTGATTACATTGG
ATCATCAAAGATGGTATTTGATATGCAGCGAAATAGCTTCCCATACAAAA
CTGACTACAAAGACCCTATTCTGAATATCACGAATGATGATGCTTACATC
AGCAAATTCAATTTATCAAAAGTCGGTTACTTTTTGGAGGTCGGTCAAGT
TGGACAAGGAAATGATATTTTCCTACACACTGATCCGATCTCGCAACAAA
TTCCCGACATCAAGTCAAAGCTGAATATCACGAATGATGATGCTTACATC
AGCAAATTCAATTTATCAAAAGTCGGTTACTTTTTGGAGGTCGGTCAAGT
TGGACAAGGAAATGATATTTTCCTACACACTGATCCGATCTCGCAACAAA
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ATTGCCTCCTGCATCTTTCCAACGCTTTTTGCGTGCTCAAAACATCAGTG
GTGTTGTGTTCACCGATCACAAAAATAAATTCACCAACAAACACAAGATC
TATTGAAATTGATCAAAACCCAAAGTCAAAATGTATCTCTTAACATGGAG
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TATACCGGTTAGCATCGGATGGACGAGAACCGAGTCAAAACATAACCTTA
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TTTATACCGGTTAGCATCGGATGGACGAGAACCGAGTCAAAACATAACCT
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AATTGTCCTGCATTCAAAGAAATCTTGAACGATAAAGAAACAAAGCCTTT
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TTGCTTTTTATACTCGGCAAATTGTCCTGCATTCAAAGAAATCTTGAACG
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ATACATGGTTGCTAACCCTACAAATGAAATTATAGTGCTGGTTGTTGGTA
TCGTCATGCTTCTATCATCCATCGCCTTTGTTTATTTCATCAAGAAAAAC
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AGTGCTGGTTGTTGGTATCGTCATGCTTCTATCATCCATCGCCTTTGTTT
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Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_042803XLOC_042803-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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Properties
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