|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000200_pilon:105384..111716+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_042599 ID=XLOC_042599|Name=XLOC_042599|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6333bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000200_pilon:105384..111716+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTCAGTATAATCCTTGAAGCGGATGACGAATTCAACGAAGAAGAAAGCAA
TGTGACCTTGGGTTCATCACAAAATAATCTGTCCGTACAAAATGCATTGA
AAGTTGTCACCAGTGATGAGGAGTTTGATACGGACATCGAAATCGAAGGT
GAGTGAGCTAAACCTCTTATAAAAGGATTTCTAGGTACATGAATCAAATG
ATGGAAATAGCTCAAAACAAATACTCGAATACTGCCACTATCCGTGCCTA
GTGTAAAAACTGCCACTTAGTACACATCCATCGTCCCAATGCCACACACC
TTGATAATTATTTCCATCCGACATACAAAGTGTGGAAGAGTAAACGCGAA
CCTGGCGCAAAGCTTTTTATCCAAAAGAGCAAATTCATCCGCGTTTATTC
CAGTCTTTTATTCAGTAACCGCACCCCTATCCTTGGGAAAAGTTTTATTA
TTTCAGTGTGAAAAGTCCGTCCATTAAAACGCGACAAAAAATATCGAATG
ATACACGCTTGTTTTGTaataacaattttataagaaataaagaacaaagt
ggaaaattggccaaaaccaagaacaaaagaacaatcctaagcctcagatt
tcagaaattacttcgaaagtgtaataaaaaaattgattgtaacagatttt
aaacccattttcagtttttaagtaaagaaactagacgtattaagaacatc
gtaagaacatctAAGCCTGGAAATTAAGAGCAACCTAGCCTGAGTTAAAA
TTatttattcttataataaaaagtgTGTACCTTCAAATGATATCCTTTAA
CTCTTTTTTCAGACACGAAAGAAGAATATGATGCAACAGGAAAGAAAACA
TATTTCGAACTTTGTAAACGTCTCGATTCCACCCCTGTATCTTATTTCCT
TAAACACATGAGTGATCCCGAAATTAATCTTGCTTACCACGGTATTGGCA
CCAAAGGGGCCAAAGCTGTCGCTGGAGCCCTTGTTGTGAGTTTTACTTTT
ACATGTTCGCCGATATTATTACAGTGATACCCTTTTTAATGGGATTCTAA
GTAAGAATTATAAGTAGAATGAAATGTTTTAATAAACATCAGTGGTCAAA
GTTGGACGGAGTTCTATATCAGGGAAGTATAATAAGAGACTTTTCCGCTA
ATATTACAGAATTTGCGCTGATTAGTTATTCATAATCTTTTTACCGTGTG
AAGCGAGGATGTCCACTGAGTGAGCCGAACTGAAATTTCTTCCATAGGTT
AATACGGTGACACTGACTGTAAACTTAACAGAAAATTCGATTGGATTTGA
AGGTACAAGAGCTATCTCGGATATGTTGAGAGAGAATTGTTACATCACTG
ACCTTGTAAGTGTTCTCAATTCAAACTGTCTAAATGTAGTCAACTCGCTA
CTATAGTTATTGTATCTCACAACATTTAAAACTAATCTATACTCCCTTAT
ATTAAGCTGCTTACTGATCTTGCAGAAGCagtgcaaaatatttacttgaT
CCATCAAAAATGTAGTCCAGTCTTAATTTATATAACATTTTCAACGTCTA
AATTGATGGTCTACATTATATAGCTTTAGAAAGAAGACATTCCATTAGCT
TTAAGCACGTACCAAACTAAAAAACATAAATTCCGTCTTTTCGGACaaaa
aaaTCcatattaaaatcatttttgtttgttcTTCATTATAGAACCTTTCA
TCGAATTACCTTGGTCCAGAAGGCTGCAACAATGTGTGTGATATGCTCCA
ACAAAATCTCAACCTCAGGAAATTGGATTTATCTAAAAATCGTTTCGGAG
ATTCTGTTGGAAATATTCTCGCTGAAGCATTCAAGGtacctctctaattc
gaatatttctgtaattGAACTGAAACATTGGTCTCCTCAGCTGAAAAGTG
GTAAAAATTActctccgtaattcgaatctttctttaactCGAGAAAAGTC
TTTGGTTCCCAGAAGATCGAACTAGACACAGTCGGTTGATCAAGCTTGGT
CCATGTATATAAAGATCAGTGATTCTGAACACCATTGATGGGCTATCTAC
GTCGATTTTTCTTATTATGGAAGAAAACGTTTGAGTTTTAAATGGTAATT
CTCTTTCTTATTTAGAATAATTTCAAACTGTCTCATTTGGATTTGAGTTC
AAATGACCTCGGAGAGAAAGCCGGTATTGCTCTTGGACCTGGAGTTAGTA
AGTTCTATATCCTTTTGCAACACGAATGAATGAATCTacctttaaaggaa
gaaattttggcggaaagaaaataatgttttttcggtcatctgccaaatta
aattttctcaGAATAAACTTTCGACCATCCACCAAATTAGATTCTCGCCA
AGATTTCTGCCTCGAGTATTTGATATTCGTATACTTTAAGAGAGATTTAA
AAGTCTACCTTTTGCTTTCTCAGTCCCTCGCTTGGTGTTTTAAAACACAA
CTGTGGGAAAAATCACAAGTAAAGCACTCCACAACATACGTATCAGTTGA
AACAACTATTATTGACTATGTTTATCTATCGACCCTTGAAGCGTGGTTTT
CCAAGTCAGATTGACGTCAAAGTCAATCTTAATCAACGTCACATCACATG
TTTTTGACGTCATTGAGTTCATTCCTTCATGGTAAGCTCGACCCACGCCC
TTTTGTGGGGTGGAGGGTTCACAGGTGTCTTATGTGCGAACACTTTCATT
TTGAAACATTCTCATTACAGATGCGAACGATGCTATGGAATATTTGAATT
TGAGTTGGAATCAATTGAACAGAAAAGCCACAGTTGAAATTGCACATGGT
TTAAGAGTAAGAATATAATGACTTTCATTTTAGTATGATGTTAGAATCTT
GCCCTATAAAAAGCTACGATTAATCGATCTTGCCCAGAGGGGAGGGAAGG
GTCAAACACGAATTATCTCGTGAATATTTTTCTCTAGAAAGAATAGCGGA
TTTTTCTTATTCACAGTTTTTCTAATTATGACATTTTTCCGATTTCAGGC
TAATTGTACGTTAAAAGTCTTGGATCTATCGTGGAACGGTTTTTCAGACT
TCGGTGCCGTTGCTTTAGCAGATGCTTTAAAAGCAAACAACACATTAACC
GAACTCAATATCTGGTAAGGTGATTACTAGTGATTACTAATCTAAAGCTC
GTCTACATTAATGAACTTTGTTTTCAAATGAACCcagcagagattttcat
caCTTTGCTAAACAAGAAATATGGCGAATTTGTTGTGACTACGAGATTGT
ACATACTAGCATGTCTAAAGTCATATGATTTGTCGTGGAAATcaattatt
ctcaacttcagttgaacTACAATCTGAGAAtgtatgtgtctgtgtgtctg
tgtgtatgtcccaaaactttggggcagcctggagacttcaaaaattgatc
gatttggctgaaattttgcacacttgttccttgggtgaatatctgggggt
gctttttgcatttttcaaaaattttgatttttgtggcctggggacgagtt
ttttgccaaaacgaggctaaagctttggagcagcctacaggcctccaaaa
tggtcggatttgattgaaatttggcacacttgttcatggGGTGAATATca
gggggtctacaattgggcctatgaataatttaaagccactgaagttgagc
ccagtgcgttgcgcacgttcgactatttgacattcaaaatcatttaaaaC
TCCATTGACATTTGTTTTTCATTATTATTCTTCCTTAGCAACAACCGTAT
CCATGACGACGGAGCAGTTGCGCTCGCCAAAGCTCTTGACTTCAATAATA
CTCTTGAGATATTGAAGGTACTTTCTAATAAAAGCTTTGTTAGAAATAGT
TGGAGTCGTCGGATTCAGTACACTACATCGCCACCAATATAAAACATTTG
AATCAGATAGCAACCATAATATATATTAgaaacacaaaatggaaagtccg
ggggagcccgcgaaaaaaactctatttcaaaaagatcattgtaaaaagta
cgagcggtttatagaggcccatgtgtcttcacggtggcctgcaaacctgt
aaagctttattattattatatttgaATCCATTATATCCAACAGGCTTAGA
AAATATCCTTTCTTTCAATATCAGAACCACTTCTATTCACATTAATACGT
TTGTtactttacattttttgttGCAGCTGAACGGCAATCCACTGACGGAA
AAAGGAGCTTTGTTGCTCCTGAACAGTATCAACAATAAGAGTGACAGTGC
GATCCACGAACTCCATATCATGGTATGAAAAGTTGTTATCTTGGAGGAAG
TGTAGATAAAGTTTCAAAGGTTTTTGATGAGTGGCACAAATATGGTCGAT
GATCATACTTTTCAAATCGTTATAAACTAGATTTTTTCTGGTTGCATTTG
AGGTTGAAAAAGCGTCTGAAATTACAATAGTGAATGGATCTTTATTTGTG
AATTATAGAACTGAATTGTATTACTTTTAGTCGAGCTTTTCTTTTGAGGA
ACCCTCACCTATGGACATTATTTTGTTAAAGACCTGCCAGAATTCACTTT
ATATTTTTGTCAACACAATATTCGTACGATTACAGGGTGTTTTCATTCAA
GATGAGTTCTTGAAATTATACAAACAGCTTCGAGAAAACAAAGAAGTGAT
TGTATTGGCTGATTTCCGTGATTTGACGCCGCTTGAAAAAGTTCAGAGat
tcatcaaagaaaacaaGGATACATGGCTAGAAGGTTTCCATTCTATCGAT
GAGGGGCTAGTCTATCGTGTACCCATCCCAGATTTCTTTGATATCTTACA
GGTAAGGAACCTCTTGTTGCTACAATCAGTACCATAGCATGttggcaatt
ttggctattttaccatttttcgaaaattgaagttcgagcgagaatgtcaa
tttcgggccttcaacttgatttcatcgaatgtttcgatctgggagggatt
tattggtttctaggctatatttcaagccctacctGACcacttttgaactt
ttggatcctcagatcctaaggtcctcagATTATAAGGTCCAAACATGCTT
TTCGATTGAAATTGGtcccccagcagagcagaatttagcatttttcgaaa
tttggagttcgggcgagaaagtcgcttttgggctaaattgataaattcat
tcgagtatttcaattcgAGAGGAGTTtctagacttccaggctatattcag
agccctattggaccattcttgaactttttgcTCCTCAGAAGTCCTAAGTC
TAGCGtaaaaactcagagttaaaactctacccctCCGACCtgatttagag
cgcttccaaattgtttgtggctataagattttGTGGGGAATTTCTCTTTT
GTGTTAAGTATTTTGGAATTGATTGTAGAATTTacaggccatttcacagt
cgcaaagcggaCCACTGTGCACTATTGAAGACTTACTATTGCTCCAAagt
ttggaaattttttgaagatttttgcgtctagccaaccaGAAGTCGTTACT
AGAGCGCAACCAGtcttgattacccatgattcatttcgactttGAAATGG
CCTATTCAAAATAGAAACcaatgttttggtgttttttatttctttaatgA
ACAATTATGATCTAGTTTGTACCTAATCTTTTCTTCGATTAGAttttttt
AGTTAATGATCATGTCTCGACTGATGCCCTAGGCTTTGGCCtcatttaca
aatatttttatgaatgACATGGCTAGATAGTatcatttatttcaaaagtt
CATTTGATTGCATGAGATTTTCTCGGATGATTTATACCCCACTTATTTAc
tgttttcaattCCAACATTCATCATTTTTTACATTCCATAGAATCTTGGT
CTTGATTTTTCGTTCGAAGATCAGATCGCTTTGCTgggaaaaatgaagaa
agattCACGAGGACGCATCAAATATCGGTATAAATTTATAGCCTGGTAAA
GCCACTTAGGCCCGTCTCTTAGGCAGGCAGATCAATATCAACGATAgctt
tctcaaattttgtgcTCGCTCAGCATCGCGAAGAGAGAAAGTCGTTCTTt
cgtttgtttaaaaatgctatataagaaaaaggttgaaaatacGTCAAATG
ATGTCCCTTTGTTTCTGGAGCAAGCTTTTGAATCATGAGGTGCTCTTTTT
ATTACGAGTTTGGTAAAGCTGGCTGTGAAACCCTCAGTTGCTTTCAAGCC
GTCCCACAAAGCTAAAAAATTGGATAATTCATTTGagattttaactttta
aatttgCTATTTCTAGTGACCCACTTCTTGGATTTCAAAAGGAGCCACCA
GCCGCACCACCAGCGGAGACCGTCAGCGCATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000200_pilon:105384..111716+ >XLOC_042599 ID=XLOC_042599|Name=XLOC_042599|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2802bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000200_pilon:105384..111716+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTCAGTATAATCCTTGAAGCGGATGACGAATTCAACGAAGAAGAAAGCAA
TGTGACCTTGGGTTCATCACAAAATAATCTGTCCGTACAAAATGCATTGA
AAGTTGTCACCAGTGATGAGGAGTTTGATACGGACATCGAAATCGAAGGT
CAGTATAATCCTTGAAGCGGATGACGAATTCAACGAAGAAGAAAGCAATG
TGACCTTGGGTTCATCACAAAATAATCTGTCCGTACAAAATGCATTGAAA
GTTGTCACCAGTGATGAGGAGTTTGATACGGACATCGAAATCGAAGACAC
GAAAGAAGAATATGATGCAACAGGAAAGAAAACATATTTCGAACTTTGTA
AACGTCTCGATTCCACCCCTGTATCTTATTTCCTTAAACACATGAGTGAT
CCCGAAATTAATCTTGCTTACCACGGTATTGGCACCAAAGGGGCCAAAGC
TGTCGCTGGAGCCCTTGTTACACGAAAGAAGAATATGATGCAACAGGAAA
GAAAACATATTTCGAACTTTGTAAACGTCTCGATTCCACCCCTGTATCTT
ATTTCCTTAAACACATGAGTGATCCCGAAATTAATCTTGCTTACCACGGT
ATTGGCACCAAAGGGGCCAAAGCTGTCGCTGGAGCCCTTGTTGTTAATAC
GGTGACACTGACTGTAAACTTAACAGAAAATTCGATTGGATTTGAAGGTA
CAAGAGCTATCTCGGATATGTTGAGAGAGAATTGTTACATCACTGACCTT
GTTAATACGGTGACACTGACTGTAAACTTAACAGAAAATTCGATTGGATT
TGAAGGTACAAGAGCTATCTCGGATATGTTGAGAGAGAATTGTTACATCA
CTGACCTTAACCTTTCATCGAATTACCTTGGTCCAGAAGGCTGCAACAAT
GTGTGTGATATGCTCCAACAAAATCTCAACCTCAGGAAATTGGATTTATC
TAAAAATCGTTTCGGAGATTCTGTTGGAAATATTCTCGCTGAAGCATTCA
AGAACCTTTCATCGAATTACCTTGGTCCAGAAGGCTGCAACAATGTGTGT
GATATGCTCCAACAAAATCTCAACCTCAGGAAATTGGATTTATCTAAAAA
TCGTTTCGGAGATTCTGTTGGAAATATTCTCGCTGAAGCATTCAAGAATA
ATTTCAAACTGTCTCATTTGGATTTGAGTTCAAATGACCTCGGAGAGAAA
GCCGGTATTGCTCTTGGACCTGGAGTTAAATAATTTCAAACTGTCTCATT
TGGATTTGAGTTCAAATGACCTCGGAGAGAAAGCCGGTATTGCTCTTGGA
CCTGGAGTTAATGCGAACGATGCTATGGAATATTTGAATTTGAGTTGGAA
TCAATTGAACAGAAAAGCCACAGTTGAAATTGCACATGGTTTAAGAATGC
GAACGATGCTATGGAATATTTGAATTTGAGTTGGAATCAATTGAACAGAA
AAGCCACAGTTGAAATTGCACATGGTTTAAGAGCTAATTGTACGTTAAAA
GTCTTGGATCTATCGTGGAACGGTTTTTCAGACTTCGGTGCCGTTGCTTT
AGCAGATGCTTTAAAAGCAAACAACACATTAACCGAACTCAATATCTGGC
TAATTGTACGTTAAAAGTCTTGGATCTATCGTGGAACGGTTTTTCAGACT
TCGGTGCCGTTGCTTTAGCAGATGCTTTAAAAGCAAACAACACATTAACC
GAACTCAATATCTGCAACAACCGTATCCATGACGACGGAGCAGTTGCGCT
CGCCAAAGCTCTTGACTTCAATAATACTCTTGAGATATTGAAGCAACAAC
CGTATCCATGACGACGGAGCAGTTGCGCTCGCCAAAGCTCTTGACTTCAA
TAATACTCTTGAGATATTGAAGCTGAACGGCAATCCACTGACGGAAAAAG
GAGCTTTGTTGCTCCTGAACAGTATCAACAATAAGAGTGACAGTGCGATC
CACGAACTCCATATCATGCTGAACGGCAATCCACTGACGGAAAAAGGAGC
TTTGTTGCTCCTGAACAGTATCAACAATAAGAGTGACAGTGCGATCCACG
AACTCCATATCATGGGTGTTTTCATTCAAGATGAGTTCTTGAAATTATAC
AAACAGCTTCGAGAAAACAAAGAAGTGATTGTATTGGCTGATTTCCGTGA
TTTGACGCCGCTTGAAAAAGTTCAGAGattcatcaaagaaaacaaGGATA
CATGGCTAGAAGGTTTCCATTCTATCGATGAGGGGCTAGTCTATCGTGTA
CCCATCCCAGATTTCTTTGATATCTTACAGGGTGTTTTCATTCAAGATGA
GTTCTTGAAATTATACAAACAGCTTCGAGAAAACAAAGAAGTGATTGTAT
TGGCTGATTTCCGTGATTTGACGCCGCTTGAAAAAGTTCAGAGattcatc
aaagaaaacaaGGATACATGGCTAGAAGGTTTCCATTCTATCGATGAGGG
GCTAGTCTATCGTGTACCCATCCCAGATTTCTTTGATATCTTACAGAATC
TTGGTCTTGATTTTTCGTTCGAAGATCAGATCGCTTTGCTgggaaaaatg
aagaaagattCACGAGGACGCATCAAATATCGAATCTTGGTCTTGATTTT
TCGTTCGAAGATCAGATCGCTTTGCTgggaaaaatgaagaaagattCACG
AGGACGCATCAAATATCGTGACCCACTTCTTGGATTTCAAAAGGAGCCAC
CAGCCGCACCACCAGCGGAGACCGTCAGCGCATAATGACCCACTTCTTGG
ATTTCAAAAGGAGCCACCAGCCGCACCACCAGCGGAGACCGTCAGCGCAT
AA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000200_pilon | genome | sc0000200_pilon:105384..111716 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1378-1407:6304 |
| Aaloc | 1345-1377:6268 |
| Aaloc | 1258-1341:5842 |
| Aaloc | 1042-1257:4586 |
| Aaloc | 946-1041:4177 |
| Aaloc | 868-945:3740 |
| Aaloc | 751-864:2999 |
| Aaloc | 667-750:2723 |
| Aaloc | 583-663:2116 |
| Aaloc | 439-582:1692 |
| Aaloc | 331-438:1248 |
| Aaloc | 160-330:815 |
| Aaloc | 10-156:1 |
|
