XLOC_042611 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_042611
Unique NameXLOC_042611
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000247_pilon:391275..403455-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_042611 ID=XLOC_042611|Name=XLOC_042611|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12181bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000247_pilon:391275..403455- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GACTCTAAGAGAGACTTTTTTTTTAATTTTCTTCGATTTTTAAAAAAAGT GGTACCCTTAAAGAGACTTTTTTACAATTTTTTCTCTTGAAATCAAAAAA AATTCCCAAAATCGTGAATTTTCCGACCCTTAGAGAGAGTAATTTAAAGT TTTCTGATTTTTCCGACCCGTAGAGAGACTTTGAAAGGTGAAAAGACCGA CCCTTACCGTCCGCACCAGCACCCATTGTTGCCTAAGTATCCTTCTCAGG AGAATACATCACCACGACCTTATTTCTTACTTTTTAAGATGTGAACGAAT GTTTGACAACACCATGCAAATGTGCTCAACCGAAGAATTGCAAAGCTACA TGCACCGATACCACAGGGAGCTTCAAGTGTTCTTGTAACAAAGGATTCAA ACTGGGTTATGACCAACGAACTTGTGAAGGTAAAAACGAAAAAAATTCTC ACACAATATACAAAATAGAGGATGGTGGCTCAATTTGCAAAAATTAAAAA AAAAACATCCATGATATGGAAGCCATATCGTTAGAACATTTGAAGAACCA ACGTTGCTTTTACAAGTCAAATATTGGTGCAGCTTGGGTATTTTAGACGA TTGAATTGTAAATTCCTAAAAAAACAATAATCTCTCTTGCCTGACAGATT TGCATAACAAATGTTGATCTCTTTGTAAAAAGATCTGAGATTTGCAGTAC TACCGATTACAAAAATCATGAACTTATACATCTATTTTACTTTTAGACAT CAACGAATGCAGCAGCAAAGCATTGAATGGATGTCAACACAAATGTTTGA ATAACATGGGATCATTCACGTGTGCTTGTAATAAAGGATATAAACTGCTT CCTGATGGAAAGAGTTGTCAAGGTAGGTTTATGAATTATGGTAATGAATG CCGTGAGTTTATGTGTTTTTGAGGGAAAAATTCAGAGAGTCCTGATTCCA 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CTGGTTTCAATCTTCTTGGTTCTGATCAGCGCACGTGTTTACCTTCGTCA CAATGGTCTGGAAATGCACCTCAATGTCAAAGTAAGCTATAGAGTGAGCT GCAGATCTTTTAGTTGTAACACTCAGATAGTGAGTGCATCGCAAAAAGGT TTTACATTTTAAACTAAATGATGTTCAATTTGTTTATAGACAAATTATCC TTTTTTCAAAGTTTGATTTAATACTTTTAATACCTCAATACCAAAGTAAG AACTTAGATCGCATGTAATGCACCAGACTCGAATAAATACAGTTGACGCT CTCTTTATTTGATTTTCTAGGGAATTGGATTTTCATTGAATATGCAATGA ATAATTCTGAGTTTGATGTTAATCTTTAATTTTTCCACTATCCTATTTCT TAGGGAAAGATTGTCCAACGATTGAAGCACCAGAACATGGTTCTATTATG ATACCGTGTGTTGCCAAGTATGGATTCACATGTTTGAAGAAATGTTCAAA AGGATTTTATCTGGATGGAACTACTTCTGCAAAATGTGTTCTGGAGGGTA ATCAAACTACTTGGACTGCCAAAGACTCCATTTGTAGAGGTTAGTCACGC CAAATAAATTTTCTCTTCCATATTTCTGGAGGTATTTCATAAAGAGCAGC ACCTTTGTTGTTTTTTAATCTTTTTGAACTTTTTTCATACGCTGATGAAT AAATATTGTAAGAAATATTACTGTTCAAGTTTATTTGCTATATACCAAAT ACCTTGAATACCGTTTTTAGCCTCTCAAAAACTTCATTCTGGGCATCATT TTTCAATAAATATCACTTCCAGCTCCTTACTGTTCTGCCGAAAAAGTCTT GCCTTCAGATATAGTGCTATTTTTTGTGTCCGACAATGTTTCAGACACAA AAGTATGATTATGCATCACACTATGTTTTTAGCATCGACACCTTGTGAAC CAAATCCATGCTTAAACAATGGTCAATGTCTGGAGACATCAATCGACACT TTTGTTTGTGATTGTTCTGGAACTTTATCCAAAGGAAAATTATGTGACAT CGGTATTGTTGATATTCCAACCCTTCCACAACTTGTTCTGAATCAGTGGA GCACAGATATCGAAATTATGGCTAGACCAACAGCATTCGTGAACATCGTT CCAAAATCGAGAATGGAGCTAACCTTTGATCCTCCTGAAATCAGAATCGA AGTGCCAGAAAGTTCTGCTAAATTTCAAATCCTTTCATCAAAGACAGGTG TTTTTGAAGTAGAATTTGTGATTCAAGGAAGAAACGATTTTGAATTTGAA ACACCAAAACCAAAACAAGTTTATGTTTTCCCAAAGAAAACTTCACTGTT GGTAGATATGGATATTAGCACCGTCATTGATAACGCAAAATTGATACAAA GAAACTTAACCGATACTTTGGTTTTGAAATCCATGTGCTCAAATGGCGAG AACGTTGTAGGTTTTACAACGATCCAATCCAAATCTGTGGTATTGCCCGT TTCTATGGTTGGGGTTGAAAAAGTAACATTGACCGCTTTAAAAGAGAGAG GAATTTTAAACCCTGTAGACGAAATCGAGAGTTTCCTCAAAACGAAGGAA ATTTCAATATTTGATTACCAATGTGTCAATGCAACTTCAGAGCTTGCACA ACAAGTTGAATACGCAATCAAGTATAATTTCTTCCAAGCAGCTTACTTAA AAAAGTTTACAGTATCAATGCCAACTTGGTTCGAATTAGCAAAGACTTTT TCTGAGCCTGAGTACAATTCTGCAAATCTAGCAAGTCAACTTGTCACACT TGAAGATATCTTCAGTCTGAAATGTTATGCTACAGGTAGCCAAGGAAAAA ACAGATTATCAAAGGGAATTCACAGCCTTTACCAACCATACACTCCAGTT CTTCTCAAAATACTTGACAAGAAGTTTGAAATGTCAAAGACAAACAGAAT TTGTTATTTCGCAAACCTCGAAGAGAATTCGTTTCACATCAACAGTGATT CACCAGTGAATTTCATCTCCAGTCCTTCACCAGATCACATCTTTGAGAAA TTACAATCCTCGTATATGAGTGTTTCGCCAACGAAAGAAGAATTTTTCGT TGATTTTTCAATGAAGATGAAATCTTTTGATGGAAGATTCAAAGGAAAAG GATTCATGACATTGGAAGATTCCGATAAGGTAAGATGACCGATTTCAGTT ATGATTGGTCCCAATCTCTTGCCTGCTTTAATCACGTCACCTATGGACGC CAAAGAATTTTATTTTCTGGTGCTATATCAAGAAGCATCACAAAGCGACT GCCTCAAGTGTGACAGAACTTTGTTCACTAAAAAGCTGCGTCAATAAAAT CATAAGTTTAACTAACTATGTCAAAGCAGTTGCATGTTTCTTTCATTTTA GTTTTTCACTCGAATGTTTGATTCCCAAAATAAAATTTCCGGCAACATTG CTCTGGATTTTGACGTCAATTTGAAATTTCTTGGCAAGACATTAGCTGTT GAAGGGAAATCGACACAAGCTGAATACAACCTAACTTCTTCAGGTAAATT ATTCGTGTTTTTCTGATCTTTAAAATGATTTAGATATCATCCTTGTATGA AGGGAACAACTTTTCATAACTCTTTTGATAATACATCCCTTTACATATTT TGTATTTCAGGCAAGAGGGATGCTACGCTGAAGTTAACAACATCAGTCAA TCAAATAAAATTCCAATCACCAAATGCTGCTATCAGATTCAGCCCACGAG CGAAATCAAAGCTTTCTATTGAAGTTCCAATGTTAGCAACTGGTGGACAA ATTAGATCTATCTCAAATGAAAACGCTTTAAAAACTTACTCACGATATCT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000247_pilon:391275..403455-

>XLOC_042611 ID=XLOC_042611|Name=XLOC_042611|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=7536bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000247_pilon:391275..403455- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTTTCGAATTTGACATGGTTTGTTGCAGTTTTAATCTGTTGGAGTTT
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GTACTCGCTCAAGAGCTAATGTTTGCGCTGAAACAATCAAACAACCTTAC
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GGTGTTTGCACGTGTAAATCAGGCTATAATGGAAACAGATGCGAAAAAGC
GATTTGTAATCCTGGTTGTGTAAATGGACATTGTTCAAGACCTGGTGTTT
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TGTGAAGTTGGATTTCAATTGCTGTCCGACAAAAAGACTTGTAGAGATAT
CAACGAATGCTCAACGCTGAACGGAGGGTGTAATCAAATTTGCACCAATA
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GATGGCAAAACCTGCAAAGATATTAACGAATGTTCGGAACAGAAACCTTG
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AACACTATCGGTTCATATACTTGCTCATGCCGTCCTGGATATCGTTTGAA
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ATAAATGTGGACACAATTGTCACAACACTATCGGTTCATATACTTGCTCA
TGCCGTCCTGGATATCGTTTGAATGGAGACAAAATTTTGTGTAAAGCCTT
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GCTATGTGACCGACCAATCATGCTCTTATGAATGTCATTCTGGTTTCAAT
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TTTACCTTCGTCACAATGGTCTGGAAATGCACCTCAATGTCAAAGGAAAG
ATTGTCCAACGATTGAAGCACCAGAACATGGTTCTATTATGATACCGTGT
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GAAGCACCAGAACATGGTTCTATTATGATACCGTGTGTTGCCAAGTATGG
ATTCACATGTTTGAAGAAATGTTCAAAAGGATTTTATCTGGATGGAACTA
CTTCTGCAAAATGTGTTCTGGAGGGTAATCAAACTACTTGGACTGCCAAA
GACTCCATTTGTAGAGCATCGACACCTTGTGAACCAAATCCATGCTTAAA
CAATGGTCAATGTCTGGAGACATCAATCGACACTTTTGTTTGTGATTGTT
CTGGAACTTTATCCAAAGGAAAATTATGTGACATCGGTATTGTTGATATT
CCAACCCTTCCACAACTTGTTCTGAATCAGTGGAGCACAGATATCGAAAT
TATGGCTAGACCAACAGCATTCGTGAACATCGTTCCAAAATCGAGAATGG
AGCTAACCTTTGATCCTCCTGAAATCAGAATCGAAGTGCCAGAAAGTTCT
GCTAAATTTCAAATCCTTTCATCAAAGACAGGTGTTTTTGAAGTAGAATT
TGTGATTCAAGGAAGAAACGATTTTGAATTTGAAACACCAAAACCAAAAC
AAGTTTATGTTTTCCCAAAGAAAACTTCACTGTTGGTAGATATGGATATT
AGCACCGTCATTGATAACGCAAAATTGATACAAAGAAACTTAACCGATAC
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CAACGATCCAATCCAAATCTGTGGTATTGCCCGTTTCTATGGTTGGGGTT
GAAAAAGTAACATTGACCGCTTTAAAAGAGAGAGGAATTTTAAACCCTGT
AGACGAAATCGAGAGTTTCCTCAAAACGAAGGAAATTTCAATATTTGATT
ACCAATGTGTCAATGCAACTTCAGAGCTTGCACAACAAGTTGAATACGCA
ATCAAGTATAATTTCTTCCAAGCAGCTTACTTAAAAAAGTTTACAGTATC
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ATTCTGCAAATCTAGCAAGTCAACTTGTCACACTTGAAGATATCTTCAGT
CTGAAATGTTATGCTACAGGTAGCCAAGGAAAAAACAGATTATCAAAGGG
AATTCACAGCCTTTACCAACCATACACTCCAGTTCTTCTCAAAATACTTG
ACAAGAAGTTTGAAATGTCAAAGACAAACAGAATTTGTTATTTCGCAAAC
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CTCCAGTCCTTCACCAGATCACATCTTTGAGAAATTACAATCCTCGTATA
TGAGTGTTTCGCCAACGAAAGAAGAATTTTTCGTTGATTTTTCAATGAAG
ATGAAATCTTTTGATGGAAGATTCAAAGGAAAAGGATTCATGACATTGGA
AGATTCCGATAAGCATCGACACCTTGTGAACCAAATCCATGCTTAAACAA
TGGTCAATGTCTGGAGACATCAATCGACACTTTTGTTTGTGATTGTTCTG
GAACTTTATCCAAAGGAAAATTATGTGACATCGGTATTGTTGATATTCCA
ACCCTTCCACAACTTGTTCTGAATCAGTGGAGCACAGATATCGAAATTAT
GGCTAGACCAACAGCATTCGTGAACATCGTTCCAAAATCGAGAATGGAGC
TAACCTTTGATCCTCCTGAAATCAGAATCGAAGTGCCAGAAAGTTCTGCT
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ACCGTCATTGATAACGCAAAATTGATACAAAGAAACTTAACCGATACTTT
GGTTTTGAAATCCATGTGCTCAAATGGCGAGAACGTTGTAGGTTTTACAA
CGATCCAATCCAAATCTGTGGTATTGCCCGTTTCTATGGTTGGGGTTGAA
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AAGTATAATTTCTTCCAAGCAGCTTACTTAAAAAAGTTTACAGTATCAAT
GCCAACTTGGTTCGAATTAGCAAAGACTTTTTCTGAGCCTGAGTACAATT
CTGCAAATCTAGCAAGTCAACTTGTCACACTTGAAGATATCTTCAGTCTG
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TCACAGCCTTTACCAACCATACACTCCAGTTCTTCTCAAAATACTTGACA
AGAAGTTTGAAATGTCAAAGACAAACAGAATTTGTTATTTCGCAAACCTC
GAAGAGAATTCGTTTCACATCAACAGTGATTCACCAGTGAATTTCATCTC
CAGTCCTTCACCAGATCACATCTTTGAGAAATTACAATCCTCGTATATGA
GTGTTTCGCCAACGAAAGAAGAATTTTTCGTTGATTTTTCAATGAAGATG
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TTCCGATAAGTTTTTCACTCGAATGTTTGATTCCCAAAATAAAATTTCCG
GCAACATTGCTCTGGATTTTGACGTCAATTTGAAATTTCTTGGCAAGACA
TTAGCTGTTGAAGGGAAATCGACACAAGCTGAATACAACCTAACTTCTTC
AGTTTTTCACTCGAATGTTTGATTCCCAAAATAAAATTTCCGGCAACATT
GCTCTGGATTTTGACGTCAATTTGAAATTTCTTGGCAAGACATTAGCTGT
TGAAGGGAAATCGACACAAGCTGAATACAACCTAACTTCTTCAGGCAAGA
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TATCTCACTAGAGCTGAACGGAATAGTCAAGGTGTTGGAAACCTTCTTGC
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ATTTCAAGCATCTTGGCAATTTTAATACTTTTGTAATGATGGGACTTGAT
TCGACAAACTACTATGAAGCAATTAATACATTACAGCCGGTGAAGGAGTC
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Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_042611XLOC_042611-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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Properties
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