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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000289_pilon:237835..245784- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_042460 ID=XLOC_042460|Name=XLOC_042460|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7950bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000289_pilon:237835..245784- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGGGTTTACGTTAAGAAGAAGTTGAACTCTAAAGAACTTGGAAAATACGG
CTTACTGTTTTATAACAGTTTGTTCATGCTCCCTGTAGCTCTTACAATGG
CTGGACTGAACGGTGAAGTTGCTAAGGTATCAGGTTGAATTCACCCATTA
TACAATTTTTTTAAAGCCTTAGGATGTTCTTAACTTTTTGAGCTTTATGC
CTAAAAATGTTCTTACATGTTCTTATTTTCACCATTTTGTGATTATTATT
GTCCATTTTCTTAAGAAATATGACCATTTTAGAGTCTGCAAAGCCTTTAA
AAATTCTTAATTTGTTCATAACATATTGGCCATCAAAGCCTTATGTTCTT
ATATAGTTTGTTCTTATAAAAAAACGTGTAATATATGATGAGATTGCCTG
ATCTTTTTATTTACAATTCTGACCAGGGACATGTCTGGATCTGTTCGACC
GTAGTCGCACGAACATTCAGCGAACAGTCGCGCCTGCCATTTAATTACTT
AAAAAAACCTAAATAGCGCTCCCAAACCATTCCCACTGCACTTTTTTAAC
CTTGGAAATATAGAATTGGGATTTCAATAGAAATTCTTATCCCCACTGAG
AAAAAAAGTTACACCGGGGCTGTGTTACATTTTGAATAAAAATTTCCAAA
ACTCACATAAATATATGGATTATTCGTGTTTAATTTTTTCAAGTTGCGTA
ATTTTGATGGTTGGAATAACCCGACGTTCCTTGTTCAATTGTTCATGTCA
TGCACCATGGGGTAAGAGAGCGTGTTTCAGGATTTCTATTTAAACCCTAT
TCATGATATGCACCACTGCAATGTCTTCCGACATTACATCACGGACCCAA
TAGTTGATTGTTTCTAAGTGACGTAAAATCAGTCAATACGCCACTTTCAA
CCAATCAGCTATTGGGTGGAATGGAAGACATTGCAATGGTGCATATCAGG
TATTAAAGTCTTTCTCAAATGTATGTGGACACTTTATTTTTTTGACATTT
TCTCAGCATGGATTAATGATGTATTAAAAAGCTATTGGAAAGATATTTCA
AAGAAGAATAATCTAAAGGATAAAATATTTTTAGAAGATAAAAAGTGAAG
AATTTTTTTACTGTCTTAATTTAAAACTTGCTTATTTCAAATTTATGTTT
AGGTTTTTACGTATCTTTCTTAGATAAAAAGAGCCCTTTGAAGTAGCCCT
AAAACGGCCAAAAACATCTGAAATGACCAACTGGCTTCCCCAAATATGTC
TTTTTGTTGGACTGGATTTTTTTAAGGAAAATAGTAATGTTTATTGACTT
TTTCTTTTTTTTTGCACTTCGTCGTCACAGGTTCGTGTTGAACTATGCAA
CAGTACTATGCACGCAAGCTAACTCCGCATTAACTACAACTATTGTTGGA
TGTTTAAAGGTACATTGGGCTTTTCCAGAAAAAATTTGAATATGGGGGGG
GGGCATGGAAAATATGACAATTTTCAGTGATTTACCCCCGGACAAAGTGA
TTTTAGGCCTCCCGGACAACGGGTTTTACCCCTCCGGACAAGCATCACTT
GATATTGATAAGCCTCGAGCTAAGTACACATTGTTTACGATTGTTTACAT
ACTTTACATCAACTTTAAAGAAAAGAAACATAAACAGACCCCCCAGACAA
CCCAAATTTACCCCCCGGACAAGGCAAATTTTGATGATTTTTCGCTAACC
CCGCACAATATATCCTCCACCCCCCATGTACGGACATTTTCTGGAAGAGC
CCGTTCCTTGCATTTATATGCGCTAGAATCACTGACCTTTATAAAACCTG
GAGGCAGTTTCTTAATACTTAAAATATTTATTCGAAGTTTTACCCTAATG
ATGGCACTACTCAATAGTGGTGTAAATGCACCGAGAGCCCTAGATCTACT
TTTCCTTGAATATTTGTGATTATATATCTCCGTTTTACAACACTGCAATG
GCTTCTCTGCGGGTACCACTATCAAAGAAACTCCGATCAAAGATGGTGGA
TATAGCTTAGTCCAGGGTGCCTAATAAACATCCCCGTTTGTTAGTTTTTC
GACTTTTCCCAACTTCCTGGACCTCATAAAGACCCCCTCCCCCGGTTTTT
TCATTTTTGAAAAATATTCTCAGCTTTTAAAAGAAGGGAGCCTTATTTGT
ATCTAAATAGCTGGTTTTGAAATTATTGCCATGTATCTCAGCGGATTTTA
TTAAAACTACTTTCTATTCATAAAAAAATCATTTAATGTCTCAAAGGACA
TAATCACCAATGTAATTGTTTGAATACGAGGCAGGTGATGTTCGTGACGT
AATTTATGAAAAGGTCTATTACCATTTTTTGGGGACCTATGTAGAGGTAT
AATATCCAGCCCATCGGCAACTGAGAGCATATTTGTGGCTCCGGTTCATA
ACTACGAGTCTCATTTTTTCATTCCATAGAACATCTTGGTGACGTATTTT
GGGATGGTTGTCGGTGGAGACTACGTGTTCAGTTGGACCAATTTTCTTGG
TTTGAATATCAGGTAAAAATATCTTTGTTTCGACTGTTTATAAACATCAG
ATTAGATTTTGCTGAGCCACCGTAGTGCAGTGGTAGAGCATCCGGCTACG
TTTCGCAAGGTTGTAGGTTCGACCCCCAGCCGGGTCACACCAAAGATTAC
CAAAATGGTACTTGATGCCTCTCTGCTTGATGTTCAGCAATTAAGAGAAG
GATCAAGGGTAAGTGGAGCAGTCCAGGGAGAAAGAGTGGCGCCATCCCCT
ACCTTCGGGTAGATAGCTATCGAAAGAGGAGCCTACAGGTCCCCTCCGAC
TGTGGCCGCAGACTTACTTACTTTTAATAAACTTTTAATGTTGCGATTTA
GCTATTTTTGAGTTTTTATATAATAATTATCTCGAGAAAAGGGTTGTGCT
AGGGTTTTAAATGCAAGGTAAAATTCATATTTGATTGTAAAGGATTTTTC
TTTACCATTTCATAGATTAAGTCGCAGAGTTCTTAATTAATATTTGATAT
AAAATGCTCTGCTACGGTCTATCGAGCATTCAGTTTGAAGTGGTTTTCAC
ACACACGCCGAATTGAAAGTAAAATTTACCGCAAGATTTCTATGATTATA
TCGTATGAAAATAAACAAAAGCACCAGATTCAGTCTGCCATTTAAGTGGC
GCAAATTTTAAGGCTTGAGAAAGGATGAAAGGTTGAAGATTTAGCTCCTT
TTTCGGTTTTTAAACTCAATGGTATCGAGCACTTTTCAATCCCAGACGGC
ACACAACGTCAAAACAACGTCCATGTGACATTCATAACGTCCAAATTTTT
GTTTTTTTTTATTCGTGGTCAGATTTCTCTTTTTTTGCTCTTTGTTGAAT
ATCTTTCATATATAATTACAATAAGGGCAATAAATTAGAGTAAATTTGGT
TTTATAAATAAATAAAATAAATAATTGGAAACAATAACCGCTAGTGGCAC
TAGACTGTAGCTAGCAGCAAGTGACAATGAGTCTAACCTAGGGTCTAACG
TTATTTGAACGTTAAAACAACGTTGTGTGCCAGCTGAGATAAATTGAAAT
CGGATTCGCCACTAATCATAAGATTACATATGATACCCTTGTGTCACAGA
CCCGCTAGGACCCTAGCCCCACTGAAAAATTTGGCCAAAATTTCGTCCCC
GGTGGACAAAATAGCCTACAATTTCAGCCCCACTTGGAAACTGACTTTGC
TGTCCAAAACCACCCCCAGTGGATATTTTGAGCTCGGGAACAATAGAATT
TCTATCCCCTATGAGATTTCGATAGAAATTTTTATCCCCACTGTGGGAAA
AAACCACCGGGGCTGTGAGGCAGGGGTGCCATATGAAAAATGATAACATT
CTTCTATACTCTTTCTCATTTTCAGTATATTTGGAAGCATCGTTTATTCA
TACATTGTCTTTGTGGAAAAGGAAAAACCTCCGTCGCCAGTGTTACCTAC
GAAAACAGTTAGTAATTTATAATTTTTAATCTTTAAAAAAGAAAAAAATA
TATTATTATTGATAATCAAATATTTAGGCAACAATTTTTTAGAAATATTT
TAAGGTTATAGTATCACGTAGTATTTTGATTATATGCAGTGCAACGGTCA
AAGTTACGAAGCGTTTCGTTAGCTGGTCTTAAAGGGACAATCAGATGGTT
TAAAATCTTTTACCTGCACAATCCCCCCTTGACCCTTAGAAAATTCCAAA
TCTTTTTTGGACCTACCTTGGAGGTCCTATAAATTAACCGATGTCCGTCC
GTCCGTCCGTTCGTTCGTTCGTCCGTCCGTCTGTTACCAGCTTTTCTCGA
GATTGGCTCATTAGTTTTTTCTGATTTTTGGCACAATGATGCAAAATGGT
AATGCCCAAAATGTGACGGAGCCCGATTTTCGAAAAAAAATCATTTCCGG
CCGAAAATGCCGGAAATATGCCGGAAAAACCGGTTTTTTGGCATTTTCTC
GAGATTTCATCATTAGTTTTTTCAGATTTTTTGCACAAAGATGCGTATTA
GCAATGCCCAAAACATGGCAGAGTCCGATTTTTGAGAAAAATTCTTTTCC
TGCCGAAACTGCCGGAAATATGCCGGAAATCGCCGTTTTTACAGATTTTT
ATCGGACTTTTTCCTTATAATTGGTTGTTTTTTCACACAAAAACATTGTT
AATAGCAATGTCCACGATCAAGCATGGTTCAATTGTCGATAAAACTGATT
TTTGAAGCCGGAACTTTCTAAAAATTGCCGGAACAGCCGATTTTCGCCGG
AAAAACGGTATTTCTTGAATTTCTCGAGCTGTACTTTATATTTCTTTATG
AAATTTTGCACACTGATGTAAAATGACAATACCTAAAAAGTGATGGAGCC
CGATTTTCGAAAAACATTTTTTTCCGGCCGAAAATGCCGGAAATATACCG
GAAAAACTGTTTTTTTGGCATTTTCTCGAGATTTTATCATTAGTTTTTTC
TGATTTTTTGCTCAAAGATGCGTAGTAATATTGTTCAAAACATGGCCGAG
TTTGATTTTTGAGGAAATTTTTTTCCGGCCGAAAATGCCGTAAATATGCC
GGTAATCGCCGTTTTTCTGGATTTTCATTAGACTTTTTCCTTACAATTGG
TTGTTTTTTCATTCAAAAACATTATTAATAGCAATGCCCACCATCAAGCA
TGTTTCAATTTTTAATAAAATTGATTTTTGAAGCCGGAGCTATTTAAAAA
TCGCCGGAACAACCTATTTTTGCCGGAAAGACAGTATTTCTTGATTTTCT
CGAGCTGTACTTTATATTTTTTTTTGAAATTTTGCACACTGATGCAATAT
GACAATATCTAAAATGTGACGGAGCCCGATTTTAGAAATGCCGGAAAAAC
CGGTTTTTTTACATTTTCTCGAATTTTCATCAAAAGTTTTTTCTGATCTT
TTGCAGAAAGATGCGTATTCCCAATGCTCAAAACATGGCTGAGTTTGAGT
TTTTTTTTTTTGGTTGAAAATGCCGGAAATCGCCGTTTTTGCAGATTTTC
ATTAGATTTTTTCCTTGTATTTCTATGTTTTTCACACAAAAACATTATTG
ATAACAAAGCTCACCATCAAGCATGATTCAATTGTCAATAAAACTGATTT
TTGTGACCAGAACTTTCTATTTTTTTCCCCTACAACCCTTCCCTCTCCCC
CCATCAACAATCAATGATGAATTTATCGTGTTATGCATTTTCGCTAAACG
CTATATTTTTTGACTGATTTTTTTCTCCTCGAATTGCTATCCAACTTTCA
TCATCAGGTAGGTCCATTCAGCATCTAGCTTGTTTTTTTTAACTTTTTTT
GAAAGTCGATATTATGACAATTTGAAATATCTAAAAATGACTTCTTACAC
GATTCTAACGTCGATTTTTTCCTTGCTAGAAGTCAAAAACTTGTGACTTG
AATATCTCAACTTTGGAAAAGAGTTATACAAAAAGATTTTGAGAAAAGAT
TATTGGAAATTTTCACCAGGACCATTGGAGGGTTCTACAAGCAAAATATC
TTAAATCATTCGATTGTCCCTTTAAATATACACAGTGTTTAAAAGGAAAA
TATCTCAAGCCCCAGTTCCAGAGTTATAAGCGTCCAATTTCTAATTGGGA
GTTTTATTTCCAGGTACAGTAGTTCTTCTTTTTTGATATTAAAGATTATC
AAATTTTGTCAAAAACTTCCCTTGGAACTTCTAAAATTTAGTAATTTTTA
AACCAGAGCATTTCATAGTTTTTAGGGAACGCTCTATTTTACATCACAGA
AAATCGGTGGACTTTTGCTTTACTTTATAATGTTTAATGAGATTCGCGCA
TAGTTTCTTTTCAATTAGGCTGAATTTAAGAACTAAATTTTTTTGATTCA
TTTACCATATAGTGTCCTGAATATGGAAGAATCTCTAATTTATGCAAACT
TTGAATTTTGAATAACTTTTTTGAAAATTTTATTGAAGTACCTCGGAAAT
TAGATATCGATTTATAAATTTTTTAACTGCATAGGATATAATAATTTATG
GAACTTTATATTAAATTCAAACCTTTTGGAGTCGGCCCTCCTTTTTCAGG
GTTCATCTTTTTTGCTACTCACACCCATGATAACTTTTGCCAGACCTGAC
TCATAGGCCTCTGAATGTCGTAAAATCTTTTCTTTTTTCAAACAAACTTA
TTTTGGTCGCGTCCCATGAAAGATGTCACAGATCCTAAAGGCTTGGGGAC
ACGAGAATTTTTTTTTCGCGTTGGTGCAATGCAGCATGCTCCATCCCACC
AACCTGAAACGCTTTCTCGTGTCTCCACCTCATTTTTCTTTCTACCGATA
AAAGTGAAATCTCACCTTTGTTCCTGGGACAAAATCATCGTGTCTTTTGG
GTATTTTCCTCACTTTTTGTTCCATGAAACAAAAAAAAAGAAACCATGGG
ACACGTACTTTTTTCTTGTGTTGGTTGGATAGAGCATGTTGCATTGCACC
AACGCGAACAAAAACGTCTCGTGTCCCCAAGCCTTAAGGGTCGACCCCAT
TAATATTTCAGTAATTTGAAAATTTAATGTAAATTTTTTTGCTATTTATA
ATCACATGTATTACTAATAGGTAAAATTTATATTGAAGCATTTTTAAAAA
TGTATTTTAGACATCTACTTGAAACCATTTCTTATCTAATGGCGATATTC
CTGGATATCTTGGCATATCCTATCCATAATATATAGAATGAAAAAATAAA
ATGATTTTTCTGTCAGACCTACAAACAACAAAGAGTGGCCGAATTCTTCT
TCCTCTTAGAGAGACGATGTTACAATGAAAGTCCTCTCTGGGTCCCTCTG
TCTTTATCCTAGCTTGGGACAGGCTGACTGTCATTTAAGACAGTCAGGCG
ACATTACCCCAGCGGCCTGTACAAGATGACAACAAACTCCAGGTAGACTG
AAAAAAAACTACTAAAAATTTCCATAAATGTTAGATGTCTGGAGGTGGGA
GGTCACTCTGAGGTGCCTAATCAACACTCCCTCCCCCGTCTATTAACGTT
TAAAAGATATTTTACCTGTCGAAAGGAGAGTCTCTCATTATGCTCTAAAA
AGCCTTGTTTAAGTTTATGATTATTTTTTTTGGAGGGGAATATTTAGAGG
TACAATTTCCAACCCCCCCCCGAACATACAAATGTGAAGATTAGTCTATT
AGGAGAAATTACCTGAAAAACTTTTATTGAAACATTCCATTTTACTTTTA
TTCACTGTCGCTTCTGGTTGCTCGTTTCAGTAACAAAGTCACCCTTTTAA
CATTATTTTTATGCTCGATGTGGCGTGAAGACGCCTAACAGCAGCCCCGT
CCGCCCCGTCCGCCCCGTTCCATAACATGAAAGTGTAATGTGGATATACT
AAACCAAACATTAATATTTAATTTTTCATCATGTTAGCTTTTTTTTATTT
CTTCATAGATATTAATAAACAAGAATGACAAGAAATTAAAAAACAATTGA
Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000289_pilon:237835..245784- >XLOC_042460 ID=XLOC_042460|Name=XLOC_042460|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=960bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000289_pilon:237835..245784- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGGGTTTACGTTAAGAAGAAGTTGAACTCTAAAGAACTTGGAAAATACGG
CTTACTGTTTTATAACAGTTTGTTCATGCTCCCTGTAGCTCTTACAATGG
CTGGACTGAACGGTGAAGTTGCTAAGGGGGTTTACGTTAAGAAGAAGTTG
AACTCTAAAGAACTTGGAAAATACGGCTTACTGTTTTATAACAGTTTGTT
CATGCTCCCTGTAGCTCTTACAATGGCTGGACTGAACGGTGAAGTTGCTA
AGTTGCGTAATTTTGATGGTTGGAATAACCCGACGTTCCTTGTTCAATTG
TTCATGTCATGCACCATGGGTTGCGTAATTTTGATGGTTGGAATAACCCG
ACGTTCCTTGTTCAATTGTTCATGTCATGCACCATGGGGTTCGTGTTGAA
CTATGCAACAGTACTATGCACGCAAGCTAACTCCGCATTAACTACAACTA
TTGTTGGATGTTTAAAGGTTCGTGTTGAACTATGCAACAGTACTATGCAC
GCAAGCTAACTCCGCATTAACTACAACTATTGTTGGATGTTTAAAGAACA
TCTTGGTGACGTATTTTGGGATGGTTGTCGGTGGAGACTACGTGTTCAGT
TGGACCAATTTTCTTGGTTTGAATATCAGAACATCTTGGTGACGTATTTT
GGGATGGTTGTCGGTGGAGACTACGTGTTCAGTTGGACCAATTTTCTTGG
TTTGAATATCAGTATATTTGGAAGCATCGTTTATTCATACATTGTCTTTG
TGGAAAAGGAAAAACCTCCGTCGCCAGTGTTACCTACGAAAACATATATT
TGGAAGCATCGTTTATTCATACATTGTCTTTGTGGAAAAGGAAAAACCTC
CGTCGCCAGTGTTACCTACGAAAACAATATTAATAAACAAGAATGACAAG
AAATTAAAAAACAATTGAATATTAATAAACAAGAATGACAAGAAATTAAA
AAACAATTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000289_pilon | genome | sc0000289_pilon:237835..245784 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 439-480:43 |
| Aaloc | 358-438:4075 |
| Aaloc | 274-354:5522 |
| Aaloc | 196-273:6620 |
| Aaloc | 127-192:7258 |
| Aaloc | 1-126:7951 |
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