XLOC_042673 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_042673
Unique NameXLOC_042673
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000034_pilon:1324033..1339679+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_042673 ID=XLOC_042673|Name=XLOC_042673|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=15647bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000034_pilon:1324033..1339679+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCACACAGTAAATGCAGATGACCGGTTCACCACCAAAGGATACAGTTA CCACCACGCATACGCCCTTTCCATCTGTGGTCACCCTTACAAACCAAGTG TGTGTGTCAACAATGCCACAACCAAGGTATAAATAATTGATTCGAATTTA TGACTTTCAGTaattttagaccatgttcagacgttacggttccgtatcgt tccgaaacgaaacgattccgaaacaagtgtgaacgtcaaaaatttgaaac atcaaaaaagaagacgttacaaagcaaaacagattgaaacgatttcgctc cactattttcattggaacggaactgctccgtttttttACTCCGggcgttc cgaaaccaataatgaacactctcgatccgtaacggaaACTATACTGGGGC GATACGAAACCGTAgtgtctgaacatggtcttactTTATTCTCAGATTTG ATCATTTGGAAACGTGAAAAGTTACTTAAATGATATCAATCTAAAGGAGa gacttttctttattttttacgtgcttattttttgcgctcttttaATCCTT GGCCTTAAGGGCTACTAAGTTTACATAATATATTTACGAacatattcgac aatatggtttgtgGACCCTAAATATGAGATGGAAACAACTGGTActttat tataaaaagaaatctcctttctgtaaacaatcgaactgacaatatattgc gaacatattttcaatatattgcctgacaatatattacGTAGTTTATATAG CCCTTTAAGATTTGTGTTGATTAGGCTGAAACATTGTTTTGACATGGTAT ACAATTTTCAcattcaaaaacaacaaaaattcgGTTTTTTCCCGATATAA AAAACCAACAAATTGAGACAAGGGATTATTATATACGAAAGCAAGTTTTG CCGGGATTTtggaaagttttaaaagttttttttccatcATTTCCCAGACC TCAAAATGTATTATTGTATTCATTCATTTTCACTGTCTATTTATTTCTTT GTAGGAGAAAGCATCTGAGCTGACGGCAGCCATCTGTAGAAACACCATGA TTCCTGACAATGATAAATTACTTTCCGCTCAACCAATCAGGTACGCACGA ATCCTTCTCGCTGACTATAATTGGCCATTACAGATAataatttacccccc ccccctccccaccAATGTCGTGGAGGTCTTTTTTACGTCCAGGGGTACGT TAATAAGGGGACAATAAAGTTTCGTGAAAAATCGACATGATGGAAGGGAT ATCATTCATTTCTACGATAGCCCATTCAAACCAATTTTTTGTAGCGAATC TCAAAATAATTAAATTGGTGGATTAGATCAAGCATAGAAGGTTCGCAGGA ATGAGATTCTACTCTCGGGTCCCTAATAGCCAAggaggttggaataagcg gggggggtgttggaaaaaatctcaaaacttaaggggggttggaataaaaa tgtcctgggtgcaTCAGTCATCAACTATGAGAAAATGGTCATCGACTATC ACAAAATATTTCGGTTTTGTTAATGTGGCACAGTATTGGGTAGCTTATAC ACATTGaaactgacctttatatatccctggaccaagtttctcaatccagg ccaaccaaaatctttgatcggagttttttaaagtgctaccctaatggcgg cactactcaatagcagtgtaaatgcatcgagagcgctagatctaggCTCC CTCGAATACTTTTTACGATATAGCACAgctagacgttaatttttaacatt gcaatggcttcttctcgggtaccaattccaaaaaaactcaaatcaaagat ggcagatttagcttggtccagggatatacaAAGGTCAGTGACATTAGACA TATTCTCTTTTTTGTACAGCATTGGTGAATACGTGGAATCCATTGAAGTC ATCAACAATACATTCACTGCAAACTCTACAGGTTGGTTTAACTCTCCTTT GTGCTTTAAATGTCCTTTGTGCTTTAAATGATCTgaccttttttgggaaa atcatcctaaaatattcttacatcatTCTTAAGTTAGGATCCTTATTCAg gctagatttaacatttagtacatacgtctcaagcataaaatgacattttt gtgataggagtgagccttacttgggggtaatcaggggggggtcatgcagt tattatataaacactatgacaattactaccgtggtggtatataaaccaaa atttgggaaaacagttactccaccagtggactaactgcaacatgggtggt gcctaagcccaaaattgtcgattttggtaggatatggtgtactaagtgag cacatttttcaatttttcacttaaaattttaggtttttaaaaattccgga agcaaaaaaattcaaaacattttttcaaaagtaaaaaaaaaatcacaaaa ttttttcttcaatcaaggcatgaaagatattttaacaaacttggaaaatg attgagatatttaactcttgaacagTCGTTAAcaagacgtacccagtaaa atggtatcaaaaatgaggaattcagtgaaaaaattgccaaatttggcatt tttgggggtggtatacaccaattttgagggtaaaatcagttagtacacta tggaataactgcaagggtggtggtgtctgtagaaaatgtccaaaattgca gttactccacatagtgtcaaggagtaactgcaagacccccccctggggta attgacaatttgtaattgaaaatgctctaaaaaatggcattcttagcttg agtagcaaaattccatgatggtgatattcttagcattattcttatttttt tggccattttcatcatggacattcttataaagtgtattcttatatataaa atttattttattattatttatttttgattgtatttCAGGCACTTCCATAT ATCTCAATGGTTATTCGTCCTATTTATGATAagtaaactaaataaataaa taagtaaattatcatgtaaaaaaaatattatataattttcaatttgcaaa aatatacgTACGACCAAAAAGTTTATTCGCTCGATTGAGATCAAAATCAT AGATTGAAGCTTGGATAAAATTGTACAACTGCCCTATCTGGGCAAGTTGA AATACAGAGCTATATATCTCTTCAGTGAGGCCTTTTCACTTCTGAAAGAT ATAACTCTGCAGGCAAGGCTTaaaactcggagaaattctaaatagacagc attcaaaaattcaaaacttaaaaattcaaaaattcaaaacttatttattc gcctgcatatcattaaaaatttacatatttaagtttgtataaattagggG AGGGGATGCAGGCCAGGAGTCCATCCAATAGACGTTTCCGTCTAATCATA TGGAATGGCTACCTGGACGCAGATTATTTTTTCTGTGGGGTTGATATAAC TATTAGAgtaacaatatttcaatattccaaataacaaagtaaaaaaaaac tcaacgtaactatcgacaaaaaaaatatagttatataagtaatcttttgt tttaataaatcaaattagagtatttttatatctatatggactttcatttt tctggtatgcaagaggtcaattttgaaggaactcgcttatcttttttttg atcATATATCCAGATAATGGTTGTAGATCgattttagtatgtaatattag ctGGTTCCAGTTTAAAAGAGATTGGTACTTAATCGATTTCAATCCATAGT TTAATGTTTTGGCTTTTGGGCGCTCCAaaagtttcagttcgttatttcta gtaagataattatgagacagagttttgaagtttaaaatgttCGTAACAGC TTCAGGAGAAAGATTAGTGAGAGTTTGATGTACGAGTCGGATATTGCACT TTGTTACAGTATGTGGCAAAGTTGGAATATCCAGGTTAATGAAAAGAGGA GCAGATTCtgcattaaaatctgaaaaagtcaaGATGCGCACGcatctttt ttgaagtttgcctaTTCTAGAGTTTTGAGTGAGACTTTGCCCCCATACGA TTATTGCGTATGACAAATGAGAGTGAAAAATAGCATAgtataaagtttta agaatGGTCTGTGGAACAAAGTGACGCAGTTTGGATAAAATGCCATTTGA CCTTCTAAGTTTTGCGGATAAATGATCAAAATGGAAATTCCACGCTAGAC ATTCATCGAGAAAAAGACCAAGATATTTGAcacatttcgaaaatttcaag aCATGCCCATCAAGATTGAGATTCATTGTATATGGTACAGGTTTATTTTT ACTTCTAAACAGGATAACCTCAGTTTTTGTAGTATTAAGAGAGATTTTGT TGGCACGAAGCCAAGAGGAGAGTCTGATTAAGTCAGAATTCACTTTCGTC TCAAGTGAATTTAGATTCGAATCGGAAGAGAGAAGAcaggtgtcgtcagc aaaaaggTTTGTTTCGCTATTCAGAATGGCTTCAGGAATGTCATTTATAT ATATTAGAAAAAGTAGAGGCCCTAGGACAGAGCCCTGGGGGACTCCGTGT CTGATAGATCGTTTTGAGGAATCATGCCCAGAAATTGAAACATATTGCTT CCTCTCAGTCAGGTAAGATCGAAACCAGAGGTTCGCAACGCCACGTATGC CATAGTGATGAAGTTTTGATAGAAGAATTTCATGATCTACTGTATCGAAA GCTTTTTGAAGATCAATGAATACCCCGCAAGAATACAACCCTTTGTCAAT ATTTGACCGAATTTTTTCTGTTAGATTTATTAATGCGTGAGAAGTAGAGT GTTTATTACGGAATCCAAATTGgtttttgaaaatgctgttgttaatgtta agaaaatttacaactctgaatttaattaatttttcaaagattttatcaat attAGAGAGGAGCGAAATTGGTCTAAAGTTGTTAGGATCGTATGGGGAAC CTTTATTTTTATACACGGGTATTACTTTTGCTACTTTAAGAGTTGTTATG AACTTGCCTGTCTGTattgataaattgaaaattttagcaagGAGTTGAGC TACCTCACCAAGAaccgattttaagatttttggtgGAATGCTGAATGGTC CATTTGCCTTAGGTTTAAGAGCATTGATAATTTTTACGATTTCCTCAGCT TGTATCTCCTCGAAAAACATAGAATTTATTGGTGAATTTACAAGAGTTTG AAGAAAGTTCGCTTCCTCATTATTAACATTTATAGTTTGACGTATTTTAT CGGCTATTgaagtaaaatatttattcaattccTCGCTTGTTACTTTAGGA TCAGATGTTACTTGTCCGTCAATATTTAGAGATATTGTTGTGCTACTACG GCATTTTTTACTTTCGATCAATTCGTATACGCCTTTCCAGATATTTTTAC TGTTCTTTATATTTGTTTGAAAGTACTTTTTATAATGGTTATTCTTACTT CTTCTACAGAGCTTAACAATTTGATTTCTGTAGAATTTATATCTGATGTG GAGTTGGTGTTTAATAGTGTTGTCCTTCTCTCGCGTGTAAGCCTTTAAGA GTTGATCTCGTTTAGCAATAGAGGTTTTAATGCCTTTAGTTATCCAAGAT TTAGCTCCCTTTTTAATTTGCTTATTGGTGAGTTTTTGCAGAGGTGCGTG TATATCTATTAGGGTATTCATTCGATCAAAAAAGCTGTTAAAAAGAAGAT CTGGATTATCCGAGTCAGAATGCAAGATGTCATTCCAATCTACTCTGTAA AAGGATTCTTTGAATTTattgttatcaaaatttttccatctcctgtaata ttttgtttccttgcaggagttaaaatgaaaattctcaaatatCAGAAATT GAGGCAAGTGGTCAGAAATACCTGAAAGAAGATTTCCTGTTAAAGGTTTG TATTTAGAAGGAGTGAAGAAAATGTTATCAATGAGTGTCCTAGACCTATC AGTGATTCTGGTAGGTAGAGAAATactaggtaaaagaaaaaaggattcAA GAGAGTCTACGAAGTTATTTACATGTGGAGAGGTACCACATTCTAGCAAG TTGATATTAAAATCACCCATAAGCACAAGGCGCTTATTTTCCTTGTTAGC TTTTTGTAAGAAGGGAATGAAGAAGTCGTTTGTAAAAGTTTCGATTTTCA TCGTTGGATGTTTATAGATACATCCAACAATTACATTTTCTTGCTTCTCA AACAAGAGTTCGCAAAAAGTAGATTCAAGCTCCTTTTCTGAGTTGAGAAG ATTAGAAAGGTCTTTTCTAGGTTTGGATTTTAGCTTGTCAGAAATGAAGA GGGCAGTGCCGCCGGCACTCGCCTTTGTATTAGTAAAGAATGATTTATAG CCATCTATCTCAAGCTTGTGTGGGATAGACGAATCTGTAAGCCTAGATTC CGAAATTCCTAAGACTTTGAATTCGTGATTTAATGTTTCTAAGAGGTTAT TATACTCATCAAAATGTTTCGGTAAAGAGCAGATATTTAAGTGAAGAAAA GAGAGGTGTGAAGATGTATTAGAAAAAGCAAAGTTAAAGTCGTCACAATC TAGATACCTACAATCAATAGTGTTTGAATTGTACTCTGAATTAGTTTCTC GAATTTCGTCTATAGTTGTTAGATCAGAAAAAGATTCATCAGAATTGGat tgagaaatatgaaataaattaaaaatcaatataataaattgatcttttta aataatatttgtCGGAACAAAGAGAAGAGCAAAAGTAGTGTTGTTGAATC TGGGATTGATGCCTGAAAATAAGCTTGTGAAAAAAGTGAGATCTTCATTG GCTAAGGTATTCAAaggttcaaaatgaaaaaaacttgatTGCTTGAAAAA TGGCTAAACATGAAGTAATAGAGatataataatttaaatttgaaatgtaG AAGTCTGAAGTAACTTGCAGTCCAAACATCAAGTTTAACTTTGCACGGCT CATATTCTTTCAGCAGGTTTatagtaaaacaaaaagaatttgtataaaaa agcgtgtaatccaGACATAACAGAAATTAAGTAAAAtcaatggagggaac aaattaTACAAACTGATATCACCCCGTTACACTTATTGTATTAAACGGAT TATGAACGACTCCAGCTTTTGTCTTTGCTCTATGTAAGAGATGGCAGAAA GCCGACGAAAACTTGGCAGTATGAAACCTTTGCTTGAACAATATTCAGTG AAGGCATTACAGTGGTGTCAACCGAAGATATTGCATTGCATTGACTTAAG AAAGTCTGCTTAATGCTTACTTGCTTCAAAAATTAGGGAAGGGCAGGAAA AATGTGGCAGTCTTTACTGGCGAGTTTATGTATGAGtatttttcagcgac ggagaagCTTTCGATTTGTCTAAAAATATGTGACTCGCtttccttcaaaa aaaaatgaggAAAGGTAAGGCCAGATCTTAGGTGCAATTCATATCTGCTG TATTTAGAGAATTAAAGAATTCAAAGAGAGGCCGGTAAACCGTTTCGAAA ATATGTACCTATTTACAGCGGTGGCATGAGCTATATGTAATAGCTTAGGT GTAAGTTTACTAGAGGATCCAATTATAttctttaaatttgtttttctttc atattcaCAATACCCGATCCCTTCCCTCTTATGACAAAGTATTGTGTGCA AGATTCGAAATAGGTCATGGGTTGTGTTTCCAGTCttgtgttcttaaaaa aatcaaacaatttaaaaataatgaatCTGTGTACAGTTCACAATTTTAAA ACTGCAGTTATTATTACATTGGAAAGGTGTTTTGTTTGAGCTTGCCTGTT GAGAGTTATTAATAAAACAAATCGAGCGACAAAATTAGTGGTGGCAAAAA GCATGATATATTTTAAGTCTTAAGTcatgttttttatctttctatTCAGG GCAAGAAGTGAAAGAAACAGCGATCGATGCAAATGGAAATATCGTCTTCT TATTCTTTTCAAGAAGGTAGATATAAAATGATCCATTTTAAAAATTACAT ACAACCTCCTTACTTATTTCCTCCataccaaaaaaaatctttttttcaaa tgtgcTATTGTGGACTTTCTCGGAAACAATTTATTCCACGAACTTTTATC TTTTAACCTACCCCGCCATTAAACTCGTGGAATTCATATTTTTGCACTTC CTTAATACAGGTATACTGATGTTTGCTTGAAGGGCACTTCTGCATCTGTG ACGTTGATCTGTGATAAAACGAAGACCGGACAGGTATACATTTCTTATGG TGAATTTTACGCCCACTTCTTTACCACACCGCCATTTGACAGAAATTGTA CATGGTTCATTTTCCTATTTGTAAATTAAACTGTAATATATACTcttctt gtctcccgaatagacgggggggggtctgaataagcagggggtaggaaaat tttctaaattctaataagcggggttGATGGAATAagaactgatatcaatt tcaacaacaaaaaagaggggtggatggatttttttctcttaacaattagc ggggggacgtctattcgggagacaagagtatcttgcattttgttaaattt ttgtccCAGTgttccccaaattttcgataTTAGAGAAGAGTGTAGTATGC AAATGCAATATCCCTAAAAAAGATTTACTTGCACACAATATAGTCTGTAC CCcaatgttgaggaggtgtgacgtcaagggtgtccttgaaaataaaaata taggtGTTCgggtttttcgagtgtaaaaatccagcgtggtcagtaaaacg aggtcgaaaaatccGTAGGGTTCCTGAAAAAAGACCTCATCTAGATAAGG GggttatttttttttctggaatagcctaaTTCTTGTTAATCATGTCATCG ACTAGCCTTATAATTTattattcactttttcttttcatcaggGCAAATTG GAGATTGGTGACGAAACTTGTAAAACTGAAACTTGTAATGGATGCATGTA AGATGGCTTGTCACCGATTTCATAAACCCCAACTTCTTTCTGGAATTATC CCCTTAATACTCCTAAACcttgaaaaaatgtgaaaatttctcctgCTATG AATTATAAAGGTAGAGAAAACTCTTGTTATCCTGCAACTTCGTGGAAAAA TTTTCTTGTGTTCACACGATGAGTGAccatagaatgcacccccccccTGA GCTTAGGCCCCCCTAAAGCTAAagcatttttgcttgattggaggctgtat ttttcaaaacatactggggctagcttgctagggggaGGGCTGAGCGTTGT GTAATAAAACTGGGGGCAGAGCGAGgctgataggttgaagatattttttt gctttgtgAAAGTGGGGACTATGTTTCTAGAATctattttccttagcccc ccccccctgaaaaatggATGGGTTGGTTGACTATAtatctctgattggct gaaattcACATATATAagcatttttgtttcaaatgaGGTAATTCTGGCTA GTCACTAAATATGTCCCCATCACTAAATATCTCCCCAGTCAATCTGAGTA TCTGAGCAGTGTCGTGAGGTAACAGCTAACAAGTGGTTCAATCCGACTAA CATTCTATTTGTCCTCGATAAGGGTTCACTACCAGTCTTCATAGTTTGTC TACTCGATTCTTTTATACTAGTAAATTGTTCAGGTACAGCTTAAGATCGA GCtttttttACGAAATTCTGAATGGGTTCTTTGCTTTGATTTTGTTCAGG TATCATTTCACGTGGCGCACTGTTCACGCATGTGCAAGATGTACTTTTAA TGATTACAAGACCATTCAAAGCGGTTGTACGGTAGGACTTGCAATTTCTT ACATAAACTGGGTATTGTATGTGTGGTTTTTTGACTATATATGATAAATC GACAAATTCAAAACTTCAACAACTAACCGGGCAAAGACAAGATATCCCAG AAGGAGATTTAAATAAAGTTAGCTAGTTCAGTAAGAGACTTTAAATGTTT ATGATATTTGAAGTATTCTTCTTCGTTTACTGTAACgtttgcaatatttt tcaaccACACAGTttactttctctaattcgatccttTAGGGATCAGAGCT TTCctttgaattagagaaatattcgaattacagagattaTTTTATACTAC TTCCTTACTAAGGGGaataatattttagttcgaattacagagagattcga ataatagaggttcgaattagagagagttcactgtagtatcaaaaaaaatt tcaagtaaagctgggagcaaaccgtcaaacattgttcttctaacatcgtg acgtttcatgtttgaaattgatgtttgatggtttgctcccagcttaagAA TCTTTCGTACTCTTTAAATTGAATGTTTAAATGTGTTTTCTGTTTCATAG AAAGGGAAAAAGACGCTCCATTACGTGTGGAAAGAGAACAGGTTTGTTGA AGTACTTCATAACTACTTGTGCCCCAAAATagtggacaaatttttatata aagtaaaatccttataatttatgccaatttttatgacttgtatactttca atctcaaaaacctGTTCAATCATTTTGGGAATGGAATAATTATTGGTTGA ACAGAGAATtgtaatcttatttcaattattctaagACCAGTTTAGATTAC GAGTTTTGGGGATTTTAATAtctataaaaatttgtccgcttttttgggGC ACACTGTTTATTGGAGGGGGGTCATTAGATGGTTTAAGATATCCTgccga ttgaaaaaaaatcatactaTTATCTTGAGCAAAACCCTCAAATCTTTTCC CCTAACTTAACTTTCAAAGTCGAGATAATTCAATTTAaacgtttttgact tttacaaAGTatcaatgaaattttattttaaaactgtGTTATGCTGAATT AAGATATTAGGCTAGTTAAAGGCCTGGGGGTACTAGGGCTGCGAGCTGAA GGGGTGCCGCCCGATTttccgggactaaaaaggagaaaacaaaggaaaat ttttacgacccttattggaacaaatttgaccaaatttcgatttttccggg ggtaaaaaattgaaattttcctatttctctgATCCTTAGTGGGacttaaa tttgattttctgtaTTTTCCGACCCtcagcgggactttggaaaacCAAAA AAGTACCACCGTACCATCCATTTGCCAAGTACCCTCCCCTCCGGGGGTAA AAGGACAGTTAGGTAAAAGGAATTTTGCTCATCAGGACCACAGAAGGAAT CTACTACCGTATGATTACCTTTTAATAGCGGATTCATGATATCTTACTCA CTTTGTAGGAAATGTATGGGCGGTGTGGAAAAACCAGAAGATCGAACGGA AGAATGCAGTATCTTCGAAAAGAGCATCTTAGATTTcaaggtaaaaaaat atttcgttcATTAACTTGAGACCCACGGAAAAGTATTTGATGGCGAACTG TCTGTAATGATGTGAATTTTTTggtgaattattattttttggttaCTGGA AAAGTTAAGCAAAGTAAGTGAGTTTGTCACCGCAGTTAAGGGTAAAGTTA CGGAAGCCACTGTGCCACTCTTTTCGCATGATGCTTTGATTTTGGCATGA CCCGCccagggattgaacccacaaccttacgCACCACAGCCGAATACTGT GATCAAATATGATAACTAAATTTTCTAGTTCTGACATTATGATTCGAGCT TTCAAAGCCACTTTTTTATGGATGACAGCTTGACCAGTTATTTATCTTCA TTAATATTGTTTTTAGTTGGTGATTCTGGGCTTCTTGGTATTTGGTTTGG CGTTGGCCATCATTGTCCTTGTCTTGTGTTACCGAAACAAACGGTAAGAA TGTCTTTTTATATCAATTGAAACGGTTTTTAGCCTGTACCGAActctttt ttataggaaaagaATCGTGAACTTTGGTTTGTTACGGCAAATAAAAATAA GAGTAAAATACTATTCTCCTATTCATACCtttttttACCGTTCCGTGTCT GAGACATTTCCTTGCAAGTCTCTCGCTATGCCTTGTTGCCTCAATGCAAT GGCACCTgtcgtttttcaaaaaaacgcaGCTGTTTTCACAGCTGGGCAGA AACTTTTGCAGGCAgaaattttcgcgtttttcgcgattttgatccttttt cgcgaaagtttctgccaggtgagaaattaaacctgaaaaacgcggaagtt ttttttcgcgaaaaataaactttcgtatactcagttttgcactatttgct aaatttttgcatgttttatgagtttttgttaccaaaaaaggtaaatttta tatgaattcgcgaaagttctatctgtgaaatttcgcctaaaaccataatt cgcgaaacttaaatttcgcgactttttgacTTCACGAAACGTTCTgcccg cgaaactttctgcccttagAGAGAAAATTGGTGCTAGCGAGACACAGAAT CTCTCTTATTGAAACAGATCGATATACGGCAAtacctttttaaaaaacaa aaatcgcCCTTGAGAGGGGCGGACAGGTTACGCTTTATGTTCTAAACACA GATTTATCCTATGGTGGTCTGGTTTTCCGTAACATCAGCCTCTCTTTCTA AAGTCATTTCAAACGAGTACATTGTACATTTGTTcactttcaaattattt tacatTTGCCTCTATATGTTATTGAATTCAAAGCAAGCAGATTATTATAT TGTGTTCATGTCTTTCTTTGTCCATGAGTTGGTCCAAAATCTAATCAGAT ATATTATATTATGGTCGATTTAGGCTATGACCGTGTTCAATTCAATAGTT ATCGTCacctttttcgactttttgttttattattttcagtttgagttaCA AGTACAGCCGTTTGATTGACGCATCGCAAAGCAAAGATGGAGAATTACCT GCAGCAGATACTTGCGCGTACGAAGAAGGTGAAGAAGAGGAGGACGAGGT AATGCTCTCAGGTTCAATTTCttatagttttattgttatgaAAGTAAAAG TGGTAATCGTAACATATTCTACAACAATTCGATTTTCTTTTTGGACTTAG CTCCGGGTACCCGGGTACCGGGTGGacgtcctatgaattaaccgttgtct gttcgtccgtccgtccgtccgtccgttcgtccgaatattgggctccgtca catttcggccattgccattttgcatctttgtgccgaaaatcagaaaaaac taatgagccaatctcgagaaaagctggtaacatgctgaaaaaacagtttt tttggcattttctcgagattttattattagtttttttttattttttgctc aaagatgcgtattaacaatgcccaaaacatggcagagtccgatttttgag aaaaaaaattttccggccgacaATGCCGGAAAcattccggaaatcgccgt ttttctggattttcattggactttttccttaaaattggttgtttttcatt caaaaacattattaatagcaatgcccaccatcaagcataattcaattttc aataaaattgatttttgaagccggaactatttaaaaaatcgccggaacaa cctattttcgccggaaggacagtatttcttgaatttctcgagctgtactt tatatttttcatgaaattttgcacactgatgcaaaatgacaatacctaaa atgtgacggagcccgattttcaaaaaaaaaaaatttcggccgaaaatgcc agaaatatgccggaaaaaccggttttttgacattttctcgaattttcatc cttagatttttctgattttttgcagaaagatgcgtattcgcaacgCTCAA AACTTGgtcgagttcgatttttgagaaaacattttttccggttgaaaatg ccggaaatcgccgtgtttgcagattttcattggatttttccttatatttc tatgttttttacacaaaaacattattgacaacaatgctcaccatcaagca tgattcaattgtcaataaaactgatttttgcgaccagaattttctattta ttttttctacaacccttccctctcccccatcaacaatcattgatgaattt attgcgttatgcattttcgctaaacgctgtattttctgactgattttttt catttttctcctcgcattgctatctaactttcatcatcaggtaggtccat tcagcatctagcttgtcttctttgtttttcactttttcacttcatctcca ttttccaacttttctatttgataacattccacttttGAGTATATTTTCAA GGAGCACAAAACCACAATGTAAATCTATCTTCTATGAAACGAAAgtaatg ttattttttgtttcggCCGCAGAATAAAGCAGACACTTTTGATGCTCGAT CATTCGCTAGTTTCAATATCCGTGTGTGATATTTGTGTTTAATCCTTCGT TTTAATCCTTCGTTGCTAAGGGATAATCAGTTGGTAATTAATCGGTCTCA CTTGGCACCGCTTTTCTGTGGTTAGAACCTACTGCATAATGGGAAGGGAT TGCTCAAGGTACCAGCAAAGTTCGATCGCAATTTGTGGAAGTCAATTTGT CTTACAAGGAAGACCAAGCCAAAAACCCTTCTAACAATTTAGCGTAGATA ATAGAAAGTTGATCgggttttcaaaaaagatttagctcacttttttagta tatttttgtactgttttcttttataggtcattttGACTCGCTCCAAGGGA CGAAAACCGAAAATTTTGGACCGTCTGAAGGGAATGCGAAAGGTTTGTAT AGTTCCAATGATATAATTTACCACTCTCGTGTTATCTTCACTAAATTTAA AGGTGGCGCGCCCGATATAAttcttttactattttcaatttATATCCCTT TTTGGGTAAAGAAAAATTTGCCCTAGAATACGAACACCTATAATATAATG AAAATTACTTCCAATGGATTTGTTGGTATTTTGCTCCctcgaaaaaatgt ttttgtatgtATGTCCGCCCTTTTAAACATTAACATATCGGAACTAAGAG CTATTTAACGTCTTATTTACAATAACAGCATCCCTGTCTCGGTAAATTGA GAATCTTCCAGGTATTTTCTCATAATGGGcgttttttggcctatttttcc agttGTGTCTGTCACACTGTTGTTATAAACCAATTATTATATAGTTCGGT AGTTGATCACGCTGAACGACTAACTCTAAGACAAAGTAGGATACCGTTAG GAAAACTGAAGGAGATGAGTATAATACGAAGTAACATTATCTCGTATCAT TTCTCGCACTTTATCAGGCAATTCGCAATGTTtttgctcgcgaaaaattc tcaaaaaaaattggaaatctataaaaccttgaaatcttaataaatatcaa attttcgacatatttttatcctttaatgcctttttaagACAAAGAGCAGT CGTCTTTTTCAGACTTAAGGAATCTTTTCACTTTTAagacaattttcgaa aattctcattATTATTAAACGATTcccgaaagtttatgctcgcgaaaaat attttttcatcgaatttgcaaaaataaatgtcgtaaatttcgcgattttt tgacGTAAGTTTGTACGCATAAAGTATCACCAGATAATTCCTATATTACT GTCCAACACATTTTTATGAACGACTCCGGTCTTATTATTCTGCTTTATTC ACTATTTTAGCAGAAAGACGATTTTTCGGAATTCGAGACAATCAACTTGG ATTCTATCAAGGGTTTGAGTGACGATgaagacgaagaagaaatataa

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000034_pilon:1324033..1339679+

>XLOC_042673 ID=XLOC_042673|Name=XLOC_042673|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2028bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000034_pilon:1324033..1339679+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCACACAGTAAATGCAGATGACCGGTTCACCACCAAAGGATACAGTTA
CCACCACGCATACGCCCTTTCCATCTGTGGTCACCCTTACAAACCAAGTG
TGTGTGTCAACAATGCCACAACCAAGATGCACACAGTAAATGCAGATGAC
CGGTTCACCACCAAAGGATACAGTTACCACCACGCATACGCCCTTTCCAT
CTGTGGTCACCCTTACAAACCAAGTGTGTGTGTCAACAATGCCACAACCA
AGGAGAAAGCATCTGAGCTGACGGCAGCCATCTGTAGAAACACCATGATT
CCTGACAATGATAAATTACTTTCCGCTCAACCAATCAGGAGAAAGCATCT
GAGCTGACGGCAGCCATCTGTAGAAACACCATGATTCCTGACAATGATAA
ATTACTTTCCGCTCAACCAATCAGCATTGGTGAATACGTGGAATCCATTG
AAGTCATCAACAATACATTCACTGCAAACTCTACAGCATTGGTGAATACG
TGGAATCCATTGAAGTCATCAACAATACATTCACTGCAAACTCTACAGGG
CAAGAAGTGAAAGAAACAGCGATCGATGCAAATGGAAATATCGTCTTCTT
ATTCTTTTCAAGAAGGGCAAGAAGTGAAAGAAACAGCGATCGATGCAAAT
GGAAATATCGTCTTCTTATTCTTTTCAAGAAGGTATACTGATGTTTGCTT
GAAGGGCACTTCTGCATCTGTGACGTTGATCTGTGATAAAACGAAGACCG
GACAGGTATACTGATGTTTGCTTGAAGGGCACTTCTGCATCTGTGACGTT
GATCTGTGATAAAACGAAGACCGGACAGgGCAAATTGGAGATTGGTGACG
AAACTTGTAAAACTGAAACTTGTAATGGATGCATgGCAAATTGGAGATTG
GTGACGAAACTTGTAAAACTGAAACTTGTAATGGATGCATGTATCATTTC
ACGTGGCGCACTGTTCACGCATGTGCAAGATGTACTTTTAATGATTACAA
GACCATTCAAAGCGGTTGTACGGTATCATTTCACGTGGCGCACTGTTCAC
GCATGTGCAAGATGTACTTTTAATGATTACAAGACCATTCAAAGCGGTTG
TACGAAAGGGAAAAAGACGCTCCATTACGTGTGGAAAGAGAACAGAAAGG
GAAAAAGACGCTCCATTACGTGTGGAAAGAGAACAGGAAATGTATGGGCG
GTGTGGAAAAACCAGAAGATCGAACGGAAGAATGCAGTATCTTCGAAAAG
AGCATCTTAGATTTcaagGAAATGTATGGGCGGTGTGGAAAAACCAGAAG
ATCGAACGGAAGAATGCAGTATCTTCGAAAAGAGCATCTTAGATTTcaag
TTGGTGATTCTGGGCTTCTTGGTATTTGGTTTGGCGTTGGCCATCATTGT
CCTTGTCTTGTGTTACCGAAACAAACGTTGGTGATTCTGGGCTTCTTGGT
ATTTGGTTTGGCGTTGGCCATCATTGTCCTTGTCTTGTGTTACCGAAACA
AACGtttgagttaCAAGTACAGCCGTTTGATTGACGCATCGCAAAGCAAA
GATGGAGAATTACCTGCAGCAGATACTTGCGCGTACGAAGAAGGTGAAGA
AGAGGAGGACGAGtttgagttaCAAGTACAGCCGTTTGATTGACGCATCG
CAAAGCAAAGATGGAGAATTACCTGCAGCAGATACTTGCGCGTACGAAGA
AGGTGAAGAAGAGGAGGACGAGgtcattttGACTCGCTCCAAGGGACGAA
AACCGAAAATTTTGGACCGTCTGAAGGGAATGCGAAAGgtcattttGACT
CGCTCCAAGGGACGAAAACCGAAAATTTTGGACCGTCTGAAGGGAATGCG
AAAGCAGAAAGACGATTTTTCGGAATTCGAGACAATCAACTTGGATTCTA
TCAAGGGTTTGAGTGACGATgaagacgaagaagaaatataaCAGAAAGAC
GATTTTTCGGAATTCGAGACAATCAACTTGGATTCTATCAAGGGTTTGAG
TGACGATgaagacgaagaagaaatataa
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_042673XLOC_042673-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000034_pilongenomesc0000034_pilon:1324033..1339679 +
Properties
Property NameValue
Aaloc928-1014:15561
Aaloc862-927:14577
Aaloc754-861:12741
Aaloc676-750:11667
Aaloc595-675:11210
Aaloc553-591:10301
Aaloc472-552:9651
Aaloc415-468:8842
Aaloc343-414:8112
Aaloc277-339:7852
Aaloc214-273:1871
Aaloc127-210:1005
Aaloc1-126:1