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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000289_pilon:247144..253998- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_042459 ID=XLOC_042459|Name=XLOC_042459|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6855bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000289_pilon:247144..253998- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGATGGTCAGTCCAGTTCGTAAAGTTTCGACTGCGTTATTTTATGCAAC
ATCATCATTATTGATCGTGTTTGTTAATAAAATGGTATTGACAACGCACA
AGTAAGTTTTTACGTTCGTTCGTTCGTTCGGAAAATATGACGAAAAATTT
GAACTCGAAAAATATATCCTATATTGTACTCGGTACTGTGTGATAACTAT
TACGTAAACAACACAAGTTTAATTTTGCTAGAAAATATTTTAGATTGAGT
ATTTTGGCCGGTATACGGACATAAAAAAAGTGCTTAGAAAAATCCCTGAG
TTTGTTTCAAAGTAATGATTTTGTTGTACTAAAACATATTTAAGAGAATT
AAGGGGTAAGGGGTAACTTCTCTTTATAAAAGAGGATATTTTGGAAGTAA
AAGTTGGGATAGCCAAGAGGTACCTGTCCTAAAATCAATAACGAGTTTAT
GTATTTGCACTTTTGGGGACGGTAAAGTGACTGACGCGATTTGGAATAAC
CCGCACGCAGTTCTGACCCGCAAAATCGAGGACGGTAAAAGTGCTGATTT
ACCGTCGTCCTCAGTTGGTCATTATCTAGTCAAATTAGAACATTACCGTC
TCCGTCGCAGGAAAACACACATACATGAGTGAGGTTAAGTAAATCGGTAA
AATCACGACGACGAACGAAAATTTAACAGGCTAGTAAGTTTCAACCAATC
AAATTTCGTATTTCCACCAGCCTATTACATTTTTCGTCCGTCGTCGTGAT
TATCCCGGTATACTGAACCTCACTATAAACTCGGTAATATCTTTAACAGC
AGTGGAACGTTTTTTTTTCTTCCACCCATAGCTATACTGCGGATAAGTAT
GTTAATTGGCTTTCTTCATGATTAAATTGGGAAATTTTTGCATGTTGAAT
TCTCTCTTTCTTCTTGTAGATTCCCTTCTTATCAAGCTCTTGGAATCGGC
CAGGTATATATTACAGATGAGATGGAGTTTTTCTAAGATACTTTAATGAT
TGGTCATTTGAAGTAATAAAAATGACGCGTTCTTTAGAAAAAGTAATAAA
AATTGTTTTATTACTGGTTAAACGATCAACCAAATCAAATAAGAGCTTGT
AAAAACTCCATCTCGTCCCATATATTATGTTTCGAATATTTTGTTTTTGT
GATACACTTTATTATGAAGTCGACCAAGCGCATCAATTATCATTATTTTT
CACTGTGCTTTTAGTAAGCAATGACCAATAAGAGTGCTCGAACTTAATGA
TTACAAAGTTTTATACTACACGTTTTTTAATAAGAACATCCAAAAATTTT
GAAGCCTTTGGATGTTCTTAACTTTTTGAGTTTTAAGCCTAAAAATGTTC
TTAACATGTTCTTATTTTGACCATTTTGTGATTACTTTTTGACCATTTCC
CTAAGAAATAGGGTATTTTTGAGTTCACAAAGCCTTAGAATGTTCTTAAC
TTGTCCTTATGTTCTTATATAGTTTGTTCTTATAGAAAAGCGTAGTAGTA
CTACTTGTAGTAGTTTGAGCGAAGAAAACGAACAAGGGTTTCGAATTAAA
TCTGGCGCGAGAGAAAAAATCAAGTAAATAAAAGGAGCGATAAGGGGAAA
TGCCTTATAAAAGGTTGATAGATTTCCTTTCTTCTCTTTTGAAAGCCAGG
TGTTCATTCAAAAGATGTTTTTCTATTTTAAATTCAATAAAAGAAATATG
ATTAAACGATTGACTTTTTATTTTAATGTTTTTTGTTTTCATAATGACCC
ATAAAGTCTGTCAAAATGGAAAAATGAGCTAAAATTGCTTGATACACGGC
CAATTTTCGTTCTGTTTACTTGATATTTTTCGTGCAAATTTACATGGGAT
CAAAGCTAAAGCTAAGCAAAAATTTAATTCGAAACCCGTGTATTAACCTT
TTGTTTTTCGAACCATTTCAGATGATAGCATCGTTACTAGTGTTGGGAAC
AGCAAGGGCAAGTGGTATCATCACATTCCCTTCATTCCAGCGAGACACTT
TAAGAAAGGTAATCATATACATGGAGCGATGGTCAAGTTGTCAAAGGCGT
CAGCGTCTCAAACCAGGGATTCGCTGTTCGAATCCCCGCTCCTTCCAATG
TTCCGTTCAATTCATAGATAGCCGAGCCGGCTGGCCGTGGACCCCGTGAA
AACAATGGAAAGACTGTCTAAAAGTCCTAAATTACTGGCCTATCCACGTA
AAATATCGACTCTCTCTATCTATCTATAAACGTTACCAGAATGTTTTCTA
TGGATTTTACCGTACATTTATGGATTTACTCAAATTGTTCTTATTTTGTT
CTTATTTATAGGGTGTAATTGAGGTAGTTTAGGCGTTATACCCAATTTTT
ACTACTTTGACCCCTATCAGCATTGCTCTTAAATTGTTCTTATTTTTTTG
ACACTTTGACCCCTAATTTGCTTGAATTAGAGTAATTTTGGGCTCAGCAT
TGTTCTTAAATTGTTCCTAATTTTTTGGTGATTTTGAGCCTCATTGTTCT
CATAAAATTGTTTTTATAAAAAAAATGTATTACTTTGGATAATTCGTTTA
TGGAATCCTAAAAGAATACAATATTATCAACATTTGTTTAAACATTCCTT
CATTGAAATTCCTTACGACTTCTTGTTTAAAATGAACGCTTCTCCTAGAG
GGGAGGCGTTTAATCGAAGAGGGCGTTAATTTGAATATGTTTTCTTTAAA
GTGGGGCGTTTGTTCAGGTGGTCCTTTTGTTTTTGGGAAGATTATTAAAC
TTAACCACTCTAGCCTTAAACTGCTGTTTTTATTCTCACAGATTTTCCCG
TTACCACTGATATTCTTCCTGAACTTGGTATGTGGGCTTGGAAGTACAAA
AACTTTGAAGTATGTAAACTGTCATCAGCTATAAATTAATAGCCGTAGTC
TGTATGTCACTTTGTTTGTTTGTCTGTCCGTGTGTTACTATCGTTTTCGC
AAGCAATGTTTTGTTCTTTTAAAAGATGACTTTTGTTTTGATTGACAGAT
TATAATTTCTGCCTTGACTTGCCCGCCTATATGTTTTTCTTTTTTTTTTC
TCTCTTTTCTTTTGTTTTATGTTTTCGAATGTAATTGACGACCTTATTTG
ATAATTAAAACGACATTCGAATCCTTTTCAAAACAAAGCAAAATCTTTTT
ATAGAAAAGAACAAATCTGAAAAAAAATCAAAAAAAATCAAAAAGTTATG
GCCGGAACGGCTAGTTTATATATTTTGCATGTCTCACTGTACACTTTTGT
GGTCGGATAGTTCATCCGCTTTGCAGCAATTCTGGAAAATCCTGTAAAAA
TGTTCGCTGGTAAATCACTAATATTAATTTTGTGTCCTAAAGGGTCACTA
AATGTCCGAGTTTTTGAGTCACGTTGCATTTTACGTTTTTTATTTCAGTC
TACCAATGTTTACAGTTTTGAGAAGATTTTCGATCCTTTTCACCATGTTG
GCTGAATATGTTTTACTGAGGTATAAAATTATTATTCTAAGTCTTTCACG
TACTGTTCTTGTACGGTCCCCAGTGGTTTGCGTGAATGGGTTTTTTCATT
TACGTAAATGCGTGGAAATTTAAAGAAAATTGCGTGAATGCTAACCTATA
CTAGACGTCACCCGTGTTTTTTGTACGCAATCAACGTCTATTCCACTTTG
CGACTTTTTCGAATGTTTTGAGCTCAGATTTTGGCCTCCAAACATTCGAT
TTTTTGAAGTCACTTTTAATTTTCGAAGCTACTGCAGTAGCGAAAAAATC
GAATTTGCGTCAAAGCACTTGAAAGGCTTCTATTTTTCAAAAATCATCAA
AATTATAGTGGAACTCACCAAGAAACGGAATGAAAAATGTCGGTTTTTCG
TGACGTGCTCGCTACGTGAATGCGTGAATCGGAAAGCTTTGCGTGAATAA
AAATAGAGAAAAAACATTGCGTGAATGCGTAGATTTGAGAAACAAATTGC
GTGATCACGTGAATTGAAGGTCAGCTGGGGGGCCTTTTGTACCAAGCAAA
TACTTAAAGTTTTCTTGTAGGATACTGCTGCTTTTTGGAATTGAATTTAC
AGTGGAATCTCCCTCGTTCGAACTAGAATCTTTCTGTAATTCGAACGTTG
GTCCTCTTAGCTGGAAAGTTGTGTAAAATACTACCCGTAATTCTCCAATT
CGAAGAAAAGTCTTCGTTCCTGGAAGATCGAATTAGAGAGAGTTGACTGT
ATACTTCCACCAGAGAATTGATGACGATAATTGAAGTTAATACAATAAAC
CGAGTAAAAAAAGATCAACAACAGGCAAAAATCATAAACTTAGTTTGTGG
TCGTCAGCTTAAAGGTTTTGTTTTTAAATAAGAGTGACATCGTTTGCTTA
CTCATCAATCTTAATTTAAAAGCTTTTTCACATTTGATTGACACGGATGT
GGAACAAGATTGACCAGAAAGAGGAAAAGAAAAACATTTTCGCTTATATC
AGCATAACATAACAATAGGCAAGCACTGCCCTGATATGAAATATGTGTCT
GATGTGAAACGGAAACACTTATATAAAAATAAAACCTTTAAACTATTCAA
TTGATGGGAAGGTAATACGGTTTTATTTGATTTATATTTTCTCTATTTCT
TCTATTTTCTCTTCACAGGAAATCTGCAAGTTGTCGAGTGCAGTCATCCG
TCTACACCATGATCTTTGGTGCTCTGATAGCTGCAAGGTATAGCAATAGA
CCTTTTCATAAATTGCGTTACAAACATCACTTGCCTCGTTTTGAAATTAT
TGCCATGGTGATTAACTCCCAGCGGATTTTATTAATATTAATATTCATAT
GTCTCAAGAGACATAATCACCATGTTAATGGTTTGAATACGAGGCAAGTG
ATGTTCGTTAAGTAATTTATGAAAATGTCTATTATCATCAATTACTTAAG
GACATGTTTTTTTTTGACTGTACCAAAATCAGGTTTTCGAAAATCGTGAA
AATCACTTTATTTTAATTATTTCGTCATTCGCATGATTAATTTTCCCAAA
ATTTTGATATGTATTGAAATTTGGGAAGGGCTTTAAAATGAACCATTTGA
AATTTCAAAATTCGGAGTATTTCAGGATTAATTAATCATGGAGTGTTTTG
GATCATATCTCACTCCATGACTCATTATTCGGTCCTGAGGAGGTTTCTAT
GCATTCCTGAGGTAGCCTAAAATCATAAAATAGCCTGAGGAGTAATTTTT
TACAGGCCGGAGTGATTTATGATCAAAACAAACAAAGGACTTTTTTAATC
ATTTTTCACTCATTTTAACAATTCCCGTTTTCTTTAGTTCGTTCCTTTCT
TATCAACTAAACAAAAATCTCAAATCACTTCCCCGATAGATAGACTTGTC
AGGAAAATATATACGATTAGAATTAGCACCTAGATTTCAAAAATGATCAA
TTTGATCCCATTTCCCCCCGGTTTTTTCCAAAAAAAAGAGGTCGATGTGA
AAAATCAATCCTTTAGCTACACCCTGATATAAGTTTCGTATATAAATTGG
ACACGACAAAGGCCAAATATAGAGCCGACTTTATAAATCCGAAATAGACT
ATGATTTTTTTCATCCTGAAATACTCCGGATTCAACAAGCGATATCTTAA
GTTCCATAAAAGCTATTAAGATCGGACAAAAAGTATCGGACAGAGCTACT
AATCTATTTTCTTATTTTTGAATAACGATAAGAAAGGGTTCAGCTGTCTC
TGTTAGTGCCGATTTGAACCGGGTTGGTTGAAAATCGGCATTTTGGTACA
GTCGAAAAAAAACATGTCCTTAACTTGATGTCTTATTTTACAGAAAATTA
TACCTTTTCATAAATTACGTTACGAACATCACTTGCCTCGTTTTGAAATT
ATTGCCATGGTGATTAACTCCCCAGTGGATTTTATTAAATTTACTTCCTA
TTCATAAAAAAATCATTTAATGTCTCAGGAGACATAATCACCATGTTAAT
TGTTTGAATACGGGGCAAGTGATGTCCGTTAAGTAATTTATGAAAATGTC
TATTATCATCAATTACTTTAACTTGATGTCTTATTTTACAGAAAATTATT
TGTGTTTCCTTTTCACTCGCCAATTACGGAACTTGTGCAGCGGTGGATAT
AACAATTTTTAGGAGTTATCTACCGGGCATGAAATTTTTGACAATGGGTT
TATTGGAAGCGAAGAGAAAACCTTTCTAATCATAAAATTGTACAGAATAT
GATCTCTTGCTTACTAGACCTCTTTTTTGAACGCGGTCTTGTATTTGTAC
GGTACAATATGAAATATTGCATTTTGAAATTGTTAATTTACCCTCCCCTC
AGAAATATTTTACAAACCCTATCCTCCAACCCATCCACTCCGCATTGTAG
GAGTATTTCTCTGAAGAAACTTTTTCACAGTACAGCTTAAAGCTTCTGCA
AACTATATGGCCGGAAATATGAAGTTGGGTAATATTTCCGTCGGGGAAAA
AACTTCGTCACTTTCCCCCGACTTTTTAAGTAGTAGTAAGTTTGCGACCG
CAGTCGAGGGCGACCCGAAGGCTCCCTTTTCGTATAGCTCTCTACCCGCC
GGTAGGGGTGGGCATTTCTCCACTTACCCTTGATCCCTCTCTTTAGTTGC
TGAGCATCAAGCAGAGGGGTACGAAGTACCATTTTGGAAATCTTTAGTAT
GACCCGGCTGGGGACCGAACCCAAAACTTTGCGCACCGTAGCTGGATGCT
CTACCTTAATGCTACGGTCGCCGACTTTTTACCTCGATAATGTATTCTCT
CAGTCTTCGTCAATATTTCAAAATGATTGATTTGTTTTTAGTTCGGATTT
GGTATTCGATTGGTATGGTTACGCATTGATCATGGGGAATAATGTTATGA
CTGCT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000289_pilon:247144..253998- >XLOC_042459 ID=XLOC_042459|Name=XLOC_042459|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=990bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000289_pilon:247144..253998- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGATGGTCAGTCCAGTTCGTAAAGTTTCGACTGCGTTATTTTATGCAAC ATCATCATTATTGATCGTGTTTGTTAATAAAATGGTATTGACAACGCACA AATGATGGTCAGTCCAGTTCGTAAAGTTTCGACTGCGTTATTTTATGCAA CATCATCATTATTGATCGTGTTTGTTAATAAAATGGTATTGACAACGCAC AAATTCCCTTCTTATCAAGCTCTTGGAATCGGCCAGATTCCCTTCTTATC AAGCTCTTGGAATCGGCCAGATGATAGCATCGTTACTAGTGTTGGGAACA GCAAGGGCAAGTGGTATCATCACATTCCCTTCATTCCAGCGAGACACTTT AAGAAAGATGATAGCATCGTTACTAGTGTTGGGAACAGCAAGGGCAAGTG GTATCATCACATTCCCTTCATTCCAGCGAGACACTTTAAGAAAGATTTTC CCGTTACCACTGATATTCTTCCTGAACTTGGTATGTGGGCTTGGAAGTAC AAAAACTTTGAAATTTTCCCGTTACCACTGATATTCTTCCTGAACTTGGT ATGTGGGCTTGGAAGTACAAAAACTTTGAATCTACCAATGTTTACAGTTT TGAGAAGATTTTCGATCCTTTTCACCATGTTGGCTGAATATGTTTTACTG AGTCTACCAATGTTTACAGTTTTGAGAAGATTTTCGATCCTTTTCACCAT GTTGGCTGAATATGTTTTACTGAGGAAATCTGCAAGTTGTCGAGTGCAGT CATCCGTCTACACCATGATCTTTGGTGCTCTGATAGCTGCAAGGAAATCT GCAAGTTGTCGAGTGCAGTCATCCGTCTACACCATGATCTTTGGTGCTCT GATAGCTGCAAGTTCGGATTTGGTATTCGATTGGTATGGTTACGCATTGA TCATGGGGAATAATGTTATGACTGCTTTCGGATTTGGTATTCGATTGGTA TGGTTACGCATTGATCATGGGGAATAATGTTATGACTGCT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000289_pilon | genome | sc0000289_pilon:247144..253998 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 433-495:64 |
| Aaloc | 364-429:2237 |
| Aaloc | 292-360:3457 |
| Aaloc | 223-288:4065 |
| Aaloc | 136-222:4935 |
| Aaloc | 103-135:5936 |
| Aaloc | 1-99:6856 |
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